RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520721.1

IGHV3-22-201, Transcript of immunoglobulin heavy variable 3-22 (pseudogene), humanhuman

BASIC

Gene IGHV3-22, Length 359 nt, Biotype IG V pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-22-201ENST00000520721 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
IGHV3-22-201ENST00000520721 FZD1Q9UP38 647 aa21.53■■□□□ 1.04
IGHV3-22-201ENST00000520721 GNAI3P08754 354 aa21.52■■□□□ 1.04
IGHV3-22-201ENST00000520721 SLC5A1P13866 664 aa21.52■■□□□ 1.04
IGHV3-22-201ENST00000520721 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
IGHV3-22-201ENST00000520721 MTX1Q13505 466 aa21.52■■□□□ 1.04
IGHV3-22-201ENST00000520721 PRKG1Q13976 671 aa21.52■■□□□ 1.04
IGHV3-22-201ENST00000520721 MRIQ9BWK5 157 aa21.52■■□□□ 1.04
IGHV3-22-201ENST00000520721 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
IGHV3-22-201ENST00000520721 VEZTQ9HBM0 779 aa21.52■■□□□ 1.04
IGHV3-22-201ENST00000520721 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
IGHV3-22-201ENST00000520721 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
IGHV3-22-201ENST00000520721 TRPA1O75762 1119 aa21.51■■□□□ 1.03
IGHV3-22-201ENST00000520721 IL15P40933 162 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
IGHV3-22-201ENST00000520721 RASA3Q14644 834 aa21.51■■□□□ 1.03
IGHV3-22-201ENST00000520721 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
IGHV3-22-201ENST00000520721 CEP126Q9P2H0 1117 aa21.51■■□□□ 1.03
IGHV3-22-201ENST00000520721 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
IGHV3-22-201ENST00000520721 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa21.51■■□□□ 1.03
IGHV3-22-201ENST00000520721 ZBTB22O15209 634 aa21.5■■□□□ 1.03
IGHV3-22-201ENST00000520721 TM4SF4P48230 202 aa21.5■■□□□ 1.03
IGHV3-22-201ENST00000520721 TEPSINQ96N21 525 aa21.5■■□□□ 1.03
IGHV3-22-201ENST00000520721 ATP2B3Q16720 1220 aa21.49■■□□□ 1.03
IGHV3-22-201ENST00000520721 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa21.49■■□□□ 1.03
IGHV3-22-201ENST00000520721 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
IGHV3-22-201ENST00000520721 UNCXA6NJT0 531 aa21.48■■□□□ 1.03
IGHV3-22-201ENST00000520721 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
IGHV3-22-201ENST00000520721 TNFAIP1Q13829 316 aa21.48■■□□□ 1.03
IGHV3-22-201ENST00000520721 TEKT1Q969V4 418 aa21.48■■□□□ 1.03
IGHV3-22-201ENST00000520721 ZDHHC15Q96MV8 337 aa21.48■■□□□ 1.03
IGHV3-22-201ENST00000520721 MYH2Q9UKX2 1941 aa21.47■■□□□ 1.03
IGHV3-22-201ENST00000520721 USP2O75604 605 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
IGHV3-22-201ENST00000520721 SPRYD7Q5W111 196 aa21.47■■□□□ 1.03
IGHV3-22-201ENST00000520721 WDR66Q8TBY9 1149 aa21.47■■□□□ 1.03
IGHV3-22-201ENST00000520721 CLUAP1Q96AJ1 413 aa21.47■■□□□ 1.03
IGHV3-22-201ENST00000520721 SRGAP3O43295 1099 aa21.46■■□□□ 1.03
IGHV3-22-201ENST00000520721 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
IGHV3-22-201ENST00000520721 HHIPL2Q6UWX4 724 aa21.46■■□□□ 1.03
IGHV3-22-201ENST00000520721 CDAN1Q8IWY9 1227 aa21.46■■□□□ 1.03
IGHV3-22-201ENST00000520721 CLMNQ96JQ2 1002 aa21.46■■□□□ 1.03
IGHV3-22-201ENST00000520721 MAST3O60307 1309 aa21.46■■□□□ 1.03
IGHV3-22-201ENST00000520721 PHKA1P46020 1223 aa21.45■■□□□ 1.02
IGHV3-22-201ENST00000520721 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa21.45■■□□□ 1.02
IGHV3-22-201ENST00000520721 TMEM57Q8N5G2 664 aa21.45■■□□□ 1.02
IGHV3-22-201ENST00000520721 ZBED9Q6R2W3 1325 aa21.45■■□□□ 1.02
IGHV3-22-201ENST00000520721 TCP10L2B9ZVM9 353 aa21.44■■□□□ 1.02
IGHV3-22-201ENST00000520721 GNAI2P04899 355 aa21.44■■□□□ 1.02
IGHV3-22-201ENST00000520721 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
IGHV3-22-201ENST00000520721 SLC10A4Q96EP9 437 aa21.44■■□□□ 1.02
