RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485532.1

PRAME-212, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 709 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-212ENST00000485532 SUCLG2Q96I99 432 aa16■□□□□ 0.15
PRAME-212ENST00000485532 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
PRAME-212ENST00000485532 SAGE1Q9NXZ1 904 aa16■□□□□ 0.15
PRAME-212ENST00000485532 HDAC9Q9UKV0 1011 aa16■□□□□ 0.15
PRAME-212ENST00000485532 ECM29Q5VYK3 1845 aa15.99■□□□□ 0.15
PRAME-212ENST00000485532 IL1R1P14778 569 aa15.99■□□□□ 0.15
PRAME-212ENST00000485532 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa15.99■□□□□ 0.15
PRAME-212ENST00000485532 CNNM1Q9NRU3 951 aa15.99■□□□□ 0.15
PRAME-212ENST00000485532 ALDH1L1O75891 902 aa15.98■□□□□ 0.15
PRAME-212ENST00000485532 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
PRAME-212ENST00000485532 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
PRAME-212ENST00000485532 ZNF804AQ7Z570 1209 aa15.98■□□□□ 0.15
PRAME-212ENST00000485532 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
PRAME-212ENST00000485532 CLRN2A0PK11 232 aa15.97■□□□□ 0.15
PRAME-212ENST00000485532 DLGAP5Q15398 846 aa15.97■□□□□ 0.15
PRAME-212ENST00000485532 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
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PRAME-212ENST00000485532 GYG1P46976 350 aa15.96■□□□□ 0.15
PRAME-212ENST00000485532 CFAP100Q494V2 611 aa15.96■□□□□ 0.15
PRAME-212ENST00000485532 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
PRAME-212ENST00000485532 SSC5DA1L4H1 1573 aa15.96■□□□□ 0.14
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PRAME-212ENST00000485532 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
PRAME-212ENST00000485532 DEFB129Q9H1M3 183 aa15.95■□□□□ 0.14
PRAME-212ENST00000485532 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
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PRAME-212ENST00000485532 SPDYE6P0CI01 402 aa15.94■□□□□ 0.14
PRAME-212ENST00000485532 ARMC9Q7Z3E5 817 aa15.94■□□□□ 0.14
PRAME-212ENST00000485532 MTMR14Q8NCE2 650 aa15.94■□□□□ 0.14
PRAME-212ENST00000485532 UTYO14607 1347 aa15.94■□□□□ 0.14
PRAME-212ENST00000485532 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
PRAME-212ENST00000485532 RGS19P49795 217 aa15.93■□□□□ 0.14
PRAME-212ENST00000485532 LRRC24Q50LG9 513 aa15.93■□□□□ 0.14
PRAME-212ENST00000485532 LDLRAD1Q5T700 205 aa15.93■□□□□ 0.14
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PRAME-212ENST00000485532 ANKRD44Q8N8A2 993 aa15.93■□□□□ 0.14
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PRAME-212ENST00000485532 SSH1Q8WYL5 1049 aa15.93■□□□□ 0.14
PRAME-212ENST00000485532 CLMNQ96JQ2 1002 aa15.93■□□□□ 0.14
PRAME-212ENST00000485532 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
PRAME-212ENST00000485532 VEZTQ9HBM0 779 aa15.93■□□□□ 0.14
PRAME-212ENST00000485532 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa15.93■□□□□ 0.14
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PRAME-212ENST00000485532 TM4SF4P48230 202 aa15.92■□□□□ 0.14
PRAME-212ENST00000485532 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP15.92■□□□□ 0.14
PRAME-212ENST00000485532 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
PRAME-212ENST00000485532 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
