RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437652.5

UBAP2L-209, Transcript of ubiquitin associated protein 2 like, human

TSL 3

Gene UBAP2L, Length 911 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBAP2L-209	ENST00000437652	ZBED3	Q96IU2	234 aa	Predicted RBP	32.91	■■■□□ 2.86
UBAP2L-209	ENST00000437652	CSRNP1	Q96S65	589 aa		32.91	■■■□□ 2.86
UBAP2L-209	ENST00000437652	PUS3	Q9BZE2	481 aa	Known RBP	32.91	■■■□□ 2.86
UBAP2L-209	ENST00000437652		A0A1B0GUL6	1792 aa		32.91	■■■□□ 2.86
UBAP2L-209	ENST00000437652	PAPPA2	Q9BXP8	1791 aa		32.91	■■■□□ 2.86
UBAP2L-209	ENST00000437652		F8W031	263 aa	Predicted RBP	32.9	■■■□□ 2.86
UBAP2L-209	ENST00000437652	TRPA1	O75762	1119 aa		32.9	■■■□□ 2.86
UBAP2L-209	ENST00000437652	FKBP1A	P62942	108 aa	Known RBP	32.9	■■■□□ 2.86
UBAP2L-209	ENST00000437652	RASAL3	Q86YV0	1011 aa		32.9	■■■□□ 2.86
UBAP2L-209	ENST00000437652	BICC1	Q9H694	974 aa	Known RBP	32.9	■■■□□ 2.86
UBAP2L-209	ENST00000437652	RNF186	Q9NXI6	227 aa		32.9	■■■□□ 2.86
UBAP2L-209	ENST00000437652	SAGE1	Q9NXZ1	904 aa		32.9	■■■□□ 2.86
UBAP2L-209	ENST00000437652	MROH5	Q6ZUA9	1318 aa		32.88	■■■□□ 2.85
UBAP2L-209	ENST00000437652	HIBADH	P31937	336 aa	Known RBP	32.88	■■■□□ 2.85
UBAP2L-209	ENST00000437652	MTMR14	Q8NCE2	650 aa		32.88	■■■□□ 2.85
UBAP2L-209	ENST00000437652	CDCA7L	Q96GN5	454 aa		32.88	■■■□□ 2.85
UBAP2L-209	ENST00000437652	JAG2	Q9Y219	1238 aa		32.88	■■■□□ 2.85
UBAP2L-209	ENST00000437652	RIPOR2	Q9Y4F9	1068 aa		32.88	■■■□□ 2.85
UBAP2L-209	ENST00000437652	MYO1B	O43795	1136 aa		32.87	■■■□□ 2.85
UBAP2L-209	ENST00000437652	ARMC9	Q7Z3E5	817 aa		32.87	■■■□□ 2.85
UBAP2L-209	ENST00000437652	ALDH1L2	Q3SY69	923 aa		32.86	■■■□□ 2.85
UBAP2L-209	ENST00000437652	RABL6	Q3YEC7	729 aa	Predicted RBP	32.86	■■■□□ 2.85
UBAP2L-209	ENST00000437652	CFAP100	Q494V2	611 aa		32.86	■■■□□ 2.85
UBAP2L-209	ENST00000437652	GYG1	P46976	350 aa		32.85	■■■□□ 2.85
UBAP2L-209	ENST00000437652	RBM5	P52756	815 aa	Known RBP eCLIP	32.85	■■■□□ 2.85
UBAP2L-209	ENST00000437652	TDRD7	Q8NHU6	1098 aa	Known RBP	32.85	■■■□□ 2.85
UBAP2L-209	ENST00000437652	CCDC85C	A6NKD9	419 aa		32.84	■■■□□ 2.85
UBAP2L-209	ENST00000437652	PRKG1	Q13976	671 aa		32.84	■■■□□ 2.85
UBAP2L-209	ENST00000437652	FAM84B	Q96KN1	310 aa	Predicted RBP	32.84	■■■□□ 2.85
UBAP2L-209	ENST00000437652	USP44	Q9H0E7	712 aa		32.84	■■■□□ 2.85
UBAP2L-209	ENST00000437652	DEFB129	Q9H1M3	183 aa		32.84	■■■□□ 2.85
UBAP2L-209	ENST00000437652	FAM205A	Q6ZU69	1335 aa		32.83	■■■□□ 2.85
