RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552296.6

PCBP2-222, Transcript of poly(rC) binding protein 2, human

APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC

Gene PCBP2, Length 1,342 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PCBP2-222	ENST00000552296	GRIK5	Q16478	980 aa		11.34	□□□□□ -0.59
PCBP2-222	ENST00000552296	PPP1R3F	Q6ZSY5	799 aa	Predicted RBP	11.34	□□□□□ -0.59
PCBP2-222	ENST00000552296	ANKRD13A	Q8IZ07	590 aa		11.34	□□□□□ -0.59
PCBP2-222	ENST00000552296	CD99L2	Q8TCZ2	262 aa		11.34	□□□□□ -0.59
PCBP2-222	ENST00000552296	FAM84B	Q96KN1	310 aa	Predicted RBP	11.34	□□□□□ -0.59
PCBP2-222	ENST00000552296	ZNF70	Q9UC06	446 aa	Predicted RBP	11.34	□□□□□ -0.59
PCBP2-222	ENST00000552296	SERPINA10	Q9UK55	444 aa		11.34	□□□□□ -0.59
PCBP2-222	ENST00000552296	GRM8	O00222	908 aa		11.33	□□□□□ -0.6
PCBP2-222	ENST00000552296	MYO1B	O43795	1136 aa		11.33	□□□□□ -0.6
PCBP2-222	ENST00000552296	UBE4A	Q14139	1066 aa		11.33	□□□□□ -0.6
PCBP2-222	ENST00000552296	INTS3	Q68E01	1043 aa	Known RBP	11.33	□□□□□ -0.6
PCBP2-222	ENST00000552296	LDHAL6A	Q6ZMR3	332 aa		11.33	□□□□□ -0.6
PCBP2-222	ENST00000552296	PUS3	Q9BZE2	481 aa	Known RBP	11.33	□□□□□ -0.6
PCBP2-222	ENST00000552296	VEZT	Q9HBM0	779 aa		11.33	□□□□□ -0.6
PCBP2-222	ENST00000552296	RIPOR2	Q9Y4F9	1068 aa		11.33	□□□□□ -0.6
PCBP2-222	ENST00000552296	UTY	O14607	1347 aa		11.32	□□□□□ -0.6
PCBP2-222	ENST00000552296	MGAM	O43451	1857 aa		11.32	□□□□□ -0.6
PCBP2-222	ENST00000552296	GYG1	P46976	350 aa		11.32	□□□□□ -0.6
PCBP2-222	ENST00000552296	IREB2	P48200	963 aa	Known RBP	11.32	□□□□□ -0.6
PCBP2-222	ENST00000552296	CCDC57	Q2TAC2	916 aa		11.32	□□□□□ -0.6
PCBP2-222	ENST00000552296	MFSD14B	Q5SR56	506 aa		11.32	□□□□□ -0.6
PCBP2-222	ENST00000552296	DZIP1L	Q8IYY4	767 aa	Known RBP	11.32	□□□□□ -0.6
PCBP2-222	ENST00000552296	VGLL2	Q8N8G2	317 aa		11.32	□□□□□ -0.6
PCBP2-222	ENST00000552296	DDX55	Q8NHQ9	600 aa	Known RBP eCLIP	11.32	□□□□□ -0.6
PCBP2-222	ENST00000552296	BRI3BP	Q8WY22	251 aa		11.32	□□□□□ -0.6
PCBP2-222	ENST00000552296	OPTN	Q96CV9	577 aa		11.32	□□□□□ -0.6
PCBP2-222	ENST00000552296	ERO1A	Q96HE7	468 aa		11.32	□□□□□ -0.6
PCBP2-222	ENST00000552296	TDRD3	Q9H7E2	651 aa	Known RBP	11.32	□□□□□ -0.6
PCBP2-222	ENST00000552296	PTPRF	P10586	1907 aa		11.31	□□□□□ -0.6
PCBP2-222	ENST00000552296	SP3	Q02447	781 aa		11.31	□□□□□ -0.6
PCBP2-222	ENST00000552296	FBXO33	Q7Z6M2	555 aa		11.31	□□□□□ -0.6
PCBP2-222	ENST00000552296	SUCLG2	Q96I99	432 aa		11.31	□□□□□ -0.6
PCBP2-222	ENST00000552296	TMEM39B	Q9GZU3	492 aa		11.31	□□□□□ -0.6
PCBP2-222	ENST00000552296	ELP3	Q9H9T3	547 aa		11.31	□□□□□ -0.6
PCBP2-222	ENST00000552296	TTF2	Q9UNY4	1162 aa	Known RBP	11.31	□□□□□ -0.6
