RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589867.2

MBD1-221, Transcript of methyl-CpG binding domain protein 1, human

TSL 3

Gene MBD1, Length 673 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MBD1-221	ENST00000589867	SCARF1	Q14162	830 aa		21.55	■■□□□ 1.04
MBD1-221	ENST00000589867	GRIK5	Q16478	980 aa		21.55	■■□□□ 1.04
MBD1-221	ENST00000589867	C20orf194	Q5TEA3	1177 aa		21.55	■■□□□ 1.04
MBD1-221	ENST00000589867	KLRG1	Q96E93	195 aa		21.55	■■□□□ 1.04
MBD1-221	ENST00000589867	IQSEC3	Q9UPP2	1182 aa	Predicted RBP	21.55	■■□□□ 1.04
MBD1-221	ENST00000589867	ARAP2	Q8WZ64	1704 aa		21.55	■■□□□ 1.04
MBD1-221	ENST00000589867	TMEM88B	A6NKF7	163 aa		21.54	■■□□□ 1.04
MBD1-221	ENST00000589867	NBPF9	Q3BBW0	867 aa		21.54	■■□□□ 1.04
MBD1-221	ENST00000589867	USP48	Q86UV5	1035 aa		21.54	■■□□□ 1.04
MBD1-221	ENST00000589867	SSH3	Q8TE77	659 aa		21.54	■■□□□ 1.04
MBD1-221	ENST00000589867	LPIN2	Q92539	896 aa		21.54	■■□□□ 1.04
MBD1-221	ENST00000589867	GGA3	Q9NZ52	723 aa		21.54	■■□□□ 1.04
MBD1-221	ENST00000589867	CEP126	Q9P2H0	1117 aa		21.54	■■□□□ 1.04
MBD1-221	ENST00000589867	PCDHAC2	Q9Y5I4	1007 aa		21.54	■■□□□ 1.04
MBD1-221	ENST00000589867	COL1A1	P02452	1464 aa	Predicted RBP	21.53	■■□□□ 1.04
MBD1-221	ENST00000589867	WNT10B	O00744	389 aa		21.53	■■□□□ 1.04
MBD1-221	ENST00000589867	MVP	Q14764	893 aa	Known RBP	21.53	■■□□□ 1.04
MBD1-221	ENST00000589867	ADM5	C9JUS6	153 aa		21.52	■■□□□ 1.04
MBD1-221	ENST00000589867	IFIT1	P09914	478 aa	Known RBP	21.52	■■□□□ 1.04
MBD1-221	ENST00000589867	ADORA1	P30542	326 aa		21.52	■■□□□ 1.04
MBD1-221	ENST00000589867	TFCP2	Q12800	502 aa		21.52	■■□□□ 1.04
MBD1-221	ENST00000589867	ATP2B3	Q16720	1220 aa		21.52	■■□□□ 1.04
MBD1-221	ENST00000589867	CDC37L1	Q7L3B6	337 aa		21.52	■■□□□ 1.04
MBD1-221	ENST00000589867	COG6	Q9Y2V7	657 aa		21.52	■■□□□ 1.04
MBD1-221	ENST00000589867	AOX1	Q06278	1338 aa		21.52	■■□□□ 1.03
MBD1-221	ENST00000589867	SLC5A1	P13866	664 aa		21.51	■■□□□ 1.03
MBD1-221	ENST00000589867	ANGEL2	Q5VTE6	544 aa	Known RBP	21.51	■■□□□ 1.03
MBD1-221	ENST00000589867	CEP85	Q6P2H3	762 aa		21.51	■■□□□ 1.03
MBD1-221	ENST00000589867	YTHDC1	Q96MU7	727 aa	Known RBP	21.51	■■□□□ 1.03
MBD1-221	ENST00000589867	SCAF8	Q9UPN6	1271 aa	Known RBP	21.51	■■□□□ 1.03
MBD1-221	ENST00000589867	CAVIN4	Q5BKX8	364 aa		21.5	■■□□□ 1.03
MBD1-221	ENST00000589867	MFSD14B	Q5SR56	506 aa		21.5	■■□□□ 1.03
