RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492539.5

NELFE-212, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 3

Gene NELFE, Length 583 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-212ENST00000492539 TBC1D8O95759 1140 aa25.26■■□□□ 1.63
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NELFE-212ENST00000492539 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
NELFE-212ENST00000492539 ZNF804AQ7Z570 1209 aa25.26■■□□□ 1.63
NELFE-212ENST00000492539 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
NELFE-212ENST00000492539 SSC5DA1L4H1 1573 aa25.26■■□□□ 1.63
NELFE-212ENST00000492539 SREBF2Q12772 1141 aa25.25■■□□□ 1.63
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NELFE-212ENST00000492539 CFHR5Q9BXR6 569 aa25.25■■□□□ 1.63
NELFE-212ENST00000492539 DEFB129Q9H1M3 183 aa25.25■■□□□ 1.63
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NELFE-212ENST00000492539 MAP3K11Q16584 847 aa25.24■■□□□ 1.63
NELFE-212ENST00000492539 CCDC57Q2TAC2 916 aa25.24■■□□□ 1.63
NELFE-212ENST00000492539 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
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NELFE-212ENST00000492539 SPDYE2BA6NHP3 402 aa25.22■■□□□ 1.63
NELFE-212ENST00000492539 GPR25O00155 361 aa25.22■■□□□ 1.63
NELFE-212ENST00000492539 ALDH1L1O75891 902 aa25.22■■□□□ 1.63
NELFE-212ENST00000492539 SPDYE6P0CI01 402 aa25.22■■□□□ 1.63
NELFE-212ENST00000492539 CFAP100Q494V2 611 aa25.22■■□□□ 1.63
NELFE-212ENST00000492539 FZD1Q9UP38 647 aa25.22■■□□□ 1.63
NELFE-212ENST00000492539 HPS5Q9UPZ3 1129 aa25.22■■□□□ 1.63
NELFE-212ENST00000492539 F8W031 263 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
NELFE-212ENST00000492539 TAF7LQ5H9L4 462 aa25.2■■□□□ 1.62
NELFE-212ENST00000492539 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
NELFE-212ENST00000492539 CNNM1Q9NRU3 951 aa25.2■■□□□ 1.62
NELFE-212ENST00000492539 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
NELFE-212ENST00000492539 AOX1Q06278 1338 aa25.19■■□□□ 1.62
NELFE-212ENST00000492539 FAM205AQ6ZU69 1335 aa25.19■■□□□ 1.62
NELFE-212ENST00000492539 MYO1BO43795 1136 aa25.19■■□□□ 1.62
NELFE-212ENST00000492539 JAG2Q9Y219 1238 aa25.19■■□□□ 1.62
NELFE-212ENST00000492539 CLRN2A0PK11 232 aa25.18■■□□□ 1.62
NELFE-212ENST00000492539 UNCXA6NJT0 531 aa25.18■■□□□ 1.62
NELFE-212ENST00000492539 PLIN1O60240 522 aa25.18■■□□□ 1.62
NELFE-212ENST00000492539 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa25.18■■□□□ 1.62
NELFE-212ENST00000492539 OTOFQ9HC10 1997 aa25.18■■□□□ 1.62
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NELFE-212ENST00000492539 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
NELFE-212ENST00000492539 UBE4AQ14139 1066 aa25.17■■□□□ 1.62
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NELFE-212ENST00000492539 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa25.17■■□□□ 1.62
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NELFE-212ENST00000492539 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa25.16■■□□□ 1.62
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NELFE-212ENST00000492539 INHBEP58166 350 aa25.15■■□□□ 1.62
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NELFE-212ENST00000492539 VEZTQ9HBM0 779 aa25.15■■□□□ 1.62
NELFE-212ENST00000492539 ZNF521Q96K83 1311 aa25.14■■□□□ 1.62
NELFE-212ENST00000492539 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.62
NELFE-212ENST00000492539 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.62
NELFE-212ENST00000492539 IFNL1Q8IU54 200 aa25.14■■□□□ 1.62
NELFE-212ENST00000492539 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.62
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NELFE-212ENST00000492539 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
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NELFE-212ENST00000492539 GYG1P46976 350 aa25.13■■□□□ 1.61
NELFE-212ENST00000492539 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP25.13■■□□□ 1.61
NELFE-212ENST00000492539 MFSD14BQ5SR56 506 aa25.13■■□□□ 1.61
NELFE-212ENST00000492539 FAM9BQ8IZU0 186 aa25.13■■□□□ 1.61
NELFE-212ENST00000492539 SERPINA10Q9UK55 444 aa25.13■■□□□ 1.61
NELFE-212ENST00000492539 HTTP42858 3142 aa25.12■■□□□ 1.61
NELFE-212ENST00000492539 USP2O75604 605 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
NELFE-212ENST00000492539 RASA3Q14644 834 aa25.12■■□□□ 1.61
NELFE-212ENST00000492539 SPDYE2Q495Y8 402 aa25.12■■□□□ 1.61
NELFE-212ENST00000492539 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa25.12■■□□□ 1.61
NELFE-212ENST00000492539 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP25.11■■□□□ 1.61
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NELFE-212ENST00000492539 MROH5Q6ZUA9 1318 aa25.11■■□□□ 1.61
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NELFE-212ENST00000492539 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
NELFE-212ENST00000492539 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
NELFE-212ENST00000492539 CCER2I3L3R5 266 aa25.07■■□□□ 1.6
NELFE-212ENST00000492539 FBXO33Q7Z6M2 555 aa25.07■■□□□ 1.6
NELFE-212ENST00000492539 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
NELFE-212ENST00000492539 ANKRD44Q8N8A2 993 aa25.07■■□□□ 1.6
NELFE-212ENST00000492539 TEPSINQ96N21 525 aa25.07■■□□□ 1.6
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