PCBP2-222	ENST00000552296	PLIN1	O60240	522 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PCBP2-222	ENST00000552296	ALDH1L1	O75891	902 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PCBP2-222	ENST00000552296	HIBADH	P31937	336 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
PCBP2-222	ENST00000552296	TNFAIP1	Q13829	316 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PCBP2-222	ENST00000552296	VGLL4	Q14135	290 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PCBP2-222	ENST00000552296	RABL6	Q3YEC7	729 aa	Predicted RBP	11.3	□□□□□ -0.6
PCBP2-222	ENST00000552296	HABP4	Q5JVS0	413 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
PCBP2-222	ENST00000552296	ZNF333	Q96JL9	665 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PCBP2-222	ENST00000552296	EFCC1	Q9HA90	598 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PCBP2-222	ENST00000552296	CNNM1	Q9NRU3	951 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PCBP2-222	ENST00000552296	CHMP3	Q9Y3E7	222 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PCBP2-222	ENST00000552296	AK9	Q5TCS8	1911 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PCBP2-222	ENST00000552296	NBPF7	P0C2Y1	421 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
PCBP2-222	ENST00000552296	EN2	P19622	333 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
PCBP2-222	ENST00000552296	CRK	P46108	304 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PCBP2-222	ENST00000552296	RBM5	P52756	815 aa	Known RBP eCLIP	11.29	□□□□□ -0.6
PCBP2-222	ENST00000552296	HDLBP	Q00341	1268 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
PCBP2-222	ENST00000552296	OTUD7B	Q6GQQ9	843 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PCBP2-222	ENST00000552296	FAM43A	Q8N2R8	423 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PCBP2-222	ENST00000552296	ANKRD44	Q8N8A2	993 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PCBP2-222	ENST00000552296	PHIP	Q8WWQ0	1821 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PCBP2-222	ENST00000552296	GCC1	Q96CN9	775 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PCBP2-222	ENST00000552296	ZBTB4	Q9P1Z0	1013 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
PCBP2-222	ENST00000552296	ZNF521	Q96K83	1311 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PCBP2-222	ENST00000552296	TCP10L2	B9ZVM9	353 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PCBP2-222	ENST00000552296	MAP3K9	P80192	1104 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PCBP2-222	ENST00000552296	LRRC24	Q50LG9	513 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PCBP2-222	ENST00000552296	SNCAIP	Q9Y6H5	919 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PCBP2-222	ENST00000552296	MYH2	Q9UKX2	1941 aa		11.27	□□□□□ -0.6
