RNA–Protein interactions for RNA: YPR175W

DPB2, Transcript of Second largest subunit of DNA polymerase II (DNA polymerase epsilon), yeastyeast

Gene DPB2, Length 2,070 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DPB2YPR175W PLB2Q03674 706 aa6.72□□□□□ -1.33
DPB2YPR175W SGD1Q06132 899 aa6.72□□□□□ -1.33
DPB2YPR175W ADY3Q07732 790 aa6.72□□□□□ -1.33
DPB2YPR175W CHS2P14180 963 aa6.72□□□□□ -1.33
DPB2YPR175W MET8P15807 274 aa6.72□□□□□ -1.33
DPB2YPR175W AAC3P18238 307 aa6.72□□□□□ -1.33
DPB2YPR175W UBC1P21734 215 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
DPB2YPR175W APN2P38207 520 aa6.72□□□□□ -1.33
DPB2YPR175W CDS1P38221 457 aa6.72□□□□□ -1.33
DPB2YPR175W BFA1P47113 574 aa6.72□□□□□ -1.33
DPB2YPR175W MTR3P48240 250 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
DPB2YPR175W AI1P03875 834 aa6.71□□□□□ -1.34
DPB2YPR175W RMA1P36001 430 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
DPB2YPR175W SDS22P36047 338 aa6.71□□□□□ -1.34
DPB2YPR175W ASI2P53895 289 aa6.71□□□□□ -1.34
DPB2YPR175W RSM24Q03976 319 aa6.71□□□□□ -1.34
DPB2YPR175W SNU66Q12420 587 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
DPB2YPR175W GAL10P04397 699 aa6.7□□□□□ -1.34
DPB2YPR175W ERG6P25087 383 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
DPB2YPR175W XRS2P33301 854 aa6.7□□□□□ -1.34
DPB2YPR175W VHR1P40522 640 aa6.7□□□□□ -1.34
DPB2YPR175W YDL183CP48569 320 aa6.7□□□□□ -1.34
DPB2YPR175W EXG2P52911 562 aa6.7□□□□□ -1.34
DPB2YPR175W ARG5,6Q01217 863 aa6.7□□□□□ -1.34
DPB2YPR175W MRPL13Q02204 264 aa6.7□□□□□ -1.34
DPB2YPR175W ARA2Q04212 335 aa6.7□□□□□ -1.34
DPB2YPR175W CYC1P00044 109 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
DPB2YPR175W FRS1P15624 595 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
DPB2YPR175W SIR1P21691 654 aa6.7□□□□□ -1.34
DPB2YPR175W PAH1P32567 862 aa6.7□□□□□ -1.34
DPB2YPR175W YHR112CP38716 378 aa6.7□□□□□ -1.34
DPB2YPR175W GCV2P49095 1034 aa6.7□□□□□ -1.34
DPB2YPR175W MRPS35P53292 345 aa6.7□□□□□ -1.34
DPB2YPR175W VHS3Q08438 674 aa6.7□□□□□ -1.34
DPB2YPR175W GAR1P28007 205 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
DPB2YPR175W PRE4P30657 266 aa6.69□□□□□ -1.34
DPB2YPR175W PEF1P53238 335 aa6.69□□□□□ -1.34
DPB2YPR175W ACS1Q01574 713 aa6.69□□□□□ -1.34
DPB2YPR175W RGC1Q06108 1083 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
DPB2YPR175W PHO5P00635 467 aa6.69□□□□□ -1.34
DPB2YPR175W PYC1P11154 1178 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
DPB2YPR175W POL3P15436 1097 aa6.69□□□□□ -1.34
DPB2YPR175W ARG1P22768 420 aa6.69□□□□□ -1.34
DPB2YPR175W SEC21P32074 935 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
DPB2YPR175W PET127P32606 800 aa6.69□□□□□ -1.34
DPB2YPR175W SRB7P47822 140 aa6.69□□□□□ -1.34
DPB2YPR175W YGR035CP53222 116 aa6.69□□□□□ -1.34
DPB2YPR175W ORC4P54791 529 aa6.69□□□□□ -1.34
