RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552296.6

PCBP2-222, Transcript of poly(rC) binding protein 2, human

APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC

Gene PCBP2, Length 1,342 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PCBP2-222	ENST00000552296	GTF2I	P78347	998 aa		11.43	□□□□□ -0.58
PCBP2-222	ENST00000552296	CHRND	Q07001	517 aa		11.43	□□□□□ -0.58
PCBP2-222	ENST00000552296	NEXN	Q0ZGT2	675 aa		11.43	□□□□□ -0.58
PCBP2-222	ENST00000552296	TWISTNB	Q3B726	338 aa	Predicted RBP	11.43	□□□□□ -0.58
PCBP2-222	ENST00000552296	PRPF38B	Q5VTL8	546 aa	Known RBP	11.43	□□□□□ -0.58
PCBP2-222	ENST00000552296	SPRYD7	Q5W111	196 aa		11.43	□□□□□ -0.58
PCBP2-222	ENST00000552296	FBXO46	Q6PJ61	603 aa	Predicted RBP	11.43	□□□□□ -0.58
PCBP2-222	ENST00000552296	APOBEC3F	Q8IUX4	373 aa	Known RBP	11.43	□□□□□ -0.58
PCBP2-222	ENST00000552296	KIAA0825	Q8IV33	1275 aa		11.43	□□□□□ -0.58
PCBP2-222	ENST00000552296	WWC1	Q8IX03	1113 aa		11.43	□□□□□ -0.58
PCBP2-222	ENST00000552296	CD209	Q9NNX6	404 aa		11.43	□□□□□ -0.58
PCBP2-222	ENST00000552296	PCDHAC2	Q9Y5I4	1007 aa		11.43	□□□□□ -0.58
PCBP2-222	ENST00000552296	IGHMBP2	P38935	993 aa	Known RBP	11.42	□□□□□ -0.58
PCBP2-222	ENST00000552296	FOXO4	P98177	505 aa		11.42	□□□□□ -0.58
PCBP2-222	ENST00000552296	FLII	Q13045	1269 aa		11.42	□□□□□ -0.58
PCBP2-222	ENST00000552296	MKRN3	Q13064	507 aa	Known RBP	11.42	□□□□□ -0.58
PCBP2-222	ENST00000552296	STK31	Q9BXU1	1019 aa		11.42	□□□□□ -0.58
PCBP2-222	ENST00000552296	ANKRD2	Q9GZV1	360 aa		11.42	□□□□□ -0.58
PCBP2-222	ENST00000552296	IL16	Q14005	1332 aa		11.42	□□□□□ -0.58
PCBP2-222	ENST00000552296	FKTN	O75072	461 aa		11.41	□□□□□ -0.58
PCBP2-222	ENST00000552296	IL1R1	P14778	569 aa		11.41	□□□□□ -0.58
PCBP2-222	ENST00000552296	NF2	P35240	595 aa		11.41	□□□□□ -0.58
PCBP2-222	ENST00000552296	SREBF2	Q12772	1141 aa		11.41	□□□□□ -0.58
PCBP2-222	ENST00000552296	CHRDL2	Q6WN34	429 aa		11.41	□□□□□ -0.58
PCBP2-222	ENST00000552296	ARMC9	Q7Z3E5	817 aa		11.41	□□□□□ -0.58
PCBP2-222	ENST00000552296	LINS1	Q8NG48	757 aa		11.41	□□□□□ -0.58
PCBP2-222	ENST00000552296	DNAAF4	Q8WXU2	420 aa		11.41	□□□□□ -0.58
PCBP2-222	ENST00000552296	FBXW7	Q969H0	707 aa		11.41	□□□□□ -0.58
PCBP2-222	ENST00000552296	DEFB129	Q9H1M3	183 aa		11.41	□□□□□ -0.58
PCBP2-222	ENST00000552296	HDAC9	Q9UKV0	1011 aa		11.41	□□□□□ -0.58
PCBP2-222	ENST00000552296	IGF2BP3	O00425	579 aa	Known RBP eCLIP	11.4	□□□□□ -0.58	7e-7	■■□□□ 14.2
