RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550655.5

CS-219, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 589 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-219ENST00000550655 OGFOD1Q8N543 542 aa22.13■■□□□ 1.13
CS-219ENST00000550655 COPRSQ9NQ92 184 aa22.13■■□□□ 1.13
CS-219ENST00000550655 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
CS-219ENST00000550655 JAG2Q9Y219 1238 aa22.13■■□□□ 1.13
CS-219ENST00000550655 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa22.12■■□□□ 1.13
CS-219ENST00000550655 SASH1O94885 1247 aa22.12■■□□□ 1.13
CS-219ENST00000550655 MMP14P50281 582 aa22.12■■□□□ 1.13
CS-219ENST00000550655 NBPF9Q3BBW0 867 aa22.12■■□□□ 1.13
CS-219ENST00000550655 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
CS-219ENST00000550655 TLL2Q9Y6L7 1015 aa22.12■■□□□ 1.13
CS-219ENST00000550655 WNT10BO00744 389 aa22.11■■□□□ 1.13
CS-219ENST00000550655 GNAI2P04899 355 aa22.11■■□□□ 1.13
CS-219ENST00000550655 VEGFBP49765 207 aa22.11■■□□□ 1.13
CS-219ENST00000550655 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
CS-219ENST00000550655 SRGAP3O43295 1099 aa22.1■■□□□ 1.13
CS-219ENST00000550655 DEFB115Q30KQ5 88 aa22.1■■□□□ 1.13
CS-219ENST00000550655 SULF1Q8IWU6 871 aa22.1■■□□□ 1.13
CS-219ENST00000550655 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
CS-219ENST00000550655 ZNF408Q9H9D4 720 aa22.1■■□□□ 1.13
CS-219ENST00000550655 HDAC9Q9UKV0 1011 aa22.1■■□□□ 1.13
CS-219ENST00000550655 IL15P40933 162 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
CS-219ENST00000550655 SAPCD2Q86UD0 394 aa22.09■■□□□ 1.13
CS-219ENST00000550655 LPIN2Q92539 896 aa22.09■■□□□ 1.13
CS-219ENST00000550655 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
CS-219ENST00000550655 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa22.08■■□□□ 1.13
CS-219ENST00000550655 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
CS-219ENST00000550655 BCAMP50895 628 aa22.08■■□□□ 1.13
CS-219ENST00000550655 CAVIN4Q5BKX8 364 aa22.08■■□□□ 1.13
CS-219ENST00000550655 VPS37DQ86XT2 251 aa22.08■■□□□ 1.13
CS-219ENST00000550655 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
CS-219ENST00000550655 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa22.07■■□□□ 1.12
CS-219ENST00000550655 F8W031 263 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
CS-219ENST00000550655 SLC5A1P13866 664 aa22.07■■□□□ 1.12
CS-219ENST00000550655 MFSD14BQ5SR56 506 aa22.07■■□□□ 1.12
CS-219ENST00000550655 MTMR14Q8NCE2 650 aa22.07■■□□□ 1.12
CS-219ENST00000550655 CDCA5Q96FF9 252 aa22.07■■□□□ 1.12
CS-219ENST00000550655 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
CS-219ENST00000550655 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa22.07■■□□□ 1.12
CS-219ENST00000550655 ATP2B3Q16720 1220 aa22.06■■□□□ 1.12
CS-219ENST00000550655 ITPRIPQ8IWB1 547 aa22.06■■□□□ 1.12
CS-219ENST00000550655 CEP126Q9P2H0 1117 aa22.06■■□□□ 1.12
CS-219ENST00000550655 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
CS-219ENST00000550655 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
CS-219ENST00000550655 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
CS-219ENST00000550655 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
CS-219ENST00000550655 DLGAP5Q15398 846 aa22.04■■□□□ 1.12
CS-219ENST00000550655 GRIK5Q16478 980 aa22.04■■□□□ 1.12
CS-219ENST00000550655 CFAP100Q494V2 611 aa22.04■■□□□ 1.12
