RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542337.5

DDB1-220, Transcript of damage specific DNA binding protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene DDB1, Length 558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1-220ENST00000542337 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa25.19■■□□□ 1.62
DDB1-220ENST00000542337 IL15P40933 162 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
DDB1-220ENST00000542337 TNNI2P48788 182 aa25.18■■□□□ 1.62
DDB1-220ENST00000542337 ATG9AQ7Z3C6 839 aa25.18■■□□□ 1.62
DDB1-220ENST00000542337 TEKT1Q969V4 418 aa25.18■■□□□ 1.62
DDB1-220ENST00000542337 MAST3O60307 1309 aa25.17■■□□□ 1.62
DDB1-220ENST00000542337 UNCXA6NJT0 531 aa25.17■■□□□ 1.62
DDB1-220ENST00000542337 IREB2P48200 963 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
DDB1-220ENST00000542337 SREBF2Q12772 1141 aa25.17■■□□□ 1.62
DDB1-220ENST00000542337 ATP2B3Q16720 1220 aa25.17■■□□□ 1.62
DDB1-220ENST00000542337 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa25.17■■□□□ 1.62
DDB1-220ENST00000542337 WDR66Q8TBY9 1149 aa25.17■■□□□ 1.62
DDB1-220ENST00000542337 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
DDB1-220ENST00000542337 MAP3K11Q16584 847 aa25.16■■□□□ 1.62
DDB1-220ENST00000542337 MRIQ9BWK5 157 aa25.16■■□□□ 1.62
DDB1-220ENST00000542337 BCAR3O75815 825 aa25.15■■□□□ 1.62
DDB1-220ENST00000542337 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
DDB1-220ENST00000542337 COPRSQ9NQ92 184 aa25.15■■□□□ 1.62
DDB1-220ENST00000542337 TMOD2Q9NZR1 351 aa25.15■■□□□ 1.62
DDB1-220ENST00000542337 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
DDB1-220ENST00000542337 AOX1Q06278 1338 aa25.14■■□□□ 1.62
DDB1-220ENST00000542337 TRIM27P14373 513 aa25.14■■□□□ 1.62
DDB1-220ENST00000542337 TM4SF4P48230 202 aa25.14■■□□□ 1.62
DDB1-220ENST00000542337 DGKZQ13574 1117 aa25.14■■□□□ 1.62
DDB1-220ENST00000542337 TCP10L2B9ZVM9 353 aa25.13■■□□□ 1.61
DDB1-220ENST00000542337 SRGAP3O43295 1099 aa25.13■■□□□ 1.61
DDB1-220ENST00000542337 GRIK5Q16478 980 aa25.13■■□□□ 1.61
DDB1-220ENST00000542337 SPRYD7Q5W111 196 aa25.13■■□□□ 1.61
DDB1-220ENST00000542337 MCOLN1Q9GZU1 580 aa25.13■■□□□ 1.61
DDB1-220ENST00000542337 FZD1Q9UP38 647 aa25.13■■□□□ 1.61
DDB1-220ENST00000542337 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
DDB1-220ENST00000542337 GNAI2P04899 355 aa25.12■■□□□ 1.61
DDB1-220ENST00000542337 ZDHHC15Q96MV8 337 aa25.12■■□□□ 1.61
DDB1-220ENST00000542337 CCDC85CA6NKD9 419 aa25.11■■□□□ 1.61
DDB1-220ENST00000542337 INHBEP58166 350 aa25.11■■□□□ 1.61
DDB1-220ENST00000542337 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa25.11■■□□□ 1.61
DDB1-220ENST00000542337 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa25.11■■□□□ 1.61
DDB1-220ENST00000542337 CLUAP1Q96AJ1 413 aa25.11■■□□□ 1.61
DDB1-220ENST00000542337 AKAP2Q9Y2D5 859 aa25.11■■□□□ 1.61
DDB1-220ENST00000542337 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
DDB1-220ENST00000542337 SEMA3EO15041 775 aa25.1■■□□□ 1.61
DDB1-220ENST00000542337 USP2O75604 605 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
DDB1-220ENST00000542337 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
DDB1-220ENST00000542337 HHIPL2Q6UWX4 724 aa25.1■■□□□ 1.61
DDB1-220ENST00000542337 DENND2AQ9ULE3 1009 aa25.1■■□□□ 1.61
DDB1-220ENST00000542337 ALDH1A1P00352 501 aa25.09■■□□□ 1.61
DDB1-220ENST00000542337 ECM29Q5VYK3 1845 aa25.08■■□□□ 1.61
DDB1-220ENST00000542337 TBC1D8O95759 1140 aa25.08■■□□□ 1.61
