RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246139.9

CITED1-201, Transcript of Cbp/p300 interacting transactivator with Glu/Asp rich carboxy-terminal domain 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CITED1, Length 1,231 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1-201ENST00000246139 GNAI2P04899 355 aa26.01■■□□□ 1.75
CITED1-201ENST00000246139 IL15P40933 162 aaPredicted RBP26.01■■□□□ 1.75
CITED1-201ENST00000246139 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
CITED1-201ENST00000246139 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa26■■□□□ 1.75
CITED1-201ENST00000246139 MTX1Q13505 466 aa25.99■■□□□ 1.75
CITED1-201ENST00000246139 ARMC9Q7Z3E5 817 aa25.99■■□□□ 1.75
CITED1-201ENST00000246139 SERPINA10Q9UK55 444 aa25.99■■□□□ 1.75
CITED1-201ENST00000246139 ATP2B3Q16720 1220 aa25.98■■□□□ 1.75
CITED1-201ENST00000246139 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
CITED1-201ENST00000246139 AOX1Q06278 1338 aa25.96■■□□□ 1.75
CITED1-201ENST00000246139 CRKP46108 304 aa25.96■■□□□ 1.75
CITED1-201ENST00000246139 GRIK5Q16478 980 aa25.96■■□□□ 1.75
CITED1-201ENST00000246139 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
CITED1-201ENST00000246139 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa25.96■■□□□ 1.75
CITED1-201ENST00000246139 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa25.95■■□□□ 1.74
CITED1-201ENST00000246139 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.74
CITED1-201ENST00000246139 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.74
CITED1-201ENST00000246139 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa25.95■■□□□ 1.74
CITED1-201ENST00000246139 RLBP1P12271 317 aa25.94■■□□□ 1.74
CITED1-201ENST00000246139 RASA3Q14644 834 aa25.94■■□□□ 1.74
CITED1-201ENST00000246139 ITPRIPQ8IWB1 547 aa25.94■■□□□ 1.74
CITED1-201ENST00000246139 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
CITED1-201ENST00000246139 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
CITED1-201ENST00000246139 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
CITED1-201ENST00000246139 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
CITED1-201ENST00000246139 FZD1Q9UP38 647 aa25.93■■□□□ 1.74
CITED1-201ENST00000246139 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
CITED1-201ENST00000246139 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa25.92■■□□□ 1.74
CITED1-201ENST00000246139 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
CITED1-201ENST00000246139 TNFAIP1Q13829 316 aa25.92■■□□□ 1.74
CITED1-201ENST00000246139 SPDYE2Q495Y8 402 aa25.92■■□□□ 1.74
CITED1-201ENST00000246139 TEKT1Q969V4 418 aa25.92■■□□□ 1.74
CITED1-201ENST00000246139 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
CITED1-201ENST00000246139 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
CITED1-201ENST00000246139 WDR66Q8TBY9 1149 aa25.91■■□□□ 1.74
CITED1-201ENST00000246139 TCP10L2B9ZVM9 353 aa25.9■■□□□ 1.74
CITED1-201ENST00000246139 TBC1D8O95759 1140 aa25.9■■□□□ 1.74
CITED1-201ENST00000246139 SOX10P56693 466 aa25.9■■□□□ 1.74
CITED1-201ENST00000246139 TFCP2Q12800 502 aa25.9■■□□□ 1.74
CITED1-201ENST00000246139 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa25.9■■□□□ 1.74
CITED1-201ENST00000246139 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP25.89■■□□□ 1.74
CITED1-201ENST00000246139 TIMM10P62072 90 aa25.89■■□□□ 1.74
CITED1-201ENST00000246139 LDLRAD1Q5T700 205 aa25.89■■□□□ 1.74
CITED1-201ENST00000246139 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP25.89■■□□□ 1.74
CITED1-201ENST00000246139 SLC10A4Q96EP9 437 aa25.89■■□□□ 1.74
CITED1-201ENST00000246139 AKAP2Q9Y2D5 859 aa25.89■■□□□ 1.74
