RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372616.1

CTPS1-201, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CTPS1, Length 2,037 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-201ENST00000372616 KDM3BQ7LBC6 1761 aa8.48□□□□□ -1.05
CTPS1-201ENST00000372616 PHKG2P15735 406 aa8.47□□□□□ -1.05
CTPS1-201ENST00000372616 PDCP20941 246 aa8.47□□□□□ -1.05
CTPS1-201ENST00000372616 CHMLP26374 656 aa8.47□□□□□ -1.05
CTPS1-201ENST00000372616 HSPA4P34932 840 aa8.47□□□□□ -1.05
CTPS1-201ENST00000372616 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
CTPS1-201ENST00000372616 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
CTPS1-201ENST00000372616 TSPYL1Q9H0U9 437 aa8.47□□□□□ -1.05
CTPS1-201ENST00000372616 PRDM10Q9NQV6 1147 aa8.47□□□□□ -1.05
CTPS1-201ENST00000372616 IGSF5Q9NSI5 407 aa8.47□□□□□ -1.05
CTPS1-201ENST00000372616 SMC3Q9UQE7 1217 aa8.47□□□□□ -1.05
CTPS1-201ENST00000372616 PXDNLA1KZ92 1463 aa8.47□□□□□ -1.05
CTPS1-201ENST00000372616 WNK3Q9BYP7 1800 aa8.47□□□□□ -1.05
CTPS1-201ENST00000372616 SALL3Q9BXA9 1300 aa8.47□□□□□ -1.05
CTPS1-201ENST00000372616 SLIT2O94813 1529 aa8.47□□□□□ -1.05
CTPS1-201ENST00000372616 RAB11FIP3O75154 756 aa8.47□□□□□ -1.05
CTPS1-201ENST00000372616 ADAMTS2O95450 1211 aa8.47□□□□□ -1.05
CTPS1-201ENST00000372616 F13A1P00488 732 aa8.47□□□□□ -1.05
CTPS1-201ENST00000372616 ABL1P00519 1130 aa8.47□□□□□ -1.05
CTPS1-201ENST00000372616 TUBB4AP04350 444 aa8.47□□□□□ -1.05
CTPS1-201ENST00000372616 Q3C1V9 767 aa8.47□□□□□ -1.05
CTPS1-201ENST00000372616 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
CTPS1-201ENST00000372616 SCUBE3Q8IX30 993 aa8.47□□□□□ -1.05
CTPS1-201ENST00000372616 FUCA2Q9BTY2 467 aa8.47□□□□□ -1.05
CTPS1-201ENST00000372616 KIAA1024Q9UPX6 916 aa8.47□□□□□ -1.05
CTPS1-201ENST00000372616 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.05
CTPS1-201ENST00000372616 HOXB7P09629 217 aa8.46□□□□□ -1.05
CTPS1-201ENST00000372616 BRICD5Q6PL45 260 aa8.46□□□□□ -1.05
CTPS1-201ENST00000372616 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa8.46□□□□□ -1.05
CTPS1-201ENST00000372616 PHTF2Q8N3S3 785 aa8.46□□□□□ -1.05
CTPS1-201ENST00000372616 CCDC112Q8NEF3 446 aa8.46□□□□□ -1.05
CTPS1-201ENST00000372616 RUFY2Q8WXA3 655 aa8.46□□□□□ -1.05
CTPS1-201ENST00000372616 RAD50Q92878 1312 aa8.46□□□□□ -1.06
CTPS1-201ENST00000372616 MRC1P22897 1456 aa8.46□□□□□ -1.06
CTPS1-201ENST00000372616 ANKRD33BA6NCL7 494 aa8.46□□□□□ -1.06
CTPS1-201ENST00000372616 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
CTPS1-201ENST00000372616 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
CTPS1-201ENST00000372616 MAP3K11Q16584 847 aa8.46□□□□□ -1.06
CTPS1-201ENST00000372616 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
CTPS1-201ENST00000372616 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
CTPS1-201ENST00000372616 SCUBE2Q9NQ36 999 aa8.46□□□□□ -1.06
CTPS1-201ENST00000372616 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
CTPS1-201ENST00000372616 DISP2A7MBM2 1401 aa8.45□□□□□ -1.06
CTPS1-201ENST00000372616 BTBD11A6QL63 1104 aa8.45□□□□□ -1.06
CTPS1-201ENST00000372616 CDC25BP30305 580 aa8.45□□□□□ -1.06
CTPS1-201ENST00000372616 KRT85P78386 507 aa8.45□□□□□ -1.06
CTPS1-201ENST00000372616 FGD1P98174 961 aa8.45□□□□□ -1.06
CTPS1-201ENST00000372616 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa8.45□□□□□ -1.06
CTPS1-201ENST00000372616 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
