RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481121.5

NELFE-208, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 2

Gene NELFE, Length 1,543 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-208ENST00000481121 HDAC9Q9UKV0 1011 aa25.8■■□□□ 1.72
NELFE-208ENST00000481121 FAM205AQ6ZU69 1335 aa25.8■■□□□ 1.72
NELFE-208ENST00000481121 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP25.79■■□□□ 1.72
NELFE-208ENST00000481121 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP25.79■■□□□ 1.72
NELFE-208ENST00000481121 CERS5Q8N5B7 392 aa25.79■■□□□ 1.72
NELFE-208ENST00000481121 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP25.79■■□□□ 1.72
NELFE-208ENST00000481121 MMP14P50281 582 aa25.78■■□□□ 1.72
NELFE-208ENST00000481121 BCAMP50895 628 aa25.78■■□□□ 1.72
NELFE-208ENST00000481121 POLA2Q14181 598 aa25.78■■□□□ 1.72
NELFE-208ENST00000481121 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP25.78■■□□□ 1.72
NELFE-208ENST00000481121 CREBZFQ9NS37 354 aa25.78■■□□□ 1.72
NELFE-208ENST00000481121 GGA3Q9NZ52 723 aa25.78■■□□□ 1.72
NELFE-208ENST00000481121 TRAF5O00463 557 aa25.78■■□□□ 1.72
NELFE-208ENST00000481121 ATP8B2P98198 1209 aa25.78■■□□□ 1.72
NELFE-208ENST00000481121 PDE3AQ14432 1141 aa25.78■■□□□ 1.72
NELFE-208ENST00000481121 CDC37L1Q7L3B6 337 aa25.78■■□□□ 1.72
NELFE-208ENST00000481121 SSH3Q8TE77 659 aa25.78■■□□□ 1.72
NELFE-208ENST00000481121 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP25.78■■□□□ 1.72
NELFE-208ENST00000481121 TMEM88BA6NKF7 163 aa25.77■■□□□ 1.72
NELFE-208ENST00000481121 TFCP2Q12800 502 aa25.76■■□□□ 1.71
NELFE-208ENST00000481121 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP25.76■■□□□ 1.718e-8■■■□□ 18.4
NELFE-208ENST00000481121 SCARF1Q14162 830 aa25.76■■□□□ 1.71
NELFE-208ENST00000481121 MFSD14BQ5SR56 506 aa25.76■■□□□ 1.71
NELFE-208ENST00000481121 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP25.75■■□□□ 1.71
NELFE-208ENST00000481121 F8W031 263 aaPredicted RBP25.75■■□□□ 1.71
NELFE-208ENST00000481121 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP25.75■■□□□ 1.71
NELFE-208ENST00000481121 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP25.75■■□□□ 1.71
NELFE-208ENST00000481121 CEP85Q6P2H3 762 aa25.75■■□□□ 1.71
NELFE-208ENST00000481121 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP25.75■■□□□ 1.71
NELFE-208ENST00000481121 C20orf194Q5TEA3 1177 aa25.74■■□□□ 1.71
NELFE-208ENST00000481121 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP25.74■■□□□ 1.71
NELFE-208ENST00000481121 KRT26Q7Z3Y9 468 aa25.74■■□□□ 1.71
NELFE-208ENST00000481121 AKAP2Q9Y2D5 859 aa25.74■■□□□ 1.71
NELFE-208ENST00000481121 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP25.73■■□□□ 1.71
NELFE-208ENST00000481121 A0A1B0GUL7 405 aa25.73■■□□□ 1.71
NELFE-208ENST00000481121 NBPF9Q3BBW0 867 aa25.73■■□□□ 1.71
NELFE-208ENST00000481121 USP48Q86UV5 1035 aa25.73■■□□□ 1.71
NELFE-208ENST00000481121 SULF1Q8IWU6 871 aa25.73■■□□□ 1.71
NELFE-208ENST00000481121 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa25.73■■□□□ 1.71
NELFE-208ENST00000481121 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa25.73■■□□□ 1.71
NELFE-208ENST00000481121 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP25.72■■□□□ 1.71
NELFE-208ENST00000481121 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa25.72■■□□□ 1.71
NELFE-208ENST00000481121 WNT10BO00744 389 aa25.72■■□□□ 1.71
NELFE-208ENST00000481121 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa25.72■■□□□ 1.71
NELFE-208ENST00000481121 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP25.72■■□□□ 1.71
NELFE-208ENST00000481121 ADM5C9JUS6 153 aa25.71■■□□□ 1.71
NELFE-208ENST00000481121 SURF6O75683 361 aaKnown RBP25.71■■□□□ 1.71
