RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000287820.10

PPARG-201, Transcript of peroxisome proliferator activated receptor gamma, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PPARG, Length 1,850 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARG-201ENST00000287820 RAB9BQ9NP90 201 aa6.75□□□□□ -1.33
PPARG-201ENST00000287820 KCNIP1Q9NZI2 227 aa6.75□□□□□ -1.33
PPARG-201ENST00000287820 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
PPARG-201ENST00000287820 FBN3Q75N90 2809 aa6.75□□□□□ -1.33
PPARG-201ENST00000287820 A0A087WXM4 84 aa6.75□□□□□ -1.33
PPARG-201ENST00000287820 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa6.75□□□□□ -1.33
PPARG-201ENST00000287820 TNFAIP8O95379 198 aa6.75□□□□□ -1.33
PPARG-201ENST00000287820 IGHV3-43DP0DP04 118 aa6.75□□□□□ -1.33
PPARG-201ENST00000287820 CD36P16671 472 aa6.75□□□□□ -1.33
PPARG-201ENST00000287820 MNDAP41218 407 aa6.75□□□□□ -1.33
PPARG-201ENST00000287820 GNG10P50151 68 aa6.75□□□□□ -1.33
PPARG-201ENST00000287820 ARHGDIBP52566 201 aa6.75□□□□□ -1.33
PPARG-201ENST00000287820 EFNB2P52799 333 aa6.75□□□□□ -1.33
PPARG-201ENST00000287820 BLCAPP62952 87 aa6.75□□□□□ -1.33
PPARG-201ENST00000287820 NEDD8Q15843 81 aa6.75□□□□□ -1.33
PPARG-201ENST00000287820 LY6G6FQ5SQ64 297 aa6.75□□□□□ -1.33
PPARG-201ENST00000287820 Q6ZPA2 131 aa6.75□□□□□ -1.33
PPARG-201ENST00000287820 Q6ZS46 218 aa6.75□□□□□ -1.33
PPARG-201ENST00000287820 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
PPARG-201ENST00000287820 ZNF439Q8NDP4 499 aa6.75□□□□□ -1.33
PPARG-201ENST00000287820 TSPAN14Q8NG11 270 aa6.75□□□□□ -1.33
PPARG-201ENST00000287820 OR10X1Q8NGY0 326 aa6.75□□□□□ -1.33
PPARG-201ENST00000287820 PTX4Q96A99 478 aa6.75□□□□□ -1.33
PPARG-201ENST00000287820 RPEQ96AT9 228 aa6.75□□□□□ -1.33
PPARG-201ENST00000287820 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa6.75□□□□□ -1.33
PPARG-201ENST00000287820 PECRQ9BY49 303 aa6.75□□□□□ -1.33
PPARG-201ENST00000287820 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa6.75□□□□□ -1.33
PPARG-201ENST00000287820 LIN7BQ9HAP6 207 aa6.75□□□□□ -1.33
PPARG-201ENST00000287820 OR2S2Q9NQN1 319 aa6.75□□□□□ -1.33
PPARG-201ENST00000287820 KCNK7Q9Y2U2 307 aa6.75□□□□□ -1.33
PPARG-201ENST00000287820 VWFP04275 2813 aa6.74□□□□□ -1.33
PPARG-201ENST00000287820 TRIM64CA6NLI5 447 aa6.74□□□□□ -1.33
PPARG-201ENST00000287820 NOTOA8MTQ0 251 aa6.74□□□□□ -1.33
PPARG-201ENST00000287820 RAB27BO00194 218 aa6.74□□□□□ -1.33
PPARG-201ENST00000287820 RRP9O43818 475 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
PPARG-201ENST00000287820 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
PPARG-201ENST00000287820 FAM106CPP0CH98 169 aa6.74□□□□□ -1.33
PPARG-201ENST00000287820 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
PPARG-201ENST00000287820 RAB6AP20340 208 aa6.74□□□□□ -1.33
PPARG-201ENST00000287820 GADD45AP24522 165 aa6.74□□□□□ -1.33
PPARG-201ENST00000287820 SDC2P34741 201 aa6.74□□□□□ -1.33
PPARG-201ENST00000287820 RAB7AP51149 207 aa6.74□□□□□ -1.33
PPARG-201ENST00000287820 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
PPARG-201ENST00000287820 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
PPARG-201ENST00000287820 PLAC9Q5JTB6 97 aa6.74□□□□□ -1.33
PPARG-201ENST00000287820 C16orf82Q7Z2V1 217 aa6.74□□□□□ -1.33
PPARG-201ENST00000287820 OR8H3Q8N146 312 aa6.74□□□□□ -1.33
PPARG-201ENST00000287820 PRR18Q8N4B5 295 aa6.74□□□□□ -1.33
