RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492485.5

TRIOBP-211, Transcript of TRIO and F-actin binding protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TRIOBP, Length 3,948 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIOBP-211ENST00000492485 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa10.7□□□□□ -0.7
TRIOBP-211ENST00000492485 SYNGR2O43760 224 aa10.7□□□□□ -0.7
TRIOBP-211ENST00000492485 GNG10P50151 68 aa10.7□□□□□ -0.7
TRIOBP-211ENST00000492485 ERVFC1-1P60608 527 aa10.7□□□□□ -0.7
TRIOBP-211ENST00000492485 ASPHD2Q6ICH7 369 aa10.7□□□□□ -0.7
TRIOBP-211ENST00000492485 SLC23A3Q6PIS1 610 aa10.7□□□□□ -0.7
TRIOBP-211ENST00000492485 LINC00114Q6XXX2 140 aa10.7□□□□□ -0.7
TRIOBP-211ENST00000492485 OR10G4Q8NGN3 311 aa10.7□□□□□ -0.7
TRIOBP-211ENST00000492485 OR10G9Q8NGN4 311 aa10.7□□□□□ -0.7
TRIOBP-211ENST00000492485 OR10G7Q8NGN6 311 aa10.7□□□□□ -0.7
TRIOBP-211ENST00000492485 PRSS50Q9UI38 385 aa10.7□□□□□ -0.7
TRIOBP-211ENST00000492485 A0A1B0GTI1 187 aa10.7□□□□□ -0.7
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TRIOBP-211ENST00000492485 VAMP5O95183 116 aa10.7□□□□□ -0.7
TRIOBP-211ENST00000492485 PGA3P0DJD8 388 aa10.7□□□□□ -0.7
TRIOBP-211ENST00000492485 RPS23P62266 143 aaKnown RBP10.7□□□□□ -0.7
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TRIOBP-211ENST00000492485 CATR1Q13166 79 aa10.7□□□□□ -0.7
TRIOBP-211ENST00000492485 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP10.7□□□□□ -0.7
TRIOBP-211ENST00000492485 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa10.7□□□□□ -0.7
TRIOBP-211ENST00000492485 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa10.7□□□□□ -0.7
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TRIOBP-211ENST00000492485 RNF24Q9Y225 148 aa10.7□□□□□ -0.7
TRIOBP-211ENST00000492485 STARD10Q9Y365 291 aa10.7□□□□□ -0.7
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TRIOBP-211ENST00000492485 TNCP24821 2201 aa10.7□□□□□ -0.7
TRIOBP-211ENST00000492485 A8MXE2 369 aa10.7□□□□□ -0.7
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TRIOBP-211ENST00000492485 CDPF1Q6NVV7 123 aa10.7□□□□□ -0.7
TRIOBP-211ENST00000492485 AQP10Q96PS8 301 aa10.7□□□□□ -0.7
TRIOBP-211ENST00000492485 WFDC1Q9HC57 220 aa10.7□□□□□ -0.7
TRIOBP-211ENST00000492485 OR1A1Q9P1Q5 309 aa10.7□□□□□ -0.7
TRIOBP-211ENST00000492485 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa10.69□□□□□ -0.7
TRIOBP-211ENST00000492485 CBY3A6NI87 242 aa10.69□□□□□ -0.7
TRIOBP-211ENST00000492485 SEC14L6B5MCN3 397 aa10.69□□□□□ -0.7
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TRIOBP-211ENST00000492485 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP10.69□□□□□ -0.7
TRIOBP-211ENST00000492485 OR8G1Q15617 311 aa10.69□□□□□ -0.7
TRIOBP-211ENST00000492485 PHYHD1Q5SRE7 291 aa10.69□□□□□ -0.7
TRIOBP-211ENST00000492485 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa10.69□□□□□ -0.7
TRIOBP-211ENST00000492485 Q8WTZ3 238 aa10.69□□□□□ -0.7
TRIOBP-211ENST00000492485 SPSB1Q96BD6 273 aa10.69□□□□□ -0.7
TRIOBP-211ENST00000492485 OR51M1Q9H341 326 aa10.69□□□□□ -0.7
TRIOBP-211ENST00000492485 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP10.69□□□□□ -0.7
TRIOBP-211ENST00000492485 MYO9AB2RTY4 2548 aa10.69□□□□□ -0.7
TRIOBP-211ENST00000492485 COLCA2A8K830 154 aa10.69□□□□□ -0.7
TRIOBP-211ENST00000492485 IGKV3-11P04433 115 aa10.69□□□□□ -0.7
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TRIOBP-211ENST00000492485 VDAC1P21796 283 aa10.69□□□□□ -0.7
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TRIOBP-211ENST00000492485 OR8U8P0C7N1 319 aa10.69□□□□□ -0.7
TRIOBP-211ENST00000492485 DTYMKP23919 212 aa10.69□□□□□ -0.7
TRIOBP-211ENST00000492485 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP10.69□□□□□ -0.7
TRIOBP-211ENST00000492485 VAX1Q5SQQ9 334 aa10.69□□□□□ -0.7
TRIOBP-211ENST00000492485 C16orf82Q7Z2V1 217 aa10.69□□□□□ -0.7
TRIOBP-211ENST00000492485 FAM58AQ8N1B3 248 aa10.69□□□□□ -0.7
TRIOBP-211ENST00000492485 OR2M3Q8NG83 312 aa10.69□□□□□ -0.7
TRIOBP-211ENST00000492485 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP10.69□□□□□ -0.7
TRIOBP-211ENST00000492485 CTDSP1Q9GZU7 261 aa10.69□□□□□ -0.7
TRIOBP-211ENST00000492485 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa10.68□□□□□ -0.7
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TRIOBP-211ENST00000492485 SEC11BP0C7V7 166 aa10.68□□□□□ -0.7
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TRIOBP-211ENST00000492485 RAB31Q13636 194 aa10.68□□□□□ -0.7
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TRIOBP-211ENST00000492485 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP10.68□□□□□ -0.7
TRIOBP-211ENST00000492485 Q9N2K0 584 aa10.68□□□□□ -0.7
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