RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590049.5

CAPNS1-209, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5

Gene CAPNS1, Length 592 nt, Biotype non stop decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-209ENST00000590049 NEUROD2Q15784 382 aa14.88□□□□□ -0.03
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CAPNS1-209ENST00000590049 C11orf16Q9NQ32 467 aa14.88□□□□□ -0.03
CAPNS1-209ENST00000590049 PODXL2Q9NZ53 605 aa14.88□□□□□ -0.03
CAPNS1-209ENST00000590049 LMOD3Q0VAK6 560 aa14.87□□□□□ -0.03
CAPNS1-209ENST00000590049 GAS2L2Q8NHY3 880 aa14.87□□□□□ -0.03
CAPNS1-209ENST00000590049 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
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CAPNS1-209ENST00000590049 ZBED9Q6R2W3 1325 aa14.87□□□□□ -0.03
CAPNS1-209ENST00000590049 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
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CAPNS1-209ENST00000590049 SHHQ15465 462 aa14.86□□□□□ -0.03
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CAPNS1-209ENST00000590049 MTMR14Q8NCE2 650 aa14.86□□□□□ -0.03
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CAPNS1-209ENST00000590049 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
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CAPNS1-209ENST00000590049 ZNF804BA4D1E1 1349 aa14.85□□□□□ -0.03
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CAPNS1-209ENST00000590049 BMP1P13497 986 aa14.84□□□□□ -0.03
CAPNS1-209ENST00000590049 IRF5Q13568 498 aa14.84□□□□□ -0.03
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CAPNS1-209ENST00000590049 POTEEQ6S8J3 1075 aa14.84□□□□□ -0.03
CAPNS1-209ENST00000590049 PHACTR3Q96KR7 559 aa14.84□□□□□ -0.03
CAPNS1-209ENST00000590049 OTOFQ9HC10 1997 aa14.84□□□□□ -0.03
CAPNS1-209ENST00000590049 ST18O60284 1047 aa14.83□□□□□ -0.04
CAPNS1-209ENST00000590049 SNAPC2Q13487 334 aa14.83□□□□□ -0.04
CAPNS1-209ENST00000590049 VGLL4Q14135 290 aa14.83□□□□□ -0.04
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CAPNS1-209ENST00000590049 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
CAPNS1-209ENST00000590049 SH3TC1Q8TE82 1336 aa14.83□□□□□ -0.04
CAPNS1-209ENST00000590049 MYL6BP14649 208 aa14.82□□□□□ -0.04
CAPNS1-209ENST00000590049 LRRC26Q2I0M4 334 aa14.82□□□□□ -0.04
CAPNS1-209ENST00000590049 C9orf50Q5SZB4 431 aa14.82□□□□□ -0.04
CAPNS1-209ENST00000590049 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
CAPNS1-209ENST00000590049 FBXW7Q969H0 707 aa14.82□□□□□ -0.04
CAPNS1-209ENST00000590049 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
CAPNS1-209ENST00000590049 CSADQ9Y600 493 aa14.82□□□□□ -0.04
CAPNS1-209ENST00000590049 CACNA1BQ00975 2339 aa14.82□□□□□ -0.04
CAPNS1-209ENST00000590049 RPS8P62241 208 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
CAPNS1-209ENST00000590049 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
CAPNS1-209ENST00000590049 PDE3AQ14432 1141 aa14.81□□□□□ -0.04
CAPNS1-209ENST00000590049 CCDC27Q2M243 656 aa14.81□□□□□ -0.04
CAPNS1-209ENST00000590049 STRIP1Q5VSL9 837 aa14.81□□□□□ -0.04
CAPNS1-209ENST00000590049 OGDHLQ9ULD0 1010 aa14.81□□□□□ -0.04