CTPS1-201ENST00000372616 MEIS3Q99687 375 aa8.45□□□□□ -1.06
CTPS1-201ENST00000372616 STK31Q9BXU1 1019 aa8.45□□□□□ -1.06
CTPS1-201ENST00000372616 TM6SF1Q9BZW5 370 aa8.45□□□□□ -1.06
CTPS1-201ENST00000372616 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
CTPS1-201ENST00000372616 LGR6Q9HBX8 967 aa8.45□□□□□ -1.06
CTPS1-201ENST00000372616 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
CTPS1-201ENST00000372616 TCHHQ07283 1943 aa8.45□□□□□ -1.06
CTPS1-201ENST00000372616 ERVV-2B6SEH9 535 aa8.44□□□□□ -1.06
CTPS1-201ENST00000372616 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa8.44□□□□□ -1.06
CTPS1-201ENST00000372616 CYP27B1O15528 508 aa8.44□□□□□ -1.06
CTPS1-201ENST00000372616 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
CTPS1-201ENST00000372616 ATP2B3Q16720 1220 aa8.44□□□□□ -1.06
CTPS1-201ENST00000372616 CNTROBQ8N137 903 aa8.44□□□□□ -1.06
CTPS1-201ENST00000372616 KRT222Q8N1A0 295 aa8.44□□□□□ -1.06
CTPS1-201ENST00000372616 SLC52A2Q9HAB3 445 aa8.44□□□□□ -1.06
CTPS1-201ENST00000372616 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa8.44□□□□□ -1.06
CTPS1-201ENST00000372616 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
CTPS1-201ENST00000372616 SHANK3Q9BYB0 1731 aa8.44□□□□□ -1.06
CTPS1-201ENST00000372616 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa8.44□□□□□ -1.06
CTPS1-201ENST00000372616 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
CTPS1-201ENST00000372616 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
CTPS1-201ENST00000372616 SYT1P21579 422 aa8.44□□□□□ -1.06
CTPS1-201ENST00000372616 SLC20A2Q08357 652 aa8.44□□□□□ -1.06
CTPS1-201ENST00000372616 VPS53Q5VIR6 699 aa8.44□□□□□ -1.06
CTPS1-201ENST00000372616 CCDC30Q5VVM6 783 aa8.44□□□□□ -1.06
CTPS1-201ENST00000372616 UNC5CLQ8IV45 518 aa8.44□□□□□ -1.06
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
CTPS1-201ENST00000372616 RILPL2Q969X0 211 aa8.44□□□□□ -1.06
CTPS1-201ENST00000372616 NGLY1Q96IV0 654 aa8.44□□□□□ -1.06
CTPS1-201ENST00000372616 NUP62CLQ9H1M0 184 aa8.44□□□□□ -1.06
CTPS1-201ENST00000372616 CTNNA3Q9UI47 895 aa8.44□□□□□ -1.06
CTPS1-201ENST00000372616 CNPY2Q9Y2B0 182 aa8.44□□□□□ -1.06
CTPS1-201ENST00000372616 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa8.43□□□□□ -1.06
CTPS1-201ENST00000372616 EXOC5O00471 708 aa8.43□□□□□ -1.06
CTPS1-201ENST00000372616 ATP8B2P98198 1209 aa8.43□□□□□ -1.06
CTPS1-201ENST00000372616 MTMR3Q13615 1198 aa8.43□□□□□ -1.06
CTPS1-201ENST00000372616 ANKRD1Q15327 319 aa8.43□□□□□ -1.06
CTPS1-201ENST00000372616 CAPN12Q6ZSI9 719 aa8.43□□□□□ -1.06
CTPS1-201ENST00000372616 DRC7Q8IY82 874 aa8.43□□□□□ -1.06
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
CTPS1-201ENST00000372616 LRP6O75581 1613 aa8.43□□□□□ -1.06
CTPS1-201ENST00000372616 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa8.43□□□□□ -1.06
CTPS1-201ENST00000372616 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa8.43□□□□□ -1.06
CTPS1-201ENST00000372616 NRDCO43847 1150 aa8.42□□□□□ -1.06
CTPS1-201ENST00000372616 TNNT1P13805 278 aa8.42□□□□□ -1.06
CTPS1-201ENST00000372616 CABP4P57796 275 aa8.42□□□□□ -1.06
CTPS1-201ENST00000372616 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
CTPS1-201ENST00000372616 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
CTPS1-201ENST00000372616 ADAM32Q8TC27 787 aa8.42□□□□□ -1.06
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