DPB2YPR175W YKU80Q04437 629 aa6.69□□□□□ -1.34
DPB2YPR175W TPO1Q07824 586 aa6.69□□□□□ -1.34
DPB2YPR175W URA3P03962 267 aa6.68□□□□□ -1.34
DPB2YPR175W CBF2P32504 956 aa6.68□□□□□ -1.34
DPB2YPR175W NOP16P40007 231 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
DPB2YPR175W YER010CP40011 234 aa6.68□□□□□ -1.34
DPB2YPR175W RAD26P40352 1085 aa6.68□□□□□ -1.34
DPB2YPR175W CTF18P49956 741 aa6.68□□□□□ -1.34
DPB2YPR175W TAF4P50105 388 aa6.68□□□□□ -1.34
DPB2YPR175W YMR018WQ04364 514 aa6.68□□□□□ -1.34
DPB2YPR175W THI72Q08579 599 aa6.68□□□□□ -1.34
DPB2YPR175W YLR122CQ12312 125 aa6.68□□□□□ -1.34
DPB2YPR175W VPS5Q92331 675 aa6.68□□□□□ -1.34
DPB2YPR175W ADE3P07245 946 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
DPB2YPR175W CDC6P09119 513 aa6.67□□□□□ -1.34
DPB2YPR175W RIC1P40395 1056 aa6.67□□□□□ -1.34
DPB2YPR175W RGA2Q06407 1009 aa6.67□□□□□ -1.34
DPB2YPR175W IWR1Q07532 353 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
DPB2YPR175W MCA1Q08601 432 aa6.67□□□□□ -1.34
DPB2YPR175W PCD1Q12524 340 aa6.67□□□□□ -1.34
DPB2YPR175W NUC1P08466 329 aa6.67□□□□□ -1.34
DPB2YPR175W CLB4P24871 460 aa6.67□□□□□ -1.34
DPB2YPR175W SSP120P39931 234 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
DPB2YPR175W PRP31P49704 494 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
DPB2YPR175W NCS6P53088 359 aa6.67□□□□□ -1.34
DPB2YPR175W SIC1P38634 284 aa6.66□□□□□ -1.34
DPB2YPR175W YHR033WP38690 423 aa6.66□□□□□ -1.34
DPB2YPR175W PZF1P39933 429 aa6.66□□□□□ -1.34
DPB2YPR175W YEL068CP39977 110 aa6.66□□□□□ -1.34
DPB2YPR175W NSE5Q03718 556 aa6.66□□□□□ -1.34
DPB2YPR175W TSR2Q06672 205 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
DPB2YPR175W SLC1P33333 303 aa6.65□□□□□ -1.34
DPB2YPR175W LRG1P35688 1017 aa6.65□□□□□ -1.34
DPB2YPR175W YLF2P38746 405 aa6.65□□□□□ -1.34
DPB2YPR175W PRM2P40534 656 aa6.65□□□□□ -1.34
DPB2YPR175W BIT61P47041 543 aa6.65□□□□□ -1.34
DPB2YPR175W TIM10P87108 93 aa6.65□□□□□ -1.34
DPB2YPR175W ATG11Q12527 1178 aa6.65□□□□□ -1.34
DPB2YPR175W MSB1P21339 1137 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
DPB2YPR175W SEG2P34250 1132 aa6.65□□□□□ -1.35
DPB2YPR175W ATG19P35193 415 aa6.65□□□□□ -1.35
DPB2YPR175W MET12P46151 657 aa6.65□□□□□ -1.35
DPB2YPR175W PSP2P50109 593 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
DPB2YPR175W CWH43P25618 953 aa6.64□□□□□ -1.35
DPB2YPR175W BCD1P38772 366 aa6.64□□□□□ -1.35
DPB2YPR175W ENP2P48234 707 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
DPB2YPR175W AAD4Q07747 329 aa6.64□□□□□ -1.35
DPB2YPR175W YDL177CQ12257 170 aa6.64□□□□□ -1.35
DPB2YPR175W HRP1Q99383 534 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
DPB2YPR175W YLR415CO13578 112 aa6.64□□□□□ -1.35
DPB2YPR175W TOS1P38288 455 aa6.64□□□□□ -1.35
DPB2YPR175W CRG1P38892 291 aaRIP-Chip data6.64□□□□□ -1.35not detected
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