RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423112.2

RFX3-AS1-201, RFX3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene RFX3-AS1, Length 552 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ST8SIA5O15466 376 aa12.33□□□□□ -0.44
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MAP2K4P45985 399 aa12.33□□□□□ -0.44
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SOX2P48431 317 aa12.33□□□□□ -0.44
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DEFB135Q30KP9 77 aa12.33□□□□□ -0.44
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FAM209BQ5JX69 171 aa12.33□□□□□ -0.44
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ABRACLQ9P1F3 81 aa12.33□□□□□ -0.44
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa12.33□□□□□ -0.44
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FAM223BA6NKX1 122 aa12.32□□□□□ -0.44
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TUSC2O75896 110 aa12.32□□□□□ -0.44
RFX3-AS1-201ENST00000423112 IFNA4P05014 189 aa12.32□□□□□ -0.44
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FUT3P21217 361 aa12.32□□□□□ -0.44
RFX3-AS1-201ENST00000423112 BDKRB2P30411 391 aa12.32□□□□□ -0.44
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZNF45Q02386 682 aa12.32□□□□□ -0.44
RFX3-AS1-201ENST00000423112 HSP90B2PQ58FF3 399 aa12.32□□□□□ -0.44
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FAM223AQ8IWN6 122 aa12.32□□□□□ -0.44
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NSL1Q96IY1 281 aa12.32□□□□□ -0.44
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MFFQ9GZY8 342 aa12.32□□□□□ -0.44
RFX3-AS1-201ENST00000423112 UBE2QL1A1L167 161 aa12.31□□□□□ -0.44
RFX3-AS1-201ENST00000423112 H3BNX3 289 aa12.31□□□□□ -0.44
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LGALS9O00182 355 aa12.31□□□□□ -0.44
RFX3-AS1-201ENST00000423112 IGKV1-16P04430 117 aa12.31□□□□□ -0.44
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CAPGP40121 348 aa12.31□□□□□ -0.44
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP12.31□□□□□ -0.44
RFX3-AS1-201ENST00000423112 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP12.31□□□□□ -0.44
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP12.31□□□□□ -0.44
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PDPNQ86YL7 162 aa12.31□□□□□ -0.44
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TMEM61Q8N0U2 210 aa12.31□□□□□ -0.44
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP12.31□□□□□ -0.44
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GPR148Q8TDV2 347 aa12.31□□□□□ -0.44
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP12.31□□□□□ -0.44
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RNF183Q96D59 192 aa12.31□□□□□ -0.44
RFX3-AS1-201ENST00000423112 VPS13DQ5THJ4 4388 aa12.31□□□□□ -0.44
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP12.3□□□□□ -0.44
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ITGB1BP1O14713 200 aa12.3□□□□□ -0.44
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CBLN1P23435 193 aa12.3□□□□□ -0.44
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP12.3□□□□□ -0.44
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ATP5G2Q06055 141 aa12.3□□□□□ -0.44
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FLOT2Q14254 428 aa12.3□□□□□ -0.44
RFX3-AS1-201ENST00000423112 HMGN3Q15651 99 aa12.3□□□□□ -0.44
RFX3-AS1-201ENST00000423112 C5orf24Q7Z6I8 188 aa12.3□□□□□ -0.44
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa12.3□□□□□ -0.44
RFX3-AS1-201ENST00000423112 C2CD4CQ8TF44 421 aa12.3□□□□□ -0.44
RFX3-AS1-201ENST00000423112 IL1F10Q8WWZ1 152 aa12.3□□□□□ -0.44
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PHB2Q99623 299 aa12.3□□□□□ -0.44
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP12.3□□□□□ -0.44
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CIB1Q99828 191 aa12.3□□□□□ -0.44
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP12.3□□□□□ -0.44
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP12.3□□□□□ -0.44
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KIR2DL5BA0A0G2JN68 375 aa12.29□□□□□ -0.44
