RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000585953.5

RPRD1A-204, Transcript of regulation of nuclear pre-mRNA domain containing 1A, human

TSL 3

Gene RPRD1A, Length 2,357 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPRD1A-204	ENST00000585953	IKBKE	Q14164	716 aa		4.24	□□□□□ -1.73
RPRD1A-204	ENST00000585953	FMR1NB	Q8N0W7	255 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
RPRD1A-204	ENST00000585953	SRA1	Q9HD15	236 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
RPRD1A-204	ENST00000585953	VTI1B	Q9UEU0	232 aa		4.24	□□□□□ -1.73
RPRD1A-204	ENST00000585953	TM4SF5	O14894	197 aa		4.23	□□□□□ -1.73
RPRD1A-204	ENST00000585953	FSCN2	O14926	492 aa		4.23	□□□□□ -1.73
RPRD1A-204	ENST00000585953	CTSH	P09668	335 aa		4.23	□□□□□ -1.73
RPRD1A-204	ENST00000585953	RAC1	P63000	192 aa		4.23	□□□□□ -1.73
RPRD1A-204	ENST00000585953	PIP4K2B	P78356	416 aa		4.23	□□□□□ -1.73
RPRD1A-204	ENST00000585953	RPS26P11	Q5JNZ5	115 aa	Predicted RBP	4.23	□□□□□ -1.73
RPRD1A-204	ENST00000585953	HGSNAT	Q68CP4	663 aa		4.23	□□□□□ -1.73
RPRD1A-204	ENST00000585953	FAM117B	Q6P1L5	589 aa		4.23	□□□□□ -1.73
RPRD1A-204	ENST00000585953	MAP4K3	Q8IVH8	894 aa		4.23	□□□□□ -1.73
RPRD1A-204	ENST00000585953	ZNF428	Q96B54	188 aa		4.23	□□□□□ -1.73
RPRD1A-204	ENST00000585953	CARD10	Q9BWT7	1032 aa		4.23	□□□□□ -1.73
RPRD1A-204	ENST00000585953	KRTAP4-9	Q9BYQ8	210 aa		4.23	□□□□□ -1.73
RPRD1A-204	ENST00000585953	AKAP2	Q9Y2D5	859 aa		4.23	□□□□□ -1.73
RPRD1A-204	ENST00000585953	SOX1	O00570	391 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
RPRD1A-204	ENST00000585953	B3GALT4	O96024	378 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RPRD1A-204	ENST00000585953	ELN	P15502	786 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RPRD1A-204	ENST00000585953	ITGAE	P38570	1179 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RPRD1A-204	ENST00000585953	FAAP100	Q0VG06	881 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RPRD1A-204	ENST00000585953	TRIM28	Q13263	835 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
RPRD1A-204	ENST00000585953	ZNF423	Q2M1K9	1284 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RPRD1A-204	ENST00000585953	FBXO11	Q86XK2	927 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RPRD1A-204	ENST00000585953	GALNT11	Q8NCW6	608 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RPRD1A-204	ENST00000585953	SLC7A3	Q8WY07	619 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RPRD1A-204	ENST00000585953	WNT8B	Q93098	351 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RPRD1A-204	ENST00000585953	CRELD1	Q96HD1	420 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RPRD1A-204	ENST00000585953	BCL11A	Q9H165	835 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RPRD1A-204	ENST00000585953	ZFYVE1	Q9HBF4	777 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RPRD1A-204	ENST00000585953	PPM1H	Q9ULR3	514 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RPRD1A-204	ENST00000585953	SOX17	Q9H6I2	414 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
RPRD1A-204	ENST00000585953	OSGEP	Q9NPF4	335 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RPRD1A-204	ENST00000585953	SEC31B	Q9NQW1	1179 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RPRD1A-204	ENST00000585953	C19orf57	Q0VDD7	668 aa		4.21	□□□□□ -1.73
RPRD1A-204	ENST00000585953	MEI1	Q5TIA1	1274 aa		4.21	□□□□□ -1.73
RPRD1A-204	ENST00000585953	KLHL23	Q8NBE8	558 aa		4.21	□□□□□ -1.73
RPRD1A-204	ENST00000585953	ANKRD24	Q8TF21	1146 aa		4.21	□□□□□ -1.73
RPRD1A-204	ENST00000585953	MRRF	Q96E11	262 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.73
RPRD1A-204	ENST00000585953	KIAA1522	Q9P206	1035 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.73
RPRD1A-204	ENST00000585953	C9orf172	C9J069	976 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RPRD1A-204	ENST00000585953	DLL1	O00548	723 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RPRD1A-204	ENST00000585953	FBXO24	O75426	580 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RPRD1A-204	ENST00000585953	FZD5	Q13467	585 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RPRD1A-204	ENST00000585953	TPTE2	Q6XPS3	522 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RPRD1A-204	ENST00000585953	KLHDC7B	Q96G42	594 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RPRD1A-204	ENST00000585953	GPN3	Q9UHW5	284 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
RPRD1A-204	ENST00000585953	TTF2	Q9UNY4	1162 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
RPRD1A-204	ENST00000585953	ADAM11	O75078	769 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RPRD1A-204	ENST00000585953	VAMP1	P23763	118 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RPRD1A-204	ENST00000585953	ARL4D	P49703	201 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RPRD1A-204	ENST00000585953	RBM25	P49756	843 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
