RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446745.2

LTB-211, Transcript of lymphotoxin beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LTB, Length 853 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTB-211ENST00000446745 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP26.29■■□□□ 1.8
LTB-211ENST00000446745 DLGAP5Q15398 846 aa26.29■■□□□ 1.8
LTB-211ENST00000446745 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP26.29■■□□□ 1.8
LTB-211ENST00000446745 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP26.29■■□□□ 1.8
LTB-211ENST00000446745 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP26.29■■□□□ 1.8
LTB-211ENST00000446745 FBXO3Q9UK99 471 aa26.29■■□□□ 1.8
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LTB-211ENST00000446745 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP26.28■■□□□ 1.8
LTB-211ENST00000446745 IFFO2Q5TF58 517 aa26.28■■□□□ 1.8
LTB-211ENST00000446745 DLK2Q6UY11 383 aa26.28■■□□□ 1.8
LTB-211ENST00000446745 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa26.28■■□□□ 1.8
LTB-211ENST00000446745 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP26.28■■□□□ 1.8
LTB-211ENST00000446745 KLHDC4Q8TBB5 520 aa26.28■■□□□ 1.8
LTB-211ENST00000446745 FAM205AQ6ZU69 1335 aa26.28■■□□□ 1.8
LTB-211ENST00000446745 MYO1BO43795 1136 aa26.27■■□□□ 1.8
LTB-211ENST00000446745 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP26.27■■□□□ 1.8
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LTB-211ENST00000446745 NF2P35240 595 aa26.27■■□□□ 1.8
LTB-211ENST00000446745 FKBP1BP68106 108 aa26.27■■□□□ 1.8
LTB-211ENST00000446745 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP26.27■■□□□ 1.8
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LTB-211ENST00000446745 CERS5Q8N5B7 392 aa26.26■■□□□ 1.79
LTB-211ENST00000446745 VGLL2Q8N8G2 317 aa26.26■■□□□ 1.79
LTB-211ENST00000446745 MTMR14Q8NCE2 650 aa26.26■■□□□ 1.79
LTB-211ENST00000446745 ZBED9Q6R2W3 1325 aa26.25■■□□□ 1.79
LTB-211ENST00000446745 F8W031 263 aaPredicted RBP26.25■■□□□ 1.79
LTB-211ENST00000446745 BCAR3O75815 825 aa26.25■■□□□ 1.79
LTB-211ENST00000446745 CIAO1O76071 339 aa26.25■■□□□ 1.79
LTB-211ENST00000446745 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP26.25■■□□□ 1.79
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LTB-211ENST00000446745 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP26.25■■□□□ 1.79
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LTB-211ENST00000446745 JAG2Q9Y219 1238 aa26.25■■□□□ 1.79
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LTB-211ENST00000446745 TRIM27P14373 513 aa26.24■■□□□ 1.79
LTB-211ENST00000446745 FBXO33Q7Z6M2 555 aa26.24■■□□□ 1.79
LTB-211ENST00000446745 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa26.23■■□□□ 1.79
LTB-211ENST00000446745 AOC2O75106 756 aa26.23■■□□□ 1.79
LTB-211ENST00000446745 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP26.23■■□□□ 1.79
LTB-211ENST00000446745 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa26.23■■□□□ 1.79
LTB-211ENST00000446745 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa26.23■■□□□ 1.79
LTB-211ENST00000446745 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP26.23■■□□□ 1.79
LTB-211ENST00000446745 PRDM10Q9NQV6 1147 aa26.23■■□□□ 1.79
LTB-211ENST00000446745 ECM29Q5VYK3 1845 aa26.23■■□□□ 1.79
LTB-211ENST00000446745 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP26.23■■□□□ 1.79
LTB-211ENST00000446745 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP26.22■■□□□ 1.79
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LTB-211ENST00000446745 SIL1Q9H173 461 aa26.22■■□□□ 1.79
LTB-211ENST00000446745 CEP126Q9P2H0 1117 aa26.22■■□□□ 1.79
LTB-211ENST00000446745 ARAP2Q8WZ64 1704 aa26.22■■□□□ 1.79
LTB-211ENST00000446745 CA12O43570 354 aa26.21■■□□□ 1.79
LTB-211ENST00000446745 TNS4Q8IZW8 715 aa26.21■■□□□ 1.79
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LTB-211ENST00000446745 SPDYE6P0CI01 402 aa26.19■■□□□ 1.78
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LTB-211ENST00000446745 ATG9AQ7Z3C6 839 aa26.19■■□□□ 1.78
LTB-211ENST00000446745 CLUAP1Q96AJ1 413 aa26.19■■□□□ 1.78
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LTB-211ENST00000446745 ATP2B3Q16720 1220 aa26.17■■□□□ 1.78
LTB-211ENST00000446745 DEFB129Q9H1M3 183 aa26.17■■□□□ 1.78
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LTB-211ENST00000446745 ARMC9Q7Z3E5 817 aa26.16■■□□□ 1.78
LTB-211ENST00000446745 MYH13Q9UKX3 1938 aa26.16■■□□□ 1.78
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LTB-211ENST00000446745 TNFAIP1Q13829 316 aa26.15■■□□□ 1.78
LTB-211ENST00000446745 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP26.15■■□□□ 1.78
LTB-211ENST00000446745 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP26.15■■□□□ 1.78
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LTB-211ENST00000446745 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa26.15■■□□□ 1.78
LTB-211ENST00000446745 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP26.14■■□□□ 1.78
LTB-211ENST00000446745 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP26.14■■□□□ 1.78
LTB-211ENST00000446745 CLRN2A0PK11 232 aa26.13■■□□□ 1.77
LTB-211ENST00000446745 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP26.13■■□□□ 1.77
LTB-211ENST00000446745 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa26.13■■□□□ 1.77
LTB-211ENST00000446745 WDR66Q8TBY9 1149 aa26.13■■□□□ 1.77
LTB-211ENST00000446745 CRKP46108 304 aa26.12■■□□□ 1.77
LTB-211ENST00000446745 TMEM57Q8N5G2 664 aa26.12■■□□□ 1.77
LTB-211ENST00000446745 TEKT1Q969V4 418 aa26.12■■□□□ 1.77
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