RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368547.3

ECHS1-201, Transcript of enoyl-CoA hydratase, short chain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ECHS1, Length 1,617 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1-201ENST00000368547 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa24.64■■□□□ 1.53
ECHS1-201ENST00000368547 CENPXA8MT69 81 aa24.64■■□□□ 1.53
ECHS1-201ENST00000368547 SH2D1BO14796 132 aa24.64■■□□□ 1.53
ECHS1-201ENST00000368547 ADAM20O43506 726 aa24.64■■□□□ 1.53
ECHS1-201ENST00000368547 GNB3P16520 340 aa24.64■■□□□ 1.53
ECHS1-201ENST00000368547 IKZF1Q13422 519 aa24.64■■□□□ 1.53
ECHS1-201ENST00000368547 CLDND2Q8NHS1 167 aa24.64■■□□□ 1.53
ECHS1-201ENST00000368547 GAFA1Q96PS6 74 aa24.64■■□□□ 1.53
ECHS1-201ENST00000368547 DNTTIP1Q9H147 329 aa24.64■■□□□ 1.53
ECHS1-201ENST00000368547 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP24.64■■□□□ 1.53
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF581Q9P0T4 197 aa24.64■■□□□ 1.53
ECHS1-201ENST00000368547 METRNQ9UJH8 293 aa24.64■■□□□ 1.53
ECHS1-201ENST00000368547 AKAP9Q99996 3911 aa24.64■■□□□ 1.53
ECHS1-201ENST00000368547 A0A1B0GW55 424 aa24.63■■□□□ 1.53
ECHS1-201ENST00000368547 NKX6-3A6NJ46 265 aa24.63■■□□□ 1.53
ECHS1-201ENST00000368547 SERPINE3A8MV23 424 aa24.63■■□□□ 1.53
ECHS1-201ENST00000368547 DUX4L2P0CJ85 424 aa24.63■■□□□ 1.53
ECHS1-201ENST00000368547 DUX4L3P0CJ86 424 aa24.63■■□□□ 1.53
ECHS1-201ENST00000368547 DUX4L4P0CJ87 422 aa24.63■■□□□ 1.53
ECHS1-201ENST00000368547 DUX4L5P0CJ88 424 aa24.63■■□□□ 1.53
ECHS1-201ENST00000368547 DUX4L6P0CJ89 424 aa24.63■■□□□ 1.53
ECHS1-201ENST00000368547 DUX4L7P0CJ90 424 aa24.63■■□□□ 1.53
ECHS1-201ENST00000368547 GABRR1P24046 479 aa24.63■■□□□ 1.53
ECHS1-201ENST00000368547 Q6P435 159 aa24.63■■□□□ 1.53
ECHS1-201ENST00000368547 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP24.63■■□□□ 1.53
ECHS1-201ENST00000368547 NRARPQ7Z6K4 114 aa24.63■■□□□ 1.53
ECHS1-201ENST00000368547 LINC00596Q86U02 117 aa24.63■■□□□ 1.53
ECHS1-201ENST00000368547 FAM216BQ8N7L0 139 aa24.63■■□□□ 1.53
ECHS1-201ENST00000368547 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa24.63■■□□□ 1.53
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF665Q9H7R5 613 aa24.63■■□□□ 1.53
ECHS1-201ENST00000368547 DUX4Q9UBX2 424 aa24.63■■□□□ 1.53
ECHS1-201ENST00000368547 KCNK7Q9Y2U2 307 aa24.63■■□□□ 1.53
ECHS1-201ENST00000368547 CYSRT1A8MQ03 144 aa24.62■■□□□ 1.53
ECHS1-201ENST00000368547 H3BUI4 141 aa24.62■■□□□ 1.53
ECHS1-201ENST00000368547 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
ECHS1-201ENST00000368547 OR2H2O95918 312 aa24.62■■□□□ 1.53
ECHS1-201ENST00000368547 CSF1P09603 554 aa24.62■■□□□ 1.53
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF44P15621 663 aa24.62■■□□□ 1.53
ECHS1-201ENST00000368547 RPS2P15880 293 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
ECHS1-201ENST00000368547 GUCA2AQ02747 115 aa24.62■■□□□ 1.53
ECHS1-201ENST00000368547 COL10A1Q03692 680 aa24.62■■□□□ 1.53
ECHS1-201ENST00000368547 SDSLQ96GA7 329 aa24.62■■□□□ 1.53
ECHS1-201ENST00000368547 PECRQ9BY49 303 aa24.62■■□□□ 1.53
ECHS1-201ENST00000368547 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
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ECHS1-201ENST00000368547 CTSZQ9UBR2 303 aa24.62■■□□□ 1.53
ECHS1-201ENST00000368547 MIOXQ9UGB7 285 aa24.62■■□□□ 1.53
ECHS1-201ENST00000368547 MAB21L2Q9Y586 359 aa24.62■■□□□ 1.53
