RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567828.1

PPP4C-212, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, humanhuman

TSL 3

Gene PPP4C, Length 742 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4C-212ENST00000567828 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP28.34■■■□□ 2.13
PPP4C-212ENST00000567828 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP28.34■■■□□ 2.13
PPP4C-212ENST00000567828 BCAR3O75815 825 aa28.33■■■□□ 2.13
PPP4C-212ENST00000567828 TNNQ9UQP3 1299 aa28.33■■■□□ 2.13
PPP4C-212ENST00000567828 CIAO1O76071 339 aa28.32■■■□□ 2.12
PPP4C-212ENST00000567828 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP28.32■■■□□ 2.12
PPP4C-212ENST00000567828 MCOLN1Q9GZU1 580 aa28.32■■■□□ 2.12
PPP4C-212ENST00000567828 FBXO3Q9UK99 471 aa28.32■■■□□ 2.12
PPP4C-212ENST00000567828 HDAC5Q9UQL6 1122 aa28.32■■■□□ 2.12
PPP4C-212ENST00000567828 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP28.31■■■□□ 2.12
PPP4C-212ENST00000567828 TRIM27P14373 513 aa28.31■■■□□ 2.12
PPP4C-212ENST00000567828 MAP3K11Q16584 847 aa28.31■■■□□ 2.12
PPP4C-212ENST00000567828 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa28.31■■■□□ 2.12
PPP4C-212ENST00000567828 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP28.31■■■□□ 2.12
PPP4C-212ENST00000567828 DGKZQ13574 1117 aa28.3■■■□□ 2.12
PPP4C-212ENST00000567828 TNFAIP1Q13829 316 aa28.3■■■□□ 2.12
PPP4C-212ENST00000567828 ATP2B3Q16720 1220 aa28.3■■■□□ 2.12
PPP4C-212ENST00000567828 CLMNQ96JQ2 1002 aa28.3■■■□□ 2.12
PPP4C-212ENST00000567828 CEP126Q9P2H0 1117 aa28.3■■■□□ 2.12
PPP4C-212ENST00000567828 TCP10L2B9ZVM9 353 aa28.29■■■□□ 2.12
PPP4C-212ENST00000567828 AK9Q5TCS8 1911 aa28.28■■■□□ 2.12
PPP4C-212ENST00000567828 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP28.28■■■□□ 2.12
PPP4C-212ENST00000567828 GNAI3P08754 354 aa28.28■■■□□ 2.12
PPP4C-212ENST00000567828 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP28.28■■■□□ 2.12
PPP4C-212ENST00000567828 SPRYD7Q5W111 196 aa28.28■■■□□ 2.12
PPP4C-212ENST00000567828 CDAN1Q8IWY9 1227 aa28.28■■■□□ 2.12
PPP4C-212ENST00000567828 TEKT1Q969V4 418 aa28.28■■■□□ 2.12
PPP4C-212ENST00000567828 IL15P40933 162 aaPredicted RBP28.27■■■□□ 2.12
PPP4C-212ENST00000567828 TM4SF4P48230 202 aa28.27■■■□□ 2.12
PPP4C-212ENST00000567828 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa28.27■■■□□ 2.12
PPP4C-212ENST00000567828 CLUAP1Q96AJ1 413 aa28.27■■■□□ 2.12
PPP4C-212ENST00000567828 SLC10A4Q96EP9 437 aa28.27■■■□□ 2.12
PPP4C-212ENST00000567828 COPRSQ9NQ92 184 aa28.27■■■□□ 2.12
PPP4C-212ENST00000567828 MYH2Q9UKX2 1941 aa28.27■■■□□ 2.12
PPP4C-212ENST00000567828 USP2O75604 605 aaPredicted RBP28.26■■■□□ 2.11
PPP4C-212ENST00000567828 SREBF2Q12772 1141 aa28.26■■■□□ 2.11
PPP4C-212ENST00000567828 TMEM39BQ9GZU3 492 aa28.26■■■□□ 2.11
PPP4C-212ENST00000567828 MAST3O60307 1309 aa28.25■■■□□ 2.11
PPP4C-212ENST00000567828 CCDC85CA6NKD9 419 aa28.25■■■□□ 2.11
PPP4C-212ENST00000567828 TBC1D8O95759 1140 aa28.25■■■□□ 2.11
PPP4C-212ENST00000567828 IREB2P48200 963 aaKnown RBP28.25■■■□□ 2.11
PPP4C-212ENST00000567828 CACNB3P54284 484 aa28.25■■■□□ 2.11
PPP4C-212ENST00000567828 TEPSINQ96N21 525 aa28.25■■■□□ 2.11
PPP4C-212ENST00000567828 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa28.25■■■□□ 2.11
PPP4C-212ENST00000567828 SRGAP3O43295 1099 aa28.24■■■□□ 2.11
PPP4C-212ENST00000567828 TNNI2P48788 182 aa28.24■■■□□ 2.11
PPP4C-212ENST00000567828 WDR66Q8TBY9 1149 aa28.24■■■□□ 2.11
PPP4C-212ENST00000567828 WNK4Q96J92 1243 aa28.24■■■□□ 2.11
PPP4C-212ENST00000567828 ZDHHC15Q96MV8 337 aa28.24■■■□□ 2.11
PPP4C-212ENST00000567828 ADORA1P30542 326 aa28.22■■■□□ 2.11