IGHV3-22-201ENST00000520721 MCOLN1Q9GZU1 580 aa21.44■■□□□ 1.02
IGHV3-22-201ENST00000520721 TMEM39BQ9GZU3 492 aa21.44■■□□□ 1.02
IGHV3-22-201ENST00000520721 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
IGHV3-22-201ENST00000520721 SALL1Q9NSC2 1324 aa21.44■■□□□ 1.02
IGHV3-22-201ENST00000520721 SEMA3EO15041 775 aa21.43■■□□□ 1.02
IGHV3-22-201ENST00000520721 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
IGHV3-22-201ENST00000520721 ADORA1P30542 326 aa21.43■■□□□ 1.02
IGHV3-22-201ENST00000520721 RGS19P49795 217 aa21.43■■□□□ 1.02
IGHV3-22-201ENST00000520721 FKBP1CQ5VVH2 108 aa21.43■■□□□ 1.02
IGHV3-22-201ENST00000520721 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa21.42■■□□□ 1.02
IGHV3-22-201ENST00000520721 PRDX5P30044 214 aa21.42■■□□□ 1.02
IGHV3-22-201ENST00000520721 IREB2P48200 963 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
IGHV3-22-201ENST00000520721 TNNI2P48788 182 aa21.42■■□□□ 1.02
IGHV3-22-201ENST00000520721 CACNB3P54284 484 aa21.42■■□□□ 1.02
IGHV3-22-201ENST00000520721 TIMM10P62072 90 aa21.42■■□□□ 1.02
IGHV3-22-201ENST00000520721 SREBF2Q12772 1141 aa21.42■■□□□ 1.02
IGHV3-22-201ENST00000520721 AK9Q5TCS8 1911 aa21.42■■□□□ 1.02
IGHV3-22-201ENST00000520721 CCDC102BQ68D86 513 aa21.42■■□□□ 1.02
IGHV3-22-201ENST00000520721 WNK4Q96J92 1243 aa21.42■■□□□ 1.02
IGHV3-22-201ENST00000520721 CFHR5Q9BXR6 569 aa21.42■■□□□ 1.02
IGHV3-22-201ENST00000520721 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
IGHV3-22-201ENST00000520721 TFCP2Q12800 502 aa21.41■■□□□ 1.02
IGHV3-22-201ENST00000520721 DGKZQ13574 1117 aa21.41■■□□□ 1.02
IGHV3-22-201ENST00000520721 FAM83AQ86UY5 434 aa21.41■■□□□ 1.02
IGHV3-22-201ENST00000520721 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa21.41■■□□□ 1.02
IGHV3-22-201ENST00000520721 DENND2AQ9ULE3 1009 aa21.41■■□□□ 1.02
IGHV3-22-201ENST00000520721 A0A1B0GUL7 405 aa21.4■■□□□ 1.02
IGHV3-22-201ENST00000520721 CCDC85CA6NKD9 419 aa21.4■■□□□ 1.02
IGHV3-22-201ENST00000520721 TBC1D8O95759 1140 aa21.4■■□□□ 1.02
IGHV3-22-201ENST00000520721 GJA5P36382 358 aa21.4■■□□□ 1.02
IGHV3-22-201ENST00000520721 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
IGHV3-22-201ENST00000520721 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
IGHV3-22-201ENST00000520721 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
IGHV3-22-201ENST00000520721 RLBP1P12271 317 aa21.39■■□□□ 1.01
IGHV3-22-201ENST00000520721 INHBEP58166 350 aa21.39■■□□□ 1.01
IGHV3-22-201ENST00000520721 DIXDC1Q155Q3 683 aa21.39■■□□□ 1.01
IGHV3-22-201ENST00000520721 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
IGHV3-22-201ENST00000520721 AKAP2Q9Y2D5 859 aa21.39■■□□□ 1.01
IGHV3-22-201ENST00000520721 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa21.39■■□□□ 1.01
IGHV3-22-201ENST00000520721 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
IGHV3-22-201ENST00000520721 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
IGHV3-22-201ENST00000520721 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
IGHV3-22-201ENST00000520721 LDHBP07195 334 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
IGHV3-22-201ENST00000520721 RASGRF1Q13972 1273 aa21.38■■□□□ 1.01
IGHV3-22-201ENST00000520721 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP21.38■■□□□ 1.01
IGHV3-22-201ENST00000520721 XAGE2Q96GT9 111 aa21.38■■□□□ 1.01
IGHV3-22-201ENST00000520721 HTTP42858 3142 aa21.37■■□□□ 1.01
IGHV3-22-201ENST00000520721 POLA2Q14181 598 aa21.37■■□□□ 1.01
IGHV3-22-201ENST00000520721 IFNL1Q8IU54 200 aa21.37■■□□□ 1.01
IGHV3-22-201ENST00000520721 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa21.37■■□□□ 1.01
IGHV3-22-201ENST00000520721 TMOD2Q9NZR1 351 aa21.37■■□□□ 1.01
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