RNA–Protein interactions for RNA: YHR042W

NCP1, Transcript of NADP-cytochrome P450 reductase, yeast

Gene NCP1, Length 2,076 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
NCP1	YHR042W	GPB2	P39717	880 aa		11.72	□□□□□ -0.53
NCP1	YHR042W	RPT2	P40327	437 aa	Known RBP	11.72	□□□□□ -0.53
NCP1	YHR042W	PSP2	P50109	593 aa	Known RBP	11.72	□□□□□ -0.53
NCP1	YHR042W	TIF1	P10081	395 aa	Known RBP	11.71	□□□□□ -0.53
NCP1	YHR042W	SNT1	P25357	1226 aa		11.71	□□□□□ -0.53
NCP1	YHR042W	SPS22	P25380	463 aa		11.71	□□□□□ -0.53
NCP1	YHR042W	SWC5	P38326	303 aa		11.71	□□□□□ -0.53
NCP1	YHR042W	YIL054W	P40524	105 aa		11.71	□□□□□ -0.53
NCP1	YHR042W	YJL107C	P42947	387 aa		11.71	□□□□□ -0.53
NCP1	YHR042W	PAN2	P53010	1115 aa	Predicted RBP	11.71	□□□□□ -0.53
NCP1	YHR042W	CDC55	Q00362	526 aa		11.71	□□□□□ -0.53
NCP1	YHR042W	RNY1	Q02933	434 aa	Known RBP	11.71	□□□□□ -0.53
NCP1	YHR042W	SXM1	Q04175	944 aa	Known RBP	11.71	□□□□□ -0.53
NCP1	YHR042W	GPN2	Q08726	347 aa	Predicted RBP	11.71	□□□□□ -0.53
NCP1	YHR042W	STB3	Q12427	513 aa		11.71	□□□□□ -0.53
NCP1	YHR042W	SPT5	P27692	1063 aa	Known RBP	11.71	□□□□□ -0.54
NCP1	YHR042W	MRP4	P32902	394 aa		11.71	□□□□□ -0.54
NCP1	YHR042W	TAH11	P47112	604 aa		11.71	□□□□□ -0.54
NCP1	YHR042W	SCS3	P53012	380 aa		11.71	□□□□□ -0.54
NCP1	YHR042W	CLB4	P24871	460 aa		11.7	□□□□□ -0.54
NCP1	YHR042W	MRM1	P25270	412 aa		11.7	□□□□□ -0.54
NCP1	YHR042W	YBL036C	P38197	257 aa		11.7	□□□□□ -0.54
NCP1	YHR042W	SCC4	P40090	624 aa		11.7	□□□□□ -0.54
NCP1	YHR042W	ECM7	Q06200	448 aa		11.7	□□□□□ -0.54
NCP1	YHR042W	DPH2	P32461	534 aa		11.69	□□□□□ -0.54
NCP1	YHR042W	YDR089W	P38966	869 aa		11.69	□□□□□ -0.54
NCP1	YHR042W	ALG5	P40350	334 aa		11.69	□□□□□ -0.54
NCP1	YHR042W	ULI1	P43604	169 aa		11.69	□□□□□ -0.54
NCP1	YHR042W	DAK1	P54838	584 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
NCP1	YHR042W	OSH6	Q02201	448 aa		11.69	□□□□□ -0.54
NCP1	YHR042W	SPO19	Q03029	223 aa		11.69	□□□□□ -0.54
NCP1	YHR042W	HFD1	Q04458	532 aa		11.69	□□□□□ -0.54
NCP1	YHR042W	AVL9	Q12500	764 aa		11.69	□□□□□ -0.54
NCP1	YHR042W	SIN4	P32259	974 aa		11.69	□□□□□ -0.54
NCP1	YHR042W	AVT2	P39981	480 aa		11.69	□□□□□ -0.54
NCP1	YHR042W	ADI1	Q03677	179 aa		11.69	□□□□□ -0.54
NCP1	YHR042W	YSH1	Q06224	779 aa	Predicted RBP	11.69	□□□□□ -0.54
NCP1	YHR042W	AIM39	Q08223	395 aa		11.69	□□□□□ -0.54
NCP1	YHR042W	YHL008C	P38750	627 aa		11.68	□□□□□ -0.54
NCP1	YHR042W	YJL206C	P39529	758 aa		11.68	□□□□□ -0.54
NCP1	YHR042W	YFL012W	P43580	148 aa		11.68	□□□□□ -0.54
NCP1	YHR042W	MND1	P53102	219 aa		11.68	□□□□□ -0.54
NCP1	YHR042W	ACL4	Q03771	387 aa		11.68	□□□□□ -0.54
NCP1	YHR042W	SGT2	Q12118	346 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
NCP1	YHR042W	SPE4	Q12455	300 aa		11.68	□□□□□ -0.54
NCP1	YHR042W	RTP1	Q12751	981 aa		11.68	□□□□□ -0.54
NCP1	YHR042W	MRPS28	P21771	286 aa		11.67	□□□□□ -0.54
NCP1	YHR042W	YUR1	P26725	428 aa		11.67	□□□□□ -0.54
NCP1	YHR042W	PEA2	P40091	420 aa		11.67	□□□□□ -0.54
NCP1	YHR042W	SIP5	P40210	489 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
NCP1	YHR042W	ALT1	P52893	592 aa		11.67	□□□□□ -0.54
