RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567147.5

RNPS1-222, Transcript of RNA binding protein with serine rich domain 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene RNPS1, Length 830 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNPS1-222ENST00000567147 VPS37DQ86XT2 251 aa21.85■■□□□ 1.09
RNPS1-222ENST00000567147 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
RNPS1-222ENST00000567147 FAM205AQ6ZU69 1335 aa21.84■■□□□ 1.09
RNPS1-222ENST00000567147 CLRN2A0PK11 232 aa21.84■■□□□ 1.09
RNPS1-222ENST00000567147 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
RNPS1-222ENST00000567147 MEIS3Q99687 375 aa21.84■■□□□ 1.09
RNPS1-222ENST00000567147 ECM29Q5VYK3 1845 aa21.84■■□□□ 1.09
RNPS1-222ENST00000567147 BRCA2P51587 3418 aa21.84■■□□□ 1.09
RNPS1-222ENST00000567147 EN2P19622 333 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
RNPS1-222ENST00000567147 INHBEP58166 350 aa21.83■■□□□ 1.09
RNPS1-222ENST00000567147 CAVIN4Q5BKX8 364 aa21.83■■□□□ 1.09
RNPS1-222ENST00000567147 PTPN22Q9Y2R2 807 aa21.83■■□□□ 1.09
RNPS1-222ENST00000567147 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
RNPS1-222ENST00000567147 AOX1Q06278 1338 aa21.82■■□□□ 1.08
RNPS1-222ENST00000567147 LAMB1P07942 1786 aa21.82■■□□□ 1.08
RNPS1-222ENST00000567147 TRIM27P14373 513 aa21.82■■□□□ 1.08
RNPS1-222ENST00000567147 GJA5P36382 358 aa21.82■■□□□ 1.08
RNPS1-222ENST00000567147 CAP1Q01518 475 aa21.82■■□□□ 1.08
RNPS1-222ENST00000567147 CRHR2Q13324 411 aa21.82■■□□□ 1.08
RNPS1-222ENST00000567147 MFSD14BQ5SR56 506 aa21.82■■□□□ 1.08
RNPS1-222ENST00000567147 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa21.82■■□□□ 1.08
RNPS1-222ENST00000567147 MTMR14Q8NCE2 650 aa21.82■■□□□ 1.08
RNPS1-222ENST00000567147 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
RNPS1-222ENST00000567147 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
RNPS1-222ENST00000567147 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
RNPS1-222ENST00000567147 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
RNPS1-222ENST00000567147 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
RNPS1-222ENST00000567147 BCAMP50895 628 aa21.81■■□□□ 1.08
RNPS1-222ENST00000567147 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
RNPS1-222ENST00000567147 MAP3K11Q16584 847 aa21.81■■□□□ 1.08
RNPS1-222ENST00000567147 CFAP100Q494V2 611 aa21.81■■□□□ 1.08
RNPS1-222ENST00000567147 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
RNPS1-222ENST00000567147 ATG9AQ7Z3C6 839 aa21.81■■□□□ 1.08
RNPS1-222ENST00000567147 ERO1AQ96HE7 468 aa21.81■■□□□ 1.08
RNPS1-222ENST00000567147 SIL1Q9H173 461 aa21.81■■□□□ 1.08
RNPS1-222ENST00000567147 VEZTQ9HBM0 779 aa21.81■■□□□ 1.08
RNPS1-222ENST00000567147 TNNQ9UQP3 1299 aa21.81■■□□□ 1.08
RNPS1-222ENST00000567147 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
RNPS1-222ENST00000567147 GNAI3P08754 354 aa21.8■■□□□ 1.08
RNPS1-222ENST00000567147 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
RNPS1-222ENST00000567147 FGFR2P21802 821 aa21.8■■□□□ 1.08
RNPS1-222ENST00000567147 CLUAP1Q96AJ1 413 aa21.8■■□□□ 1.08
RNPS1-222ENST00000567147 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
RNPS1-222ENST00000567147 SPDYE2BA6NHP3 402 aa21.79■■□□□ 1.08
RNPS1-222ENST00000567147 SPDYE6P0CI01 402 aa21.79■■□□□ 1.08
RNPS1-222ENST00000567147 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP21.79■■□□□ 1.08
RNPS1-222ENST00000567147 PTPN18Q99952 460 aa21.79■■□□□ 1.08
RNPS1-222ENST00000567147 EFCC1Q9HA90 598 aa21.79■■□□□ 1.08
RNPS1-222ENST00000567147 FBXO3Q9UK99 471 aa21.79■■□□□ 1.08
RNPS1-222ENST00000567147 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
