RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000434333.1

HLA-B-250, Transcript of major histocompatibility complex, class I, B, humanhuman

Gene HLA-B, Length 863 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-B-250ENST00000434333 LPIN2Q92539 896 aa25.14■■□□□ 1.62
HLA-B-250ENST00000434333 TEPSINQ96N21 525 aa25.14■■□□□ 1.62
HLA-B-250ENST00000434333 MEIS3Q99687 375 aa25.14■■□□□ 1.62
HLA-B-250ENST00000434333 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
HLA-B-250ENST00000434333 OTOFQ9HC10 1997 aa25.14■■□□□ 1.61
HLA-B-250ENST00000434333 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
HLA-B-250ENST00000434333 TBC1D8O95759 1140 aa25.13■■□□□ 1.61
HLA-B-250ENST00000434333 SREBF2Q12772 1141 aa25.13■■□□□ 1.61
HLA-B-250ENST00000434333 TNFAIP1Q13829 316 aa25.13■■□□□ 1.61
HLA-B-250ENST00000434333 FBXO3Q9UK99 471 aa25.13■■□□□ 1.61
HLA-B-250ENST00000434333 MYH13Q9UKX3 1938 aa25.13■■□□□ 1.61
HLA-B-250ENST00000434333 CIAO1O76071 339 aa25.12■■□□□ 1.61
HLA-B-250ENST00000434333 SLC5A1P13866 664 aa25.12■■□□□ 1.61
HLA-B-250ENST00000434333 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
HLA-B-250ENST00000434333 ARHGAP45Q92619 1136 aa25.12■■□□□ 1.61
HLA-B-250ENST00000434333 SIL1Q9H173 461 aa25.12■■□□□ 1.61
HLA-B-250ENST00000434333 UNCXA6NJT0 531 aa25.11■■□□□ 1.61
HLA-B-250ENST00000434333 SLC10A4Q96EP9 437 aa25.11■■□□□ 1.61
HLA-B-250ENST00000434333 WNK4Q96J92 1243 aa25.11■■□□□ 1.61
HLA-B-250ENST00000434333 CFHR5Q9BXR6 569 aa25.11■■□□□ 1.61
HLA-B-250ENST00000434333 TCP10L2B9ZVM9 353 aa25.1■■□□□ 1.61
HLA-B-250ENST00000434333 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
HLA-B-250ENST00000434333 TEKT1Q969V4 418 aa25.1■■□□□ 1.61
HLA-B-250ENST00000434333 MRIQ9BWK5 157 aa25.1■■□□□ 1.61
HLA-B-250ENST00000434333 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
HLA-B-250ENST00000434333 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa25.1■■□□□ 1.61
HLA-B-250ENST00000434333 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
HLA-B-250ENST00000434333 GJA5P36382 358 aa25.09■■□□□ 1.61
HLA-B-250ENST00000434333 IREB2P48200 963 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
HLA-B-250ENST00000434333 RGS19P49795 217 aa25.09■■□□□ 1.61
HLA-B-250ENST00000434333 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
HLA-B-250ENST00000434333 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
HLA-B-250ENST00000434333 ZDHHC15Q96MV8 337 aa25.09■■□□□ 1.61
HLA-B-250ENST00000434333 TMEM39BQ9GZU3 492 aa25.09■■□□□ 1.61
HLA-B-250ENST00000434333 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa25.09■■□□□ 1.61
HLA-B-250ENST00000434333 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
HLA-B-250ENST00000434333 COPRSQ9NQ92 184 aa25.08■■□□□ 1.61
HLA-B-250ENST00000434333 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
HLA-B-250ENST00000434333 TNNQ9UQP3 1299 aa25.08■■□□□ 1.61
HLA-B-250ENST00000434333 GPR25O00155 361 aa25.07■■□□□ 1.6
HLA-B-250ENST00000434333 CACNB3P54284 484 aa25.07■■□□□ 1.6
HLA-B-250ENST00000434333 ATP2B3Q16720 1220 aa25.07■■□□□ 1.6
HLA-B-250ENST00000434333 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
HLA-B-250ENST00000434333 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa25.07■■□□□ 1.6
HLA-B-250ENST00000434333 CEP126Q9P2H0 1117 aa25.07■■□□□ 1.6
HLA-B-250ENST00000434333 HDAC5Q9UQL6 1122 aa25.07■■□□□ 1.6
HLA-B-250ENST00000434333 MAST3O60307 1309 aa25.07■■□□□ 1.6
HLA-B-250ENST00000434333 IL15P40933 162 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
HLA-B-250ENST00000434333 TNNI2P48788 182 aa25.06■■□□□ 1.6
HLA-B-250ENST00000434333 WDR66Q8TBY9 1149 aa25.06■■□□□ 1.6
