RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373162.5

TRAPPC3-202, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRAPPC3, Length 1,056 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-202ENST00000373162 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
TRAPPC3-202ENST00000373162 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
TRAPPC3-202ENST00000373162 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa22.41■■□□□ 1.18
TRAPPC3-202ENST00000373162 VPS37DQ86XT2 251 aa22.41■■□□□ 1.18
TRAPPC3-202ENST00000373162 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
TRAPPC3-202ENST00000373162 CLUAP1Q96AJ1 413 aa22.41■■□□□ 1.18
TRAPPC3-202ENST00000373162 TEPSINQ96N21 525 aa22.41■■□□□ 1.18
TRAPPC3-202ENST00000373162 BEGAINQ9BUH8 593 aa22.41■■□□□ 1.18
TRAPPC3-202ENST00000373162 CEP126Q9P2H0 1117 aa22.41■■□□□ 1.18
TRAPPC3-202ENST00000373162 NF2P35240 595 aa22.4■■□□□ 1.18
TRAPPC3-202ENST00000373162 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
TRAPPC3-202ENST00000373162 FZD1Q9UP38 647 aa22.4■■□□□ 1.18
TRAPPC3-202ENST00000373162 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa22.39■■□□□ 1.17
TRAPPC3-202ENST00000373162 SRGAP3O43295 1099 aa22.39■■□□□ 1.17
TRAPPC3-202ENST00000373162 MYO1BO43795 1136 aa22.39■■□□□ 1.17
TRAPPC3-202ENST00000373162 RLBP1P12271 317 aa22.39■■□□□ 1.17
TRAPPC3-202ENST00000373162 RASA3Q14644 834 aa22.39■■□□□ 1.17
TRAPPC3-202ENST00000373162 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa22.39■■□□□ 1.17
TRAPPC3-202ENST00000373162 SALL1Q9NSC2 1324 aa22.38■■□□□ 1.17
TRAPPC3-202ENST00000373162 PHKA1P46020 1223 aa22.38■■□□□ 1.17
TRAPPC3-202ENST00000373162 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
TRAPPC3-202ENST00000373162 CDAN1Q8IWY9 1227 aa22.38■■□□□ 1.17
TRAPPC3-202ENST00000373162 ZDHHC15Q96MV8 337 aa22.38■■□□□ 1.17
TRAPPC3-202ENST00000373162 RNF186Q9NXI6 227 aa22.38■■□□□ 1.17
TRAPPC3-202ENST00000373162 GNAI2P04899 355 aa22.37■■□□□ 1.17
TRAPPC3-202ENST00000373162 ADORA1P30542 326 aa22.37■■□□□ 1.17
TRAPPC3-202ENST00000373162 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
TRAPPC3-202ENST00000373162 ARMC9Q7Z3E5 817 aa22.37■■□□□ 1.17
TRAPPC3-202ENST00000373162 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
TRAPPC3-202ENST00000373162 VEZTQ9HBM0 779 aa22.37■■□□□ 1.17
TRAPPC3-202ENST00000373162 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP22.36■■□□□ 1.17
TRAPPC3-202ENST00000373162 POLA2Q14181 598 aa22.36■■□□□ 1.17
TRAPPC3-202ENST00000373162 HHIPL2Q6UWX4 724 aa22.36■■□□□ 1.17
TRAPPC3-202ENST00000373162 WDR66Q8TBY9 1149 aa22.36■■□□□ 1.17
TRAPPC3-202ENST00000373162 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
TRAPPC3-202ENST00000373162 MAST3O60307 1309 aa22.35■■□□□ 1.17
TRAPPC3-202ENST00000373162 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
TRAPPC3-202ENST00000373162 UNCXA6NJT0 531 aa22.35■■□□□ 1.17
TRAPPC3-202ENST00000373162 SEMA3EO15041 775 aa22.35■■□□□ 1.17
TRAPPC3-202ENST00000373162 USP2O75604 605 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
TRAPPC3-202ENST00000373162 TM4SF4P48230 202 aa22.35■■□□□ 1.17
TRAPPC3-202ENST00000373162 TNFAIP1Q13829 316 aa22.35■■□□□ 1.17
TRAPPC3-202ENST00000373162 TEKT1Q969V4 418 aa22.35■■□□□ 1.17
TRAPPC3-202ENST00000373162 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
TRAPPC3-202ENST00000373162 PRDX5P30044 214 aa22.34■■□□□ 1.17
TRAPPC3-202ENST00000373162 TFCP2Q12800 502 aa22.34■■□□□ 1.17
TRAPPC3-202ENST00000373162 PRKG1Q13976 671 aa22.34■■□□□ 1.17
TRAPPC3-202ENST00000373162 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
TRAPPC3-202ENST00000373162 SPRYD7Q5W111 196 aa22.34■■□□□ 1.17
TRAPPC3-202ENST00000373162 CCDC102BQ68D86 513 aa22.34■■□□□ 1.17
