RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000324444.7

SYNE4-201, Transcript of spectrin repeat containing nuclear envelope family member 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 5 BASIC

Gene SYNE4, Length 1,354 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4-201ENST00000324444 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa14.67□□□□□ -0.06
SYNE4-201ENST00000324444 ATRQ13535 2644 aa14.66□□□□□ -0.06
SYNE4-201ENST00000324444 OOSP1A8MZH6 123 aa14.66□□□□□ -0.06
SYNE4-201ENST00000324444 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa14.66□□□□□ -0.06
SYNE4-201ENST00000324444 PET100P0DJ07 73 aa14.66□□□□□ -0.06
SYNE4-201ENST00000324444 COX7A1P24310 79 aa14.66□□□□□ -0.06
SYNE4-201ENST00000324444 HTR1DP28221 377 aa14.66□□□□□ -0.06
SYNE4-201ENST00000324444 LPAR6P43657 344 aa14.66□□□□□ -0.06
SYNE4-201ENST00000324444 RAB13P51153 203 aa14.66□□□□□ -0.06
SYNE4-201ENST00000324444 LGALS4P56470 323 aa14.66□□□□□ -0.06
SYNE4-201ENST00000324444 RPL30P62888 115 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
SYNE4-201ENST00000324444 PAX8Q06710 450 aa14.66□□□□□ -0.06
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SYNE4-201ENST00000324444 SLC35G3Q8N808 338 aa14.66□□□□□ -0.06
SYNE4-201ENST00000324444 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa14.66□□□□□ -0.06
SYNE4-201ENST00000324444 C5orf30Q96GV9 206 aa14.66□□□□□ -0.06
SYNE4-201ENST00000324444 CHIAQ9BZP6 476 aa14.66□□□□□ -0.06
SYNE4-201ENST00000324444 DPM3Q9P2X0 92 aa14.66□□□□□ -0.06
SYNE4-201ENST00000324444 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa14.66□□□□□ -0.06
SYNE4-201ENST00000324444 DNHD1Q96M86 4753 aa14.66□□□□□ -0.06
SYNE4-201ENST00000324444 PROP1O75360 226 aa14.65□□□□□ -0.06
SYNE4-201ENST00000324444 ADAP1O75689 374 aa14.65□□□□□ -0.06
SYNE4-201ENST00000324444 C1QBP02746 253 aa14.65□□□□□ -0.06
SYNE4-201ENST00000324444 ARG1P05089 322 aa14.65□□□□□ -0.06
SYNE4-201ENST00000324444 UBE2E1P51965 193 aa14.65□□□□□ -0.06
SYNE4-201ENST00000324444 AKR1C2P52895 323 aa14.65□□□□□ -0.06
SYNE4-201ENST00000324444 H2BFSP57053 126 aa14.65□□□□□ -0.06
SYNE4-201ENST00000324444 ERVK-16P61578 105 aa14.65□□□□□ -0.06
SYNE4-201ENST00000324444 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
SYNE4-201ENST00000324444 ZNF585BQ52M93 769 aa14.65□□□□□ -0.06
SYNE4-201ENST00000324444 DCAF12L2Q5VW00 463 aa14.65□□□□□ -0.06
SYNE4-201ENST00000324444 LYZL2Q7Z4W2 148 aa14.65□□□□□ -0.06
SYNE4-201ENST00000324444 OR2T35Q8NGX2 323 aa14.65□□□□□ -0.06
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SYNE4-201ENST00000324444 HYLS1Q96M11 299 aa14.65□□□□□ -0.06
SYNE4-201ENST00000324444 SIRT7Q9NRC8 400 aa14.65□□□□□ -0.06
SYNE4-201ENST00000324444 MMP26Q9NRE1 261 aa14.65□□□□□ -0.06
SYNE4-201ENST00000324444 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
SYNE4-201ENST00000324444 A0A1B0GU03 582 aa14.64□□□□□ -0.07
SYNE4-201ENST00000324444 LINC00473A8K010 186 aa14.64□□□□□ -0.07
SYNE4-201ENST00000324444 A8MV72 311 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
SYNE4-201ENST00000324444 J3QLI3 93 aa14.64□□□□□ -0.07
SYNE4-201ENST00000324444 FCGR3BO75015 233 aa14.64□□□□□ -0.07
SYNE4-201ENST00000324444 HRASP01112 189 aa14.64□□□□□ -0.07
