RNA–Protein interactions for RNA: YOR168W

GLN4, Transcript of Glutamine tRNA synthetase, yeast

Gene GLN4, Length 2,430 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
GLN4	YOR168W	SPB1	P25582	841 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
GLN4	YOR168W	GCS1	P35197	352 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GLN4	YOR168W	TEF4	P36008	412 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
GLN4	YOR168W	EMC3	P36039	253 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GLN4	YOR168W	STU2	P46675	888 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GLN4	YOR168W	LYS4	P49367	693 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
GLN4	YOR168W	RRN5	Q02983	363 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GLN4	YOR168W	YHM2	Q04013	314 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GLN4	YOR168W	ENV7	Q12003	364 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GLN4	YOR168W	TY1A-GR1	Q12085	440 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GLN4	YOR168W	PCD1	Q12524	340 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GLN4	YOR168W	TY1A-PR3	Q6Q5H1	440 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
GLN4	YOR168W	TY1A-OL	Q92392	440 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
GLN4	YOR168W	DED1	P06634	604 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
GLN4	YOR168W	NUC1	P08466	329 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GLN4	YOR168W	CDC26	P14724	124 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GLN4	YOR168W	MER1	P16523	270 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GLN4	YOR168W	HCA4	P20448	770 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
GLN4	YOR168W	RSC6	P25632	483 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GLN4	YOR168W	SMI1	P32566	505 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GLN4	YOR168W	SAC6	P32599	642 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
GLN4	YOR168W	PGM2	P37012	569 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
GLN4	YOR168W	SWD1	P39706	426 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GLN4	YOR168W	RRN7	P40992	514 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GLN4	YOR168W	IRC5	P43610	853 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GLN4	YOR168W	UBC9	P50623	157 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
GLN4	YOR168W	LSB1	P53281	241 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GLN4	YOR168W	TAP42	Q04372	366 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GLN4	YOR168W	ATG38	Q05789	226 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
GLN4	YOR168W	EST2	Q06163	884 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GLN4	YOR168W	CTT1	P06115	562 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GLN4	YOR168W	YCK2	P23292	546 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
GLN4	YOR168W	MCM3	P24279	971 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
GLN4	YOR168W	RRP43	P25359	394 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
GLN4	YOR168W	PER1	P25625	357 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GLN4	YOR168W	VPS17	P32913	551 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GLN4	YOR168W	WHI3	P34761	661 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
GLN4	YOR168W	CTF13	P35203	478 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GLN4	YOR168W	VRP1	P37370	817 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GLN4	YOR168W	STT3	P39007	718 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
GLN4	YOR168W	MRX1	P40050	688 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GLN4	YOR168W	MKT1	P40850	830 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
GLN4	YOR168W	THI6	P41835	540 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GLN4	YOR168W	YFL052W	P43551	465 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GLN4	YOR168W	DSD1	P53095	428 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GLN4	YOR168W	YGR130C	P53278	816 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GLN4	YOR168W	YAP6	Q03935	383 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GLN4	YOR168W	ERB1	Q04660	807 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
GLN4	YOR168W	AIM32	Q04689	311 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GLN4	YOR168W	MCP2	Q06567	569 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GLN4	YOR168W	PCL8	Q08966	492 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GLN4	YOR168W	MGM1	P32266	881 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GLN4	YOR168W	SUR1	P33300	382 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GLN4	YOR168W	SHM1	P37292	490 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
GLN4	YOR168W	UTP9	P38882	575 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
GLN4	YOR168W	VNX1	P42839	908 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GLN4	YOR168W	BNA2	P47125	453 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GLN4	YOR168W	MRX6	P48564	524 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GLN4	YOR168W	UTP22	P53254	1237 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
GLN4	YOR168W	REX2	P54964	269 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
GLN4	YOR168W	TOF2	Q02208	771 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GLN4	YOR168W	PML39	Q03760	334 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GLN4	YOR168W	DUS3	Q06053	668 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
GLN4	YOR168W	CSR1	Q06705	408 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
GLN4	YOR168W	CWC2	Q12046	339 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
GLN4	YOR168W	GCN4	P03069	281 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GLN4	YOR168W	ACO1	P19414	778 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.53	□□□□□ -1.68	not detected
GLN4	YOR168W	DBP2	P24783	546 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
GLN4	YOR168W	CYS3	P31373	394 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
GLN4	YOR168W	CDC12	P32468	407 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
GLN4	YOR168W	RPT3	P33298	428 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
GLN4	YOR168W	ADH5	P38113	351 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
GLN4	YOR168W	PNT1	P38969	423 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GLN4	YOR168W	SCS2	P40075	244 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
GLN4	YOR168W	ARF3	P40994	183 aa	RIP-Chip data	4.53	□□□□□ -1.68	not detected
GLN4	YOR168W	SHE4	P51534	789 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GLN4	YOR168W	DUO1	P53168	247 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
GLN4	YOR168W	FRK1	Q03002	865 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
GLN4	YOR168W	FCP1	Q03254	732 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GLN4	YOR168W	GNT1	Q12096	491 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GLN4	YOR168W	TPK1	P06244	397 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GLN4	YOR168W	CAF20	P12962	161 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
GLN4	YOR168W	RPL5	P26321	297 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
GLN4	YOR168W	SMY1	P32364	656 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
GLN4	YOR168W	SFA1	P32771	386 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GLN4	YOR168W	POL12	P38121	705 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
GLN4	YOR168W	ETP1	P38748	585 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
GLN4	YOR168W	PSD1	P39006	500 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GLN4	YOR168W	UBP7	P40453	1071 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GLN4	YOR168W	PKP1	P40530	394 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GLN4	YOR168W	UTP5	Q04177	643 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
GLN4	YOR168W	PML1	Q07930	204 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
GLN4	YOR168W	SPE3	Q12074	293 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
GLN4	YOR168W	SUI3	P09064	285 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
GLN4	YOR168W	CWH43	P25618	953 aa		4.52	□□□□□ -1.69
GLN4	YOR168W	YJU2	P28320	278 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
GLN4	YOR168W	REC104	P33323	182 aa		4.52	□□□□□ -1.69
GLN4	YOR168W	MKS1	P34072	584 aa		4.52	□□□□□ -1.69
GLN4	YOR168W	PEX32	P38292	413 aa		4.52	□□□□□ -1.69
GLN4	YOR168W	NEM1	P38757	446 aa		4.52	□□□□□ -1.69

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