PCBP2-222	ENST00000552296	DOCK2	Q92608	1830 aa		11.27	□□□□□ -0.6
PCBP2-222	ENST00000552296	RPAP1	Q9BWH6	1393 aa	Predicted RBP	11.27	□□□□□ -0.61
PCBP2-222	ENST00000552296	MROH5	Q6ZUA9	1318 aa		11.27	□□□□□ -0.61
PCBP2-222	ENST00000552296	CCL15-CCL14	A0A0B4J2E2	113 aa		11.27	□□□□□ -0.61
PCBP2-222	ENST00000552296	SPDYE5	A6NIY4	337 aa		11.27	□□□□□ -0.61
PCBP2-222	ENST00000552296	FGFR2	P21802	821 aa		11.27	□□□□□ -0.61
PCBP2-222	ENST00000552296	GTF2A2	P52657	109 aa		11.27	□□□□□ -0.61
PCBP2-222	ENST00000552296	CCL15	Q16663	113 aa		11.27	□□□□□ -0.61
PCBP2-222	ENST00000552296	TAF7L	Q5H9L4	462 aa		11.27	□□□□□ -0.61
PCBP2-222	ENST00000552296	APOBEC3H	Q6NTF7	200 aa	Known RBP	11.27	□□□□□ -0.61
PCBP2-222	ENST00000552296	MRI	Q9BWK5	157 aa		11.27	□□□□□ -0.61
PCBP2-222	ENST00000552296	SRCIN1	Q9C0H9	1055 aa		11.27	□□□□□ -0.61
PCBP2-222	ENST00000552296	BICC1	Q9H694	974 aa	Known RBP	11.27	□□□□□ -0.61
PCBP2-222	ENST00000552296	C9orf78	Q9NZ63	289 aa	Predicted RBP	11.27	□□□□□ -0.61
PCBP2-222	ENST00000552296	PTCH2	Q9Y6C5	1203 aa		11.27	□□□□□ -0.61
PCBP2-222	ENST00000552296	TRIOBP	Q9H2D6	2365 aa		11.27	□□□□□ -0.61
PCBP2-222	ENST00000552296	DOCK3	Q8IZD9	2030 aa		11.26	□□□□□ -0.61
PCBP2-222	ENST00000552296	LAMA3	Q16787	3333 aa		11.26	□□□□□ -0.61
PCBP2-222	ENST00000552296	COL6A3	P12111	3177 aa		11.26	□□□□□ -0.61
PCBP2-222	ENST00000552296	KIF16B	Q96L93	1317 aa		11.26	□□□□□ -0.61
PCBP2-222	ENST00000552296	CACNB3	P54284	484 aa		11.26	□□□□□ -0.61
PCBP2-222	ENST00000552296	TAF1C	Q15572	869 aa	Predicted RBP	11.26	□□□□□ -0.61
PCBP2-222	ENST00000552296	FKBP1C	Q5VVH2	108 aa		11.26	□□□□□ -0.61
PCBP2-222	ENST00000552296	FAM83A	Q86UY5	434 aa		11.26	□□□□□ -0.61
PCBP2-222	ENST00000552296	OTUD5	Q96G74	571 aa		11.26	□□□□□ -0.61
PCBP2-222	ENST00000552296	ZDHHC15	Q96MV8	337 aa		11.26	□□□□□ -0.61
PCBP2-222	ENST00000552296	ARHGAP39	Q9C0H5	1083 aa		11.26	□□□□□ -0.61
PCBP2-222	ENST00000552296	MRS2	Q9HD23	443 aa		11.26	□□□□□ -0.61
PCBP2-222	ENST00000552296	ZCCHC17	Q9NP64	241 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
PCBP2-222	ENST00000552296	IQSEC3	Q9UPP2	1182 aa	Predicted RBP	11.26	□□□□□ -0.61
PCBP2-222	ENST00000552296	SALL2	Q9Y467	1007 aa	Predicted RBP	11.26	□□□□□ -0.61
PCBP2-222	ENST00000552296	ADGRA2	Q96PE1	1338 aa		11.25	□□□□□ -0.61
PCBP2-222	ENST00000552296	BTBD19	C9JJ37	291 aa		11.25	□□□□□ -0.61
PCBP2-222	ENST00000552296	IRF6	O14896	467 aa		11.25	□□□□□ -0.61
PCBP2-222	ENST00000552296	TLR2	O60603	784 aa		11.25	□□□□□ -0.61
PCBP2-222	ENST00000552296	PDE8B	O95263	885 aa		11.25	□□□□□ -0.61

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