RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000185355.6

Ldb1-208, Transcript of LIM domain-binding protein 1, mouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Ldb1, Length 2,088 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Slc39a11	Q8BWY7	342 aa		32.47	■■■□□ 2.79
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Ubxn4	Q8VCH8	506 aa		32.47	■■■□□ 2.79
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Ccer1	Q9CQL2	403 aa		32.47	■■■□□ 2.79
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Telo2	Q9DC40	840 aa	Known RBP	32.47	■■■□□ 2.79
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Osbpl5	Q9ER64	874 aa		32.47	■■■□□ 2.79
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Cpd	O89001	1377 aa		32.47	■■■□□ 2.79
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Stox1	B2RQL2	990 aa		32.46	■■■□□ 2.79
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Cyp26a1	O55127	497 aa		32.46	■■■□□ 2.79
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Cnnm2	Q3TWN3	875 aa		32.46	■■■□□ 2.79
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Olfm5	Q8BU90	496 aa		32.46	■■■□□ 2.79
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Eaf2	Q91ZD6	262 aa		32.46	■■■□□ 2.79
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Sil1	Q9EPK6	465 aa		32.46	■■■□□ 2.79
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Lrrc43	Q3V0L5	667 aa		32.46	■■■□□ 2.79
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Prdm1	Q60636	856 aa		32.46	■■■□□ 2.79
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Slc44a1	Q6X893	653 aa		32.46	■■■□□ 2.79
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Vmac	Q8BP01	174 aa		32.46	■■■□□ 2.79
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Hmgn5	Q9JL35	406 aa		32.46	■■■□□ 2.79
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Nfe2l3	Q9WTM4	660 aa		32.46	■■■□□ 2.79
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Mx2	Q9WVP9	655 aa		32.46	■■■□□ 2.79
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Prl7d1	P04769	244 aa		32.45	■■■□□ 2.79
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Me1	P06801	572 aa		32.45	■■■□□ 2.79
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Rrp1	P56183	494 aa	Known RBP	32.45	■■■□□ 2.79
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Ccdc174	Q3U155	467 aa		32.45	■■■□□ 2.79
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Agtpbp1	Q641K1	1218 aa		32.45	■■■□□ 2.79
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Ces1d	Q8VCT4	565 aa		32.45	■■■□□ 2.79
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Slc5a4b	Q91ZP4	660 aa		32.45	■■■□□ 2.79
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Rbm43	Q99J64	343 aa		32.45	■■■□□ 2.79
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Kcnn1	Q9EQR3	537 aa		32.45	■■■□□ 2.79
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Ccng2	O08918	344 aa		32.44	■■■□□ 2.78
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Clec11a	O88200	328 aa		32.44	■■■□□ 2.78
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Cplx2	P84086	134 aa		32.44	■■■□□ 2.78
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Bola3	Q8CEI1	110 aa		32.44	■■■□□ 2.78
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Plcd3	Q8K2J0	785 aa		32.44	■■■□□ 2.78
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Sf3b3	Q921M3	1217 aa	Known RBP	32.44	■■■□□ 2.78
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Clta	O08585	235 aa		32.44	■■■□□ 2.78
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Slc7a3	P70423	618 aa		32.44	■■■□□ 2.78
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Tbc1d31	Q6NXY1	996 aa		32.44	■■■□□ 2.78
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Polr3g	Q6NXY9	223 aa		32.44	■■■□□ 2.78
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Hook1	Q8BIL5	728 aa		32.44	■■■□□ 2.78
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Foxo3	Q9WVH4	672 aa		32.44	■■■□□ 2.78
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Aox4	Q3TYQ9	1336 aa		32.44	■■■□□ 2.78
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Tcof1	O08784	1320 aa	Known RBP	32.43	■■■□□ 2.78
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Izumo3	A6PWV3	263 aa		32.42	■■■□□ 2.78
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Snw1	Q9CSN1	536 aa	Known RBP	32.42	■■■□□ 2.78
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Kansl3	A2RSY1	903 aa	Known RBP	32.42	■■■□□ 2.78
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Hmx1	O70218	332 aa		32.42	■■■□□ 2.78
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Pnma3	Q8JZW8	466 aa		32.42	■■■□□ 2.78
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Yeats4	Q9CR11	227 aa	Known RBP	32.42	■■■□□ 2.78
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Tulp1	Q9Z273	543 aa		32.42	■■■□□ 2.78