MBD1-221	ENST00000589867	KRT26	Q7Z3Y9	468 aa		21.5	■■□□□ 1.03
MBD1-221	ENST00000589867	MYH13	Q9UKX3	1938 aa		21.5	■■□□□ 1.03
MBD1-221	ENST00000589867		F8W031	263 aa	Predicted RBP	21.49	■■□□□ 1.03
MBD1-221	ENST00000589867	PHKA1	P46020	1223 aa		21.49	■■□□□ 1.03
MBD1-221	ENST00000589867	MMP14	P50281	582 aa		21.49	■■□□□ 1.03
MBD1-221	ENST00000589867	TIMM10	P62072	90 aa		21.49	■■□□□ 1.03
MBD1-221	ENST00000589867	OGFOD1	Q8N543	542 aa		21.49	■■□□□ 1.03
MBD1-221	ENST00000589867	JMY	Q8N9B5	988 aa		21.49	■■□□□ 1.03
MBD1-221	ENST00000589867	ZBTB40	Q9NUA8	1239 aa		21.49	■■□□□ 1.03
MBD1-221	ENST00000589867	MKRN1	Q9UHC7	482 aa	Known RBP	21.49	■■□□□ 1.03
MBD1-221	ENST00000589867	CNTNAP1	P78357	1384 aa		21.48	■■□□□ 1.03
MBD1-221	ENST00000589867	MS4A1	P11836	297 aa		21.48	■■□□□ 1.03
MBD1-221	ENST00000589867	VPS37D	Q86XT2	251 aa		21.48	■■□□□ 1.03
MBD1-221	ENST00000589867	MTMR14	Q8NCE2	650 aa		21.48	■■□□□ 1.03
MBD1-221	ENST00000589867	DCPS	Q96C86	337 aa	Known RBP	21.48	■■□□□ 1.03
MBD1-221	ENST00000589867	NOP58	Q9Y2X3	529 aa	Known RBP	21.48	■■□□□ 1.03
MBD1-221	ENST00000589867	PITPNM2	Q9BZ72	1349 aa		21.48	■■□□□ 1.03
MBD1-221	ENST00000589867	RASSF10	A6NK89	507 aa		21.47	■■□□□ 1.03
MBD1-221	ENST00000589867	CELF2	O95319	508 aa	Known RBP	21.47	■■□□□ 1.03
MBD1-221	ENST00000589867	CHAF1A	Q13111	956 aa	Predicted RBP	21.47	■■□□□ 1.03
MBD1-221	ENST00000589867	PDE3A	Q14432	1141 aa		21.47	■■□□□ 1.03
MBD1-221	ENST00000589867	SIRT2	Q8IXJ6	389 aa		21.47	■■□□□ 1.03
MBD1-221	ENST00000589867	ECM29	Q5VYK3	1845 aa		21.47	■■□□□ 1.03
MBD1-221	ENST00000589867		A0A1B0GUL7	405 aa		21.46	■■□□□ 1.03
MBD1-221	ENST00000589867	ZBTB22	O15209	634 aa		21.46	■■□□□ 1.03
MBD1-221	ENST00000589867	CFAP100	Q494V2	611 aa		21.46	■■□□□ 1.03
MBD1-221	ENST00000589867	PRMT6	Q96LA8	375 aa	Predicted RBP	21.46	■■□□□ 1.03
MBD1-221	ENST00000589867	HDAC9	Q9UKV0	1011 aa		21.46	■■□□□ 1.03
MBD1-221	ENST00000589867	SPDYE2B	A6NHP3	402 aa		21.45	■■□□□ 1.02
MBD1-221	ENST00000589867	SPDYE6	P0CI01	402 aa		21.45	■■□□□ 1.02
MBD1-221	ENST00000589867	CCDC102B	Q68D86	513 aa		21.45	■■□□□ 1.02
MBD1-221	ENST00000589867	XAGE2	Q96GT9	111 aa		21.45	■■□□□ 1.02
MBD1-221	ENST00000589867	DDX19B	Q9UMR2	479 aa		21.45	■■□□□ 1.02
MBD1-221	ENST00000589867	TLL2	Q9Y6L7	1015 aa		21.45	■■□□□ 1.02
