RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000627746.2

PPP4C-214, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PPP4C, Length 1,301 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4C-214ENST00000627746 CSRNP1Q96S65 589 aa29.18■■■□□ 2.26
PPP4C-214ENST00000627746 ARAP2Q8WZ64 1704 aa29.18■■■□□ 2.26
PPP4C-214ENST00000627746 ADORA1P30542 326 aa29.17■■■□□ 2.26
PPP4C-214ENST00000627746 TIMM10P62072 90 aa29.17■■■□□ 2.26
PPP4C-214ENST00000627746 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP29.17■■■□□ 2.26
PPP4C-214ENST00000627746 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP29.17■■■□□ 2.26
PPP4C-214ENST00000627746 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP29.17■■■□□ 2.26
PPP4C-214ENST00000627746 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa29.16■■■□□ 2.26
PPP4C-214ENST00000627746 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP29.16■■■□□ 2.26
PPP4C-214ENST00000627746 MTX1Q13505 466 aa29.16■■■□□ 2.26
PPP4C-214ENST00000627746 RASA3Q14644 834 aa29.16■■■□□ 2.26
PPP4C-214ENST00000627746 SPDYE2Q495Y8 402 aa29.16■■■□□ 2.26
PPP4C-214ENST00000627746 RLBP1P12271 317 aa29.15■■■□□ 2.26
PPP4C-214ENST00000627746 TFCP2Q12800 502 aa29.15■■■□□ 2.26
PPP4C-214ENST00000627746 ARMC9Q7Z3E5 817 aa29.15■■■□□ 2.26
PPP4C-214ENST00000627746 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP29.14■■■□□ 2.25
PPP4C-214ENST00000627746 PHKA1P46020 1223 aa29.14■■■□□ 2.25
PPP4C-214ENST00000627746 TCP10L2B9ZVM9 353 aa29.13■■■□□ 2.25
PPP4C-214ENST00000627746 CDAN1Q8IWY9 1227 aa29.13■■■□□ 2.25
PPP4C-214ENST00000627746 C1orf115Q9H7X2 142 aa29.13■■■□□ 2.25
PPP4C-214ENST00000627746 SSC5DA1L4H1 1573 aa29.13■■■□□ 2.25
PPP4C-214ENST00000627746 CA12O43570 354 aa29.12■■■□□ 2.25
PPP4C-214ENST00000627746 TRPA1O75762 1119 aa29.12■■■□□ 2.25
PPP4C-214ENST00000627746 CACNB3P54284 484 aa29.12■■■□□ 2.25
PPP4C-214ENST00000627746 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP29.12■■■□□ 2.25
PPP4C-214ENST00000627746 TEKT1Q969V4 418 aa29.12■■■□□ 2.25
PPP4C-214ENST00000627746 RNF186Q9NXI6 227 aa29.12■■■□□ 2.25
PPP4C-214ENST00000627746 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa29.12■■■□□ 2.25
PPP4C-214ENST00000627746 MYH13Q9UKX3 1938 aa29.11■■■□□ 2.25
PPP4C-214ENST00000627746 LDLRAD1Q5T700 205 aa29.11■■■□□ 2.25
PPP4C-214ENST00000627746 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP29.1■■■□□ 2.25
PPP4C-214ENST00000627746 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa29.1■■■□□ 2.25
PPP4C-214ENST00000627746 ITPRIPQ8IWB1 547 aa29.1■■■□□ 2.25
PPP4C-214ENST00000627746 WDR66Q8TBY9 1149 aa29.1■■■□□ 2.25
PPP4C-214ENST00000627746 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa29.09■■■□□ 2.25
PPP4C-214ENST00000627746 CCDC102BQ68D86 513 aa29.09■■■□□ 2.25
PPP4C-214ENST00000627746 CLMNQ96JQ2 1002 aa29.09■■■□□ 2.25
PPP4C-214ENST00000627746 TMEM39BQ9GZU3 492 aa29.09■■■□□ 2.25
PPP4C-214ENST00000627746 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP29.09■■■□□ 2.25
PPP4C-214ENST00000627746 A0A1B0GUL7 405 aa29.08■■■□□ 2.25
PPP4C-214ENST00000627746 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP29.08■■■□□ 2.25
PPP4C-214ENST00000627746 ZDHHC15Q96MV8 337 aa29.08■■■□□ 2.25
PPP4C-214ENST00000627746 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP29.07■■■□□ 2.24
PPP4C-214ENST00000627746 USP2O75604 605 aaPredicted RBP29.07■■■□□ 2.24
PPP4C-214ENST00000627746 PRDX5P30044 214 aa29.07■■■□□ 2.24
PPP4C-214ENST00000627746 XAGE2Q96GT9 111 aa29.07■■■□□ 2.24
PPP4C-214ENST00000627746 TEPSINQ96N21 525 aa29.07■■■□□ 2.24
PPP4C-214ENST00000627746 NEUROD6Q96NK8 337 aa29.07■■■□□ 2.24
