RNA–Protein interactions for RNA: YCL057W

PRD1, Transcript of Zinc metalloendopeptidase, yeastyeast

Gene PRD1, Length 2,139 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PRD1YCL057W NUG1P40010 520 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
PRD1YCL057W YJR008WP47085 338 aa5.52□□□□□ -1.53
PRD1YCL057W TCB2P48231 1178 aa5.52□□□□□ -1.53
PRD1YCL057W PEX14P53112 341 aa5.52□□□□□ -1.53
PRD1YCL057W MRPS35P53292 345 aa5.52□□□□□ -1.53
PRD1YCL057W YRF1-1P0CX20 1796 aa5.52□□□□□ -1.53
PRD1YCL057W YRF1-5P0CX21 1796 aa5.52□□□□□ -1.53
PRD1YCL057W YRF1-8P0CX22 1796 aa5.52□□□□□ -1.53
PRD1YCL057W MLP1Q02455 1875 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
PRD1YCL057W YBR259WP38338 688 aa5.51□□□□□ -1.53
PRD1YCL057W YIR014WP40570 242 aa5.51□□□□□ -1.53
PRD1YCL057W SET2P46995 733 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
PRD1YCL057W TGL2P54857 326 aa5.51□□□□□ -1.53
PRD1YCL057W ARG5,6Q01217 863 aa5.51□□□□□ -1.53
PRD1YCL057W RMP1Q12530 201 aa5.51□□□□□ -1.53
PRD1YCL057W NUP192P47054 1683 aa5.51□□□□□ -1.53
PRD1YCL057W YLR358CO13565 187 aa5.51□□□□□ -1.53
PRD1YCL057W ADE2P21264 571 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
PRD1YCL057W ESL2P36168 1195 aa5.51□□□□□ -1.53
PRD1YCL057W GRX7P38068 203 aa5.51□□□□□ -1.53
PRD1YCL057W AVT1P47082 602 aa5.51□□□□□ -1.53
PRD1YCL057W PRP31P49704 494 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
PRD1YCL057W YRB30P53107 440 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
PRD1YCL057W GPD1Q00055 391 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
PRD1YCL057W TMA10Q06177 86 aa5.51□□□□□ -1.53
PRD1YCL057W DCG1P32460 244 aa5.5□□□□□ -1.53
PRD1YCL057W YBP2P53169 641 aa5.5□□□□□ -1.53
PRD1YCL057W HMO1Q03973 246 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
PRD1YCL057W YHM2Q04013 314 aa5.5□□□□□ -1.53
PRD1YCL057W VMR1P38735 1592 aa5.5□□□□□ -1.53
PRD1YCL057W PCT1P13259 424 aa5.5□□□□□ -1.53
PRD1YCL057W APL2P36000 726 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
PRD1YCL057W FAT1P38225 669 aa5.5□□□□□ -1.53
PRD1YCL057W YHR202WP38887 602 aa5.5□□□□□ -1.53
PRD1YCL057W MPP10P47083 593 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
PRD1YCL057W MNN10P50108 393 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
PRD1YCL057W PTA1Q01329 785 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
PRD1YCL057W YOL057WQ08225 711 aa5.5□□□□□ -1.53
PRD1YCL057W BNR1P40450 1375 aa5.49□□□□□ -1.53
PRD1YCL057W SPE2P21182 396 aa5.49□□□□□ -1.53
PRD1YCL057W SEC65P29478 273 aa5.49□□□□□ -1.53
PRD1YCL057W TFC4P33339 1025 aa5.49□□□□□ -1.53
PRD1YCL057W SKY1Q03656 742 aa5.49□□□□□ -1.53
PRD1YCL057W MCM21Q06675 368 aa5.49□□□□□ -1.53
PRD1YCL057W YEF3P16521 1044 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
PRD1YCL057W HEM12P32347 362 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
PRD1YCL057W SER1P33330 395 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
PRD1YCL057W APN2P38207 520 aa5.48□□□□□ -1.53
PRD1YCL057W BIT2P38346 545 aa5.48□□□□□ -1.53
PRD1YCL057W YHR112CP38716 378 aa5.48□□□□□ -1.53