MBD1-221	ENST00000589867	G3BP1	Q13283	466 aa	Known RBP eCLIP	21.44	■■□□□ 1.02
MBD1-221	ENST00000589867	SAPCD2	Q86UD0	394 aa		21.44	■■□□□ 1.02
MBD1-221	ENST00000589867	SULF1	Q8IWU6	871 aa		21.44	■■□□□ 1.02
MBD1-221	ENST00000589867	CDCA5	Q96FF9	252 aa		21.44	■■□□□ 1.02
MBD1-221	ENST00000589867	TTF2	Q9UNY4	1162 aa	Known RBP	21.44	■■□□□ 1.02
MBD1-221	ENST00000589867	SURF6	O75683	361 aa	Known RBP	21.43	■■□□□ 1.02
MBD1-221	ENST00000589867	VEGFB	P49765	207 aa		21.43	■■□□□ 1.02
MBD1-221	ENST00000589867	DLGAP5	Q15398	846 aa		21.43	■■□□□ 1.02
MBD1-221	ENST00000589867	PRAMEF18	Q5VWM3	479 aa		21.43	■■□□□ 1.02
MBD1-221	ENST00000589867	ZNF408	Q9H9D4	720 aa		21.43	■■□□□ 1.02
MBD1-221	ENST00000589867	TBC1D22A	Q8WUA7	517 aa		21.42	■■□□□ 1.02
MBD1-221	ENST00000589867	ABT1	Q9ULW3	272 aa	Known RBP	21.42	■■□□□ 1.02
MBD1-221	ENST00000589867	AKAP2	Q9Y2D5	859 aa		21.42	■■□□□ 1.02
MBD1-221	ENST00000589867	FRAT2	O75474	233 aa	Predicted RBP	21.41	■■□□□ 1.02
MBD1-221	ENST00000589867	RASGRF1	Q13972	1273 aa		21.41	■■□□□ 1.02
MBD1-221	ENST00000589867	DEFB115	Q30KQ5	88 aa		21.41	■■□□□ 1.02
MBD1-221	ENST00000589867	SERPINA10	Q9UK55	444 aa		21.41	■■□□□ 1.02
MBD1-221	ENST00000589867	CRK	P46108	304 aa		21.4	■■□□□ 1.02
MBD1-221	ENST00000589867	GPR108	Q9NPR9	543 aa		21.4	■■□□□ 1.02
MBD1-221	ENST00000589867	CLRN2	A0PK11	232 aa		21.39	■■□□□ 1.01
MBD1-221	ENST00000589867	SEMA3E	O15041	775 aa		21.39	■■□□□ 1.01
MBD1-221	ENST00000589867	HDLBP	Q00341	1268 aa	Known RBP	21.39	■■□□□ 1.01
MBD1-221	ENST00000589867	TNNI3K	Q59H18	835 aa		21.39	■■□□□ 1.01
MBD1-221	ENST00000589867	GOLGA6L2	Q8N9W4	650 aa	Predicted RBP	21.39	■■□□□ 1.01
MBD1-221	ENST00000589867	WDR66	Q8TBY9	1149 aa		21.39	■■□□□ 1.01
MBD1-221	ENST00000589867	NEUROD6	Q96NK8	337 aa		21.39	■■□□□ 1.01
MBD1-221	ENST00000589867	SUGT1	Q9Y2Z0	365 aa		21.39	■■□□□ 1.01
MBD1-221	ENST00000589867	FPGT-TNNI3K	V9GXZ4	949 aa		21.39	■■□□□ 1.01
MBD1-221	ENST00000589867	AKAP11	Q9UKA4	1901 aa		21.39	■■□□□ 1.01
MBD1-221	ENST00000589867	SALL1	Q9NSC2	1324 aa		21.38	■■□□□ 1.01
MBD1-221	ENST00000589867	THSD7B	Q9C0I4	1608 aa		21.38	■■□□□ 1.01
MBD1-221	ENST00000589867	PRDX5	P30044	214 aa		21.38	■■□□□ 1.01
MBD1-221	ENST00000589867	CYP4F22	Q6NT55	531 aa		21.38	■■□□□ 1.01
MBD1-221	ENST00000589867	RPAP2	Q8IXW5	612 aa	Predicted RBP	21.38	■■□□□ 1.01

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