CITED1-201ENST00000246139 MAST3O60307 1309 aa25.88■■□□□ 1.73
CITED1-201ENST00000246139 ADORA1P30542 326 aa25.88■■□□□ 1.73
CITED1-201ENST00000246139 TNNI2P48788 182 aa25.88■■□□□ 1.73
CITED1-201ENST00000246139 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP25.88■■□□□ 1.73
CITED1-201ENST00000246139 PANK1Q8TE04 598 aa25.88■■□□□ 1.73
CITED1-201ENST00000246139 C1orf115Q9H7X2 142 aa25.88■■□□□ 1.73
CITED1-201ENST00000246139 ARAP2Q8WZ64 1704 aa25.88■■□□□ 1.73
CITED1-201ENST00000246139 PHKA1P46020 1223 aa25.87■■□□□ 1.73
CITED1-201ENST00000246139 TM4SF4P48230 202 aa25.87■■□□□ 1.73
CITED1-201ENST00000246139 ATP8B2P98198 1209 aa25.87■■□□□ 1.73
CITED1-201ENST00000246139 MRIQ9BWK5 157 aa25.87■■□□□ 1.73
CITED1-201ENST00000246139 A0A1B0GUL7 405 aa25.86■■□□□ 1.73
CITED1-201ENST00000246139 SLC34A2O95436 690 aa25.86■■□□□ 1.73
CITED1-201ENST00000246139 MS4A1P11836 297 aa25.86■■□□□ 1.73
CITED1-201ENST00000246139 IREB2P48200 963 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
CITED1-201ENST00000246139 POLA2Q14181 598 aa25.86■■□□□ 1.73
CITED1-201ENST00000246139 CCDC102BQ68D86 513 aa25.86■■□□□ 1.73
CITED1-201ENST00000246139 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP25.86■■□□□ 1.73
CITED1-201ENST00000246139 ZDHHC15Q96MV8 337 aa25.86■■□□□ 1.73
CITED1-201ENST00000246139 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa25.86■■□□□ 1.73
CITED1-201ENST00000246139 TMOD2Q9NZR1 351 aa25.86■■□□□ 1.73
CITED1-201ENST00000246139 SEMA3EO15041 775 aa25.85■■□□□ 1.73
CITED1-201ENST00000246139 CACNB3P54284 484 aa25.85■■□□□ 1.73
CITED1-201ENST00000246139 MAP3K11Q16584 847 aa25.85■■□□□ 1.73
CITED1-201ENST00000246139 TMEM39BQ9GZU3 492 aa25.85■■□□□ 1.73
CITED1-201ENST00000246139 DENND2AQ9ULE3 1009 aa25.85■■□□□ 1.73
CITED1-201ENST00000246139 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP25.85■■□□□ 1.73
CITED1-201ENST00000246139 SSH3Q8TE77 659 aa25.84■■□□□ 1.73
CITED1-201ENST00000246139 XAGE2Q96GT9 111 aa25.84■■□□□ 1.73
CITED1-201ENST00000246139 NEUROD6Q96NK8 337 aa25.84■■□□□ 1.73
CITED1-201ENST00000246139 RCAN3Q9UKA8 241 aa25.84■■□□□ 1.73
CITED1-201ENST00000246139 ECM29Q5VYK3 1845 aa25.84■■□□□ 1.73
CITED1-201ENST00000246139 SSC5DA1L4H1 1573 aa25.83■■□□□ 1.73
CITED1-201ENST00000246139 USP2O75604 605 aaPredicted RBP25.83■■□□□ 1.73
CITED1-201ENST00000246139 SREBF2Q12772 1141 aa25.83■■□□□ 1.73
CITED1-201ENST00000246139 SPRYD7Q5W111 196 aa25.83■■□□□ 1.73
CITED1-201ENST00000246139 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP25.83■■□□□ 1.73
CITED1-201ENST00000246139 HHIPL2Q6UWX4 724 aa25.83■■□□□ 1.73
CITED1-201ENST00000246139 CLMNQ96JQ2 1002 aa25.83■■□□□ 1.73
CITED1-201ENST00000246139 LDHBP07195 334 aaKnown RBP25.82■■□□□ 1.72
CITED1-201ENST00000246139 MVPQ14764 893 aaKnown RBP25.82■■□□□ 1.72
CITED1-201ENST00000246139 HPS5Q9UPZ3 1129 aa25.82■■□□□ 1.72
CITED1-201ENST00000246139 HTTP42858 3142 aa25.82■■□□□ 1.72
CITED1-201ENST00000246139 UNCXA6NJT0 531 aa25.81■■□□□ 1.72
CITED1-201ENST00000246139 CDAN1Q8IWY9 1227 aa25.81■■□□□ 1.72
CITED1-201ENST00000246139 TEPSINQ96N21 525 aa25.81■■□□□ 1.72
CITED1-201ENST00000246139 GPR25O00155 361 aa25.8■■□□□ 1.72
CITED1-201ENST00000246139 ZBTB22O15209 634 aa25.8■■□□□ 1.72
CITED1-201ENST00000246139 SURF6O75683 361 aaKnown RBP25.8■■□□□ 1.72
CITED1-201ENST00000246139 PRDX5P30044 214 aa25.8■■□□□ 1.72
CITED1-201ENST00000246139 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP25.8■■□□□ 1.72
CITED1-201ENST00000246139 DIXDC1Q155Q3 683 aa25.8■■□□□ 1.72
CITED1-201ENST00000246139 GORABQ5T7V8 394 aa25.8■■□□□ 1.72
CITED1-201ENST00000246139 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34 ms