ECHS1-201ENST00000368547 SIRPB1O00241 398 aa24.61■■□□□ 1.53
ECHS1-201ENST00000368547 DEGS1O15121 323 aa24.61■■□□□ 1.53
ECHS1-201ENST00000368547 MPV17LQ2QL34 196 aa24.61■■□□□ 1.53
ECHS1-201ENST00000368547 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa24.61■■□□□ 1.53
ECHS1-201ENST00000368547 ZNRF1Q8ND25 227 aa24.61■■□□□ 1.53
ECHS1-201ENST00000368547 ST8SIA4Q92187 359 aa24.61■■□□□ 1.53
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ECHS1-201ENST00000368547 RNF223E7ERA6 249 aa24.61■■□□□ 1.53
ECHS1-201ENST00000368547 SELLP14151 372 aa24.61■■□□□ 1.53
ECHS1-201ENST00000368547 USF1P22415 310 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
ECHS1-201ENST00000368547 IL13RA1P78552 427 aa24.61■■□□□ 1.53
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ECHS1-201ENST00000368547 ZNF561Q8N587 486 aa24.61■■□□□ 1.53
ECHS1-201ENST00000368547 A0A1B0GVG6 124 aa24.6■■□□□ 1.53
ECHS1-201ENST00000368547 NAP1L6A6NFF2 107 aa24.6■■□□□ 1.53
ECHS1-201ENST00000368547 SIGLEC5O15389 551 aa24.6■■□□□ 1.53
ECHS1-201ENST00000368547 IGHV2-5P01817 119 aa24.6■■□□□ 1.53
ECHS1-201ENST00000368547 WNT2P09544 360 aa24.6■■□□□ 1.53
ECHS1-201ENST00000368547 GNG2P59768 71 aa24.6■■□□□ 1.53
ECHS1-201ENST00000368547 DUSP18Q8NEJ0 188 aa24.6■■□□□ 1.53
ECHS1-201ENST00000368547 MED30Q96HR3 178 aa24.6■■□□□ 1.53
ECHS1-201ENST00000368547 REG4Q9BYZ8 158 aa24.6■■□□□ 1.53
ECHS1-201ENST00000368547 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
ECHS1-201ENST00000368547 A0A096LNT2 108 aa24.59■■□□□ 1.53
ECHS1-201ENST00000368547 CHATP28329 748 aa24.59■■□□□ 1.53
ECHS1-201ENST00000368547 LMO4P61968 165 aa24.59■■□□□ 1.53
ECHS1-201ENST00000368547 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
ECHS1-201ENST00000368547 NLRC3Q7RTR2 1065 aa24.59■■□□□ 1.53
ECHS1-201ENST00000368547 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
ECHS1-201ENST00000368547 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
ECHS1-201ENST00000368547 NEDD4LQ96PU5 975 aa24.59■■□□□ 1.53
ECHS1-201ENST00000368547 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa24.59■■□□□ 1.53
ECHS1-201ENST00000368547 F5H0A9 414 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.53
ECHS1-201ENST00000368547 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.53
ECHS1-201ENST00000368547 LMO1P25800 156 aa24.58■■□□□ 1.53
ECHS1-201ENST00000368547 RCVRNP35243 200 aa24.58■■□□□ 1.53
ECHS1-201ENST00000368547 CBX5P45973 191 aa24.58■■□□□ 1.53
ECHS1-201ENST00000368547 ATAD3CQ5T2N8 411 aa24.58■■□□□ 1.53
ECHS1-201ENST00000368547 OLFML2AQ68BL7 652 aa24.58■■□□□ 1.53
ECHS1-201ENST00000368547 OR8B3Q8NGG8 313 aa24.58■■□□□ 1.53
ECHS1-201ENST00000368547 ENKURQ8TC29 256 aa24.58■■□□□ 1.53
ECHS1-201ENST00000368547 OR8B2Q96RD0 313 aa24.58■■□□□ 1.53
ECHS1-201ENST00000368547 IFT22Q9H7X7 185 aa24.58■■□□□ 1.53
ECHS1-201ENST00000368547 MYO9AB2RTY4 2548 aa24.58■■□□□ 1.52
ECHS1-201ENST00000368547 TRAV24A0A0B4J272 114 aa24.57■■□□□ 1.52
ECHS1-201ENST00000368547 PSPNO60542 156 aa24.57■■□□□ 1.52
ECHS1-201ENST00000368547 PDCD6O75340 191 aa24.57■■□□□ 1.52
ECHS1-201ENST00000368547 SLC6A1P30531 599 aa24.57■■□□□ 1.52
ECHS1-201ENST00000368547 IL2RGP31785 369 aa24.57■■□□□ 1.52
ECHS1-201ENST00000368547 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
ECHS1-201ENST00000368547 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa24.57■■□□□ 1.52
ECHS1-201ENST00000368547 TMEM229BQ8NBD8 167 aa24.57■■□□□ 1.52
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