RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587860.1

CTIF-205, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 2

Gene CTIF, Length 2,940 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-205ENST00000587860 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa17.6■□□□□ 0.41
CTIF-205ENST00000587860 GPR108Q9NPR9 543 aa17.6■□□□□ 0.41
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CTIF-205ENST00000587860 CTDSPL2Q05D32 466 aa17.59■□□□□ 0.41
CTIF-205ENST00000587860 MICU3Q86XE3 530 aa17.59■□□□□ 0.41
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CTIF-205ENST00000587860 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP17.52■□□□□ 0.4
CTIF-205ENST00000587860 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP17.52■□□□□ 0.4
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CTIF-205ENST00000587860 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP17.51■□□□□ 0.39
CTIF-205ENST00000587860 NDUFA8P51970 172 aa17.51■□□□□ 0.39
CTIF-205ENST00000587860 STK38Q15208 465 aa17.51■□□□□ 0.39
CTIF-205ENST00000587860 AGXT2Q9BYV1 514 aa17.51■□□□□ 0.39
CTIF-205ENST00000587860 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP17.51■□□□□ 0.39
CTIF-205ENST00000587860 NUP188Q5SRE5 1749 aa17.51■□□□□ 0.39
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