NELFE-208ENST00000481121 ADORA1P30542 326 aa25.71■■□□□ 1.71
NELFE-208ENST00000481121 KLRG1Q96E93 195 aa25.71■■□□□ 1.71
NELFE-208ENST00000481121 TIMM10P62072 90 aa25.7■■□□□ 1.7
NELFE-208ENST00000481121 ZNF408Q9H9D4 720 aa25.7■■□□□ 1.7
NELFE-208ENST00000481121 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP25.7■■□□□ 1.7
NELFE-208ENST00000481121 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP25.7■■□□□ 1.7
NELFE-208ENST00000481121 PCNTO95613 3336 aa25.7■■□□□ 1.7
NELFE-208ENST00000481121 CELF2O95319 508 aaKnown RBP25.69■■□□□ 1.7
NELFE-208ENST00000481121 PHKA1P46020 1223 aa25.69■■□□□ 1.7
NELFE-208ENST00000481121 DLGAP5Q15398 846 aa25.69■■□□□ 1.7
NELFE-208ENST00000481121 CCDC102BQ68D86 513 aa25.68■■□□□ 1.7
NELFE-208ENST00000481121 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP25.68■■□□□ 1.7
NELFE-208ENST00000481121 CFAP100Q494V2 611 aa25.68■■□□□ 1.7
NELFE-208ENST00000481121 CST9Q5W186 159 aa25.68■■□□□ 1.7
NELFE-208ENST00000481121 MTMR14Q8NCE2 650 aa25.68■■□□□ 1.7
NELFE-208ENST00000481121 XAGE2Q96GT9 111 aa25.68■■□□□ 1.7
NELFE-208ENST00000481121 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP25.68■■□□□ 1.7
NELFE-208ENST00000481121 NEUROD6Q96NK8 337 aa25.68■■□□□ 1.7
NELFE-208ENST00000481121 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP25.68■■□□□ 1.7
NELFE-208ENST00000481121 CNTNAP1P78357 1384 aa25.67■■□□□ 1.7
NELFE-208ENST00000481121 SEMA3EO15041 775 aa25.67■■□□□ 1.7
NELFE-208ENST00000481121 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP25.67■■□□□ 1.7
NELFE-208ENST00000481121 RRP1P56182 461 aaKnown RBP25.67■■□□□ 1.7
NELFE-208ENST00000481121 DLK2Q6UY11 383 aa25.67■■□□□ 1.7
NELFE-208ENST00000481121 WDR66Q8TBY9 1149 aa25.67■■□□□ 1.7
NELFE-208ENST00000481121 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP25.67■■□□□ 1.7
NELFE-208ENST00000481121 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP25.66■■□□□ 1.7
NELFE-208ENST00000481121 SPDYE2BA6NHP3 402 aa25.65■■□□□ 1.7
NELFE-208ENST00000481121 HMMRO75330 724 aa25.65■■□□□ 1.7
NELFE-208ENST00000481121 SPDYE6P0CI01 402 aa25.65■■□□□ 1.7
NELFE-208ENST00000481121 GRIK5Q16478 980 aa25.65■■□□□ 1.7
NELFE-208ENST00000481121 SERPINA10Q9UK55 444 aa25.65■■□□□ 1.7
NELFE-208ENST00000481121 DENND2AQ9ULE3 1009 aa25.65■■□□□ 1.7
NELFE-208ENST00000481121 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa25.65■■□□□ 1.7
NELFE-208ENST00000481121 MYO1BO43795 1136 aa25.64■■□□□ 1.7
NELFE-208ENST00000481121 GORABQ5T7V8 394 aa25.64■■□□□ 1.7
NELFE-208ENST00000481121 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP25.64■■□□□ 1.7
NELFE-208ENST00000481121 CDCA5Q96FF9 252 aa25.64■■□□□ 1.7
NELFE-208ENST00000481121 GPR108Q9NPR9 543 aa25.64■■□□□ 1.7
NELFE-208ENST00000481121 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP25.64■■□□□ 1.7
NELFE-208ENST00000481121 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa25.64■■□□□ 1.7
NELFE-208ENST00000481121 MAST3O60307 1309 aa25.64■■□□□ 1.7
NELFE-208ENST00000481121 MYH2Q9UKX2 1941 aa25.64■■□□□ 1.69
NELFE-208ENST00000481121 TNNI3KQ59H18 835 aa25.63■■□□□ 1.69
NELFE-208ENST00000481121 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa25.63■■□□□ 1.69
NELFE-208ENST00000481121 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa25.63■■□□□ 1.69
NELFE-208ENST00000481121 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa25.63■■□□□ 1.69
NELFE-208ENST00000481121 RASSF10A6NK89 507 aa25.63■■□□□ 1.69
NELFE-208ENST00000481121 ZBTB22O15209 634 aa25.63■■□□□ 1.69
NELFE-208ENST00000481121 RASGRF1Q13972 1273 aa25.63■■□□□ 1.69
NELFE-208ENST00000481121 TLL2Q9Y6L7 1015 aa25.63■■□□□ 1.69
NELFE-208ENST00000481121 CRKP46108 304 aa25.62■■□□□ 1.69
NELFE-208ENST00000481121 ERC1Q8IUD2 1116 aa25.62■■□□□ 1.69
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