RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493618.5

ATG4B-223, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, human

TSL 5

Gene ATG4B, Length 899 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATG4B-223	ENST00000493618	TNN	Q9UQP3	1299 aa		18.3	■□□□□ 0.52
ATG4B-223	ENST00000493618	PPP1R12B	O60237	982 aa	Predicted RBP	18.29	■□□□□ 0.52
ATG4B-223	ENST00000493618	SLC5A1	P13866	664 aa		18.29	■□□□□ 0.52
ATG4B-223	ENST00000493618	SUPT20HL1	Q3ZLR7	823 aa		18.29	■□□□□ 0.52
ATG4B-223	ENST00000493618	SPRYD7	Q5W111	196 aa		18.29	■□□□□ 0.52
ATG4B-223	ENST00000493618	SLC10A4	Q96EP9	437 aa		18.29	■□□□□ 0.52
ATG4B-223	ENST00000493618	PA2G4	Q9UQ80	394 aa	Known RBP	18.29	■□□□□ 0.52
ATG4B-223	ENST00000493618	AK9	Q5TCS8	1911 aa		18.28	■□□□□ 0.52
ATG4B-223	ENST00000493618	USP2	O75604	605 aa	Predicted RBP	18.28	■□□□□ 0.52
ATG4B-223	ENST00000493618	TM4SF4	P48230	202 aa		18.28	■□□□□ 0.52
ATG4B-223	ENST00000493618	CACNB3	P54284	484 aa		18.28	■□□□□ 0.52
ATG4B-223	ENST00000493618	MAP3K11	Q16584	847 aa		18.28	■□□□□ 0.52
ATG4B-223	ENST00000493618	TBC1D22A	Q8WUA7	517 aa		18.28	■□□□□ 0.52
ATG4B-223	ENST00000493618	SREBF2	Q12772	1141 aa		18.27	■□□□□ 0.52
ATG4B-223	ENST00000493618	MIER1	Q8N108	512 aa		18.27	■□□□□ 0.52
ATG4B-223	ENST00000493618	LPIN2	Q92539	896 aa		18.27	■□□□□ 0.52
ATG4B-223	ENST00000493618	TEKT1	Q969V4	418 aa		18.27	■□□□□ 0.52
ATG4B-223	ENST00000493618	WNK4	Q96J92	1243 aa		18.27	■□□□□ 0.52
ATG4B-223	ENST00000493618	TMEM39B	Q9GZU3	492 aa		18.27	■□□□□ 0.52
ATG4B-223	ENST00000493618	KIF16B	Q96L93	1317 aa		18.26	■□□□□ 0.51
ATG4B-223	ENST00000493618	BCAR3	O75815	825 aa		18.26	■□□□□ 0.51
ATG4B-223	ENST00000493618	IREB2	P48200	963 aa	Known RBP	18.26	■□□□□ 0.51
ATG4B-223	ENST00000493618	TNFAIP1	Q13829	316 aa		18.26	■□□□□ 0.51
ATG4B-223	ENST00000493618	ATP2B3	Q16720	1220 aa		18.26	■□□□□ 0.51
ATG4B-223	ENST00000493618	FRAT1	Q92837	279 aa	Predicted RBP	18.26	■□□□□ 0.51
ATG4B-223	ENST00000493618	CEP126	Q9P2H0	1117 aa		18.26	■□□□□ 0.51
ATG4B-223	ENST00000493618	MYH2	Q9UKX2	1941 aa		18.25	■□□□□ 0.51
ATG4B-223	ENST00000493618	CIAO1	O76071	339 aa		18.25	■□□□□ 0.51
ATG4B-223	ENST00000493618	INTS3	Q68E01	1043 aa	Known RBP	18.25	■□□□□ 0.51
ATG4B-223	ENST00000493618	ZNF296	Q8WUU4	475 aa	Predicted RBP	18.25	■□□□□ 0.51
ATG4B-223	ENST00000493618	TEPSIN	Q96N21	525 aa		18.25	■□□□□ 0.51
