RNA–Protein interactions for RNA: Q0055

AI2, Reverse transcriptase required for splicing of the COX1 pre-mRNA, yeast

Gene AI2, Length 2,565 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
AI2	Q0055	MRPL19	P53875	158 aa		3.08	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	REG1	Q00816	1014 aa		3.08	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	HOS3	Q02959	697 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	HMO1	Q03973	246 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	SNO4	Q04902	237 aa		3.08	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	GTB1	Q04924	702 aa		3.08	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	DUS3	Q06053	668 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	YLH47	Q06493	454 aa		3.08	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	ADY3	Q07732	790 aa		3.08	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	NGL1	Q08213	363 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	HSP33	Q08914	237 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	HSP32	Q08992	237 aa		3.08	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	RRG1	Q12167	365 aa	Predicted RBP	3.08	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	YLL058W	Q12198	575 aa		3.08	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	SPE4	Q12455	300 aa		3.08	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	SIR1	P21691	654 aa		3.07	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	SGF29	P25554	259 aa		3.07	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	URA7	P28274	579 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	GPI10	P30777	616 aa		3.07	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	PCH2	P38126	564 aa		3.07	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	SRP68	P38687	599 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	CCT6	P39079	546 aa		3.07	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	DJP1	P40564	432 aa		3.07	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	RNH1	Q04740	348 aa		3.07	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	RIX7	Q07844	837 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	MDM38	Q08179	573 aa		3.07	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	CWC2	Q12046	339 aa	Predicted RBP	3.07	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	RIB2	Q12362	591 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	HSH49	Q99181	213 aa	Predicted RBP	3.07	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	SUI3	P09064	285 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	GSY1	P23337	708 aa		3.07	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	SWI4	P25302	1093 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	CAP1	P28495	268 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	PPQ1	P32945	549 aa		3.07	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	PEX5	P35056	612 aa		3.07	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	UBS1	P38290	277 aa		3.07	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	GND1	P38720	489 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	BUD16	P39988	312 aa		3.07	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	MRX1	P40050	688 aa		3.07	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	YIL166C	P40445	542 aa		3.07	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	SPO22	P40511	975 aa		3.07	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	BNA2	P47125	453 aa		3.07	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	YGR153W	P48238	217 aa		3.07	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	MRX6	P48564	524 aa		3.07	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	ZIP2	P53061	704 aa		3.07	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	YMR155W	Q03795	547 aa		3.07	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	MFB1	Q04922	465 aa		3.07	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	BLS1	Q06071	122 aa		3.07	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	RGC1	Q06108	1083 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	XYL2	Q07993	356 aa		3.07	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	AVO1	Q08236	1176 aa		3.07	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	YPR027C	Q12079	277 aa		3.07	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	PFK2	P16862	959 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.06	□□□□□ -1.92	not detected
AI2	Q0055	THR1	P17423	357 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	GEX1	P25596	615 aa		3.06	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	PET127	P32606	800 aa		3.06	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	ORC2	P32833	620 aa		3.06	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	TFC3	P34111	1160 aa		3.06	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	UIP5	P36137	443 aa		3.06	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	ADH5	P38113	351 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	APM3	P38153	483 aa		3.06	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	YEL068C	P39977	110 aa		3.06	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	SCS2	P40075	244 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	PRK1	P40494	810 aa		3.06	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	VID28	P40547	921 aa		3.06	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	UTP22	P53254	1237 aa	Predicted RBP	3.06	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	SFB2	P53953	876 aa		3.06	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	RSC2	Q06488	889 aa		3.06	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	GPB1	Q08886	897 aa		3.06	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	PSY3	Q12318	242 aa		3.06	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	CEX1	Q12453	761 aa		3.06	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	YPR053C	Q6Q5F3	151 aa		3.06	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	DED1	P06634	604 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	SRO9	P25567	434 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	PUP2	P32379	260 aa		3.06	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	SPC110	P32380	944 aa		3.06	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	YJL068C	P40363	299 aa		3.06	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	DSD1	P53095	428 aa		3.06	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	YSA1	Q01976	231 aa		3.06	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	MEC3	Q02574	474 aa		3.06	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	SRT1	Q03175	343 aa		3.06	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	SYF1	Q04048	859 aa	Predicted RBP	3.06	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	UFO1	Q04511	668 aa		3.06	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	ASM4	Q05166	528 aa		3.06	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	YLR407W	Q06070	228 aa		3.06	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	MMR1	Q06324	491 aa		3.06	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	GPM1	P00950	247 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	PHO3	P24031	467 aa		3.06	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	DAL80	P26343	269 aa		3.06	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	KIP1	P28742	1111 aa		3.06	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	MDL1	P33310	695 aa		3.06	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	BYE1	P36106	594 aa		3.06	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	HEL1	P36113	551 aa		3.06	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	JNM1	P36224	373 aa		3.06	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	YBL028C	P38202	106 aa		3.06	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	TDA3	P38758	523 aa		3.06	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	STL1	P39932	569 aa		3.06	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	BST1	P43571	1029 aa		3.06	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	ENP2	P48234	707 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	SGF73	P53165	657 aa		3.06	□□□□□ -1.92

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 47.8 ms