PCBP2-222	ENST00000552296	GJA5	P36382	358 aa		11.4	□□□□□ -0.58
PCBP2-222	ENST00000552296	FKBP1A	P62942	108 aa	Known RBP	11.4	□□□□□ -0.58
PCBP2-222	ENST00000552296	CAP1	Q01518	475 aa		11.4	□□□□□ -0.58
PCBP2-222	ENST00000552296	PRKG1	Q13976	671 aa		11.4	□□□□□ -0.58
PCBP2-222	ENST00000552296	TTLL12	Q14166	644 aa	Predicted RBP	11.4	□□□□□ -0.58
PCBP2-222	ENST00000552296	IFNL1	Q8IU54	200 aa		11.4	□□□□□ -0.58
PCBP2-222	ENST00000552296	CLMN	Q96JQ2	1002 aa		11.4	□□□□□ -0.58
PCBP2-222	ENST00000552296	ANGEL1	Q9UNK9	670 aa	Known RBP	11.4	□□□□□ -0.58
PCBP2-222	ENST00000552296	ZSWIM8	A7E2V4	1837 aa		11.4	□□□□□ -0.58
PCBP2-222	ENST00000552296	SPDYE2B	A6NHP3	402 aa		11.39	□□□□□ -0.59
PCBP2-222	ENST00000552296	UNCX	A6NJT0	531 aa		11.39	□□□□□ -0.59
PCBP2-222	ENST00000552296	VAMP4	O75379	141 aa		11.39	□□□□□ -0.59
PCBP2-222	ENST00000552296	TAF5L	O75529	589 aa		11.39	□□□□□ -0.59
PCBP2-222	ENST00000552296	SPDYE6	P0CI01	402 aa		11.39	□□□□□ -0.59
PCBP2-222	ENST00000552296	ZBTB48	P10074	688 aa	Predicted RBP	11.39	□□□□□ -0.59
PCBP2-222	ENST00000552296	EPHA10	Q5JZY3	1008 aa		11.39	□□□□□ -0.59
PCBP2-222	ENST00000552296	WNK4	Q96J92	1243 aa		11.39	□□□□□ -0.59
PCBP2-222	ENST00000552296	PRMT6	Q96LA8	375 aa	Predicted RBP	11.39	□□□□□ -0.59
PCBP2-222	ENST00000552296	MPHOSPH8	Q99549	860 aa		11.39	□□□□□ -0.59
PCBP2-222	ENST00000552296	PPP2R3B	Q9Y5P8	575 aa		11.39	□□□□□ -0.59
PCBP2-222	ENST00000552296	FANCI	Q9NVI1	1328 aa		11.39	□□□□□ -0.59
PCBP2-222	ENST00000552296	SZT2	Q5T011	3432 aa		11.38	□□□□□ -0.59
PCBP2-222	ENST00000552296	MANSC4	A6NHS7	340 aa	Predicted RBP	11.38	□□□□□ -0.59
PCBP2-222	ENST00000552296	USP2	O75604	605 aa	Predicted RBP	11.38	□□□□□ -0.59
PCBP2-222	ENST00000552296	INHBE	P58166	350 aa		11.38	□□□□□ -0.59
PCBP2-222	ENST00000552296	DLGAP5	Q15398	846 aa		11.38	□□□□□ -0.59
PCBP2-222	ENST00000552296	BEND3	Q5T5X7	828 aa		11.38	□□□□□ -0.59
PCBP2-222	ENST00000552296	OTOP1	Q7RTM1	612 aa		11.38	□□□□□ -0.59
PCBP2-222	ENST00000552296	HELB	Q8NG08	1087 aa	Predicted RBP	11.38	□□□□□ -0.59
PCBP2-222	ENST00000552296	MYH16	Q9H6N6	1097 aa		11.38	□□□□□ -0.59
PCBP2-222	ENST00000552296	MYH13	Q9UKX3	1938 aa		11.38	□□□□□ -0.59
PCBP2-222	ENST00000552296	ANKRD18B	A2A2Z9	1011 aa		11.37	□□□□□ -0.59
PCBP2-222	ENST00000552296	TESPA1	A2RU30	521 aa	Predicted RBP	11.37	□□□□□ -0.59
PCBP2-222	ENST00000552296	ZNF316	A6NFI3	1004 aa	Predicted RBP	11.37	□□□□□ -0.59
PCBP2-222	ENST00000552296	ALDH1A1	P00352	501 aa		11.37	□□□□□ -0.59