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa12.29□□□□□ -0.44
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa12.29□□□□□ -0.44
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SNTNA6NMZ2 147 aa12.29□□□□□ -0.44
RFX3-AS1-201ENST00000423112 APOA2P02652 100 aa12.29□□□□□ -0.44
RFX3-AS1-201ENST00000423112 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP12.29□□□□□ -0.44
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RHOGP84095 191 aa12.29□□□□□ -0.44
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RIPK1Q13546 671 aa12.29□□□□□ -0.44
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP12.29□□□□□ -0.44
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TM4SF20Q53R12 229 aa12.29□□□□□ -0.44
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LHFPL3Q86UP9 236 aa12.29□□□□□ -0.44
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KIR2DL5AQ8N109 375 aa12.29□□□□□ -0.44
RFX3-AS1-201ENST00000423112 STPG3Q8N7X2 389 aa12.29□□□□□ -0.44
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP12.29□□□□□ -0.44
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa12.29□□□□□ -0.44
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ABHD14BQ96IU4 210 aa12.29□□□□□ -0.44
RFX3-AS1-201ENST00000423112 OR14A2Q96R54 314 aa12.29□□□□□ -0.44
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa12.29□□□□□ -0.44
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa12.29□□□□□ -0.44
RFX3-AS1-201ENST00000423112 AKIP1Q9NQ31 210 aa12.29□□□□□ -0.44
RFX3-AS1-201ENST00000423112 IMPAD1Q9NX62 359 aa12.29□□□□□ -0.44
RFX3-AS1-201ENST00000423112 EXOGQ9Y2C4 368 aaKnown RBP12.29□□□□□ -0.44
RFX3-AS1-201ENST00000423112 E9PI62 339 aa12.28□□□□□ -0.44
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GGCTO75223 188 aaKnown RBP12.28□□□□□ -0.44
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP12.28□□□□□ -0.44
RFX3-AS1-201ENST00000423112 OR9G9P0C7N8 305 aa12.28□□□□□ -0.44
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CALB2P22676 271 aa12.28□□□□□ -0.44
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PJVKQ0ZLH3 352 aa12.28□□□□□ -0.44
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SLC25A30Q5SVS4 291 aa12.28□□□□□ -0.44
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MEDAGQ5VYS4 303 aa12.28□□□□□ -0.44
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP12.28□□□□□ -0.44
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KCNG3Q8TAE7 436 aa12.28□□□□□ -0.44
RFX3-AS1-201ENST00000423112 EDARADDQ8WWZ3 215 aa12.28□□□□□ -0.44
RFX3-AS1-201ENST00000423112 AGMATQ9BSE5 352 aa12.28□□□□□ -0.44
RFX3-AS1-201ENST00000423112 THTPAQ9BU02 230 aa12.28□□□□□ -0.44
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GABARAPL3Q9BY60 117 aa12.28□□□□□ -0.44
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SELENOIQ9C0D9 397 aa12.28□□□□□ -0.44
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa12.28□□□□□ -0.44
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PKHD1P08F94 4074 aa12.28□□□□□ -0.44
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PDCD6O75340 191 aa12.27□□□□□ -0.45
RFX3-AS1-201ENST00000423112 EDN2P20800 178 aa12.27□□□□□ -0.45
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa12.27□□□□□ -0.45
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GVQW1Q8N7I0 195 aa12.27□□□□□ -0.45
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FBXL7Q9UJT9 491 aa12.27□□□□□ -0.45
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TRAV25A0A0B4J276 109 aa12.26□□□□□ -0.45
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP12.26□□□□□ -0.45
RFX3-AS1-201ENST00000423112 BAG2O95816 211 aa12.26□□□□□ -0.45
RFX3-AS1-201ENST00000423112 T-ENOLP0DO92 83 aa12.26□□□□□ -0.45
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MGMTP16455 207 aa12.26□□□□□ -0.45
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GLT8D1Q68CQ7 371 aa12.26□□□□□ -0.45
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SIGIRRQ6IA17 410 aa12.26□□□□□ -0.45
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GPHB5Q86YW7 130 aa12.26□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.5 ms