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Duox1	A2AQ92	1551 aa		32.41	■■■□□ 2.78
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Atp1b3	P97370	278 aa		32.41	■■■□□ 2.78
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Gm28047	Q3US59	414 aa		32.41	■■■□□ 2.78
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Dym	Q8CHY3	669 aa		32.41	■■■□□ 2.78
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Pde4b	B1AWC9	736 aa		32.4	■■■□□ 2.78
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Brpf3	B2KF05	1204 aa	Known RBP	32.4	■■■□□ 2.78
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Slc4a4	O88343	1079 aa		32.4	■■■□□ 2.78
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Paf1	Q8K2T8	535 aa		32.4	■■■□□ 2.78
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Myh15	E9Q264	1925 aa		32.4	■■■□□ 2.78
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Stag1	Q9D3E6	1258 aa		32.39	■■■□□ 2.78
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Tpm3	P21107	285 aa	Known RBP	32.39	■■■□□ 2.78
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Krt24	A1L317	512 aa		32.38	■■■□□ 2.77
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Gm13023	A2A8N2	498 aa		32.38	■■■□□ 2.77
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Ckap2	Q3V1H1	664 aa		32.38	■■■□□ 2.77
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Crebrf	Q8CDG5	640 aa	Known RBP	32.38	■■■□□ 2.77
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Stk38	Q91VJ4	465 aa		32.38	■■■□□ 2.77
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Parvg	Q9ERD8	331 aa		32.38	■■■□□ 2.77
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Naaladl2	A0A0N4SUJ3	795 aa		32.38	■■■□□ 2.77
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Bach1	P97302	739 aa		32.38	■■■□□ 2.77
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Atp1a3	Q6PIC6	1013 aa		32.38	■■■□□ 2.77
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Cd3d	P04235	173 aa		32.37	■■■□□ 2.77
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Foxp1	P58462	705 aa		32.37	■■■□□ 2.77
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Clic4	Q9QYB1	253 aa		32.37	■■■□□ 2.77
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Stx1a	O35526	288 aa		32.36	■■■□□ 2.77
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Hps6	Q8BLY7	805 aa		32.36	■■■□□ 2.77
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Eno4	Q8C042	619 aa		32.36	■■■□□ 2.77
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Zbtb7a	O88939	569 aa	Known RBP	32.35	■■■□□ 2.77
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Stat5b	P42232	786 aa		32.35	■■■□□ 2.77
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Gzf1	Q4VBD9	706 aa		32.35	■■■□□ 2.77
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Oxsr1	Q6P9R2	527 aa		32.35	■■■□□ 2.77
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Gja10	Q9WUS4	505 aa		32.35	■■■□□ 2.77
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Myh4	Q5SX39	1939 aa		32.35	■■■□□ 2.77
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Ubn2	Q80WC1	1314 aa		32.35	■■■□□ 2.77
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Dennd3	A2RT67	1274 aa		32.35	■■■□□ 2.77
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Kiaa0319l	Q8K135	1048 aa		32.35	■■■□□ 2.77
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Emilin2	Q8K482	1074 aa		32.35	■■■□□ 2.77
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Pold4	Q9CWP8	107 aa		32.35	■■■□□ 2.77
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Phrf1	A6H619	1682 aa		32.34	■■■□□ 2.77
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Sptlc2	P97363	560 aa	Known RBP	32.34	■■■□□ 2.77
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Cyp24a1	Q64441	514 aa		32.34	■■■□□ 2.77
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Rnf41	Q8BH75	317 aa		32.34	■■■□□ 2.77
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Nop14	Q8R3N1	860 aa	Known RBP	32.34	■■■□□ 2.77
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Krt40	Q6IFX3	439 aa		32.33	■■■□□ 2.77
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Pcdhb15	Q91Y04	786 aa		32.33	■■■□□ 2.77
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Gak	Q99KY4	1305 aa		32.33	■■■□□ 2.77
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Tpm2	P58774	284 aa		32.33	■■■□□ 2.77
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Intu	Q059U7	942 aa		32.33	■■■□□ 2.77
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Popdc2	Q9ES82	367 aa		32.33	■■■□□ 2.77
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Sirt2	Q8VDQ8	389 aa		32.32	■■■□□ 2.76
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Cxcl11	Q9JHH5	100 aa		32.32	■■■□□ 2.76
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Irs4	Q9Z0Y7	1216 aa		32.32	■■■□□ 2.76

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