SYNE4-201ENST00000324444 MMP9P14780 707 aa14.64□□□□□ -0.07
SYNE4-201ENST00000324444 GZMKP49863 264 aa14.64□□□□□ -0.07
SYNE4-201ENST00000324444 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
SYNE4-201ENST00000324444 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa14.64□□□□□ -0.07
SYNE4-201ENST00000324444 DDB2Q92466 427 aa14.64□□□□□ -0.07
SYNE4-201ENST00000324444 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
SYNE4-201ENST00000324444 GPHA2Q96T91 129 aa14.64□□□□□ -0.07
SYNE4-201ENST00000324444 SLC35D1Q9NTN3 355 aa14.64□□□□□ -0.07
SYNE4-201ENST00000324444 PRR13Q9NZ81 148 aa14.64□□□□□ -0.07
SYNE4-201ENST00000324444 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP14.64□□□□□ -0.072e-6■■■■■ 27.4
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SYNE4-201ENST00000324444 CCSO14618 274 aa14.63□□□□□ -0.07
SYNE4-201ENST00000324444 SIX6O95475 246 aa14.63□□□□□ -0.07
SYNE4-201ENST00000324444 RLN2P04090 185 aa14.63□□□□□ -0.07
SYNE4-201ENST00000324444 CT45A6P0DMU7 189 aa14.63□□□□□ -0.07
SYNE4-201ENST00000324444 CT45A5P0DMU8 189 aa14.63□□□□□ -0.07
SYNE4-201ENST00000324444 CT45A7P0DMV0 189 aa14.63□□□□□ -0.07
SYNE4-201ENST00000324444 NQO2P16083 231 aa14.63□□□□□ -0.07
SYNE4-201ENST00000324444 C2orf68Q2NKX9 166 aa14.63□□□□□ -0.07
SYNE4-201ENST00000324444 UTF1Q5T230 341 aa14.63□□□□□ -0.07
SYNE4-201ENST00000324444 CYB5R2Q6BCY4 276 aa14.63□□□□□ -0.07
SYNE4-201ENST00000324444 PDPNQ86YL7 162 aa14.63□□□□□ -0.07
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SYNE4-201ENST00000324444 OR5AN1Q8NGI8 311 aa14.63□□□□□ -0.07
SYNE4-201ENST00000324444 OR4P4Q8NGL7 312 aa14.63□□□□□ -0.07
SYNE4-201ENST00000324444 LHFPL5Q8TAF8 219 aa14.63□□□□□ -0.07
SYNE4-201ENST00000324444 MMP24Q9Y5R2 645 aa14.63□□□□□ -0.07
SYNE4-201ENST00000324444 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa14.62□□□□□ -0.07
SYNE4-201ENST00000324444 SMCO1Q147U7 214 aa14.62□□□□□ -0.07
SYNE4-201ENST00000324444 MIDNQ504T8 468 aa14.62□□□□□ -0.07
SYNE4-201ENST00000324444 ZNF383Q8NA42 475 aa14.62□□□□□ -0.07
SYNE4-201ENST00000324444 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
SYNE4-201ENST00000324444 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
SYNE4-201ENST00000324444 SEC22AQ96IW7 307 aa14.62□□□□□ -0.07
SYNE4-201ENST00000324444 NABP2Q9BQ15 211 aa14.62□□□□□ -0.07
SYNE4-201ENST00000324444 COA4Q9NYJ1 87 aa14.62□□□□□ -0.07
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SYNE4-201ENST00000324444 PSMB6P28072 239 aa14.61□□□□□ -0.07
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SYNE4-201ENST00000324444 TBX15Q96SF7 602 aa14.61□□□□□ -0.07
SYNE4-201ENST00000324444 GSKIPQ9P0R6 139 aa14.61□□□□□ -0.07
SYNE4-201ENST00000324444 COL6A5A8TX70 2615 aa14.61□□□□□ -0.07
SYNE4-201ENST00000324444 LY6LH3BQJ8 138 aa14.6□□□□□ -0.07
SYNE4-201ENST00000324444 H7C2Y5 167 aa14.6□□□□□ -0.07
SYNE4-201ENST00000324444 RAMP3O60896 148 aa14.6□□□□□ -0.07
SYNE4-201ENST00000324444 OR2B11Q5JQS5 317 aa14.6□□□□□ -0.07
SYNE4-201ENST00000324444 OR4C13Q8NGP0 309 aa14.6□□□□□ -0.07
SYNE4-201ENST00000324444 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa14.6□□□□□ -0.07
SYNE4-201ENST00000324444 LHX4Q969G2 390 aa14.6□□□□□ -0.07
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