NCP1	YHR042W	YMR160W	Q03823	816 aa		11.67	□□□□□ -0.54
NCP1	YHR042W	CDD1	Q06549	142 aa		11.67	□□□□□ -0.54
NCP1	YHR042W	DIA2	Q08496	732 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
NCP1	YHR042W	CFT2	Q12102	859 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
NCP1	YHR042W	GPM3	Q12326	303 aa		11.67	□□□□□ -0.54
NCP1	YHR042W	OCA6	Q12454	224 aa		11.67	□□□□□ -0.54
NCP1	YHR042W	NKP1	Q12493	238 aa		11.67	□□□□□ -0.54
NCP1	YHR042W	CKB2	P38930	258 aa		11.67	□□□□□ -0.54
NCP1	YHR042W	PRK1	P40494	810 aa		11.67	□□□□□ -0.54
NCP1	YHR042W	VTC4	P47075	721 aa		11.67	□□□□□ -0.54
NCP1	YHR042W	MCM6	P53091	1017 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
NCP1	YHR042W	UTP8	P53276	713 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
NCP1	YHR042W	FMN1	Q03778	218 aa		11.67	□□□□□ -0.54
NCP1	YHR042W	MSC6	Q08818	692 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
NCP1	YHR042W	TRM5	P38793	499 aa		11.66	□□□□□ -0.54
NCP1	YHR042W	GEM1	P39722	662 aa		11.66	□□□□□ -0.54
NCP1	YHR042W	PEP8	P40335	379 aa		11.66	□□□□□ -0.54
NCP1	YHR042W	MSH6	Q03834	1242 aa		11.66	□□□□□ -0.54
NCP1	YHR042W	ARO80	Q04052	950 aa		11.66	□□□□□ -0.54
NCP1	YHR042W	SLP1	Q12232	587 aa		11.66	□□□□□ -0.54
NCP1	YHR042W	EXO70	P19658	623 aa		11.66	□□□□□ -0.54
NCP1	YHR042W	FAR3	P46671	204 aa		11.66	□□□□□ -0.54
NCP1	YHR042W	MAD3	P47074	515 aa		11.66	□□□□□ -0.54
NCP1	YHR042W	INA17	Q02888	182 aa		11.66	□□□□□ -0.54
NCP1	YHR042W	CWC15	Q03772	175 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
NCP1	YHR042W	SNU56	Q03782	492 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
NCP1	YHR042W	YPR027C	Q12079	277 aa		11.66	□□□□□ -0.54
NCP1	YHR042W	IMA3	P0CW40	589 aa		11.65	□□□□□ -0.54
NCP1	YHR042W	IMA4	P0CW41	589 aa		11.65	□□□□□ -0.54
NCP1	YHR042W	PUT4	P15380	627 aa		11.65	□□□□□ -0.54
NCP1	YHR042W	PKC1	P24583	1151 aa		11.65	□□□□□ -0.54
NCP1	YHR042W	MEF1	P25039	761 aa		11.65	□□□□□ -0.54
NCP1	YHR042W	VBA3	P25594	458 aa		11.65	□□□□□ -0.54
NCP1	YHR042W	DGR2	P32330	852 aa		11.65	□□□□□ -0.54
NCP1	YHR042W	SEC6	P32844	805 aa		11.65	□□□□□ -0.54
NCP1	YHR042W	SMY2	P32909	740 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
NCP1	YHR042W	SRB2	P34162	210 aa		11.65	□□□□□ -0.54
NCP1	YHR042W	VBA5	P36172	582 aa		11.65	□□□□□ -0.54
NCP1	YHR042W	AGP2	P38090	596 aa		11.65	□□□□□ -0.54
NCP1	YHR042W	FLR1	P38124	548 aa		11.65	□□□□□ -0.54
NCP1	YHR042W	NMD3	P38861	518 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
NCP1	YHR042W	RKM2	Q03942	479 aa		11.65	□□□□□ -0.54
NCP1	YHR042W	ADY3	Q07732	790 aa		11.65	□□□□□ -0.54
NCP1	YHR042W	IMA2	Q08295	589 aa		11.65	□□□□□ -0.54
NCP1	YHR042W	SKG6	P32900	734 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
NCP1	YHR042W	GUA1	P38625	525 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
NCP1	YHR042W	DIA4	P38705	446 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
NCP1	YHR042W	COS6	P53344	381 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NCP1	YHR042W	TOM1	Q03280	3268 aa		11.64	□□□□□ -0.55

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