RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453216.1

TRAM2-AS1-201, Transcript of TRAM2 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TRAM2-AS1, Length 664 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DLGAP5Q15398 846 aa33.02■■■□□ 2.88
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SSH1Q8WYL5 1049 aa33.02■■■□□ 2.88
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CSRNP1Q96S65 589 aa33.01■■■□□ 2.87
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP33■■■□□ 2.87
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 UBE4AQ14139 1066 aa33■■■□□ 2.87
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP33■■■□□ 2.87
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP33■■■□□ 2.87
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP33■■■□□ 2.87
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RNF186Q9NXI6 227 aa33■■■□□ 2.87
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MTMR14Q8NCE2 650 aa32.99■■■□□ 2.87
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TRPA1O75762 1119 aa32.98■■■□□ 2.87
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP32.98■■■□□ 2.87
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 JAG2Q9Y219 1238 aa32.98■■■□□ 2.87
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 AKAP11Q9UKA4 1901 aa32.98■■■□□ 2.87
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa32.96■■■□□ 2.87
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MROH5Q6ZUA9 1318 aa32.96■■■□□ 2.87
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CFAP100Q494V2 611 aa32.95■■■□□ 2.87
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ANKRD44Q8N8A2 993 aa32.95■■■□□ 2.87
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CDCA7LQ96GN5 454 aa32.95■■■□□ 2.87
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MCOLN1Q9GZU1 580 aa32.95■■■□□ 2.87
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FAM205AQ6ZU69 1335 aa32.95■■■□□ 2.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP32.94■■■□□ 2.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GYG1P46976 350 aa32.94■■■□□ 2.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ALDH1L2Q3SY69 923 aa32.94■■■□□ 2.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ARMC9Q7Z3E5 817 aa32.94■■■□□ 2.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP32.94■■■□□ 2.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DEFB129Q9H1M3 183 aa32.94■■■□□ 2.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MYO1BO43795 1136 aa32.93■■■□□ 2.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DGKZQ13574 1117 aa32.93■■■□□ 2.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PRKG1Q13976 671 aa32.93■■■□□ 2.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP32.93■■■□□ 2.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa32.93■■■□□ 2.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SPDYE2BA6NHP3 402 aa32.92■■■□□ 2.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CCDC85CA6NKD9 419 aa32.92■■■□□ 2.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SPDYE6P0CI01 402 aa32.92■■■□□ 2.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ECM29Q5VYK3 1845 aa32.91■■■□□ 2.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 USP44Q9H0E7 712 aa32.91■■■□□ 2.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SMC4Q9NTJ3 1288 aa32.91■■■□□ 2.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP32.9■■■□□ 2.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LRRC24Q50LG9 513 aa32.9■■■□□ 2.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 METTL24Q5JXM2 366 aa32.9■■■□□ 2.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP32.9■■■□□ 2.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa32.9■■■□□ 2.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CLRN2A0PK11 232 aa32.89■■■□□ 2.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP32.89■■■□□ 2.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MFSD14BQ5SR56 506 aa32.89■■■□□ 2.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP32.88■■■□□ 2.85
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP32.88■■■□□ 2.85
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 VPS37DQ86XT2 251 aa32.87■■■□□ 2.85
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 VEZTQ9HBM0 779 aa32.87■■■□□ 2.85
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LDLRAD1Q5T700 205 aa32.86■■■□□ 2.85
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP32.86■■■□□ 2.85
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP32.85■■■□□ 2.85
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FBXO33Q7Z6M2 555 aa32.85■■■□□ 2.85
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KLHDC4Q8TBB5 520 aa32.85■■■□□ 2.85
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 AOX1Q06278 1338 aa32.84■■■□□ 2.85
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CAVIN4Q5BKX8 364 aa32.84■■■□□ 2.85
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 VGLL2Q8N8G2 317 aa32.84■■■□□ 2.85
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SERPINA10Q9UK55 444 aa32.84■■■□□ 2.85
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FZD1Q9UP38 647 aa32.84■■■□□ 2.85
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CCER2I3L3R5 266 aa32.83■■■□□ 2.85
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP32.83■■■□□ 2.85
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP32.83■■■□□ 2.85
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TM4SF4P48230 202 aa32.83■■■□□ 2.85
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa32.83■■■□□ 2.85
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ARAP2Q8WZ64 1704 aa32.82■■■□□ 2.85
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP32.82■■■□□ 2.84
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SSC5DA1L4H1 1573 aa32.82■■■□□ 2.84
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP32.81■■■□□ 2.84
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SREBF2Q12772 1141 aa32.81■■■□□ 2.84
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MAP3K11Q16584 847 aa32.81■■■□□ 2.84
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP32.8■■■□□ 2.84
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RASA3Q14644 834 aa32.8■■■□□ 2.84
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SPRYD7Q5W111 196 aa32.8■■■□□ 2.84
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SPDYE2Q495Y8 402 aa32.79■■■□□ 2.84
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP32.79■■■□□ 2.84
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC10A4Q96EP9 437 aa32.79■■■□□ 2.84
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP32.79■■■□□ 2.84
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP32.79■■■□□ 2.84
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TBC1D8O95759 1140 aa32.78■■■□□ 2.84
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TNFAIP1Q13829 316 aa32.78■■■□□ 2.84
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP32.78■■■□□ 2.84
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP32.78■■■□□ 2.84
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa32.78■■■□□ 2.84
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP32.78■■■□□ 2.84
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 EYA2O00167 538 aa32.77■■■□□ 2.84
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CRKP46108 304 aa32.77■■■□□ 2.84
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP32.77■■■□□ 2.84
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP32.77■■■□□ 2.84
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP32.76■■■□□ 2.83
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP32.76■■■□□ 2.83
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 BCAMP50895 628 aa32.76■■■□□ 2.83
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP32.76■■■□□ 2.83
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP32.76■■■□□ 2.83
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KIF16BQ96L93 1317 aa32.76■■■□□ 2.83
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 UNCXA6NJT0 531 aa32.75■■■□□ 2.83
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FGFR2P21802 821 aa32.75■■■□□ 2.83
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