RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000342018.12

GTF3C5-201, Transcript of general transcription factor IIIC subunit 5, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene GTF3C5, Length 1,905 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C5-201ENST00000342018 BET1O15155 118 aa16.03■□□□□ 0.16
GTF3C5-201ENST00000342018 SPNP16150 400 aa16.03■□□□□ 0.16
GTF3C5-201ENST00000342018 BTCP35070 178 aa16.03■□□□□ 0.16
GTF3C5-201ENST00000342018 TSPAN5P62079 268 aa16.03■□□□□ 0.16
GTF3C5-201ENST00000342018 CDK10Q15131 360 aa16.03■□□□□ 0.16
GTF3C5-201ENST00000342018 TRIM16LQ309B1 348 aa16.03■□□□□ 0.16
GTF3C5-201ENST00000342018 ACTBL2Q562R1 376 aa16.03■□□□□ 0.16
GTF3C5-201ENST00000342018 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
GTF3C5-201ENST00000342018 KIRREL1Q96J84 757 aa16.03■□□□□ 0.16
GTF3C5-201ENST00000342018 SLC6A7Q99884 636 aa16.03■□□□□ 0.16
GTF3C5-201ENST00000342018 PIMREGQ9BSJ6 248 aa16.03■□□□□ 0.16
GTF3C5-201ENST00000342018 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
GTF3C5-201ENST00000342018 NECAP2Q9NVZ3 263 aa16.03■□□□□ 0.16
GTF3C5-201ENST00000342018 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
GTF3C5-201ENST00000342018 NAP1L6A6NFF2 107 aa16.02■□□□□ 0.16
GTF3C5-201ENST00000342018 DISC1C4P0D8 188 aa16.02■□□□□ 0.16
GTF3C5-201ENST00000342018 WNT2P09544 360 aa16.02■□□□□ 0.16
GTF3C5-201ENST00000342018 TBPP20226 339 aa16.02■□□□□ 0.16
GTF3C5-201ENST00000342018 ERP29P30040 261 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
GTF3C5-201ENST00000342018 SSTR5P35346 364 aa16.02■□□□□ 0.16
GTF3C5-201ENST00000342018 PAX5Q02548 391 aa16.02■□□□□ 0.16
GTF3C5-201ENST00000342018 MEF2DQ14814 521 aa16.02■□□□□ 0.16
GTF3C5-201ENST00000342018 ZNF565Q8N9K5 539 aa16.02■□□□□ 0.16
GTF3C5-201ENST00000342018 RFESDQ8TAC1 157 aa16.02■□□□□ 0.16
GTF3C5-201ENST00000342018 C19orf12Q9NSK7 152 aa16.02■□□□□ 0.16
GTF3C5-201ENST00000342018 CLN8Q9UBY8 286 aa16.02■□□□□ 0.16
GTF3C5-201ENST00000342018 APCP25054 2843 aa16.02■□□□□ 0.16
GTF3C5-201ENST00000342018 C12orf77C9JDV5 145 aa16.02■□□□□ 0.15
GTF3C5-201ENST00000342018 PTTG1O95997 202 aa16.02■□□□□ 0.15
GTF3C5-201ENST00000342018 PAX1P15863 534 aa16.02■□□□□ 0.15
GTF3C5-201ENST00000342018 RPL31P62899 125 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.15
GTF3C5-201ENST00000342018 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP16.02■□□□□ 0.15
GTF3C5-201ENST00000342018 C6orf183Q5T699 404 aa16.02■□□□□ 0.15
GTF3C5-201ENST00000342018 ZNF841Q6ZN19 808 aa16.02■□□□□ 0.15
GTF3C5-201ENST00000342018 FAM185AQ8N0U4 392 aa16.02■□□□□ 0.15
GTF3C5-201ENST00000342018 OR1L1Q8NH94 360 aa16.02■□□□□ 0.15
GTF3C5-201ENST00000342018 ARL11Q969Q4 196 aa16.02■□□□□ 0.15
GTF3C5-201ENST00000342018 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa16.02■□□□□ 0.15
GTF3C5-201ENST00000342018 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.15
GTF3C5-201ENST00000342018 OR6C3Q9NZP0 311 aa16.02■□□□□ 0.15
GTF3C5-201ENST00000342018 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa16.01■□□□□ 0.15
GTF3C5-201ENST00000342018 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
GTF3C5-201ENST00000342018 ZNF735P0CB33 412 aa16.01■□□□□ 0.15
GTF3C5-201ENST00000342018 OR5H8P0DN80 308 aa16.01■□□□□ 0.15
GTF3C5-201ENST00000342018 LTC4SQ16873 150 aa16.01■□□□□ 0.15
GTF3C5-201ENST00000342018 DEFB113Q30KQ7 82 aa16.01■□□□□ 0.15
GTF3C5-201ENST00000342018 VAX1Q5SQQ9 334 aa16.01■□□□□ 0.15
