RNA–Protein interactions for RNA: YGL174W

BUD13, Transcript of Subunit of the RES complex, yeast

Gene BUD13, Length 801 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
BUD13	YGL174W	ARK1	P53974	638 aa		4.61	□□□□□ -1.67
BUD13	YGL174W	TIM8	P57744	87 aa		4.61	□□□□□ -1.67
BUD13	YGL174W	UBP3	Q01477	912 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.61	□□□□□ -1.67	RIP-Chip
BUD13	YGL174W	SPO71	Q03868	1245 aa		4.61	□□□□□ -1.67
BUD13	YGL174W	WHI4	Q07655	649 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
BUD13	YGL174W	RLP24	Q07915	199 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
BUD13	YGL174W	RKM4	Q12504	494 aa		4.61	□□□□□ -1.67
BUD13	YGL174W	YLR462W	O13556	202 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BUD13	YGL174W	PGK1	P00560	416 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
BUD13	YGL174W	RAD18	P10862	487 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BUD13	YGL174W	HPR1	P17629	752 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
BUD13	YGL174W	PRP9	P19736	530 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
BUD13	YGL174W	DBP5	P20449	482 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
BUD13	YGL174W	PRE10	P21242	288 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.6	□□□□□ -1.67	not detected
BUD13	YGL174W	ISC10	P32645	267 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BUD13	YGL174W	TRZ1	P36159	838 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
BUD13	YGL174W	EXO5	P38289	585 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BUD13	YGL174W	HIS2	P38635	335 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BUD13	YGL174W	YHL049C	P38722	271 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BUD13	YGL174W	SAK1	P38990	1142 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BUD13	YGL174W	ACA1	P39970	489 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BUD13	YGL174W	YEL075C	P39972	122 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BUD13	YGL174W	YER189W	P40104	122 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BUD13	YGL174W	FIS1	P40515	155 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BUD13	YGL174W	YFL064C	P43540	174 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BUD13	YGL174W	BRO1	P48582	844 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BUD13	YGL174W	RIM8	P53179	542 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BUD13	YGL174W	ENV11	P53246	860 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BUD13	YGL174W	ALD6	P54115	500 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
BUD13	YGL174W	EEB1	Q02891	456 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BUD13	YGL174W	CUR1	Q06469	252 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BUD13	YGL174W	YBL111C	Q3E7Y5	667 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BUD13	YGL174W	SNF1	P06782	633 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
BUD13	YGL174W	CBP1	P07252	654 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BUD13	YGL174W	CDC33	P07260	213 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
BUD13	YGL174W	GCD1	P09032	578 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
BUD13	YGL174W	SAM1	P10659	382 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
BUD13	YGL174W	PYC1	P11154	1178 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
BUD13	YGL174W	FUS1	P11710	512 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BUD13	YGL174W	YCR015C	P25616	317 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BUD13	YGL174W	KIP1	P28742	1111 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BUD13	YGL174W	YSC83	P32792	385 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BUD13	YGL174W	SQT1	P35184	431 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BUD13	YGL174W	OAF3	P36023	863 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BUD13	YGL174W	POL12	P38121	705 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
BUD13	YGL174W	ECM2	P38241	364 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
BUD13	YGL174W	RRT2	P38332	387 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BUD13	YGL174W	TIF5	P38431	405 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
BUD13	YGL174W	SPC72	P39723	622 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BUD13	YGL174W	SAP185	P40856	1058 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BUD13	YGL174W	NMD5	P46970	1048 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BUD13	YGL174W	YGL039W	P53183	348 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
BUD13	YGL174W	CPR6	P53691	371 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
BUD13	YGL174W	UTP6	Q02354	440 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
BUD13	YGL174W	YML037C	Q03703	340 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BUD13	YGL174W	USA1	Q03714	838 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BUD13	YGL174W	TDA9	Q04545	1251 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BUD13	YGL174W	TMA64	Q04600	565 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
BUD13	YGL174W	YDR338C	Q05497	695 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BUD13	YGL174W	SVF1	Q05515	481 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BUD13	YGL174W	DON1	Q05610	365 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BUD13	YGL174W	PHM6	Q05637	104 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BUD13	YGL174W	PNP1	Q05788	311 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BUD13	YGL174W	PIG1	Q06216	648 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BUD13	YGL174W	GIC2	Q06648	383 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BUD13	YGL174W	CRD1	Q07560	283 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BUD13	YGL174W	SLX4	Q12098	748 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BUD13	YGL174W	SEY1	Q99287	776 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BUD13	YGL174W	RPS9B	P05755	195 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
BUD13	YGL174W	ADH4	P10127	382 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BUD13	YGL174W	TCP1	P12612	559 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
BUD13	YGL174W	POL3	P15436	1097 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BUD13	YGL174W	PRP16	P15938	1071 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
BUD13	YGL174W	CDC10	P25342	322 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
BUD13	YGL174W	ILV6	P25605	309 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
BUD13	YGL174W	CDC48	P25694	835 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
BUD13	YGL174W	SEC21	P32074	935 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
BUD13	YGL174W	CDC11	P32458	415 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BUD13	YGL174W	GCD6	P32501	712 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
BUD13	YGL174W	MUD1	P32605	298 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
BUD13	YGL174W	RRN6	P32786	894 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BUD13	YGL174W	TFC4	P33339	1025 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BUD13	YGL174W	TGL1	P34163	548 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BUD13	YGL174W	ATG19	P35193	415 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BUD13	YGL174W	PBP2	P38151	413 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.58	□□□□□ -1.68	not detected
BUD13	YGL174W	YSW1	P38280	609 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BUD13	YGL174W	UBX7	P38349	436 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BUD13	YGL174W	ERC1	P38767	581 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BUD13	YGL174W	MRX1	P40050	688 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BUD13	YGL174W	SMX2	P40204	77 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
BUD13	YGL174W	INA22	P40576	216 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BUD13	YGL174W	URB2	P47108	1174 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BUD13	YGL174W	CTR1	P49573	406 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BUD13	YGL174W	HUL5	P53119	910 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BUD13	YGL174W	ZPR1	P53303	486 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
BUD13	YGL174W	YDR278C	Q05612	105 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BUD13	YGL174W	HIF1	Q12373	385 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BUD13	YGL174W	DFG16	Q99234	619 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BUD13	YGL174W	RPB2	P08518	1224 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
BUD13	YGL174W	KAR3	P17119	729 aa		4.57	□□□□□ -1.68

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