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CAPNS1-209ENST00000590049 SPDYE5A6NIY4 337 aa14.8□□□□□ -0.04
CAPNS1-209ENST00000590049 COL6A1P12109 1028 aa14.8□□□□□ -0.04
CAPNS1-209ENST00000590049 MAP3K9P80192 1104 aa14.8□□□□□ -0.04
CAPNS1-209ENST00000590049 DLGAP5Q15398 846 aa14.8□□□□□ -0.04
CAPNS1-209ENST00000590049 KIAA0825Q8IV33 1275 aa14.8□□□□□ -0.04
CAPNS1-209ENST00000590049 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
CAPNS1-209ENST00000590049 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa14.8□□□□□ -0.04
CAPNS1-209ENST00000590049 PRR33A8MZF0 331 aa14.79□□□□□ -0.04
CAPNS1-209ENST00000590049 MYO1BO43795 1136 aa14.79□□□□□ -0.04
CAPNS1-209ENST00000590049 GOLGA2Q08379 1002 aa14.79□□□□□ -0.04
CAPNS1-209ENST00000590049 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
CAPNS1-209ENST00000590049 NLRP10Q86W26 655 aa14.79□□□□□ -0.04
CAPNS1-209ENST00000590049 WWC1Q8IX03 1113 aa14.79□□□□□ -0.04
CAPNS1-209ENST00000590049 KCNH6Q9H252 994 aa14.79□□□□□ -0.04
CAPNS1-209ENST00000590049 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
CAPNS1-209ENST00000590049 TAOK2Q9UL54 1235 aa14.79□□□□□ -0.04
CAPNS1-209ENST00000590049 PDHXO00330 501 aa14.78□□□□□ -0.04
CAPNS1-209ENST00000590049 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
CAPNS1-209ENST00000590049 AAK1Q2M2I8 961 aa14.78□□□□□ -0.04
CAPNS1-209ENST00000590049 ANKRD23Q86SG2 305 aa14.78□□□□□ -0.04
CAPNS1-209ENST00000590049 ZNF576Q9H609 170 aa14.78□□□□□ -0.04
CAPNS1-209ENST00000590049 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
CAPNS1-209ENST00000590049 COL4A1P02462 1669 aa14.77□□□□□ -0.04
CAPNS1-209ENST00000590049 CFAP54Q96N23 3096 aa14.77□□□□□ -0.04
CAPNS1-209ENST00000590049 CLRN2A0PK11 232 aa14.77□□□□□ -0.05
CAPNS1-209ENST00000590049 IRF6O14896 467 aa14.77□□□□□ -0.05
CAPNS1-209ENST00000590049 BCRP11274 1271 aa14.77□□□□□ -0.05
CAPNS1-209ENST00000590049 RASA3Q14644 834 aa14.77□□□□□ -0.05
CAPNS1-209ENST00000590049 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
CAPNS1-209ENST00000590049 ERO1BQ86YB8 467 aa14.77□□□□□ -0.05
CAPNS1-209ENST00000590049 WDR63Q8IWG1 891 aa14.77□□□□□ -0.05
CAPNS1-209ENST00000590049 VEZTQ9HBM0 779 aa14.77□□□□□ -0.05
CAPNS1-209ENST00000590049 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
CAPNS1-209ENST00000590049 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP14.76□□□□□ -0.054e-7■□□□□ 10.4
CAPNS1-209ENST00000590049 FBXL18Q96ME1 805 aa14.76□□□□□ -0.05
CAPNS1-209ENST00000590049 XIRP2A4UGR9 3374 aa14.76□□□□□ -0.05
CAPNS1-209ENST00000590049 DLG5Q8TDM6 1919 aa14.76□□□□□ -0.05
CAPNS1-209ENST00000590049 MGAMO43451 1857 aa14.76□□□□□ -0.05
CAPNS1-209ENST00000590049 BAHCC1Q9P281 2608 aa14.76□□□□□ -0.05
CAPNS1-209ENST00000590049 HMGCRP04035 888 aa14.75□□□□□ -0.05
CAPNS1-209ENST00000590049 DNAJB2P25686 324 aa14.75□□□□□ -0.05
CAPNS1-209ENST00000590049 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa14.75□□□□□ -0.05
CAPNS1-209ENST00000590049 TRIM35Q9UPQ4 493 aa14.75□□□□□ -0.05
CAPNS1-209ENST00000590049 XDHP47989 1333 aa14.74□□□□□ -0.05
CAPNS1-209ENST00000590049 E9PSI1 815 aa14.74□□□□□ -0.05
CAPNS1-209ENST00000590049 PPIL2Q13356 520 aa14.74□□□□□ -0.05
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