PRAME-212ENST00000485532 UBE4AQ14139 1066 aa15.92■□□□□ 0.14
PRAME-212ENST00000485532 GRIK5Q16478 980 aa15.92■□□□□ 0.14
PRAME-212ENST00000485532 KLHDC4Q8TBB5 520 aa15.92■□□□□ 0.14
PRAME-212ENST00000485532 CDCA7LQ96GN5 454 aa15.92■□□□□ 0.14
PRAME-212ENST00000485532 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa15.92■□□□□ 0.14
PRAME-212ENST00000485532 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
PRAME-212ENST00000485532 FAM205AQ6ZU69 1335 aa15.92■□□□□ 0.14
PRAME-212ENST00000485532 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
PRAME-212ENST00000485532 ARAP2Q8WZ64 1704 aa15.91■□□□□ 0.14
PRAME-212ENST00000485532 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
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PRAME-212ENST00000485532 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
PRAME-212ENST00000485532 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
PRAME-212ENST00000485532 E9PSI1 815 aa15.9■□□□□ 0.14
PRAME-212ENST00000485532 SOX10P56693 466 aa15.9■□□□□ 0.14
PRAME-212ENST00000485532 SLFN5Q08AF3 891 aa15.9■□□□□ 0.14
PRAME-212ENST00000485532 SPRYD7Q5W111 196 aa15.9■□□□□ 0.14
PRAME-212ENST00000485532 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
PRAME-212ENST00000485532 CDAN1Q8IWY9 1227 aa15.9■□□□□ 0.14
PRAME-212ENST00000485532 USP44Q9H0E7 712 aa15.9■□□□□ 0.14
PRAME-212ENST00000485532 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
PRAME-212ENST00000485532 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
PRAME-212ENST00000485532 MYO1BO43795 1136 aa15.89■□□□□ 0.13
PRAME-212ENST00000485532 RASA3Q14644 834 aa15.89■□□□□ 0.13
PRAME-212ENST00000485532 METTL24Q5JXM2 366 aa15.89■□□□□ 0.13
PRAME-212ENST00000485532 SLC10A4Q96EP9 437 aa15.89■□□□□ 0.13
PRAME-212ENST00000485532 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
PRAME-212ENST00000485532 OTOFQ9HC10 1997 aa15.89■□□□□ 0.13
PRAME-212ENST00000485532 PTPRCP08575 1304 aa15.89■□□□□ 0.13
PRAME-212ENST00000485532 MROH5Q6ZUA9 1318 aa15.89■□□□□ 0.13
PRAME-212ENST00000485532 GPR25O00155 361 aa15.88■□□□□ 0.13
PRAME-212ENST00000485532 SREBF2Q12772 1141 aa15.88■□□□□ 0.13
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PRAME-212ENST00000485532 FBXO33Q7Z6M2 555 aa15.88■□□□□ 0.13
PRAME-212ENST00000485532 VGLL2Q8N8G2 317 aa15.88■□□□□ 0.13
PRAME-212ENST00000485532 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa15.88■□□□□ 0.13
PRAME-212ENST00000485532 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
PRAME-212ENST00000485532 USP2O75604 605 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
PRAME-212ENST00000485532 GJA5P36382 358 aa15.87■□□□□ 0.13
PRAME-212ENST00000485532 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP15.87■□□□□ 0.13
PRAME-212ENST00000485532 SPDYE2Q495Y8 402 aa15.87■□□□□ 0.13
PRAME-212ENST00000485532 WNK4Q96J92 1243 aa15.87■□□□□ 0.13
PRAME-212ENST00000485532 LAMB1P07942 1786 aa15.86■□□□□ 0.13
PRAME-212ENST00000485532 TCP10L2B9ZVM9 353 aa15.86■□□□□ 0.13
PRAME-212ENST00000485532 PDE8BO95263 885 aa15.86■□□□□ 0.13
PRAME-212ENST00000485532 CRKP46108 304 aa15.86■□□□□ 0.13
PRAME-212ENST00000485532 BCAMP50895 628 aa15.86■□□□□ 0.13
PRAME-212ENST00000485532 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa15.86■□□□□ 0.13
PRAME-212ENST00000485532 VPS37DQ86XT2 251 aa15.86■□□□□ 0.13
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