RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533459.1

AP002989.1-201, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene AP002989.1, Length 562 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP002989.1-201ENST00000533459 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
AP002989.1-201ENST00000533459 USP5P45974 858 aa5.95□□□□□ -1.46
AP002989.1-201ENST00000533459 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
AP002989.1-201ENST00000533459 ZNF394Q53GI3 561 aa5.95□□□□□ -1.46
AP002989.1-201ENST00000533459 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
AP002989.1-201ENST00000533459 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
AP002989.1-201ENST00000533459 GPATCH3Q96I76 525 aa5.95□□□□□ -1.46
AP002989.1-201ENST00000533459 SUSD3Q96L08 255 aa5.95□□□□□ -1.46
AP002989.1-201ENST00000533459 GGNBP2Q9H3C7 697 aa5.95□□□□□ -1.46
AP002989.1-201ENST00000533459 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa5.95□□□□□ -1.46
AP002989.1-201ENST00000533459 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
AP002989.1-201ENST00000533459 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa5.94□□□□□ -1.46
AP002989.1-201ENST00000533459 UBR1Q8IWV7 1749 aa5.94□□□□□ -1.46
AP002989.1-201ENST00000533459 FAM187AA6NFU0 413 aa5.94□□□□□ -1.46
AP002989.1-201ENST00000533459 FIGNL2A6NMB9 653 aa5.94□□□□□ -1.46
AP002989.1-201ENST00000533459 OPLAHO14841 1288 aa5.94□□□□□ -1.46
AP002989.1-201ENST00000533459 ORC1Q13415 861 aa5.94□□□□□ -1.46
AP002989.1-201ENST00000533459 SPACA7Q96KW9 195 aa5.94□□□□□ -1.46
AP002989.1-201ENST00000533459 OSBPL2Q9H1P3 480 aa5.94□□□□□ -1.46
AP002989.1-201ENST00000533459 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa5.94□□□□□ -1.46
AP002989.1-201ENST00000533459 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa5.94□□□□□ -1.46
AP002989.1-201ENST00000533459 USP31Q70CQ4 1352 aa5.93□□□□□ -1.46
AP002989.1-201ENST00000533459 STRCP1A6NGW2 1772 aa5.93□□□□□ -1.46
AP002989.1-201ENST00000533459 MICAL2O94851 1124 aa5.93□□□□□ -1.46
AP002989.1-201ENST00000533459 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
AP002989.1-201ENST00000533459 TCEAL1Q15170 157 aa5.93□□□□□ -1.46
AP002989.1-201ENST00000533459 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
AP002989.1-201ENST00000533459 JAZF1Q86VZ6 243 aa5.93□□□□□ -1.46
AP002989.1-201ENST00000533459 BRINP2Q9C0B6 783 aa5.93□□□□□ -1.46
AP002989.1-201ENST00000533459 DNAJC25Q9H1X3 360 aa5.93□□□□□ -1.46
AP002989.1-201ENST00000533459 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP5.93□□□□□ -1.46
AP002989.1-201ENST00000533459 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa5.93□□□□□ -1.46
AP002989.1-201ENST00000533459 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
AP002989.1-201ENST00000533459 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa5.93□□□□□ -1.46
AP002989.1-201ENST00000533459 MAP3K1Q13233 1512 aa5.93□□□□□ -1.46
AP002989.1-201ENST00000533459 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
AP002989.1-201ENST00000533459 NOS1P29475 1434 aa5.92□□□□□ -1.46
AP002989.1-201ENST00000533459 TET3O43151 1660 aa5.92□□□□□ -1.46
AP002989.1-201ENST00000533459 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
AP002989.1-201ENST00000533459 TGFBR3LH3BV60 316 aa5.92□□□□□ -1.46
AP002989.1-201ENST00000533459 AVPP01185 164 aa5.92□□□□□ -1.46
AP002989.1-201ENST00000533459 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
AP002989.1-201ENST00000533459 MSX1P28360 303 aa5.92□□□□□ -1.46
AP002989.1-201ENST00000533459 IDH3AP50213 366 aa5.92□□□□□ -1.46
AP002989.1-201ENST00000533459 SERINC3Q13530 473 aa5.92□□□□□ -1.46
AP002989.1-201ENST00000533459 NBPF1Q3BBV0 1214 aa5.92□□□□□ -1.46
AP002989.1-201ENST00000533459 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa5.92□□□□□ -1.46
