RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567383.5

UBE2I-216, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 I, humanhuman

TSL 4

Gene UBE2I, Length 538 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2I-216ENST00000567383 C20orf194Q5TEA3 1177 aa21.42■■□□□ 1.02
UBE2I-216ENST00000567383 DLK2Q6UY11 383 aa21.42■■□□□ 1.02
UBE2I-216ENST00000567383 KIAA0825Q8IV33 1275 aa21.42■■□□□ 1.02
UBE2I-216ENST00000567383 TRPM7Q96QT4 1865 aa21.42■■□□□ 1.02
UBE2I-216ENST00000567383 CREBZFQ9NS37 354 aa21.42■■□□□ 1.02
UBE2I-216ENST00000567383 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
UBE2I-216ENST00000567383 COG6Q9Y2V7 657 aa21.42■■□□□ 1.02
UBE2I-216ENST00000567383 SCARF1Q14162 830 aa21.41■■□□□ 1.02
UBE2I-216ENST00000567383 ATP2B3Q16720 1220 aa21.41■■□□□ 1.02
UBE2I-216ENST00000567383 TMEM88BA6NKF7 163 aa21.4■■□□□ 1.02
UBE2I-216ENST00000567383 SLC5A1P13866 664 aa21.4■■□□□ 1.02
UBE2I-216ENST00000567383 TFCP2Q12800 502 aa21.4■■□□□ 1.02
UBE2I-216ENST00000567383 NBPF9Q3BBW0 867 aa21.4■■□□□ 1.02
UBE2I-216ENST00000567383 CAVIN4Q5BKX8 364 aa21.4■■□□□ 1.02
UBE2I-216ENST00000567383 CST9Q5W186 159 aa21.4■■□□□ 1.02
UBE2I-216ENST00000567383 CDC37L1Q7L3B6 337 aa21.4■■□□□ 1.02
UBE2I-216ENST00000567383 USP48Q86UV5 1035 aa21.4■■□□□ 1.02
UBE2I-216ENST00000567383 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
UBE2I-216ENST00000567383 PCNTO95613 3336 aa21.4■■□□□ 1.02
UBE2I-216ENST00000567383 ARAP2Q8WZ64 1704 aa21.39■■□□□ 1.01
UBE2I-216ENST00000567383 MMP14P50281 582 aa21.39■■□□□ 1.01
UBE2I-216ENST00000567383 GRIK5Q16478 980 aa21.39■■□□□ 1.01
UBE2I-216ENST00000567383 CEP85Q6P2H3 762 aa21.39■■□□□ 1.01
UBE2I-216ENST00000567383 OGFOD1Q8N543 542 aa21.39■■□□□ 1.01
UBE2I-216ENST00000567383 GGA3Q9NZ52 723 aa21.39■■□□□ 1.01
UBE2I-216ENST00000567383 WNT10BO00744 389 aa21.38■■□□□ 1.01
UBE2I-216ENST00000567383 ADORA1P30542 326 aa21.38■■□□□ 1.01
UBE2I-216ENST00000567383 TIMM10P62072 90 aa21.38■■□□□ 1.01
UBE2I-216ENST00000567383 PDE3AQ14432 1141 aa21.38■■□□□ 1.01
UBE2I-216ENST00000567383 VPS37DQ86XT2 251 aa21.38■■□□□ 1.01
UBE2I-216ENST00000567383 KLRG1Q96E93 195 aa21.38■■□□□ 1.01
UBE2I-216ENST00000567383 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa21.38■■□□□ 1.01
UBE2I-216ENST00000567383 ADM5C9JUS6 153 aa21.37■■□□□ 1.01
UBE2I-216ENST00000567383 MFSD14BQ5SR56 506 aa21.37■■□□□ 1.01
UBE2I-216ENST00000567383 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
UBE2I-216ENST00000567383 KRT26Q7Z3Y9 468 aa21.37■■□□□ 1.01
UBE2I-216ENST00000567383 DDX19BQ9UMR2 479 aa21.37■■□□□ 1.01
UBE2I-216ENST00000567383 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa21.37■■□□□ 1.01
UBE2I-216ENST00000567383 F8W031 263 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
UBE2I-216ENST00000567383 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP21.36■■□□□ 1.01
UBE2I-216ENST00000567383 MTMR14Q8NCE2 650 aa21.36■■□□□ 1.01
UBE2I-216ENST00000567383 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
UBE2I-216ENST00000567383 HDAC9Q9UKV0 1011 aa21.36■■□□□ 1.01
UBE2I-216ENST00000567383 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
UBE2I-216ENST00000567383 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
UBE2I-216ENST00000567383 MYH13Q9UKX3 1938 aa21.35■■□□□ 1.01
UBE2I-216ENST00000567383 A0A1B0GUL7 405 aa21.35■■□□□ 1.01
UBE2I-216ENST00000567383 PHKA1P46020 1223 aa21.35■■□□□ 1.01
UBE2I-216ENST00000567383 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
UBE2I-216ENST00000567383 AOX1Q06278 1338 aa21.34■■□□□ 1.01