RNPS1-222ENST00000567147 A0A1B0GUL6 1792 aa21.79■■□□□ 1.08
RNPS1-222ENST00000567147 OTOFQ9HC10 1997 aa21.78■■□□□ 1.08
RNPS1-222ENST00000567147 CIAO1O76071 339 aa21.78■■□□□ 1.08
RNPS1-222ENST00000567147 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
RNPS1-222ENST00000567147 LPIN2Q92539 896 aa21.78■■□□□ 1.08
RNPS1-222ENST00000567147 MYO1BO43795 1136 aa21.77■■□□□ 1.08
RNPS1-222ENST00000567147 USP2O75604 605 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
RNPS1-222ENST00000567147 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa21.77■■□□□ 1.08
RNPS1-222ENST00000567147 CEP126Q9P2H0 1117 aa21.77■■□□□ 1.08
RNPS1-222ENST00000567147 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
RNPS1-222ENST00000567147 SLC5A1P13866 664 aa21.76■■□□□ 1.07
RNPS1-222ENST00000567147 IREB2P48200 963 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
RNPS1-222ENST00000567147 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP21.76■■□□□ 1.07
RNPS1-222ENST00000567147 SP3Q02447 781 aa21.76■■□□□ 1.07
RNPS1-222ENST00000567147 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa21.76■■□□□ 1.07
RNPS1-222ENST00000567147 ARMC5Q96C12 935 aa21.76■■□□□ 1.07
RNPS1-222ENST00000567147 ELP3Q9H9T3 547 aa21.76■■□□□ 1.07
RNPS1-222ENST00000567147 COPRSQ9NQ92 184 aa21.76■■□□□ 1.07
RNPS1-222ENST00000567147 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa21.76■■□□□ 1.07
RNPS1-222ENST00000567147 MYCP01106 439 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
RNPS1-222ENST00000567147 IL15P40933 162 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
RNPS1-222ENST00000567147 RASA3Q14644 834 aa21.75■■□□□ 1.07
RNPS1-222ENST00000567147 GRIK5Q16478 980 aa21.75■■□□□ 1.07
RNPS1-222ENST00000567147 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa21.75■■□□□ 1.07
RNPS1-222ENST00000567147 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa21.75■■□□□ 1.07
RNPS1-222ENST00000567147 SERPINA10Q9UK55 444 aa21.75■■□□□ 1.07
RNPS1-222ENST00000567147 SRGAP3O43295 1099 aa21.74■■□□□ 1.07
RNPS1-222ENST00000567147 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa21.74■■□□□ 1.07
RNPS1-222ENST00000567147 OPTNQ96CV9 577 aa21.74■■□□□ 1.07
RNPS1-222ENST00000567147 ZBED9Q6R2W3 1325 aa21.74■■□□□ 1.07
RNPS1-222ENST00000567147 GNAI2P04899 355 aa21.73■■□□□ 1.07
RNPS1-222ENST00000567147 CRKP46108 304 aa21.73■■□□□ 1.07
RNPS1-222ENST00000567147 ATP2B3Q16720 1220 aa21.73■■□□□ 1.07
RNPS1-222ENST00000567147 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
RNPS1-222ENST00000567147 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa21.73■■□□□ 1.07
RNPS1-222ENST00000567147 TMEM57Q8N5G2 664 aa21.73■■□□□ 1.07
RNPS1-222ENST00000567147 MTX1Q13505 466 aa21.72■■□□□ 1.07
RNPS1-222ENST00000567147 CDAN1Q8IWY9 1227 aa21.72■■□□□ 1.07
RNPS1-222ENST00000567147 TMEM106CQ9BVX2 250 aa21.72■■□□□ 1.07
RNPS1-222ENST00000567147 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
RNPS1-222ENST00000567147 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
RNPS1-222ENST00000567147 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa21.71■■□□□ 1.07
RNPS1-222ENST00000567147 ZNF333Q96JL9 665 aa21.71■■□□□ 1.07
RNPS1-222ENST00000567147 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
RNPS1-222ENST00000567147 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa21.71■■□□□ 1.07
RNPS1-222ENST00000567147 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
RNPS1-222ENST00000567147 UNCXA6NJT0 531 aa21.7■■□□□ 1.06
RNPS1-222ENST00000567147 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
RNPS1-222ENST00000567147 SPDYE2Q495Y8 402 aa21.7■■□□□ 1.06
RNPS1-222ENST00000567147 MS4A4AQ96JQ5 239 aa21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.4 ms