RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502484.6

PDE4D-208, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,478 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-208ENST00000502484 MUCL1Q96DR8 90 aa6.92□□□□□ -1.3
PDE4D-208ENST00000502484 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
PDE4D-208ENST00000502484 C18orf12Q96KH6 178 aa6.92□□□□□ -1.3
PDE4D-208ENST00000502484 MSL2Q9HCI7 577 aa6.92□□□□□ -1.3
PDE4D-208ENST00000502484 ASF1BQ9NVP2 202 aa6.92□□□□□ -1.3
PDE4D-208ENST00000502484 GSKIPQ9P0R6 139 aa6.92□□□□□ -1.3
PDE4D-208ENST00000502484 DNAJB11Q9UBS4 358 aa6.92□□□□□ -1.3
PDE4D-208ENST00000502484 FLNCQ14315 2725 aa6.92□□□□□ -1.3
PDE4D-208ENST00000502484 ARID1AO14497 2285 aa6.92□□□□□ -1.3
PDE4D-208ENST00000502484 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa6.92□□□□□ -1.3
PDE4D-208ENST00000502484 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa6.92□□□□□ -1.3
PDE4D-208ENST00000502484 C3orf85A0A1B0GTC6 90 aa6.92□□□□□ -1.3
PDE4D-208ENST00000502484 M0R1B8 84 aa6.92□□□□□ -1.3
PDE4D-208ENST00000502484 GPR31O00270 319 aa6.92□□□□□ -1.3
PDE4D-208ENST00000502484 HAND1O96004 215 aa6.92□□□□□ -1.3
PDE4D-208ENST00000502484 CRYAAP02489 173 aa6.92□□□□□ -1.3
PDE4D-208ENST00000502484 IGKV1-13P0DP09 117 aa6.92□□□□□ -1.3
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF250P15622 560 aa6.92□□□□□ -1.3
PDE4D-208ENST00000502484 LUMP51884 338 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
PDE4D-208ENST00000502484 MZT1Q08AG7 82 aa6.92□□□□□ -1.3
PDE4D-208ENST00000502484 WDR82Q6UXN9 313 aa6.92□□□□□ -1.3
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa6.92□□□□□ -1.3
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF826PQ6ZT77 177 aa6.92□□□□□ -1.3
PDE4D-208ENST00000502484 DOLPP1Q86YN1 238 aa6.92□□□□□ -1.3
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF843Q8N446 348 aa6.92□□□□□ -1.3
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF565Q8N9K5 539 aa6.92□□□□□ -1.3
PDE4D-208ENST00000502484 SECTM1Q8WVN6 248 aa6.92□□□□□ -1.3
PDE4D-208ENST00000502484 PHYHIPLQ96FC7 376 aa6.92□□□□□ -1.3
PDE4D-208ENST00000502484 AQP10Q96PS8 301 aa6.92□□□□□ -1.3
PDE4D-208ENST00000502484 TP53RKQ96S44 253 aa6.92□□□□□ -1.3
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
PDE4D-208ENST00000502484 PIGMQ9H3S5 423 aa6.92□□□□□ -1.3
PDE4D-208ENST00000502484 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
PDE4D-208ENST00000502484 MED9Q9NWA0 146 aa6.92□□□□□ -1.3
PDE4D-208ENST00000502484 WIPI2Q9Y4P8 454 aa6.92□□□□□ -1.3
PDE4D-208ENST00000502484 SPEF1Q9Y4P9 236 aa6.92□□□□□ -1.3
PDE4D-208ENST00000502484 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
PDE4D-208ENST00000502484 B8ZZF3 427 aa6.91□□□□□ -1.3
PDE4D-208ENST00000502484 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
PDE4D-208ENST00000502484 KCNAB3O43448 404 aa6.91□□□□□ -1.3
PDE4D-208ENST00000502484 IGHV3-13P01766 116 aa6.91□□□□□ -1.3
PDE4D-208ENST00000502484 GLRXP35754 106 aa6.91□□□□□ -1.3
PDE4D-208ENST00000502484 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
PDE4D-208ENST00000502484 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
PDE4D-208ENST00000502484 SRPXP78539 464 aa6.91□□□□□ -1.3
PDE4D-208ENST00000502484 MSMPQ1L6U9 139 aa6.91□□□□□ -1.3
PDE4D-208ENST00000502484 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa6.91□□□□□ -1.3
PDE4D-208ENST00000502484 ACP7Q6ZNF0 438 aa6.91□□□□□ -1.3