PRD1YCL057W YLR407WQ06070 228 aa5.48□□□□□ -1.53
PRD1YCL057W TMA7Q3E764 64 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
PRD1YCL057W SNF2P22082 1703 aa5.48□□□□□ -1.53
PRD1YCL057W TRP4P07285 380 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
PRD1YCL057W BUL1P48524 976 aa5.48□□□□□ -1.53
PRD1YCL057W NRG1Q03125 231 aa5.48□□□□□ -1.53
PRD1YCL057W CLU1Q03690 1277 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
PRD1YCL057W SND1Q04007 877 aa5.48□□□□□ -1.53
PRD1YCL057W CAD1P24813 409 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
PRD1YCL057W MCM6P53091 1017 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
PRD1YCL057W YNL034WP53963 612 aa5.47□□□□□ -1.53
PRD1YCL057W YNL018CP53976 612 aa5.47□□□□□ -1.53
PRD1YCL057W TGL5Q12043 749 aa5.47□□□□□ -1.53
PRD1YCL057W SEC7P11075 2009 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
PRD1YCL057W YKU70P32807 602 aa5.47□□□□□ -1.53
PRD1YCL057W YKR075CP36155 307 aa5.47□□□□□ -1.53
PRD1YCL057W BFA1P47113 574 aa5.47□□□□□ -1.53
PRD1YCL057W TEX1P53851 422 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
PRD1YCL057W NOP15P53927 220 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
PRD1YCL057W REC102Q02721 264 aa5.47□□□□□ -1.53
PRD1YCL057W IML1P47170 1584 aa5.46□□□□□ -1.53
PRD1YCL057W IMG2P25642 146 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.54
PRD1YCL057W YPT7P32939 208 aa5.46□□□□□ -1.54
PRD1YCL057W NOP56Q12460 504 aaKnown RBP RIP-Chip data5.46□□□□□ -1.54not detected
PRD1YCL057W PMA1P05030 918 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
PRD1YCL057W IES1P43579 692 aa5.45□□□□□ -1.54
PRD1YCL057W YPR027CQ12079 277 aa5.45□□□□□ -1.54
PRD1YCL057W SLX4Q12098 748 aa5.45□□□□□ -1.54
PRD1YCL057W PYC1P11154 1178 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
PRD1YCL057W CDC26P14724 124 aa5.45□□□□□ -1.54
PRD1YCL057W DAL5P15365 543 aa5.45□□□□□ -1.54
PRD1YCL057W COX11P19516 300 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
PRD1YCL057W EMP65P40085 556 aa5.45□□□□□ -1.54
PRD1YCL057W FKH2P41813 862 aa5.45□□□□□ -1.54
PRD1YCL057W YPS7Q06325 596 aa5.45□□□□□ -1.54
PRD1YCL057W ATG11Q12527 1178 aa5.45□□□□□ -1.54
PRD1YCL057W GLN4P13188 809 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
PRD1YCL057W PFK1P16861 987 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
PRD1YCL057W ATP12P22135 325 aa5.44□□□□□ -1.54
PRD1YCL057W YAP3P38749 330 aa5.44□□□□□ -1.54
PRD1YCL057W MPT5P39016 859 aaKnown RBP RIP-Chip data5.44□□□□□ -1.54not detected
PRD1YCL057W PEA2P40091 420 aa5.44□□□□□ -1.54
PRD1YCL057W BAP3P41815 604 aa5.44□□□□□ -1.54
PRD1YCL057W SLD3P53135 668 aa5.44□□□□□ -1.54
PRD1YCL057W SPC105P53148 917 aa5.44□□□□□ -1.54
PRD1YCL057W YMR210WQ03649 449 aa5.44□□□□□ -1.54
PRD1YCL057W ISA1Q07821 250 aaPredicted RBP5.44□□□□□ -1.54
PRD1YCL057W YOR378WQ08902 515 aa5.44□□□□□ -1.54
PRD1YCL057W IME1P21190 360 aa5.44□□□□□ -1.54
PRD1YCL057W ERG6P25087 383 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
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