CS-219ENST00000550655 CYP4F22Q6NT55 531 aa22.04■■□□□ 1.12
CS-219ENST00000550655 PANK1Q8TE04 598 aa22.04■■□□□ 1.12
CS-219ENST00000550655 HHIPL1Q96JK4 782 aa22.04■■□□□ 1.12
CS-219ENST00000550655 CAPNS2Q96L46 248 aa22.04■■□□□ 1.12
CS-219ENST00000550655 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
CS-219ENST00000550655 AOX1Q06278 1338 aa22.04■■□□□ 1.12
CS-219ENST00000550655 SPDYE2BA6NHP3 402 aa22.03■■□□□ 1.12
CS-219ENST00000550655 SPDYE6P0CI01 402 aa22.03■■□□□ 1.12
CS-219ENST00000550655 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
CS-219ENST00000550655 C1orf115Q9H7X2 142 aa22.03■■□□□ 1.12
CS-219ENST00000550655 RCAN3Q9UKA8 241 aa22.03■■□□□ 1.12
CS-219ENST00000550655 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
CS-219ENST00000550655 POLA2Q14181 598 aa22.02■■□□□ 1.12
CS-219ENST00000550655 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
CS-219ENST00000550655 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
CS-219ENST00000550655 TFCP2Q12800 502 aa22.01■■□□□ 1.11
CS-219ENST00000550655 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
CS-219ENST00000550655 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
CS-219ENST00000550655 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa22.01■■□□□ 1.11
CS-219ENST00000550655 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
CS-219ENST00000550655 ADORA1P30542 326 aa22■■□□□ 1.11
CS-219ENST00000550655 ECE1P42892 770 aa22■■□□□ 1.11
CS-219ENST00000550655 HUNKP57058 714 aa22■■□□□ 1.11
CS-219ENST00000550655 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa22■■□□□ 1.11
CS-219ENST00000550655 C2orf69Q8N8R5 385 aa22■■□□□ 1.11
CS-219ENST00000550655 SSH3Q8TE77 659 aa22■■□□□ 1.11
CS-219ENST00000550655 SERPINA10Q9UK55 444 aa22■■□□□ 1.11
CS-219ENST00000550655 PHKA1P46020 1223 aa21.99■■□□□ 1.11
CS-219ENST00000550655 ZBTB22O15209 634 aa21.98■■□□□ 1.11
CS-219ENST00000550655 ATP8B2P98198 1209 aa21.98■■□□□ 1.11
CS-219ENST00000550655 GRM1Q13255 1194 aa21.98■■□□□ 1.11
CS-219ENST00000550655 SSC5DA1L4H1 1573 aa21.98■■□□□ 1.11
CS-219ENST00000550655 A0A1B0GUL7 405 aa21.97■■□□□ 1.11
CS-219ENST00000550655 CLRN2A0PK11 232 aa21.97■■□□□ 1.11
CS-219ENST00000550655 AOC2O75106 756 aa21.97■■□□□ 1.11
CS-219ENST00000550655 MS4A1P11836 297 aa21.97■■□□□ 1.11
CS-219ENST00000550655 CRKP46108 304 aa21.97■■□□□ 1.11
CS-219ENST00000550655 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP21.97■■□□□ 1.11
CS-219ENST00000550655 TIMM10P62072 90 aa21.97■■□□□ 1.11
CS-219ENST00000550655 MYO1BO43795 1136 aa21.96■■□□□ 1.11
CS-219ENST00000550655 FKBP1BP68106 108 aa21.96■■□□□ 1.11
CS-219ENST00000550655 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
CS-219ENST00000550655 MVPQ14764 893 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
CS-219ENST00000550655 CCDC102BQ68D86 513 aa21.96■■□□□ 1.11
CS-219ENST00000550655 WDR66Q8TBY9 1149 aa21.96■■□□□ 1.11
CS-219ENST00000550655 WBP1LQ9NX94 342 aa21.96■■□□□ 1.11
CS-219ENST00000550655 AKAP2Q9Y2D5 859 aa21.96■■□□□ 1.11
CS-219ENST00000550655 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa21.96■■□□□ 1.11
CS-219ENST00000550655 SEMA3EO15041 775 aa21.95■■□□□ 1.1
CS-219ENST00000550655 SPDYE2Q495Y8 402 aa21.95■■□□□ 1.1
CS-219ENST00000550655 RGMBQ6NW40 437 aa21.95■■□□□ 1.1
CS-219ENST00000550655 CEP85Q6P2H3 762 aa21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.8 ms