RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628306.2

CAPNS1-216, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-216ENST00000628306 IREB2P48200 963 aaKnown RBP30.25■■■□□ 2.43
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP30.25■■■□□ 2.43
CAPNS1-216ENST00000628306 CCDC57Q2TAC2 916 aa30.24■■■□□ 2.43
CAPNS1-216ENST00000628306 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa30.24■■■□□ 2.43
CAPNS1-216ENST00000628306 MS4A4AQ96JQ5 239 aa30.24■■■□□ 2.43
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP30.24■■■□□ 2.43
CAPNS1-216ENST00000628306 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP30.23■■■□□ 2.43
CAPNS1-216ENST00000628306 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP30.23■■■□□ 2.43
CAPNS1-216ENST00000628306 GYG1P46976 350 aa30.23■■■□□ 2.43
CAPNS1-216ENST00000628306 CD99L2Q8TCZ2 262 aa30.23■■■□□ 2.43
CAPNS1-216ENST00000628306 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP30.23■■■□□ 2.43
CAPNS1-216ENST00000628306 PTPN22Q9Y2R2 807 aa30.23■■■□□ 2.43
CAPNS1-216ENST00000628306 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP30.22■■■□□ 2.43
CAPNS1-216ENST00000628306 UBE4AQ14139 1066 aa30.22■■■□□ 2.43
CAPNS1-216ENST00000628306 GRIK5Q16478 980 aa30.22■■■□□ 2.43
CAPNS1-216ENST00000628306 ALDH1L2Q3SY69 923 aa30.22■■■□□ 2.43
CAPNS1-216ENST00000628306 MFSD14BQ5SR56 506 aa30.22■■■□□ 2.43
CAPNS1-216ENST00000628306 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP30.22■■■□□ 2.43
CAPNS1-216ENST00000628306 CNNM1Q9NRU3 951 aa30.22■■■□□ 2.43
CAPNS1-216ENST00000628306 SERPINA10Q9UK55 444 aa30.22■■■□□ 2.43
CAPNS1-216ENST00000628306 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP30.21■■■□□ 2.432e-8■■■□□ 16.5
CAPNS1-216ENST00000628306 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP30.21■■■□□ 2.43
CAPNS1-216ENST00000628306 PDE3AQ14432 1141 aa30.2■■■□□ 2.43
CAPNS1-216ENST00000628306 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa30.2■■■□□ 2.43
CAPNS1-216ENST00000628306 ERO1AQ96HE7 468 aa30.2■■■□□ 2.43
CAPNS1-216ENST00000628306 SUCLG2Q96I99 432 aa30.2■■■□□ 2.43
CAPNS1-216ENST00000628306 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP30.2■■■□□ 2.43
CAPNS1-216ENST00000628306 BCAR3O75815 825 aa30.19■■■□□ 2.42
CAPNS1-216ENST00000628306 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP30.19■■■□□ 2.42
CAPNS1-216ENST00000628306 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP30.19■■■□□ 2.42
CAPNS1-216ENST00000628306 ARMC5Q96C12 935 aa30.19■■■□□ 2.42
CAPNS1-216ENST00000628306 OPTNQ96CV9 577 aa30.19■■■□□ 2.42
CAPNS1-216ENST00000628306 ELP3Q9H9T3 547 aa30.19■■■□□ 2.42
CAPNS1-216ENST00000628306 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa30.19■■■□□ 2.42
CAPNS1-216ENST00000628306 ALDH1L1O75891 902 aa30.18■■■□□ 2.42
CAPNS1-216ENST00000628306 TAF7LQ5H9L4 462 aa30.18■■■□□ 2.42
CAPNS1-216ENST00000628306 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP30.18■■■□□ 2.42
CAPNS1-216ENST00000628306 BRI3BPQ8WY22 251 aa30.17■■■□□ 2.42
CAPNS1-216ENST00000628306 TNFAIP1Q13829 316 aa30.16■■■□□ 2.42
CAPNS1-216ENST00000628306 TMEM39BQ9GZU3 492 aa30.16■■■□□ 2.42
CAPNS1-216ENST00000628306 CRKP46108 304 aa30.15■■■□□ 2.42
CAPNS1-216ENST00000628306 SP3Q02447 781 aa30.15■■■□□ 2.42
CAPNS1-216ENST00000628306 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa30.15■■■□□ 2.42
CAPNS1-216ENST00000628306 FBXO33Q7Z6M2 555 aa30.15■■■□□ 2.42
CAPNS1-216ENST00000628306 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP30.15■■■□□ 2.428e-20■■□□□ 14.3
CAPNS1-216ENST00000628306 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP30.15■■■□□ 2.42
CAPNS1-216ENST00000628306 UTYO14607 1347 aa30.15■■■□□ 2.42
CAPNS1-216ENST00000628306 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP30.15■■■□□ 2.42
CAPNS1-216ENST00000628306 VGLL4Q14135 290 aa30.15■■■□□ 2.42
