RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000431413.5

HERC3-206, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 761 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-206ENST00000431413 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP19.05■□□□□ 0.64
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HERC3-206ENST00000431413 CERS5Q8N5B7 392 aa19.05■□□□□ 0.64
HERC3-206ENST00000431413 MTMR14Q8NCE2 650 aa19.05■□□□□ 0.64
HERC3-206ENST00000431413 ABHD8Q96I13 439 aa19.05■□□□□ 0.64
HERC3-206ENST00000431413 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP19.05■□□□□ 0.64
HERC3-206ENST00000431413 SMC4Q9NTJ3 1288 aa19.05■□□□□ 0.64
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HERC3-206ENST00000431413 F8W031 263 aaPredicted RBP19.04■□□□□ 0.64
HERC3-206ENST00000431413 ARMC9Q7Z3E5 817 aa19.04■□□□□ 0.64
HERC3-206ENST00000431413 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP19.04■□□□□ 0.64
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HERC3-206ENST00000431413 RASAL3Q86YV0 1011 aa19.03■□□□□ 0.64
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HERC3-206ENST00000431413 CSRNP1Q96S65 589 aa19.03■□□□□ 0.64
HERC3-206ENST00000431413 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa19.03■□□□□ 0.64
HERC3-206ENST00000431413 FAM205AQ6ZU69 1335 aa19.02■□□□□ 0.64
HERC3-206ENST00000431413 TRPA1O75762 1119 aa19.02■□□□□ 0.64
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HERC3-206ENST00000431413 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP19.02■□□□□ 0.64
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HERC3-206ENST00000431413 METTL24Q5JXM2 366 aa19.02■□□□□ 0.64
HERC3-206ENST00000431413 MOB2Q70IA6 237 aa19.02■□□□□ 0.64
HERC3-206ENST00000431413 ANKRD44Q8N8A2 993 aa19.02■□□□□ 0.64
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HERC3-206ENST00000431413 RNF186Q9NXI6 227 aa19.02■□□□□ 0.64
HERC3-206ENST00000431413 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa19.02■□□□□ 0.64
HERC3-206ENST00000431413 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP19.02■□□□□ 0.63
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HERC3-206ENST00000431413 DEFB129Q9H1M3 183 aa19.01■□□□□ 0.63
HERC3-206ENST00000431413 HDAC5Q9UQL6 1122 aa19.01■□□□□ 0.63
HERC3-206ENST00000431413 JAG2Q9Y219 1238 aa19.01■□□□□ 0.63
HERC3-206ENST00000431413 SPDYE2BA6NHP3 402 aa19■□□□□ 0.63
HERC3-206ENST00000431413 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP19■□□□□ 0.63
HERC3-206ENST00000431413 PDE8BO95263 885 aa19■□□□□ 0.63
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HERC3-206ENST00000431413 A0A1B0GUL6 1792 aa18.98■□□□□ 0.63
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HERC3-206ENST00000431413 LRRC24Q50LG9 513 aa18.98■□□□□ 0.63
HERC3-206ENST00000431413 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa18.98■□□□□ 0.63
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HERC3-206ENST00000431413 SREBF2Q12772 1141 aa18.96■□□□□ 0.63
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HERC3-206ENST00000431413 SLC10A4Q96EP9 437 aa18.95■□□□□ 0.62
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HERC3-206ENST00000431413 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa18.94■□□□□ 0.62
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HERC3-206ENST00000431413 FBXO3Q9UK99 471 aa18.94■□□□□ 0.62
HERC3-206ENST00000431413 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP18.94■□□□□ 0.62
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HERC3-206ENST00000431413 AKAP11Q9UKA4 1901 aa18.94■□□□□ 0.62
HERC3-206ENST00000431413 SLC5A1P13866 664 aa18.93■□□□□ 0.62
HERC3-206ENST00000431413 IREB2P48200 963 aaKnown RBP18.93■□□□□ 0.62
HERC3-206ENST00000431413 TNNI2P48788 182 aa18.93■□□□□ 0.62
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HERC3-206ENST00000431413 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP18.93■□□□□ 0.62
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HERC3-206ENST00000431413 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP18.93■□□□□ 0.62
HERC3-206ENST00000431413 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP18.93■□□□□ 0.62
HERC3-206ENST00000431413 CRKP46108 304 aa18.92■□□□□ 0.62
HERC3-206ENST00000431413 BCAMP50895 628 aa18.92■□□□□ 0.62
HERC3-206ENST00000431413 INHBEP58166 350 aa18.92■□□□□ 0.62
HERC3-206ENST00000431413 SPRYD7Q5W111 196 aa18.92■□□□□ 0.62
HERC3-206ENST00000431413 LPIN2Q92539 896 aa18.92■□□□□ 0.62
HERC3-206ENST00000431413 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP18.92■□□□□ 0.62
HERC3-206ENST00000431413 ALDH1A1P00352 501 aa18.91■□□□□ 0.62
HERC3-206ENST00000431413 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP18.91■□□□□ 0.62
HERC3-206ENST00000431413 RARSP54136 660 aaKnown RBP18.91■□□□□ 0.62
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