PPP4C-212ENST00000567828 PHKA1P46020 1223 aa28.22■■■□□ 2.11
PPP4C-212ENST00000567828 MTX1Q13505 466 aa28.22■■■□□ 2.11
PPP4C-212ENST00000567828 MRIQ9BWK5 157 aa28.22■■■□□ 2.11
PPP4C-212ENST00000567828 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP28.21■■■□□ 2.11
PPP4C-212ENST00000567828 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa28.21■■■□□ 2.11
PPP4C-212ENST00000567828 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP28.21■■■□□ 2.11
PPP4C-212ENST00000567828 UNCXA6NJT0 531 aa28.2■■■□□ 2.1
PPP4C-212ENST00000567828 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP28.2■■■□□ 2.1
PPP4C-212ENST00000567828 HHIPL2Q6UWX4 724 aa28.2■■■□□ 2.1
PPP4C-212ENST00000567828 TMOD2Q9NZR1 351 aa28.2■■■□□ 2.1
PPP4C-212ENST00000567828 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP28.19■■■□□ 2.1
PPP4C-212ENST00000567828 GNAI2P04899 355 aa28.19■■■□□ 2.1
PPP4C-212ENST00000567828 PRDX5P30044 214 aa28.19■■■□□ 2.1
PPP4C-212ENST00000567828 GJA5P36382 358 aa28.19■■■□□ 2.1
PPP4C-212ENST00000567828 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa28.19■■■□□ 2.1
PPP4C-212ENST00000567828 TMEM57Q8N5G2 664 aa28.19■■■□□ 2.1
PPP4C-212ENST00000567828 TFCP2Q12800 502 aa28.18■■■□□ 2.1
PPP4C-212ENST00000567828 DIXDC1Q155Q3 683 aa28.18■■■□□ 2.1
PPP4C-212ENST00000567828 ELP3Q9H9T3 547 aa28.18■■■□□ 2.1
PPP4C-212ENST00000567828 TIMM10P62072 90 aa28.17■■■□□ 2.1
PPP4C-212ENST00000567828 CCDC102BQ68D86 513 aa28.17■■■□□ 2.1
PPP4C-212ENST00000567828 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP28.17■■■□□ 2.1
PPP4C-212ENST00000567828 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP28.17■■■□□ 2.1
PPP4C-212ENST00000567828 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa28.17■■■□□ 2.1
PPP4C-212ENST00000567828 DENND2AQ9ULE3 1009 aa28.17■■■□□ 2.1
PPP4C-212ENST00000567828 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa28.17■■■□□ 2.1
PPP4C-212ENST00000567828 LDHBP07195 334 aaKnown RBP28.16■■■□□ 2.1
PPP4C-212ENST00000567828 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP28.16■■■□□ 2.1
PPP4C-212ENST00000567828 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa28.15■■■□□ 2.1
PPP4C-212ENST00000567828 A0A1B0GUL7 405 aa28.15■■■□□ 2.1
PPP4C-212ENST00000567828 GPR25O00155 361 aa28.15■■■□□ 2.1
PPP4C-212ENST00000567828 SEMA3EO15041 775 aa28.15■■■□□ 2.1
PPP4C-212ENST00000567828 FKBP1CQ5VVH2 108 aa28.15■■■□□ 2.1
PPP4C-212ENST00000567828 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP28.15■■■□□ 2.1
PPP4C-212ENST00000567828 FAM83AQ86UY5 434 aa28.15■■■□□ 2.1
PPP4C-212ENST00000567828 IFNL1Q8IU54 200 aa28.15■■■□□ 2.1
PPP4C-212ENST00000567828 DOCK2Q92608 1830 aa28.15■■■□□ 2.1
PPP4C-212ENST00000567828 SALL1Q9NSC2 1324 aa28.15■■■□□ 2.1
PPP4C-212ENST00000567828 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP28.14■■■□□ 2.1
PPP4C-212ENST00000567828 INHBEP58166 350 aa28.14■■■□□ 2.1
PPP4C-212ENST00000567828 OPTNQ96CV9 577 aa28.14■■■□□ 2.1
PPP4C-212ENST00000567828 CFHR5Q9BXR6 569 aa28.14■■■□□ 2.1
PPP4C-212ENST00000567828 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP28.13■■■□□ 2.09
PPP4C-212ENST00000567828 ALDH1A1P00352 501 aa28.13■■■□□ 2.09
PPP4C-212ENST00000567828 RASGRF1Q13972 1273 aa28.13■■■□□ 2.09
PPP4C-212ENST00000567828 VGLL4Q14135 290 aa28.13■■■□□ 2.09
PPP4C-212ENST00000567828 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP28.13■■■□□ 2.09
PPP4C-212ENST00000567828 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa28.13■■■□□ 2.09
PPP4C-212ENST00000567828 XAGE2Q96GT9 111 aa28.13■■■□□ 2.09
PPP4C-212ENST00000567828 AKAP2Q9Y2D5 859 aa28.13■■■□□ 2.09
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