PPP4C-214ENST00000627746 MRIQ9BWK5 157 aa29.07■■■□□ 2.24
PPP4C-214ENST00000627746 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa29.07■■■□□ 2.24
PPP4C-214ENST00000627746 AKAP11Q9UKA4 1901 aa29.06■■■□□ 2.24
PPP4C-214ENST00000627746 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP29.06■■■□□ 2.24
PPP4C-214ENST00000627746 TNFAIP1Q13829 316 aa29.06■■■□□ 2.24
PPP4C-214ENST00000627746 DIXDC1Q155Q3 683 aa29.06■■■□□ 2.24
PPP4C-214ENST00000627746 PANK1Q8TE04 598 aa29.06■■■□□ 2.24
PPP4C-214ENST00000627746 SLC10A4Q96EP9 437 aa29.06■■■□□ 2.24
PPP4C-214ENST00000627746 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP29.05■■■□□ 2.243e-7■■□□□ 12.7
PPP4C-214ENST00000627746 MAP3K11Q16584 847 aa29.05■■■□□ 2.24
PPP4C-214ENST00000627746 DENND2AQ9ULE3 1009 aa29.05■■■□□ 2.24
PPP4C-214ENST00000627746 AKAP2Q9Y2D5 859 aa29.05■■■□□ 2.24
PPP4C-214ENST00000627746 ATP8B2P98198 1209 aa29.04■■■□□ 2.24
PPP4C-214ENST00000627746 HHIPL2Q6UWX4 724 aa29.04■■■□□ 2.24
PPP4C-214ENST00000627746 MAST3O60307 1309 aa29.04■■■□□ 2.24
PPP4C-214ENST00000627746 LDHBP07195 334 aaKnown RBP29.02■■■□□ 2.24
PPP4C-214ENST00000627746 TNNI2P48788 182 aa29.02■■■□□ 2.24
PPP4C-214ENST00000627746 RASGRF1Q13972 1273 aa29.02■■■□□ 2.24
PPP4C-214ENST00000627746 POLA2Q14181 598 aa29.02■■■□□ 2.24
PPP4C-214ENST00000627746 SPRYD7Q5W111 196 aa29.02■■■□□ 2.24
PPP4C-214ENST00000627746 SAGE1Q9NXZ1 904 aa29.02■■■□□ 2.24
PPP4C-214ENST00000627746 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa29.02■■■□□ 2.24
PPP4C-214ENST00000627746 SEMA3EO15041 775 aa29.01■■■□□ 2.23
PPP4C-214ENST00000627746 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP29.01■■■□□ 2.23
PPP4C-214ENST00000627746 IREB2P48200 963 aaKnown RBP29■■■□□ 2.23
PPP4C-214ENST00000627746 SSH3Q8TE77 659 aa29■■■□□ 2.23
PPP4C-214ENST00000627746 TM4SF4P48230 202 aa28.99■■■□□ 2.23
PPP4C-214ENST00000627746 TMOD2Q9NZR1 351 aa28.99■■■□□ 2.23
PPP4C-214ENST00000627746 ABCF2Q9UG63 623 aa28.99■■■□□ 2.23
PPP4C-214ENST00000627746 SALL1Q9NSC2 1324 aa28.99■■■□□ 2.23
PPP4C-214ENST00000627746 TBC1D8O95759 1140 aa28.98■■■□□ 2.23
PPP4C-214ENST00000627746 MVPQ14764 893 aaKnown RBP28.98■■■□□ 2.23
PPP4C-214ENST00000627746 SURF6O75683 361 aaKnown RBP28.97■■■□□ 2.23
PPP4C-214ENST00000627746 GORABQ5T7V8 394 aa28.97■■■□□ 2.23
PPP4C-214ENST00000627746 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa28.97■■■□□ 2.23
PPP4C-214ENST00000627746 PI16Q6UXB8 463 aa28.97■■■□□ 2.23
PPP4C-214ENST00000627746 WNK4Q96J92 1243 aa28.97■■■□□ 2.23
PPP4C-214ENST00000627746 GJA5P36382 358 aa28.96■■■□□ 2.23
PPP4C-214ENST00000627746 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP28.96■■■□□ 2.23
PPP4C-214ENST00000627746 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa28.96■■■□□ 2.23
PPP4C-214ENST00000627746 ABHD8Q96I13 439 aa28.96■■■□□ 2.23
PPP4C-214ENST00000627746 ELP3Q9H9T3 547 aa28.96■■■□□ 2.23
PPP4C-214ENST00000627746 TCP10Q12799 353 aa28.95■■■□□ 2.23
PPP4C-214ENST00000627746 USP40Q9NVE5 1235 aa28.95■■■□□ 2.23
PPP4C-214ENST00000627746 HMG20BQ9P0W2 317 aa28.95■■■□□ 2.23
PPP4C-214ENST00000627746 NFIAQ12857 509 aa28.94■■■□□ 2.22
PPP4C-214ENST00000627746 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP28.94■■■□□ 2.22
PPP4C-214ENST00000627746 FAM83AQ86UY5 434 aa28.94■■■□□ 2.22
PPP4C-214ENST00000627746 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa28.94■■■□□ 2.22
PPP4C-214ENST00000627746 OTOFQ9HC10 1997 aa28.94■■■□□ 2.22
PPP4C-214ENST00000627746 SREBF2Q12772 1141 aa28.94■■■□□ 2.22
PPP4C-214ENST00000627746 DGKZQ13574 1117 aa28.94■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 176.5 ms