CAPNS1-216ENST00000628306 EFCC1Q9HA90 598 aa30.15■■■□□ 2.42
CAPNS1-216ENST00000628306 TCP10L2B9ZVM9 353 aa30.14■■■□□ 2.41
CAPNS1-216ENST00000628306 MS4A1P11836 297 aa30.13■■■□□ 2.41
CAPNS1-216ENST00000628306 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP30.13■■■□□ 2.41
CAPNS1-216ENST00000628306 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa30.13■■■□□ 2.41
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC4A10Q6U841 1118 aa30.12■■■□□ 2.41
CAPNS1-216ENST00000628306 VGLL2Q8N8G2 317 aa30.12■■■□□ 2.41
CAPNS1-216ENST00000628306 EN2P19622 333 aaPredicted RBP30.11■■■□□ 2.41
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM43AQ8N2R8 423 aa30.11■■■□□ 2.41
CAPNS1-216ENST00000628306 ANKRD44Q8N8A2 993 aa30.11■■■□□ 2.41
CAPNS1-216ENST00000628306 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP30.11■■■□□ 2.41
CAPNS1-216ENST00000628306 MAP3K9P80192 1104 aa30.1■■■□□ 2.41
CAPNS1-216ENST00000628306 LRRC24Q50LG9 513 aa30.1■■■□□ 2.41
CAPNS1-216ENST00000628306 SSH1Q8WYL5 1049 aa30.1■■■□□ 2.41
CAPNS1-216ENST00000628306 MROH5Q6ZUA9 1318 aa30.1■■■□□ 2.41
CAPNS1-216ENST00000628306 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP30.09■■■□□ 2.41
CAPNS1-216ENST00000628306 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa30.08■■■□□ 2.41
CAPNS1-216ENST00000628306 CACNB3P54284 484 aa30.08■■■□□ 2.41
CAPNS1-216ENST00000628306 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP30.08■■■□□ 2.41
CAPNS1-216ENST00000628306 AAMPQ13685 434 aa30.08■■■□□ 2.41
CAPNS1-216ENST00000628306 CCL15Q16663 113 aa30.08■■■□□ 2.41
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF333Q96JL9 665 aa30.08■■■□□ 2.41
CAPNS1-216ENST00000628306 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa30.08■■■□□ 2.41
CAPNS1-216ENST00000628306 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP30.07■■■□□ 2.4
CAPNS1-216ENST00000628306 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa30.07■■■□□ 2.4
CAPNS1-216ENST00000628306 GTF2A2P52657 109 aa30.06■■■□□ 2.4
CAPNS1-216ENST00000628306 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP30.06■■■□□ 2.4
CAPNS1-216ENST00000628306 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP30.06■■■□□ 2.4
CAPNS1-216ENST00000628306 ARHGAP45Q92619 1136 aa30.06■■■□□ 2.4
CAPNS1-216ENST00000628306 GCC1Q96CN9 775 aa30.06■■■□□ 2.4
CAPNS1-216ENST00000628306 SMC4Q9NTJ3 1288 aa30.06■■■□□ 2.4
CAPNS1-216ENST00000628306 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa30.06■■■□□ 2.4
CAPNS1-216ENST00000628306 KIF16BQ96L93 1317 aa30.06■■■□□ 2.4
CAPNS1-216ENST00000628306 SPDYE5A6NIY4 337 aa30.05■■■□□ 2.4
CAPNS1-216ENST00000628306 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP30.05■■■□□ 2.4
CAPNS1-216ENST00000628306 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa30.05■■■□□ 2.4
CAPNS1-216ENST00000628306 EXOC6Q8TAG9 804 aa30.05■■■□□ 2.4
CAPNS1-216ENST00000628306 OTUD5Q96G74 571 aa30.05■■■□□ 2.4
CAPNS1-216ENST00000628306 TNNI2P48788 182 aa30.04■■■□□ 2.4
CAPNS1-216ENST00000628306 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP30.04■■■□□ 2.4
CAPNS1-216ENST00000628306 C20orf194Q5TEA3 1177 aa30.03■■■□□ 2.4
CAPNS1-216ENST00000628306 ZDHHC15Q96MV8 337 aa30.03■■■□□ 2.4
CAPNS1-216ENST00000628306 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa30.03■■■□□ 2.4
CAPNS1-216ENST00000628306 PDE8BO95263 885 aa30.03■■■□□ 2.4
CAPNS1-216ENST00000628306 BCAMP50895 628 aa30.03■■■□□ 2.4
CAPNS1-216ENST00000628306 KLHDC4Q8TBB5 520 aa30.03■■■□□ 2.4
CAPNS1-216ENST00000628306 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa30.03■■■□□ 2.4
CAPNS1-216ENST00000628306 CRBNQ96SW2 442 aa30.03■■■□□ 2.4
CAPNS1-216ENST00000628306 MRIQ9BWK5 157 aa30.03■■■□□ 2.4
CAPNS1-216ENST00000628306 CSADQ9Y600 493 aa30.03■■■□□ 2.4
CAPNS1-216ENST00000628306 FGFR2P21802 821 aa30.02■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.9 ms