UBE2I-216ENST00000567383 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa21.34■■□□□ 1.01
UBE2I-216ENST00000567383 ZBTB22O15209 634 aa21.34■■□□□ 1.01
UBE2I-216ENST00000567383 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
UBE2I-216ENST00000567383 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
UBE2I-216ENST00000567383 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1.01
UBE2I-216ENST00000567383 CELF2O95319 508 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1.01
UBE2I-216ENST00000567383 CFAP100Q494V2 611 aa21.33■■□□□ 1.01
UBE2I-216ENST00000567383 CCDC102BQ68D86 513 aa21.33■■□□□ 1.01
UBE2I-216ENST00000567383 SIRT2Q8IXJ6 389 aa21.33■■□□□ 1.01
UBE2I-216ENST00000567383 XAGE2Q96GT9 111 aa21.33■■□□□ 1.01
UBE2I-216ENST00000567383 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1.01
UBE2I-216ENST00000567383 AKAP2Q9Y2D5 859 aa21.33■■□□□ 1.01
UBE2I-216ENST00000567383 CNTNAP1P78357 1384 aa21.33■■□□□ 1
UBE2I-216ENST00000567383 ECM29Q5VYK3 1845 aa21.32■■□□□ 1
UBE2I-216ENST00000567383 SURF6O75683 361 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
UBE2I-216ENST00000567383 DLGAP5Q15398 846 aa21.32■■□□□ 1
UBE2I-216ENST00000567383 SULF1Q8IWU6 871 aa21.32■■□□□ 1
UBE2I-216ENST00000567383 JMYQ8N9B5 988 aa21.32■■□□□ 1
UBE2I-216ENST00000567383 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa21.32■■□□□ 1
UBE2I-216ENST00000567383 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
UBE2I-216ENST00000567383 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
UBE2I-216ENST00000567383 RASSF10A6NK89 507 aa21.31■■□□□ 1
UBE2I-216ENST00000567383 GPR108Q9NPR9 543 aa21.31■■□□□ 1
UBE2I-216ENST00000567383 SPDYE2BA6NHP3 402 aa21.3■■□□□ 1
UBE2I-216ENST00000567383 SPDYE6P0CI01 402 aa21.3■■□□□ 1
UBE2I-216ENST00000567383 CDCA5Q96FF9 252 aa21.3■■□□□ 1
UBE2I-216ENST00000567383 ZNF408Q9H9D4 720 aa21.3■■□□□ 1
UBE2I-216ENST00000567383 SERPINA10Q9UK55 444 aa21.3■■□□□ 1
UBE2I-216ENST00000567383 TLL2Q9Y6L7 1015 aa21.3■■□□□ 1
UBE2I-216ENST00000567383 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP21.29■■□□□ 1
UBE2I-216ENST00000567383 NEUROD6Q96NK8 337 aa21.29■■□□□ 1
UBE2I-216ENST00000567383 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP21.29■■□□□ 1
UBE2I-216ENST00000567383 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP21.29■■□□□ 1
UBE2I-216ENST00000567383 SEMA3EO15041 775 aa21.28■■□□□ 1
UBE2I-216ENST00000567383 RRP1P56182 461 aaKnown RBP21.28■■□□□ 1
UBE2I-216ENST00000567383 DEFB115Q30KQ5 88 aa21.28■■□□□ 1
UBE2I-216ENST00000567383 SAPCD2Q86UD0 394 aa21.28■■□□□ 1
UBE2I-216ENST00000567383 WDR66Q8TBY9 1149 aa21.28■■□□□ 1
UBE2I-216ENST00000567383 CRKP46108 304 aa21.27■■□□□ 1
UBE2I-216ENST00000567383 VEGFBP49765 207 aa21.27■■□□□ 1
UBE2I-216ENST00000567383 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP21.27■■□□□ 1
UBE2I-216ENST00000567383 RASGRF1Q13972 1273 aa21.27■■□□□ 1
UBE2I-216ENST00000567383 TNNI3KQ59H18 835 aa21.27■■□□□ 1
UBE2I-216ENST00000567383 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa21.27■■□□□ 1
UBE2I-216ENST00000567383 MRIQ9BWK5 157 aa21.27■■□□□ 1
UBE2I-216ENST00000567383 DENND2AQ9ULE3 1009 aa21.27■■□□□ 1
UBE2I-216ENST00000567383 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa21.27■■□□□ 1
UBE2I-216ENST00000567383 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa21.27■■□□□ 1
UBE2I-216ENST00000567383 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa21.27■■□□□ 1
UBE2I-216ENST00000567383 SALL1Q9NSC2 1324 aa21.27■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.2 ms