RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000572043.5

CTDNEP1-207, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CTDNEP1, Length 857 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-207ENST00000572043 TNS4Q8IZW8 715 aa22.04■■□□□ 1.12
CTDNEP1-207ENST00000572043 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
CTDNEP1-207ENST00000572043 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
CTDNEP1-207ENST00000572043 THSD7BQ9C0I4 1608 aa22.04■■□□□ 1.12
CTDNEP1-207ENST00000572043 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
CTDNEP1-207ENST00000572043 SLC10A3P09131 477 aa22.03■■□□□ 1.12
CTDNEP1-207ENST00000572043 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
CTDNEP1-207ENST00000572043 IFFO2Q5TF58 517 aa22.03■■□□□ 1.12
CTDNEP1-207ENST00000572043 RASAL3Q86YV0 1011 aa22.03■■□□□ 1.12
CTDNEP1-207ENST00000572043 A0A1B0GUL7 405 aa22.02■■□□□ 1.12
CTDNEP1-207ENST00000572043 TCP10L2B9ZVM9 353 aa22.02■■□□□ 1.12
CTDNEP1-207ENST00000572043 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
CTDNEP1-207ENST00000572043 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP22.02■■□□□ 1.12
CTDNEP1-207ENST00000572043 RASA3Q14644 834 aa22.02■■□□□ 1.12
CTDNEP1-207ENST00000572043 SPDYE2Q495Y8 402 aa22.02■■□□□ 1.12
CTDNEP1-207ENST00000572043 CCDC102BQ68D86 513 aa22.02■■□□□ 1.12
CTDNEP1-207ENST00000572043 ARMC9Q7Z3E5 817 aa22.02■■□□□ 1.12
CTDNEP1-207ENST00000572043 WDR66Q8TBY9 1149 aa22.02■■□□□ 1.12
CTDNEP1-207ENST00000572043 TEKT1Q969V4 418 aa22.02■■□□□ 1.12
CTDNEP1-207ENST00000572043 NEUROD6Q96NK8 337 aa22.02■■□□□ 1.12
CTDNEP1-207ENST00000572043 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
CTDNEP1-207ENST00000572043 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa22.02■■□□□ 1.11
CTDNEP1-207ENST00000572043 CACNB3P54284 484 aa22.01■■□□□ 1.11
CTDNEP1-207ENST00000572043 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
CTDNEP1-207ENST00000572043 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
CTDNEP1-207ENST00000572043 XAGE2Q96GT9 111 aa22.01■■□□□ 1.11
CTDNEP1-207ENST00000572043 AKAP2Q9Y2D5 859 aa22.01■■□□□ 1.11
CTDNEP1-207ENST00000572043 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa22.01■■□□□ 1.11
CTDNEP1-207ENST00000572043 PRDM10Q9NQV6 1147 aa22■■□□□ 1.11
CTDNEP1-207ENST00000572043 PRDX5P30044 214 aa21.99■■□□□ 1.11
CTDNEP1-207ENST00000572043 ATP8B2P98198 1209 aa21.99■■□□□ 1.11
CTDNEP1-207ENST00000572043 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
CTDNEP1-207ENST00000572043 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
CTDNEP1-207ENST00000572043 POLA2Q14181 598 aa21.99■■□□□ 1.11
CTDNEP1-207ENST00000572043 RCAN3Q9UKA8 241 aa21.99■■□□□ 1.11
CTDNEP1-207ENST00000572043 DENND2AQ9ULE3 1009 aa21.99■■□□□ 1.11
CTDNEP1-207ENST00000572043 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa21.99■■□□□ 1.11
CTDNEP1-207ENST00000572043 MAST3O60307 1309 aa21.99■■□□□ 1.11
CTDNEP1-207ENST00000572043 TNFAIP1Q13829 316 aa21.98■■□□□ 1.11
CTDNEP1-207ENST00000572043 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa21.98■■□□□ 1.11
CTDNEP1-207ENST00000572043 CDAN1Q8IWY9 1227 aa21.98■■□□□ 1.11
CTDNEP1-207ENST00000572043 ZDHHC15Q96MV8 337 aa21.98■■□□□ 1.11
CTDNEP1-207ENST00000572043 SSC5DA1L4H1 1573 aa21.98■■□□□ 1.11
CTDNEP1-207ENST00000572043 SURF6O75683 361 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
CTDNEP1-207ENST00000572043 LDHBP07195 334 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
CTDNEP1-207ENST00000572043 RASGRF1Q13972 1273 aa21.97■■□□□ 1.11
CTDNEP1-207ENST00000572043 MVPQ14764 893 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