RPRD1A-204	ENST00000585953	ZNF157	P51786	506 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
RPRD1A-204	ENST00000585953	LDLRAD1	Q5T700	205 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RPRD1A-204	ENST00000585953	DCAF11	Q8TEB1	546 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RPRD1A-204	ENST00000585953	KCNK4	Q9NYG8	393 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RPRD1A-204	ENST00000585953	RECK	O95980	971 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RPRD1A-204	ENST00000585953	CD68	P34810	354 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
RPRD1A-204	ENST00000585953	GSTM4	Q03013	218 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RPRD1A-204	ENST00000585953	GRIK4	Q16099	956 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RPRD1A-204	ENST00000585953	NECAB3	Q96P71	396 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
RPRD1A-204	ENST00000585953	TRIM56	Q9BRZ2	755 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
RPRD1A-204	ENST00000585953	CEP44	Q9C0F1	390 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RPRD1A-204	ENST00000585953	NRSN2	Q9GZP1	204 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RPRD1A-204	ENST00000585953	TMEM39A	Q9NV64	488 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RPRD1A-204	ENST00000585953	RNF112	Q9ULX5	631 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RPRD1A-204	ENST00000585953	USP31	Q70CQ4	1352 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RPRD1A-204	ENST00000585953	ENC1	O14682	589 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RPRD1A-204	ENST00000585953	DDX3Y	O15523	660 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
RPRD1A-204	ENST00000585953	ST13	P50502	369 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
RPRD1A-204	ENST00000585953	NLRP12	P59046	1061 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RPRD1A-204	ENST00000585953	TAF1C	Q15572	869 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
RPRD1A-204	ENST00000585953	SHISA2	Q6UWI4	295 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RPRD1A-204	ENST00000585953	CELA3A	P09093	270 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RPRD1A-204	ENST00000585953	SELP	P16109	830 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RPRD1A-204	ENST00000585953	PPP2R3A	Q06190	1150 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RPRD1A-204	ENST00000585953	TSNAXIP1	Q2TAA8	658 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RPRD1A-204	ENST00000585953	IGF2-AS	Q6U949	168 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RPRD1A-204	ENST00000585953	DDX54	Q8TDD1	881 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
RPRD1A-204	ENST00000585953	BACH2	Q9BYV9	841 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RPRD1A-204	ENST00000585953	EIF4EBP3	O60516	100 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
RPRD1A-204	ENST00000585953	PAGE1	O75459	146 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RPRD1A-204	ENST00000585953	WISP1	O95388	367 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RPRD1A-204	ENST00000585953	ADGRE1	Q14246	886 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RPRD1A-204	ENST00000585953	CCDC85B	Q15834	202 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
RPRD1A-204	ENST00000585953	SV2B	Q7L1I2	683 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RPRD1A-204	ENST00000585953	UBASH3B	Q8TF42	649 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RPRD1A-204	ENST00000585953	NRG1	Q02297	640 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
RPRD1A-204	ENST00000585953	AP3B2	Q13367	1082 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RPRD1A-204	ENST00000585953	STK35	Q8TDR2	534 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RPRD1A-204	ENST00000585953	LENG1	Q96BZ8	264 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
RPRD1A-204	ENST00000585953	USP26	Q9BXU7	913 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RPRD1A-204	ENST00000585953	MRPL18	Q9H0U6	180 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
RPRD1A-204	ENST00000585953	LOC100289279	A0A1B0GTE1	492 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RPRD1A-204	ENST00000585953	ECEL1	O95672	775 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RPRD1A-204	ENST00000585953	CYP11A1	P05108	521 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RPRD1A-204	ENST00000585953	DUOXA2	Q1HG44	320 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RPRD1A-204	ENST00000585953	TXNRD3	Q86VQ6	643 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RPRD1A-204	ENST00000585953	SULF2	Q8IWU5	870 aa		4.17	□□□□□ -1.74

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