TRAPPC3-202ENST00000373162 CLMNQ96JQ2 1002 aa22.34■■□□□ 1.17
TRAPPC3-202ENST00000373162 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
TRAPPC3-202ENST00000373162 A0A1B0GUL7 405 aa22.33■■□□□ 1.17
TRAPPC3-202ENST00000373162 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
TRAPPC3-202ENST00000373162 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa22.33■■□□□ 1.17
TRAPPC3-202ENST00000373162 FKBP1CQ5VVH2 108 aa22.33■■□□□ 1.17
TRAPPC3-202ENST00000373162 SSH3Q8TE77 659 aa22.33■■□□□ 1.17
TRAPPC3-202ENST00000373162 ABHD8Q96I13 439 aa22.33■■□□□ 1.17
TRAPPC3-202ENST00000373162 TIMM10P62072 90 aa22.32■■□□□ 1.16
TRAPPC3-202ENST00000373162 RASGRF1Q13972 1273 aa22.32■■□□□ 1.16
TRAPPC3-202ENST00000373162 TMEM39BQ9GZU3 492 aa22.32■■□□□ 1.16
TRAPPC3-202ENST00000373162 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa22.32■■□□□ 1.16
TRAPPC3-202ENST00000373162 RFX7Q2KHR2 1363 aa22.31■■□□□ 1.16
TRAPPC3-202ENST00000373162 TCP10L2B9ZVM9 353 aa22.31■■□□□ 1.16
TRAPPC3-202ENST00000373162 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
TRAPPC3-202ENST00000373162 TRPA1O75762 1119 aa22.31■■□□□ 1.16
TRAPPC3-202ENST00000373162 FAM83AQ86UY5 434 aa22.31■■□□□ 1.16
TRAPPC3-202ENST00000373162 CFHR5Q9BXR6 569 aa22.31■■□□□ 1.16
TRAPPC3-202ENST00000373162 DENND2AQ9ULE3 1009 aa22.31■■□□□ 1.16
TRAPPC3-202ENST00000373162 GJA5P36382 358 aa22.3■■□□□ 1.16
TRAPPC3-202ENST00000373162 CACNB3P54284 484 aa22.3■■□□□ 1.16
TRAPPC3-202ENST00000373162 XAGE2Q96GT9 111 aa22.3■■□□□ 1.16
TRAPPC3-202ENST00000373162 WNK4Q96J92 1243 aa22.3■■□□□ 1.16
TRAPPC3-202ENST00000373162 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
TRAPPC3-202ENST00000373162 ATP8B2P98198 1209 aa22.29■■□□□ 1.16
TRAPPC3-202ENST00000373162 DIXDC1Q155Q3 683 aa22.29■■□□□ 1.16
TRAPPC3-202ENST00000373162 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
TRAPPC3-202ENST00000373162 AKAP2Q9Y2D5 859 aa22.29■■□□□ 1.16
TRAPPC3-202ENST00000373162 MYH2Q9UKX2 1941 aa22.29■■□□□ 1.16
TRAPPC3-202ENST00000373162 GAKO14976 1311 aa22.29■■□□□ 1.16
TRAPPC3-202ENST00000373162 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
TRAPPC3-202ENST00000373162 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
TRAPPC3-202ENST00000373162 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP22.28■■□□□ 1.16
TRAPPC3-202ENST00000373162 IREB2P48200 963 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
TRAPPC3-202ENST00000373162 TNNI2P48788 182 aa22.27■■□□□ 1.16
TRAPPC3-202ENST00000373162 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa22.27■■□□□ 1.16
TRAPPC3-202ENST00000373162 ZNF384Q8TF68 577 aa22.27■■□□□ 1.16
TRAPPC3-202ENST00000373162 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
TRAPPC3-202ENST00000373162 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
TRAPPC3-202ENST00000373162 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
TRAPPC3-202ENST00000373162 MVPQ14764 893 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
TRAPPC3-202ENST00000373162 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa22.26■■□□□ 1.15
TRAPPC3-202ENST00000373162 C1orf115Q9H7X2 142 aa22.26■■□□□ 1.15
TRAPPC3-202ENST00000373162 GPR108Q9NPR9 543 aa22.26■■□□□ 1.15
TRAPPC3-202ENST00000373162 LDHBP07195 334 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
TRAPPC3-202ENST00000373162 SREBF2Q12772 1141 aa22.25■■□□□ 1.15
TRAPPC3-202ENST00000373162 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
TRAPPC3-202ENST00000373162 SLC10A4Q96EP9 437 aa22.25■■□□□ 1.15
TRAPPC3-202ENST00000373162 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
TRAPPC3-202ENST00000373162 MCOLN1Q9GZU1 580 aa22.25■■□□□ 1.15
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