AP002989.1-201ENST00000533459 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa5.92□□□□□ -1.46
AP002989.1-201ENST00000533459 USP48Q86UV5 1035 aa5.92□□□□□ -1.46
AP002989.1-201ENST00000533459 ZIC5Q96T25 663 aa5.92□□□□□ -1.46
AP002989.1-201ENST00000533459 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa5.92□□□□□ -1.46
AP002989.1-201ENST00000533459 DNMT3LQ9UJW3 386 aa5.92□□□□□ -1.46
AP002989.1-201ENST00000533459 LMTK2Q8IWU2 1503 aa5.92□□□□□ -1.46
AP002989.1-201ENST00000533459 AFF2P51816 1311 aa5.92□□□□□ -1.46
AP002989.1-201ENST00000533459 TTLL8A6PVC2 850 aa5.91□□□□□ -1.46
AP002989.1-201ENST00000533459 SOBPA7XYQ1 873 aa5.91□□□□□ -1.46
AP002989.1-201ENST00000533459 POTECB2RU33 542 aa5.91□□□□□ -1.46
AP002989.1-201ENST00000533459 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
AP002989.1-201ENST00000533459 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
AP002989.1-201ENST00000533459 UPP2O95045 317 aa5.91□□□□□ -1.46
AP002989.1-201ENST00000533459 USPL1Q5W0Q7 1092 aa5.91□□□□□ -1.46
AP002989.1-201ENST00000533459 BICDL1Q6ZP65 573 aa5.91□□□□□ -1.46
AP002989.1-201ENST00000533459 ERMP1Q7Z2K6 904 aa5.91□□□□□ -1.46
AP002989.1-201ENST00000533459 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa5.91□□□□□ -1.46
AP002989.1-201ENST00000533459 RASGRP4Q8TDF6 673 aa5.91□□□□□ -1.46
AP002989.1-201ENST00000533459 ZFP42Q96MM3 310 aa5.91□□□□□ -1.46
AP002989.1-201ENST00000533459 GPAMQ9HCL2 828 aa5.91□□□□□ -1.46
AP002989.1-201ENST00000533459 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
AP002989.1-201ENST00000533459 ABCC5O15440 1437 aa5.91□□□□□ -1.46
AP002989.1-201ENST00000533459 DCCP43146 1447 aa5.91□□□□□ -1.46
AP002989.1-201ENST00000533459 VPS8Q8N3P4 1428 aa5.91□□□□□ -1.46
AP002989.1-201ENST00000533459 RIMS2Q9UQ26 1411 aa5.91□□□□□ -1.46
AP002989.1-201ENST00000533459 NWD1Q149M9 1564 aa5.9□□□□□ -1.46
AP002989.1-201ENST00000533459 PIK3C2BO00750 1634 aa5.9□□□□□ -1.46
AP002989.1-201ENST00000533459 GIPC1O14908 333 aa5.9□□□□□ -1.46
AP002989.1-201ENST00000533459 THBS1P07996 1170 aa5.9□□□□□ -1.46
AP002989.1-201ENST00000533459 TATP17735 454 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
AP002989.1-201ENST00000533459 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
AP002989.1-201ENST00000533459 HSD3B2P26439 372 aa5.9□□□□□ -1.46
AP002989.1-201ENST00000533459 INPP5BP32019 993 aa5.9□□□□□ -1.46
AP002989.1-201ENST00000533459 ST13P50502 369 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
AP002989.1-201ENST00000533459 C8orf34Q49A92 452 aa5.9□□□□□ -1.46
AP002989.1-201ENST00000533459 NBPF6Q5VWK0 638 aa5.9□□□□□ -1.46
AP002989.1-201ENST00000533459 BRINP3Q76B58 766 aa5.9□□□□□ -1.46
AP002989.1-201ENST00000533459 HS2ST1Q7LGA3 356 aa5.9□□□□□ -1.46
AP002989.1-201ENST00000533459 BTLAQ7Z6A9 289 aa5.9□□□□□ -1.46
AP002989.1-201ENST00000533459 KCNB2Q92953 911 aa5.9□□□□□ -1.46
AP002989.1-201ENST00000533459 NBPF4Q96M43 638 aa5.9□□□□□ -1.46
AP002989.1-201ENST00000533459 RUBCNLQ9H714 662 aa5.9□□□□□ -1.46
AP002989.1-201ENST00000533459 C12orf49Q9H741 205 aa5.9□□□□□ -1.46
AP002989.1-201ENST00000533459 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa5.9□□□□□ -1.46
AP002989.1-201ENST00000533459 SPG7Q9UQ90 795 aa5.9□□□□□ -1.46
AP002989.1-201ENST00000533459 KCNMB2Q9Y691 235 aa5.9□□□□□ -1.46
AP002989.1-201ENST00000533459 PHLPP1O60346 1717 aa5.9□□□□□ -1.47
AP002989.1-201ENST00000533459 SETD5Q9C0A6 1442 aa5.9□□□□□ -1.47
AP002989.1-201ENST00000533459 ADGRB3O60242 1522 aa5.89□□□□□ -1.47
AP002989.1-201ENST00000533459 MROH1Q8NDA8 1641 aa5.89□□□□□ -1.47
AP002989.1-201ENST00000533459 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa5.89□□□□□ -1.47
AP002989.1-201ENST00000533459 A0A1W2PNR3 127 aa5.89□□□□□ -1.47
AP002989.1-201ENST00000533459 ST8SIA5O15466 376 aa5.89□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.9 ms