ATG4B-223	ENST00000493618	R3HDML	Q9H3Y0	253 aa		18.25	■□□□□ 0.51
ATG4B-223	ENST00000493618	GJA5	P36382	358 aa		18.24	■□□□□ 0.51
ATG4B-223	ENST00000493618	TNNI2	P48788	182 aa		18.24	■□□□□ 0.51
ATG4B-223	ENST00000493618	HDLBP	Q00341	1268 aa	Known RBP	18.24	■□□□□ 0.51
ATG4B-223	ENST00000493618	ARHGAP45	Q92619	1136 aa		18.24	■□□□□ 0.51
ATG4B-223	ENST00000493618	ELP3	Q9H9T3	547 aa		18.24	■□□□□ 0.51
ATG4B-223	ENST00000493618	TRIM27	P14373	513 aa		18.23	■□□□□ 0.51
ATG4B-223	ENST00000493618	ADORA1	P30542	326 aa		18.23	■□□□□ 0.51
ATG4B-223	ENST00000493618	CTU1	Q7Z7A3	348 aa	Known RBP	18.23	■□□□□ 0.51
ATG4B-223	ENST00000493618	ANKRD13A	Q8IZ07	590 aa		18.23	■□□□□ 0.51
ATG4B-223	ENST00000493618	CLUAP1	Q96AJ1	413 aa		18.23	■□□□□ 0.51
ATG4B-223	ENST00000493618	ZDHHC15	Q96MV8	337 aa		18.23	■□□□□ 0.51
ATG4B-223	ENST00000493618	HDAC5	Q9UQL6	1122 aa		18.23	■□□□□ 0.51
ATG4B-223	ENST00000493618	MAST3	O60307	1309 aa		18.23	■□□□□ 0.51
ATG4B-223	ENST00000493618	MANSC4	A6NHS7	340 aa	Predicted RBP	18.22	■□□□□ 0.51
ATG4B-223	ENST00000493618	GPR25	O00155	361 aa		18.22	■□□□□ 0.51
ATG4B-223	ENST00000493618	ZBTB48	P10074	688 aa	Predicted RBP	18.22	■□□□□ 0.51
ATG4B-223	ENST00000493618	IL15	P40933	162 aa	Predicted RBP	18.22	■□□□□ 0.51
ATG4B-223	ENST00000493618	PHKA1	P46020	1223 aa		18.22	■□□□□ 0.51
ATG4B-223	ENST00000493618	HNRNPU	Q00839	825 aa	Known RBP eCLIP	18.22	■□□□□ 0.51
ATG4B-223	ENST00000493618	DIEXF	Q68CQ4	756 aa	Known RBP	18.22	■□□□□ 0.51
ATG4B-223	ENST00000493618	APOBEC3H	Q6NTF7	200 aa	Known RBP	18.22	■□□□□ 0.51
ATG4B-223	ENST00000493618	IFNL1	Q8IU54	200 aa		18.22	■□□□□ 0.51
ATG4B-223	ENST00000493618	WDR66	Q8TBY9	1149 aa		18.22	■□□□□ 0.51
ATG4B-223	ENST00000493618	COPRS	Q9NQ92	184 aa		18.22	■□□□□ 0.51
ATG4B-223	ENST00000493618	FBXO3	Q9UK99	471 aa		18.22	■□□□□ 0.51
ATG4B-223	ENST00000493618	IGF2BP3	O00425	579 aa	Known RBP eCLIP	18.21	■□□□□ 0.51
ATG4B-223	ENST00000493618	SRGAP3	O43295	1099 aa		18.21	■□□□□ 0.51
ATG4B-223	ENST00000493618	GNAI3	P08754	354 aa		18.21	■□□□□ 0.51
ATG4B-223	ENST00000493618	DIXDC1	Q155Q3	683 aa		18.21	■□□□□ 0.51
ATG4B-223	ENST00000493618	CNKSR2	Q8WXI2	1034 aa		18.21	■□□□□ 0.51
ATG4B-223	ENST00000493618	TMOD2	Q9NZR1	351 aa		18.21	■□□□□ 0.51
ATG4B-223	ENST00000493618	IPO8	O15397	1037 aa	Known RBP	18.2	■□□□□ 0.5
ATG4B-223	ENST00000493618	PRDX5	P30044	214 aa		18.2	■□□□□ 0.5