DDB1-220ENST00000542337 MTX1Q13505 466 aa25.08■■□□□ 1.61
DDB1-220ENST00000542337 HOOK2Q96ED9 719 aa25.08■■□□□ 1.61
DDB1-220ENST00000542337 WNK4Q96J92 1243 aa25.08■■□□□ 1.61
DDB1-220ENST00000542337 CLMNQ96JQ2 1002 aa25.08■■□□□ 1.61
DDB1-220ENST00000542337 TMEM39BQ9GZU3 492 aa25.08■■□□□ 1.61
DDB1-220ENST00000542337 AKAP11Q9UKA4 1901 aa25.08■■□□□ 1.6
DDB1-220ENST00000542337 SSC5DA1L4H1 1573 aa25.07■■□□□ 1.6
DDB1-220ENST00000542337 LDHBP07195 334 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
DDB1-220ENST00000542337 FKBP1CQ5VVH2 108 aa25.07■■□□□ 1.6
DDB1-220ENST00000542337 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa25.07■■□□□ 1.6
DDB1-220ENST00000542337 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
DDB1-220ENST00000542337 FAM83AQ86UY5 434 aa25.06■■□□□ 1.6
DDB1-220ENST00000542337 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
DDB1-220ENST00000542337 TEPSINQ96N21 525 aa25.06■■□□□ 1.6
DDB1-220ENST00000542337 PHKA1P46020 1223 aa25.05■■□□□ 1.6
DDB1-220ENST00000542337 CACNB3P54284 484 aa25.05■■□□□ 1.6
DDB1-220ENST00000542337 TIMM10P62072 90 aa25.05■■□□□ 1.6
DDB1-220ENST00000542337 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa25.05■■□□□ 1.6
DDB1-220ENST00000542337 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
DDB1-220ENST00000542337 ARAP2Q8WZ64 1704 aa25.04■■□□□ 1.6
DDB1-220ENST00000542337 MAP3K9P80192 1104 aa25.04■■□□□ 1.6
DDB1-220ENST00000542337 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP25.04■■□□□ 1.65e-9■■■□□ 15
DDB1-220ENST00000542337 CCDC102BQ68D86 513 aa25.04■■□□□ 1.6
DDB1-220ENST00000542337 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
DDB1-220ENST00000542337 TMEM57Q8N5G2 664 aa25.04■■□□□ 1.6
DDB1-220ENST00000542337 TNNQ9UQP3 1299 aa25.04■■□□□ 1.6
DDB1-220ENST00000542337 CSADQ9Y600 493 aa25.04■■□□□ 1.6
DDB1-220ENST00000542337 ADORA1P30542 326 aa25.03■■□□□ 1.6
DDB1-220ENST00000542337 TFCP2Q12800 502 aa25.03■■□□□ 1.6
DDB1-220ENST00000542337 MVPQ14764 893 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
DDB1-220ENST00000542337 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
DDB1-220ENST00000542337 SALL1Q9NSC2 1324 aa25.03■■□□□ 1.6
DDB1-220ENST00000542337 A0A1B0GUL7 405 aa25.02■■□□□ 1.6
DDB1-220ENST00000542337 GPR25O00155 361 aa25.02■■□□□ 1.6
DDB1-220ENST00000542337 ZBTB22O15209 634 aa25.02■■□□□ 1.6
DDB1-220ENST00000542337 GORABQ5T7V8 394 aa25.02■■□□□ 1.6
DDB1-220ENST00000542337 IFNL1Q8IU54 200 aa25.02■■□□□ 1.6
DDB1-220ENST00000542337 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
DDB1-220ENST00000542337 NEUROD6Q96NK8 337 aa25.02■■□□□ 1.6
DDB1-220ENST00000542337 ELP3Q9H9T3 547 aa25.02■■□□□ 1.6
DDB1-220ENST00000542337 PRDX5P30044 214 aa25.01■■□□□ 1.59
DDB1-220ENST00000542337 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP25.01■■□□□ 1.59
DDB1-220ENST00000542337 SLF2Q8IX21 1173 aa25.01■■□□□ 1.59
DDB1-220ENST00000542337 XAGE2Q96GT9 111 aa25.01■■□□□ 1.59
DDB1-220ENST00000542337 CFHR5Q9BXR6 569 aa25.01■■□□□ 1.59
DDB1-220ENST00000542337 ZBED9Q6R2W3 1325 aa25.01■■□□□ 1.59
DDB1-220ENST00000542337 DIXDC1Q155Q3 683 aa25■■□□□ 1.59
DDB1-220ENST00000542337 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
DDB1-220ENST00000542337 DCAF15Q66K64 600 aa25■■□□□ 1.59
DDB1-220ENST00000542337 CDAN1Q8IWY9 1227 aa25■■□□□ 1.59
DDB1-220ENST00000542337 OPTNQ96CV9 577 aa25■■□□□ 1.59
DDB1-220ENST00000542337 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa25■■□□□ 1.59
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