HLA-B-250ENST00000434333 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP25.05■■□□□ 1.6
HLA-B-250ENST00000434333 BCAR3O75815 825 aa25.05■■□□□ 1.6
HLA-B-250ENST00000434333 TRIM27P14373 513 aa25.05■■□□□ 1.6
HLA-B-250ENST00000434333 INHBEP58166 350 aa25.05■■□□□ 1.6
HLA-B-250ENST00000434333 HHIPL2Q6UWX4 724 aa25.05■■□□□ 1.6
HLA-B-250ENST00000434333 IFNL1Q8IU54 200 aa25.05■■□□□ 1.6
HLA-B-250ENST00000434333 MTX1Q13505 466 aa25.04■■□□□ 1.6
HLA-B-250ENST00000434333 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
HLA-B-250ENST00000434333 ALDH1A1P00352 501 aa25.03■■□□□ 1.6
HLA-B-250ENST00000434333 GNAI3P08754 354 aa25.03■■□□□ 1.6
HLA-B-250ENST00000434333 PHKA1P46020 1223 aa25.03■■□□□ 1.6
HLA-B-250ENST00000434333 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP25.03■■□□□ 1.6
HLA-B-250ENST00000434333 ZBTB22O15209 634 aa25.02■■□□□ 1.6
HLA-B-250ENST00000434333 PRDX5P30044 214 aa25.02■■□□□ 1.6
HLA-B-250ENST00000434333 FKBP1CQ5VVH2 108 aa25.02■■□□□ 1.6
HLA-B-250ENST00000434333 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa25.02■■□□□ 1.6
HLA-B-250ENST00000434333 FAM83AQ86UY5 434 aa25.02■■□□□ 1.6
HLA-B-250ENST00000434333 ELP3Q9H9T3 547 aa25.02■■□□□ 1.6
HLA-B-250ENST00000434333 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP25.01■■□□□ 1.59
HLA-B-250ENST00000434333 ADORA1P30542 326 aa25.01■■□□□ 1.59
HLA-B-250ENST00000434333 MIER1Q8N108 512 aa25.01■■□□□ 1.59
HLA-B-250ENST00000434333 OPTNQ96CV9 577 aa25.01■■□□□ 1.59
HLA-B-250ENST00000434333 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
HLA-B-250ENST00000434333 VGLL4Q14135 290 aa25■■□□□ 1.59
HLA-B-250ENST00000434333 DIXDC1Q155Q3 683 aa25■■□□□ 1.59
HLA-B-250ENST00000434333 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa25■■□□□ 1.59
HLA-B-250ENST00000434333 PTPN18Q99952 460 aa25■■□□□ 1.59
HLA-B-250ENST00000434333 TMOD2Q9NZR1 351 aa25■■□□□ 1.59
HLA-B-250ENST00000434333 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa25■■□□□ 1.59
HLA-B-250ENST00000434333 SALL1Q9NSC2 1324 aa25■■□□□ 1.59
HLA-B-250ENST00000434333 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP25■■□□□ 1.59
HLA-B-250ENST00000434333 SEMA3EO15041 775 aa24.99■■□□□ 1.59
HLA-B-250ENST00000434333 SRGAP3O43295 1099 aa24.99■■□□□ 1.59
HLA-B-250ENST00000434333 FKTNO75072 461 aa24.99■■□□□ 1.59
HLA-B-250ENST00000434333 MAP3K9P80192 1104 aa24.99■■□□□ 1.59
HLA-B-250ENST00000434333 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP24.99■■□□□ 1.59
HLA-B-250ENST00000434333 MS4A4AQ96JQ5 239 aa24.99■■□□□ 1.59
HLA-B-250ENST00000434333 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP24.99■■□□□ 1.59
HLA-B-250ENST00000434333 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP24.99■■□□□ 1.59
HLA-B-250ENST00000434333 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
HLA-B-250ENST00000434333 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
HLA-B-250ENST00000434333 CCDC102BQ68D86 513 aa24.98■■□□□ 1.59
HLA-B-250ENST00000434333 CLUAP1Q96AJ1 413 aa24.98■■□□□ 1.59
HLA-B-250ENST00000434333 DENND2AQ9ULE3 1009 aa24.98■■□□□ 1.59
HLA-B-250ENST00000434333 HPS5Q9UPZ3 1129 aa24.98■■□□□ 1.59
HLA-B-250ENST00000434333 TIMM10P62072 90 aa24.97■■□□□ 1.59
HLA-B-250ENST00000434333 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa24.97■■□□□ 1.59
HLA-B-250ENST00000434333 LDHBP07195 334 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
HLA-B-250ENST00000434333 TFCP2Q12800 502 aa24.96■■□□□ 1.59
HLA-B-250ENST00000434333 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa24.96■■□□□ 1.59
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