CTDNEP1-207ENST00000572043 DIXDC1Q155Q3 683 aa21.97■■□□□ 1.11
CTDNEP1-207ENST00000572043 GORABQ5T7V8 394 aa21.97■■□□□ 1.11
CTDNEP1-207ENST00000572043 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
CTDNEP1-207ENST00000572043 TMEM39BQ9GZU3 492 aa21.97■■□□□ 1.11
CTDNEP1-207ENST00000572043 PCNTO95613 3336 aa21.96■■□□□ 1.11
CTDNEP1-207ENST00000572043 SEMA3EO15041 775 aa21.96■■□□□ 1.11
CTDNEP1-207ENST00000572043 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
CTDNEP1-207ENST00000572043 SSH3Q8TE77 659 aa21.96■■□□□ 1.11
CTDNEP1-207ENST00000572043 CSRNP1Q96S65 589 aa21.96■■□□□ 1.11
CTDNEP1-207ENST00000572043 ARAP2Q8WZ64 1704 aa21.96■■□□□ 1.11
CTDNEP1-207ENST00000572043 CA12O43570 354 aa21.95■■□□□ 1.1
CTDNEP1-207ENST00000572043 CAPN15O75808 1086 aa21.95■■□□□ 1.1
CTDNEP1-207ENST00000572043 TNNI2P48788 182 aa21.95■■□□□ 1.1
CTDNEP1-207ENST00000572043 TMOD2Q9NZR1 351 aa21.95■■□□□ 1.1
CTDNEP1-207ENST00000572043 ABCF2Q9UG63 623 aa21.95■■□□□ 1.1
CTDNEP1-207ENST00000572043 COG6Q9Y2V7 657 aa21.95■■□□□ 1.1
CTDNEP1-207ENST00000572043 LDLRAD1Q5T700 205 aa21.94■■□□□ 1.1
CTDNEP1-207ENST00000572043 CEP85Q6P2H3 762 aa21.94■■□□□ 1.1
CTDNEP1-207ENST00000572043 HHIPL2Q6UWX4 724 aa21.94■■□□□ 1.1
CTDNEP1-207ENST00000572043 CLMNQ96JQ2 1002 aa21.94■■□□□ 1.1
CTDNEP1-207ENST00000572043 MRIQ9BWK5 157 aa21.94■■□□□ 1.1
CTDNEP1-207ENST00000572043 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa21.94■■□□□ 1.1
CTDNEP1-207ENST00000572043 TRPA1O75762 1119 aa21.93■■□□□ 1.1
CTDNEP1-207ENST00000572043 MS4A1P11836 297 aa21.93■■□□□ 1.1
CTDNEP1-207ENST00000572043 TEPSINQ96N21 525 aa21.93■■□□□ 1.1
CTDNEP1-207ENST00000572043 SALL1Q9NSC2 1324 aa21.93■■□□□ 1.1
CTDNEP1-207ENST00000572043 RNF186Q9NXI6 227 aa21.93■■□□□ 1.1
CTDNEP1-207ENST00000572043 USP2O75604 605 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
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CTDNEP1-207ENST00000572043 PI16Q6UXB8 463 aa21.92■■□□□ 1.1
CTDNEP1-207ENST00000572043 SLC10A4Q96EP9 437 aa21.92■■□□□ 1.1
CTDNEP1-207ENST00000572043 MAP3K11Q16584 847 aa21.91■■□□□ 1.1
CTDNEP1-207ENST00000572043 TNNI3KQ59H18 835 aa21.91■■□□□ 1.1
CTDNEP1-207ENST00000572043 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
CTDNEP1-207ENST00000572043 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
CTDNEP1-207ENST00000572043 HMG20BQ9P0W2 317 aa21.91■■□□□ 1.1
CTDNEP1-207ENST00000572043 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa21.91■■□□□ 1.1
CTDNEP1-207ENST00000572043 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa21.9■■□□□ 1.1
CTDNEP1-207ENST00000572043 DBNDD2Q9BQY9 259 aa21.9■■□□□ 1.1
CTDNEP1-207ENST00000572043 TCP10Q12799 353 aa21.89■■□□□ 1.09
CTDNEP1-207ENST00000572043 C20orf194Q5TEA3 1177 aa21.89■■□□□ 1.09
CTDNEP1-207ENST00000572043 SPRYD7Q5W111 196 aa21.89■■□□□ 1.09
CTDNEP1-207ENST00000572043 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa21.89■■□□□ 1.09
CTDNEP1-207ENST00000572043 SPATA5Q8NB90 893 aa21.89■■□□□ 1.09
CTDNEP1-207ENST00000572043 USP40Q9NVE5 1235 aa21.89■■□□□ 1.09
CTDNEP1-207ENST00000572043 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa21.89■■□□□ 1.09
CTDNEP1-207ENST00000572043 ECM29Q5VYK3 1845 aa21.88■■□□□ 1.09
CTDNEP1-207ENST00000572043 TTC39AQ5SRH9 613 aa21.88■■□□□ 1.09
CTDNEP1-207ENST00000572043 SAGE1Q9NXZ1 904 aa21.88■■□□□ 1.09
CTDNEP1-207ENST00000572043 DDX19BQ9UMR2 479 aa21.88■■□□□ 1.09
CTDNEP1-207ENST00000572043 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
CTDNEP1-207ENST00000572043 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
CTDNEP1-207ENST00000572043 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
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