RNA–Protein interactions for RNA: YBL059W

YBL059W, Transcript of Putative protein of unknown function, yeast

Gene YBL059W, Length 582 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YBL059W	YBL059W	MIP6	P38760	659 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
YBL059W	YBL059W	CTF8	P38877	133 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YBL059W	YBL059W	RRP8	P38961	392 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
YBL059W	YBL059W	MPT5	P39016	859 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.85	□□□□□ -1.63	not detected
YBL059W	YBL059W	ENP2	P48234	707 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
YBL059W	YBL059W	AUS1	Q08409	1394 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YBL059W	YBL059W	FBP1	P09201	348 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YBL059W	YBL059W	DGR2	P32330	852 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YBL059W	YBL059W	LST4	P34239	828 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YBL059W	YBL059W	APN2	P38207	520 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YBL059W	YBL059W	FAT1	P38225	669 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YBL059W	YBL059W	SAK1	P38990	1142 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YBL059W	YBL059W	ERP2	P39704	215 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YBL059W	YBL059W	MAM1	P40065	302 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YBL059W	YBL059W	SDP1	P40479	209 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YBL059W	YBL059W	ASK10	P48361	1146 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YBL059W	YBL059W	TMA10	Q06177	86 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YBL059W	YBL059W	TPO1	Q07824	586 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YBL059W	YBL059W	ADE6	P38972	1358 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
YBL059W	YBL059W	MSH1	P25846	959 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YBL059W	YBL059W	MSP1	P28737	362 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YBL059W	YBL059W	DBF20	P32328	564 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YBL059W	YBL059W	APT2	P36973	181 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YBL059W	YBL059W	KTR4	P38131	464 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YBL059W	YBL059W	SRP68	P38687	599 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
YBL059W	YBL059W	YHR202W	P38887	602 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YBL059W	YBL059W	DUN1	P39009	513 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YBL059W	YBL059W	ACA1	P39970	489 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YBL059W	YBL059W	QRI7	P43122	407 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YBL059W	YBL059W	SET2	P46995	733 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
YBL059W	YBL059W	NOP15	P53927	220 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
YBL059W	YBL059W	YLR224W	Q05947	369 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YBL059W	YBL059W	NUR1	Q12066	484 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YBL059W	YBL059W	YOL114C	Q12322	202 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YBL059W	YBL059W	GLN4	P13188	809 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
YBL059W	YBL059W	HOP1	P20050	605 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YBL059W	YBL059W	PHO3	P24031	467 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YBL059W	YBL059W	BEM4	P39011	633 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YBL059W	YBL059W	FUN12	P39730	1002 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
YBL059W	YBL059W	VID27	P40157	782 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YBL059W	YBL059W	VID28	P40547	921 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YBL059W	YBL059W	IML2	P47031	731 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YBL059W	YBL059W	BRE5	P53741	515 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
YBL059W	YBL059W	YNL050C	P53952	270 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YBL059W	YBL059W	ARP4	P80428	489 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YBL059W	YBL059W	YLR407W	Q06070	228 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YBL059W	YBL059W	ADY3	Q07732	790 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YBL059W	YBL059W	NOP12	Q08208	459 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
YBL059W	YBL059W	CWC2	Q12046	339 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
YBL059W	YBL059W	PSF3	Q12146	194 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YBL059W	YBL059W	SWM1	Q12379	170 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YBL059W	YBL059W	KCS1	Q12494	1050 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YBL059W	YBL059W	SNF2	P22082	1703 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YBL059W	YBL059W	RAD50	P12753	1312 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YBL059W	YBL059W	RPS17A	P02407	136 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
YBL059W	YBL059W	MSS18	P08593	268 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YBL059W	YBL059W	RPS17B	P14127	136 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
YBL059W	YBL059W	STE11	P23561	717 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YBL059W	YBL059W	PET309	P32522	965 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
YBL059W	YBL059W	AKL1	P38080	1108 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
YBL059W	YBL059W	PPE1	P38796	400 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YBL059W	YBL059W	STL1	P39932	569 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YBL059W	YBL059W	MCM6	P53091	1017 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
YBL059W	YBL059W	PIL1	P53252	339 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
YBL059W	YBL059W	TEP1	P53916	434 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YBL059W	YBL059W	CTF4	Q01454	927 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YBL059W	YBL059W	PKH1	Q03407	766 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YBL059W	YBL059W	COG4	Q06096	861 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YBL059W	YBL059W	OMS1	Q06668	471 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YBL059W	YBL059W	RTT109	Q07794	436 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YBL059W	YBL059W	NGL1	Q08213	363 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
YBL059W	YBL059W	RPS19A	P07280	144 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
YBL059W	YBL059W	RPS19B	P07281	144 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
YBL059W	YBL059W	DAL5	P15365	543 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YBL059W	YBL059W	ATP12	P22135	325 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YBL059W	YBL059W	RPN12	P32496	274 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YBL059W	YBL059W	MET12	P46151	657 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YBL059W	YBL059W	PRP31	P49704	494 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
YBL059W	YBL059W	MNN10	P50108	393 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
YBL059W	YBL059W	EXG2	P52911	562 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YBL059W	YBL059W	MUS81	Q04149	632 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
YBL059W	YBL059W	BLS1	Q06071	122 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YBL059W	YBL059W	HIM1	Q06674	414 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YBL059W	YBL059W	ISA1	Q07821	250 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
YBL059W	YBL059W	APA1	P16550	321 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
YBL059W	YBL059W	MSM1	P22438	575 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YBL059W	YBL059W	IMG2	P25642	146 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
YBL059W	YBL059W	EXO84	P38261	753 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YBL059W	YBL059W	PLB1	P39105	664 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YBL059W	YBL059W	SSP120	P39931	234 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
YBL059W	YBL059W	VHR1	P40522	640 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YBL059W	YBL059W	URM1	P40554	99 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
YBL059W	YBL059W	PFA3	P42836	336 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YBL059W	YBL059W	ASI2	P53895	289 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YBL059W	YBL059W	SVL3	Q03088	825 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
YBL059W	YBL059W	YML131W	Q03102	365 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YBL059W	YBL059W	PPN1	Q04119	674 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YBL059W	YBL059W	YMR018W	Q04364	514 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YBL059W	YBL059W	WHI4	Q07655	649 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
YBL059W	YBL059W	VHS3	Q08438	674 aa		4.79	□□□□□ -1.64

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 8.4 ms