RNA–Protein interactions for RNA: YFR056C

YFR056C, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YFR056C, Length 369 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YFR056CYFR056C VPS34P22543 875 aa2.92□□□□□ -1.94
YFR056CYFR056C BCS1P32839 456 aa2.92□□□□□ -1.94
YFR056CYFR056C MUP3P38734 546 aa2.92□□□□□ -1.94
YFR056CYFR056C GID8P40208 455 aa2.92□□□□□ -1.94
YFR056CYFR056C RSC8P43609 557 aaKnown RBP2.92□□□□□ -1.94
YFR056CYFR056C SET2P46995 733 aaKnown RBP2.92□□□□□ -1.94
YFR056CYFR056C PMT3P47190 753 aa2.92□□□□□ -1.94
YFR056CYFR056C MRK1P50873 501 aa2.92□□□□□ -1.94
YFR056CYFR056C YGR151CP53287 111 aa2.92□□□□□ -1.94
YFR056CYFR056C GPD1Q00055 391 aaKnown RBP2.92□□□□□ -1.94
YFR056CYFR056C HMO1Q03973 246 aaKnown RBP2.92□□□□□ -1.94
YFR056CYFR056C RGC1Q06108 1083 aaKnown RBP2.92□□□□□ -1.94
YFR056CYFR056C FAP7Q12055 197 aaPredicted RBP2.92□□□□□ -1.94
YFR056CYFR056C MRC1P25588 1096 aa2.91□□□□□ -1.94
YFR056CYFR056C SEC6P32844 805 aa2.91□□□□□ -1.94
YFR056CYFR056C SET3P36124 751 aa2.91□□□□□ -1.94
YFR056CYFR056C APL3P38065 1025 aa2.91□□□□□ -1.94
YFR056CYFR056C BIT2P38346 545 aa2.91□□□□□ -1.94
YFR056CYFR056C PAF1P38351 445 aa2.91□□□□□ -1.94
YFR056CYFR056C YNL195CP40168 261 aa2.91□□□□□ -1.94
YFR056CYFR056C GLO1P50107 326 aa2.91□□□□□ -1.94
YFR056CYFR056C GPG1P53130 126 aa2.91□□□□□ -1.94
YFR056CYFR056C SEC5P89102 971 aa2.91□□□□□ -1.94
YFR056CYFR056C COG8Q04632 607 aa2.91□□□□□ -1.94
YFR056CYFR056C THI22Q06490 572 aa2.91□□□□□ -1.94
YFR056CYFR056C YDL086WQ07505 273 aa2.91□□□□□ -1.94
YFR056CYFR056C ISA1Q07821 250 aaPredicted RBP2.91□□□□□ -1.94
YFR056CYFR056C YLR001CQ07895 862 aa2.91□□□□□ -1.94
YFR056CYFR056C YAP7Q08182 245 aa2.91□□□□□ -1.94
YFR056CYFR056C CHS5Q12114 671 aaKnown RBP2.91□□□□□ -1.94
YFR056CYFR056C ICT1Q12385 394 aa2.91□□□□□ -1.94
YFR056CYFR056C ERG20P08524 352 aaKnown RBP2.9□□□□□ -1.95
YFR056CYFR056C STE12P13574 688 aa2.9□□□□□ -1.95
YFR056CYFR056C MIH1P23748 554 aa2.9□□□□□ -1.95
YFR056CYFR056C PCL2P25693 308 aa2.9□□□□□ -1.95
YFR056CYFR056C NTH1P32356 751 aa2.9□□□□□ -1.95
YFR056CYFR056C YEL1P34225 687 aa2.9□□□□□ -1.95
YFR056CYFR056C MNN4P36044 1178 aa2.9□□□□□ -1.95
YFR056CYFR056C YKR075CP36155 307 aa2.9□□□□□ -1.95
YFR056CYFR056C KSP1P38691 1029 aaKnown RBP2.9□□□□□ -1.95
YFR056CYFR056C AIM14P53109 570 aa2.9□□□□□ -1.95
YFR056CYFR056C ARP4P80428 489 aa2.9□□□□□ -1.95
YFR056CYFR056C FMP30Q02883 468 aa2.9□□□□□ -1.95
YFR056CYFR056C GIN4Q12263 1142 aa2.9□□□□□ -1.95
YFR056CYFR056C SAT4P25333 603 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
YFR056CYFR056C SWE1P32944 819 aa2.89□□□□□ -1.95
YFR056CYFR056C TYS1P36421 394 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
YFR056CYFR056C ENP1P38333 483 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
YFR056CYFR056C MPS3P47069 682 aa2.89□□□□□ -1.95
YFR056CYFR056C PEX8P53248 589 aa2.89□□□□□ -1.95
YFR056CYFR056C BRE5P53741 515 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