GTF3C5-201ENST00000342018 Q6ZS49 121 aa16.01■□□□□ 0.15
GTF3C5-201ENST00000342018 OVCH2Q7RTZ1 564 aa16.01■□□□□ 0.15
GTF3C5-201ENST00000342018 CENPSQ8N2Z9 138 aa16.01■□□□□ 0.15
GTF3C5-201ENST00000342018 C10orf105Q8TEF2 133 aa16.01■□□□□ 0.15
GTF3C5-201ENST00000342018 MGAT4AQ9UM21 535 aa16.01■□□□□ 0.15
GTF3C5-201ENST00000342018 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa16■□□□□ 0.15
GTF3C5-201ENST00000342018 SLC6A1P30531 599 aa16■□□□□ 0.15
GTF3C5-201ENST00000342018 GNB2P62879 340 aa16■□□□□ 0.15
GTF3C5-201ENST00000342018 HERPUD1Q15011 391 aa16■□□□□ 0.15
GTF3C5-201ENST00000342018 OR4A4PQ8NGN8 299 aa16■□□□□ 0.15
GTF3C5-201ENST00000342018 DEDD2Q8WXF8 326 aa16■□□□□ 0.15
GTF3C5-201ENST00000342018 MMP28Q9H239 520 aa16■□□□□ 0.15
GTF3C5-201ENST00000342018 OCEL1Q9H607 264 aa16■□□□□ 0.15
GTF3C5-201ENST00000342018 HECTD1Q9ULT8 2610 aa16■□□□□ 0.15
GTF3C5-201ENST00000342018 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa16■□□□□ 0.15
GTF3C5-201ENST00000342018 HBZP02008 142 aa16■□□□□ 0.15
GTF3C5-201ENST00000342018 IL2RGP31785 369 aa16■□□□□ 0.15
GTF3C5-201ENST00000342018 HMGN3Q15651 99 aa16■□□□□ 0.15
GTF3C5-201ENST00000342018 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
GTF3C5-201ENST00000342018 IDO2Q6ZQW0 420 aa16■□□□□ 0.15
GTF3C5-201ENST00000342018 BTN2A1Q7KYR7 527 aa16■□□□□ 0.15
GTF3C5-201ENST00000342018 LURAP1Q96LR2 239 aa16■□□□□ 0.15
GTF3C5-201ENST00000342018 GINS4Q9BRT9 223 aa16■□□□□ 0.15
GTF3C5-201ENST00000342018 DPAGT1Q9H3H5 408 aa16■□□□□ 0.15
GTF3C5-201ENST00000342018 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
GTF3C5-201ENST00000342018 SLC23A1Q9UHI7 598 aa16■□□□□ 0.15
GTF3C5-201ENST00000342018 hADV38S2A0JD32 116 aa15.99■□□□□ 0.15
GTF3C5-201ENST00000342018 POM121CA8CG34 1229 aa15.99■□□□□ 0.15
GTF3C5-201ENST00000342018 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
GTF3C5-201ENST00000342018 OMGP23515 440 aa15.99■□□□□ 0.15
GTF3C5-201ENST00000342018 ZNF273Q14593 569 aa15.99■□□□□ 0.15
GTF3C5-201ENST00000342018 CLEC12BQ2HXU8 276 aa15.99■□□□□ 0.15
GTF3C5-201ENST00000342018 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
GTF3C5-201ENST00000342018 TCF23Q7RTU1 214 aa15.99■□□□□ 0.15
GTF3C5-201ENST00000342018 CLDND2Q8NHS1 167 aa15.99■□□□□ 0.15
GTF3C5-201ENST00000342018 CHPT1Q8WUD6 406 aa15.99■□□□□ 0.15
GTF3C5-201ENST00000342018 GALMQ96C23 342 aa15.99■□□□□ 0.15
GTF3C5-201ENST00000342018 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
GTF3C5-201ENST00000342018 OR1A1Q9P1Q5 309 aa15.99■□□□□ 0.15
GTF3C5-201ENST00000342018 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa15.99■□□□□ 0.15
GTF3C5-201ENST00000342018 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
GTF3C5-201ENST00000342018 NDUFS8O00217 210 aa15.98■□□□□ 0.15
GTF3C5-201ENST00000342018 SPINT2O43291 252 aa15.98■□□□□ 0.15
GTF3C5-201ENST00000342018 HSPA12AO43301 675 aa15.98■□□□□ 0.15
GTF3C5-201ENST00000342018 GZMHP20718 246 aa15.98■□□□□ 0.15
GTF3C5-201ENST00000342018 FCGR2CP31995 323 aa15.98■□□□□ 0.15
GTF3C5-201ENST00000342018 OXA1LQ15070 435 aa15.98■□□□□ 0.15
GTF3C5-201ENST00000342018 ESCO2Q56NI9 601 aa15.98■□□□□ 0.15
GTF3C5-201ENST00000342018 TMEM200BQ69YZ2 307 aa15.98■□□□□ 0.15
GTF3C5-201ENST00000342018 TMEM17Q86X19 198 aa15.98■□□□□ 0.15
GTF3C5-201ENST00000342018 OR6F1Q8NGZ6 308 aa15.98■□□□□ 0.15
GTF3C5-201ENST00000342018 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
GTF3C5-201ENST00000342018 CALYQ9NYX4 217 aa15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.6 ms