PCBP2-222	ENST00000552296	FKBP5	Q13451	457 aa	Predicted RBP	11.37	□□□□□ -0.59
PCBP2-222	ENST00000552296	CFAP100	Q494V2	611 aa		11.37	□□□□□ -0.59
PCBP2-222	ENST00000552296	NBPF12	Q5TAG4	269 aa	Predicted RBP	11.37	□□□□□ -0.59
PCBP2-222	ENST00000552296	PTPN18	Q99952	460 aa		11.37	□□□□□ -0.59
PCBP2-222	ENST00000552296	FAM205A	Q6ZU69	1335 aa		11.37	□□□□□ -0.59
PCBP2-222	ENST00000552296	CLRN2	A0PK11	232 aa		11.36	□□□□□ -0.59
PCBP2-222	ENST00000552296	POTEF	A5A3E0	1075 aa		11.36	□□□□□ -0.59
PCBP2-222	ENST00000552296		F6X3S4	739 aa		11.36	□□□□□ -0.59
PCBP2-222	ENST00000552296	SLC10A4	Q96EP9	437 aa		11.36	□□□□□ -0.59
PCBP2-222	ENST00000552296	TEPSIN	Q96N21	525 aa		11.36	□□□□□ -0.59
PCBP2-222	ENST00000552296	RANBP2	P49792	3224 aa	Known RBP	11.36	□□□□□ -0.59
PCBP2-222	ENST00000552296		F8W031	263 aa	Predicted RBP	11.35	□□□□□ -0.59
PCBP2-222	ENST00000552296	ATXN8OS	P0DMR3	200 aa		11.35	□□□□□ -0.59
PCBP2-222	ENST00000552296	KCNJ4	P48050	445 aa		11.35	□□□□□ -0.59
PCBP2-222	ENST00000552296	IFIT5	Q13325	482 aa	Known RBP	11.35	□□□□□ -0.59
PCBP2-222	ENST00000552296	LMBR1L	Q6UX01	489 aa		11.35	□□□□□ -0.59
PCBP2-222	ENST00000552296	ZNF804A	Q7Z570	1209 aa		11.35	□□□□□ -0.59
PCBP2-222	ENST00000552296	CDAN1	Q8IWY9	1227 aa		11.35	□□□□□ -0.59
PCBP2-222	ENST00000552296	TDRD7	Q8NHU6	1098 aa	Known RBP	11.35	□□□□□ -0.59
PCBP2-222	ENST00000552296	KAZALD1	Q96I82	304 aa		11.35	□□□□□ -0.59
PCBP2-222	ENST00000552296	ZNF594	Q96JF6	807 aa	Predicted RBP	11.35	□□□□□ -0.59
PCBP2-222	ENST00000552296	MS4A4A	Q96JQ5	239 aa		11.35	□□□□□ -0.59
PCBP2-222	ENST00000552296	PPP1R12B	O60237	982 aa	Predicted RBP	11.35	□□□□□ -0.59
PCBP2-222	ENST00000552296	CRHR2	Q13324	411 aa		11.35	□□□□□ -0.59
PCBP2-222	ENST00000552296	RASA3	Q14644	834 aa		11.35	□□□□□ -0.59
PCBP2-222	ENST00000552296	SUPT20HL1	Q3ZLR7	823 aa		11.35	□□□□□ -0.59
PCBP2-222	ENST00000552296	SPDYE2	Q495Y8	402 aa		11.35	□□□□□ -0.59
PCBP2-222	ENST00000552296	WDR63	Q8IWG1	891 aa		11.35	□□□□□ -0.59
PCBP2-222	ENST00000552296	ARMC5	Q96C12	935 aa		11.35	□□□□□ -0.59
PCBP2-222	ENST00000552296	JAG2	Q9Y219	1238 aa		11.35	□□□□□ -0.59
PCBP2-222	ENST00000552296	PTPN22	Q9Y2R2	807 aa		11.35	□□□□□ -0.59
PCBP2-222	ENST00000552296	TRIM17	Q9Y577	477 aa		11.35	□□□□□ -0.59
PCBP2-222	ENST00000552296	CEP290	O15078	2479 aa		11.34	□□□□□ -0.59
PCBP2-222	ENST00000552296	EXOSC9	Q06265	439 aa	Known RBP	11.34	□□□□□ -0.59

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