UBAP2L-209	ENST00000437652	DGKZ	Q13574	1117 aa		32.83	■■■□□ 2.85
UBAP2L-209	ENST00000437652	VPS37D	Q86XT2	251 aa		32.83	■■■□□ 2.85
UBAP2L-209	ENST00000437652	ANKRD44	Q8N8A2	993 aa		32.83	■■■□□ 2.85
UBAP2L-209	ENST00000437652	MCOLN1	Q9GZU1	580 aa		32.83	■■■□□ 2.85
UBAP2L-209	ENST00000437652	SMC4	Q9NTJ3	1288 aa		32.83	■■■□□ 2.85
UBAP2L-209	ENST00000437652	PRMT6	Q96LA8	375 aa	Predicted RBP	32.82	■■■□□ 2.84
UBAP2L-209	ENST00000437652	PCDHAC2	Q9Y5I4	1007 aa		32.82	■■■□□ 2.84
UBAP2L-209	ENST00000437652	LRRC24	Q50LG9	513 aa		32.81	■■■□□ 2.84
UBAP2L-209	ENST00000437652	METTL24	Q5JXM2	366 aa		32.81	■■■□□ 2.84
UBAP2L-209	ENST00000437652	SPDYE2B	A6NHP3	402 aa		32.8	■■■□□ 2.84
UBAP2L-209	ENST00000437652	SPDYE6	P0CI01	402 aa		32.8	■■■□□ 2.84
UBAP2L-209	ENST00000437652	PTPN12	Q05209	780 aa	Known RBP	32.8	■■■□□ 2.84
UBAP2L-209	ENST00000437652	MFSD14B	Q5SR56	506 aa		32.8	■■■□□ 2.84
UBAP2L-209	ENST00000437652	ANGEL1	Q9UNK9	670 aa	Known RBP	32.8	■■■□□ 2.84
UBAP2L-209	ENST00000437652	CAVIN4	Q5BKX8	364 aa		32.79	■■■□□ 2.84
UBAP2L-209	ENST00000437652	TRMT2A	Q8IZ69	625 aa	Known RBP	32.79	■■■□□ 2.84
UBAP2L-209	ENST00000437652	PPP2R3B	Q9Y5P8	575 aa		32.79	■■■□□ 2.84
UBAP2L-209	ENST00000437652	CLRN2	A0PK11	232 aa		32.78	■■■□□ 2.84
UBAP2L-209	ENST00000437652	VEZT	Q9HBM0	779 aa		32.78	■■■□□ 2.84
UBAP2L-209	ENST00000437652	TTF2	Q9UNY4	1162 aa	Known RBP	32.78	■■■□□ 2.84
UBAP2L-209	ENST00000437652	CCER2	I3L3R5	266 aa		32.77	■■■□□ 2.84
UBAP2L-209	ENST00000437652	FRAT2	O75474	233 aa	Predicted RBP	32.77	■■■□□ 2.84
UBAP2L-209	ENST00000437652	PDE8B	O95263	885 aa		32.77	■■■□□ 2.84
UBAP2L-209	ENST00000437652	SUPT20HL1	Q3ZLR7	823 aa		32.77	■■■□□ 2.84
UBAP2L-209	ENST00000437652	FBXO33	Q7Z6M2	555 aa		32.77	■■■□□ 2.84
UBAP2L-209	ENST00000437652	COL1A1	P02452	1464 aa	Predicted RBP	32.76	■■■□□ 2.84
UBAP2L-209	ENST00000437652	PPP1R12B	O60237	982 aa	Predicted RBP	32.76	■■■□□ 2.83
UBAP2L-209	ENST00000437652	CT47B1	P0C2W7	299 aa	Predicted RBP	32.76	■■■□□ 2.83
UBAP2L-209	ENST00000437652	LDLRAD1	Q5T700	205 aa		32.76	■■■□□ 2.83
UBAP2L-209	ENST00000437652	ECM29	Q5VYK3	1845 aa		32.76	■■■□□ 2.83
UBAP2L-209	ENST00000437652	MKRN3	Q13064	507 aa	Known RBP	32.75	■■■□□ 2.83
UBAP2L-209	ENST00000437652	KLHDC4	Q8TBB5	520 aa		32.75	■■■□□ 2.83
UBAP2L-209	ENST00000437652	TM4SF4	P48230	202 aa		32.74	■■■□□ 2.83
UBAP2L-209	ENST00000437652	SLC10A4	Q96EP9	437 aa		32.74	■■■□□ 2.83
UBAP2L-209	ENST00000437652	SERPINA10	Q9UK55	444 aa		32.74	■■■□□ 2.83