YFR056CYFR056C LEE1Q02799 301 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
YFR056CYFR056C RIM13Q03792 727 aa2.89□□□□□ -1.95
YFR056CYFR056C SND1Q04007 877 aa2.89□□□□□ -1.95
YFR056CYFR056C SEG1Q04279 960 aa2.89□□□□□ -1.95
YFR056CYFR056C ATG33Q06485 197 aa2.89□□□□□ -1.95
YFR056CYFR056C BMS1Q08965 1183 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
YFR056CYFR056C RPS9BP05755 195 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
YFR056CYFR056C ADE5,7P07244 802 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
YFR056CYFR056C ERG11P10614 530 aa2.88□□□□□ -1.95
YFR056CYFR056C PTP1P25044 335 aa2.88□□□□□ -1.95
YFR056CYFR056C FEN2P25621 512 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
YFR056CYFR056C TMT1P32643 299 aa2.88□□□□□ -1.95
YFR056CYFR056C CTP1P38152 299 aa2.88□□□□□ -1.95
YFR056CYFR056C SSZ1P38788 538 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
YFR056CYFR056C YHR097CP38809 366 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
YFR056CYFR056C YHR202WP38887 602 aa2.88□□□□□ -1.95
YFR056CYFR056C PMC1P38929 1173 aaPredicted RBP2.88□□□□□ -1.95
YFR056CYFR056C YIL077CP40508 320 aa2.88□□□□□ -1.95
YFR056CYFR056C BFA1P47113 574 aa2.88□□□□□ -1.95
YFR056CYFR056C NMA2P53204 395 aa2.88□□□□□ -1.95
YFR056CYFR056C SUB1P54000 292 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
YFR056CYFR056C YSH1Q06224 779 aaPredicted RBP2.88□□□□□ -1.95
YFR056CYFR056C VHS3Q08438 674 aa2.88□□□□□ -1.95
YFR056CYFR056C OSW1Q08692 278 aa2.88□□□□□ -1.95
YFR056CYFR056C MDM20Q12387 796 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
YFR056CYFR056C POM34Q12445 299 aa2.88□□□□□ -1.95
YFR056CYFR056C LAM4P38800 1345 aa2.88□□□□□ -1.95
YFR056CYFR056C HMG1P12683 1054 aa2.87□□□□□ -1.95
YFR056CYFR056C YEF3P16521 1044 aaKnown RBP2.87□□□□□ -1.95
YFR056CYFR056C SFL1P20134 766 aa2.87□□□□□ -1.95
YFR056CYFR056C KIN82P25341 720 aa2.87□□□□□ -1.95
YFR056CYFR056C PRP19P32523 503 aaKnown RBP2.87□□□□□ -1.95
YFR056CYFR056C UGP1P32861 499 aaKnown RBP2.87□□□□□ -1.95
YFR056CYFR056C TFC4P33339 1025 aa2.87□□□□□ -1.95
YFR056CYFR056C AKL1P38080 1108 aaKnown RBP2.87□□□□□ -1.95
YFR056CYFR056C YMC2P38087 329 aa2.87□□□□□ -1.95
YFR056CYFR056C PCM1P38628 557 aaKnown RBP2.87□□□□□ -1.95
YFR056CYFR056C MGS1P40151 587 aa2.87□□□□□ -1.95
YFR056CYFR056C KHA1P40309 873 aa2.87□□□□□ -1.95
YFR056CYFR056C GPP1P41277 250 aaKnown RBP2.87□□□□□ -1.95
YFR056CYFR056C PMT6P42934 759 aa2.87□□□□□ -1.95
YFR056CYFR056C RFX1P48743 811 aa2.87□□□□□ -1.95
YFR056CYFR056C PEX14P53112 341 aa2.87□□□□□ -1.95
YFR056CYFR056C MET13P53128 600 aa2.87□□□□□ -1.95
YFR056CYFR056C COG6P53959 839 aa2.87□□□□□ -1.95
YFR056CYFR056C MTQ2Q03920 221 aaPredicted RBP2.87□□□□□ -1.95
YFR056CYFR056C BUD21Q08492 214 aaPredicted RBP2.87□□□□□ -1.95
YFR056CYFR056C TRE2Q08693 809 aa2.87□□□□□ -1.95
YFR056CYFR056C NYV1Q12255 253 aa2.87□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 23.2 ms