ATG4B-223	ENST00000493618	HHIPL2	Q6UWX4	724 aa		18.2	■□□□□ 0.5
ATG4B-223	ENST00000493618	ATF7IP	Q6VMQ6	1270 aa		18.2	■□□□□ 0.5
ATG4B-223	ENST00000493618	PPP1R3F	Q6ZSY5	799 aa	Predicted RBP	18.2	■□□□□ 0.5
ATG4B-223	ENST00000493618	OPTN	Q96CV9	577 aa		18.2	■□□□□ 0.5
ATG4B-223	ENST00000493618	GNL3L	Q9NVN8	582 aa	Known RBP	18.2	■□□□□ 0.5
ATG4B-223	ENST00000493618	SUGT1	Q9Y2Z0	365 aa		18.2	■□□□□ 0.5
ATG4B-223	ENST00000493618	DOCK2	Q92608	1830 aa		18.19	■□□□□ 0.5
ATG4B-223	ENST00000493618	UNCX	A6NJT0	531 aa		18.19	■□□□□ 0.5
ATG4B-223	ENST00000493618	TIMM10	P62072	90 aa		18.19	■□□□□ 0.5
ATG4B-223	ENST00000493618	TFCP2	Q12800	502 aa		18.19	■□□□□ 0.5
ATG4B-223	ENST00000493618	MRI	Q9BWK5	157 aa		18.19	■□□□□ 0.5
ATG4B-223	ENST00000493618	DAGLA	Q9Y4D2	1042 aa		18.19	■□□□□ 0.5
ATG4B-223	ENST00000493618	TNFRSF11A	Q9Y6Q6	616 aa	Predicted RBP	18.19	■□□□□ 0.5
ATG4B-223	ENST00000493618	FKTN	O75072	461 aa		18.18	■□□□□ 0.5
ATG4B-223	ENST00000493618	LDHB	P07195	334 aa	Known RBP	18.18	■□□□□ 0.5
ATG4B-223	ENST00000493618	SOX10	P56693	466 aa		18.18	■□□□□ 0.5
ATG4B-223	ENST00000493618	INHBE	P58166	350 aa		18.18	■□□□□ 0.5
ATG4B-223	ENST00000493618	MAP3K9	P80192	1104 aa		18.18	■□□□□ 0.5
ATG4B-223	ENST00000493618	VGLL4	Q14135	290 aa		18.18	■□□□□ 0.5
ATG4B-223	ENST00000493618	CCDC102B	Q68D86	513 aa		18.18	■□□□□ 0.5
ATG4B-223	ENST00000493618	DDX55	Q8NHQ9	600 aa	Known RBP eCLIP	18.18	■□□□□ 0.5
ATG4B-223	ENST00000493618	DENND2A	Q9ULE3	1009 aa		18.18	■□□□□ 0.5
ATG4B-223	ENST00000493618	ALDH1A1	P00352	501 aa		18.17	■□□□□ 0.5
ATG4B-223	ENST00000493618	MLLT1	Q03111	559 aa	Predicted RBP	18.17	■□□□□ 0.5
ATG4B-223	ENST00000493618	CDC42EP5	Q6NZY7	148 aa		18.17	■□□□□ 0.5
ATG4B-223	ENST00000493618	TMEM57	Q8N5G2	664 aa		18.17	■□□□□ 0.5
ATG4B-223	ENST00000493618	PTPN18	Q99952	460 aa		18.17	■□□□□ 0.5
ATG4B-223	ENST00000493618	CFHR5	Q9BXR6	569 aa		18.17	■□□□□ 0.5
ATG4B-223	ENST00000493618	CSAD	Q9Y600	493 aa		18.17	■□□□□ 0.5
ATG4B-223	ENST00000493618		A0A1B0GUL7	405 aa		18.16	■□□□□ 0.5
ATG4B-223	ENST00000493618	GNAI2	P04899	355 aa		18.16	■□□□□ 0.5
ATG4B-223	ENST00000493618	TCP10	Q12799	353 aa		18.16	■□□□□ 0.5
ATG4B-223	ENST00000493618	MIGA2	Q7L4E1	593 aa		18.16	■□□□□ 0.5
ATG4B-223	ENST00000493618	FAM83A	Q86UY5	434 aa		18.16	■□□□□ 0.5
ATG4B-223	ENST00000493618	OTUD5	Q96G74	571 aa		18.16	■□□□□ 0.5

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