UBAP2L-209	ENST00000437652	IQSEC3	Q9UPP2	1182 aa	Predicted RBP	32.74	■■■□□ 2.83
UBAP2L-209	ENST00000437652	ZBTB4	Q9P1Z0	1013 aa	Predicted RBP	32.73	■■■□□ 2.83
UBAP2L-209	ENST00000437652	NOB1	Q9ULX3	412 aa	Known RBP	32.72	■■■□□ 2.83
UBAP2L-209	ENST00000437652	FZD1	Q9UP38	647 aa		32.72	■■■□□ 2.83
UBAP2L-209	ENST00000437652	SREBF2	Q12772	1141 aa		32.71	■■■□□ 2.83
UBAP2L-209	ENST00000437652	CHAF1A	Q13111	956 aa	Predicted RBP	32.71	■■■□□ 2.83
UBAP2L-209	ENST00000437652	VGLL2	Q8N8G2	317 aa		32.71	■■■□□ 2.83
UBAP2L-209	ENST00000437652	IFIT1	P09914	478 aa	Known RBP	32.7	■■■□□ 2.83
UBAP2L-209	ENST00000437652	TNFAIP1	Q13829	316 aa		32.7	■■■□□ 2.83
UBAP2L-209	ENST00000437652	RASA3	Q14644	834 aa		32.7	■■■□□ 2.83
UBAP2L-209	ENST00000437652	MAP3K11	Q16584	847 aa		32.7	■■■□□ 2.83
UBAP2L-209	ENST00000437652	TBC1D22A	Q8WUA7	517 aa		32.7	■■■□□ 2.83
UBAP2L-209	ENST00000437652	TDRD3	Q9H7E2	651 aa	Known RBP	32.7	■■■□□ 2.83
UBAP2L-209	ENST00000437652	ZNF70	Q9UC06	446 aa	Predicted RBP	32.7	■■■□□ 2.83
UBAP2L-209	ENST00000437652	TBC1D8	O95759	1140 aa		32.69	■■■□□ 2.82
UBAP2L-209	ENST00000437652	BCAM	P50895	628 aa		32.69	■■■□□ 2.82
UBAP2L-209	ENST00000437652	NBPF12	Q5TAG4	269 aa	Predicted RBP	32.69	■■■□□ 2.82
UBAP2L-209	ENST00000437652	SPRYD7	Q5W111	196 aa		32.69	■■■□□ 2.82
UBAP2L-209	ENST00000437652	DZIP1L	Q8IYY4	767 aa	Known RBP	32.69	■■■□□ 2.82
UBAP2L-209	ENST00000437652	API5	Q9BZZ5	524 aa	Known RBP	32.69	■■■□□ 2.82
UBAP2L-209	ENST00000437652	HDAC5	Q9UQL6	1122 aa		32.69	■■■□□ 2.82
UBAP2L-209	ENST00000437652	AOX1	Q06278	1338 aa		32.69	■■■□□ 2.82
UBAP2L-209	ENST00000437652	EYA2	O00167	538 aa		32.68	■■■□□ 2.82
UBAP2L-209	ENST00000437652	UBTFL1	P0CB47	393 aa	Predicted RBP	32.68	■■■□□ 2.82
UBAP2L-209	ENST00000437652	CRK	P46108	304 aa		32.68	■■■□□ 2.82
UBAP2L-209	ENST00000437652	PUM3	Q15397	648 aa	Known RBP	32.68	■■■□□ 2.82
UBAP2L-209	ENST00000437652	IREB2	P48200	963 aa	Known RBP	32.67	■■■□□ 2.82
UBAP2L-209	ENST00000437652	SPDYE2	Q495Y8	402 aa		32.67	■■■□□ 2.82
UBAP2L-209	ENST00000437652	UNCX	A6NJT0	531 aa		32.66	■■■□□ 2.82
UBAP2L-209	ENST00000437652	RFX5	P48382	616 aa	Predicted RBP	32.66	■■■□□ 2.82
UBAP2L-209	ENST00000437652	CTU1	Q7Z7A3	348 aa	Known RBP	32.65	■■■□□ 2.82
UBAP2L-209	ENST00000437652	USP2	O75604	605 aa	Predicted RBP	32.64	■■■□□ 2.82
UBAP2L-209	ENST00000437652	FGFR2	P21802	821 aa		32.64	■■■□□ 2.82

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