PDE4D-208ENST00000502484 LYZL2Q7Z4W2 148 aa6.91□□□□□ -1.3
PDE4D-208ENST00000502484 TBC1D26Q86UD7 250 aa6.91□□□□□ -1.3
PDE4D-208ENST00000502484 COMMD7Q86VX2 200 aa6.91□□□□□ -1.3
PDE4D-208ENST00000502484 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
PDE4D-208ENST00000502484 OR1S1Q8NH92 325 aa6.91□□□□□ -1.3
PDE4D-208ENST00000502484 OR10J5Q8NHC4 309 aa6.91□□□□□ -1.3
PDE4D-208ENST00000502484 LHFPL5Q8TAF8 219 aa6.91□□□□□ -1.3
PDE4D-208ENST00000502484 STOML3Q8TAV4 291 aa6.91□□□□□ -1.3
PDE4D-208ENST00000502484 SLC5A7Q9GZV3 580 aa6.91□□□□□ -1.3
PDE4D-208ENST00000502484 TMEM222Q9H0R3 208 aa6.91□□□□□ -1.3
PDE4D-208ENST00000502484 GLS2Q9UI32 602 aa6.91□□□□□ -1.3
PDE4D-208ENST00000502484 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
PDE4D-208ENST00000502484 OR2W1Q9Y3N9 320 aa6.91□□□□□ -1.3
PDE4D-208ENST00000502484 TMED3Q9Y3Q3 217 aa6.91□□□□□ -1.3
PDE4D-208ENST00000502484 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa6.91□□□□□ -1.3
PDE4D-208ENST00000502484 A0A0G2JNJ9 132 aa6.91□□□□□ -1.3
PDE4D-208ENST00000502484 MSGN1A6NI15 193 aa6.91□□□□□ -1.3
PDE4D-208ENST00000502484 A6NLC8 198 aa6.91□□□□□ -1.3
PDE4D-208ENST00000502484 F5H0A9 414 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
PDE4D-208ENST00000502484 WNT9BO14905 357 aa6.91□□□□□ -1.3
PDE4D-208ENST00000502484 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
PDE4D-208ENST00000502484 BMP5P22003 454 aa6.91□□□□□ -1.3
PDE4D-208ENST00000502484 CD200P41217 278 aa6.91□□□□□ -1.3
PDE4D-208ENST00000502484 S100A10P60903 97 aa6.91□□□□□ -1.3
PDE4D-208ENST00000502484 FAM27E3Q08E93 113 aa6.91□□□□□ -1.3
PDE4D-208ENST00000502484 HMGN3Q15651 99 aa6.91□□□□□ -1.3
PDE4D-208ENST00000502484 MRGPRGQ86SM5 289 aa6.91□□□□□ -1.3
PDE4D-208ENST00000502484 PRR7Q8TB68 274 aa6.91□□□□□ -1.3
PDE4D-208ENST00000502484 KIRREL1Q96J84 757 aa6.91□□□□□ -1.3
PDE4D-208ENST00000502484 TMEM56Q96MV1 263 aa6.91□□□□□ -1.3
PDE4D-208ENST00000502484 SLC25A32Q9H2D1 315 aa6.91□□□□□ -1.3
PDE4D-208ENST00000502484 TAAR3PQ9P1P4 343 aa6.91□□□□□ -1.3
PDE4D-208ENST00000502484 Q9UFV3 132 aa6.91□□□□□ -1.3
PDE4D-208ENST00000502484 OR14J1Q9UGF5 321 aa6.91□□□□□ -1.3
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF835Q9Y2P0 537 aa6.91□□□□□ -1.3
PDE4D-208ENST00000502484 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa6.91□□□□□ -1.3
PDE4D-208ENST00000502484 PSPNO60542 156 aa6.9□□□□□ -1.3
PDE4D-208ENST00000502484 DEDDO75618 318 aa6.9□□□□□ -1.3
PDE4D-208ENST00000502484 C1QL1O75973 258 aa6.9□□□□□ -1.3
PDE4D-208ENST00000502484 GFRALQ6UXV0 394 aa6.9□□□□□ -1.3
PDE4D-208ENST00000502484 LRP11Q86VZ4 500 aa6.9□□□□□ -1.3
PDE4D-208ENST00000502484 CMTM1Q8IZ96 169 aa6.9□□□□□ -1.3
PDE4D-208ENST00000502484 MARVELD3Q96A59 401 aa6.9□□□□□ -1.3
PDE4D-208ENST00000502484 SHARPINQ9H0F6 387 aa6.9□□□□□ -1.3
PDE4D-208ENST00000502484 CCL28Q9NRJ3 127 aa6.9□□□□□ -1.3
PDE4D-208ENST00000502484 UFSP2Q9NUQ7 469 aa6.9□□□□□ -1.3
PDE4D-208ENST00000502484 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa6.9□□□□□ -1.3
PDE4D-208ENST00000502484 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
PDE4D-208ENST00000502484 PLCE1Q9P212 2302 aa6.9□□□□□ -1.31
PDE4D-208ENST00000502484 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa6.9□□□□□ -1.31
PDE4D-208ENST00000502484 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.31
PDE4D-208ENST00000502484 IFNL4K9M1U5 179 aa6.9□□□□□ -1.31
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