PPARG-201ENST00000287820 OR56B1Q8NGI3 324 aa6.74□□□□□ -1.33
PPARG-201ENST00000287820 OR4C13Q8NGP0 309 aa6.74□□□□□ -1.33
PPARG-201ENST00000287820 CFHR4Q92496 578 aa6.74□□□□□ -1.33
PPARG-201ENST00000287820 GALMQ96C23 342 aa6.74□□□□□ -1.33
PPARG-201ENST00000287820 KCTD7Q96MP8 289 aa6.74□□□□□ -1.33
PPARG-201ENST00000287820 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
PPARG-201ENST00000287820 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa6.74□□□□□ -1.33
PPARG-201ENST00000287820 PRSS22Q9GZN4 317 aa6.74□□□□□ -1.33
PPARG-201ENST00000287820 ZNF696Q9H7X3 374 aa6.74□□□□□ -1.33
PPARG-201ENST00000287820 ZNF702PQ9H963 129 aa6.74□□□□□ -1.33
PPARG-201ENST00000287820 GNG12Q9UBI6 72 aa6.74□□□□□ -1.33
PPARG-201ENST00000287820 AK3Q9UIJ7 227 aa6.74□□□□□ -1.33
PPARG-201ENST00000287820 SIGLEC9Q9Y336 463 aa6.74□□□□□ -1.33
PPARG-201ENST00000287820 A0A0B4J203 849 aa6.73□□□□□ -1.33
PPARG-201ENST00000287820 A0A1W2PPI3 338 aa6.73□□□□□ -1.33
PPARG-201ENST00000287820 TIMM23O14925 209 aa6.73□□□□□ -1.33
PPARG-201ENST00000287820 SLC31A2O15432 143 aa6.73□□□□□ -1.33
PPARG-201ENST00000287820 YPEL1O60688 119 aa6.73□□□□□ -1.33
PPARG-201ENST00000287820 AMY1AP04745 511 aa6.73□□□□□ -1.33
PPARG-201ENST00000287820 AMY2AP04746 511 aa6.73□□□□□ -1.33
PPARG-201ENST00000287820 ZNF137PP52743 207 aa6.73□□□□□ -1.33
PPARG-201ENST00000287820 EBI3Q14213 229 aa6.73□□□□□ -1.33
PPARG-201ENST00000287820 HMGN3Q15651 99 aa6.73□□□□□ -1.33
PPARG-201ENST00000287820 MOGAT2Q3SYC2 334 aa6.73□□□□□ -1.33
PPARG-201ENST00000287820 FBLN7Q53RD9 439 aa6.73□□□□□ -1.33
PPARG-201ENST00000287820 C11orf88Q6PI97 169 aa6.73□□□□□ -1.33
PPARG-201ENST00000287820 OR52L2PQ8NGH6 319 aa6.73□□□□□ -1.33
PPARG-201ENST00000287820 OR2T6Q8NHC8 308 aa6.73□□□□□ -1.33
PPARG-201ENST00000287820 TOMM40LQ969M1 308 aa6.73□□□□□ -1.33
PPARG-201ENST00000287820 YPEL2Q96QA6 119 aa6.73□□□□□ -1.33
PPARG-201ENST00000287820 CENPOQ9BU64 300 aa6.73□□□□□ -1.33
PPARG-201ENST00000287820 RNF167Q9H6Y7 350 aa6.73□□□□□ -1.33
PPARG-201ENST00000287820 SERTAD4Q9NUC0 356 aa6.73□□□□□ -1.33
PPARG-201ENST00000287820 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa6.73□□□□□ -1.33
PPARG-201ENST00000287820 SMIM30A4D0T7 59 aa6.73□□□□□ -1.33
PPARG-201ENST00000287820 METTL21EPA6NDL7 271 aa6.73□□□□□ -1.33
PPARG-201ENST00000287820 OR2F2O95006 317 aa6.73□□□□□ -1.33
PPARG-201ENST00000287820 DRAM1Q8N682 238 aa6.73□□□□□ -1.33
PPARG-201ENST00000287820 OR10V1Q8NGI7 309 aa6.73□□□□□ -1.33
PPARG-201ENST00000287820 OR10R2Q8NGX6 335 aa6.73□□□□□ -1.33
PPARG-201ENST00000287820 CAPSLQ8WWF8 208 aa6.73□□□□□ -1.33
PPARG-201ENST00000287820 RAB3CQ96E17 227 aa6.73□□□□□ -1.33
PPARG-201ENST00000287820 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
PPARG-201ENST00000287820 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
PPARG-201ENST00000287820 Q9N2K0 584 aa6.73□□□□□ -1.33
PPARG-201ENST00000287820 JPT1Q9UK76 154 aa6.73□□□□□ -1.33
PPARG-201ENST00000287820 PLXNB1O43157 2135 aa6.72□□□□□ -1.33
PPARG-201ENST00000287820 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa6.72□□□□□ -1.33
PPARG-201ENST00000287820 HSD17B6O14756 317 aa6.72□□□□□ -1.33
PPARG-201ENST00000287820 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
PPARG-201ENST00000287820 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
PPARG-201ENST00000287820 PRR31Q5SQ13 230 aa6.72□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 74.5 ms