RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423945.5

SBDSP1-202, Transcript of SBDS, ribosome maturation factor pseudogene 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene SBDSP1, Length 618 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBDSP1-202ENST00000423945 GNAI3P08754 354 aa22.29■■□□□ 1.16
SBDSP1-202ENST00000423945 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
SBDSP1-202ENST00000423945 SAPCD2Q86UD0 394 aa22.29■■□□□ 1.16
SBDSP1-202ENST00000423945 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
SBDSP1-202ENST00000423945 OGFOD1Q8N543 542 aa22.28■■□□□ 1.16
SBDSP1-202ENST00000423945 SIL1Q9H173 461 aa22.28■■□□□ 1.16
SBDSP1-202ENST00000423945 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa22.28■■□□□ 1.16
SBDSP1-202ENST00000423945 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa22.28■■□□□ 1.16
SBDSP1-202ENST00000423945 ECM29Q5VYK3 1845 aa22.27■■□□□ 1.16
SBDSP1-202ENST00000423945 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
SBDSP1-202ENST00000423945 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
SBDSP1-202ENST00000423945 RLBP1P12271 317 aa22.27■■□□□ 1.16
SBDSP1-202ENST00000423945 MMP14P50281 582 aa22.27■■□□□ 1.16
SBDSP1-202ENST00000423945 MTX1Q13505 466 aa22.27■■□□□ 1.16
SBDSP1-202ENST00000423945 COPRSQ9NQ92 184 aa22.27■■□□□ 1.16
SBDSP1-202ENST00000423945 FBXO3Q9UK99 471 aa22.27■■□□□ 1.16
SBDSP1-202ENST00000423945 HDAC5Q9UQL6 1122 aa22.27■■□□□ 1.16
SBDSP1-202ENST00000423945 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
SBDSP1-202ENST00000423945 CIAO1O76071 339 aa22.26■■□□□ 1.15
SBDSP1-202ENST00000423945 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
SBDSP1-202ENST00000423945 CYP4F22Q6NT55 531 aa22.26■■□□□ 1.15
SBDSP1-202ENST00000423945 SULF1Q8IWU6 871 aa22.26■■□□□ 1.15
SBDSP1-202ENST00000423945 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
SBDSP1-202ENST00000423945 BCAMP50895 628 aa22.25■■□□□ 1.15
SBDSP1-202ENST00000423945 CDCA5Q96FF9 252 aa22.25■■□□□ 1.15
SBDSP1-202ENST00000423945 HDAC9Q9UKV0 1011 aa22.25■■□□□ 1.15
SBDSP1-202ENST00000423945 AOX1Q06278 1338 aa22.25■■□□□ 1.15
SBDSP1-202ENST00000423945 MYH13Q9UKX3 1938 aa22.24■■□□□ 1.15
SBDSP1-202ENST00000423945 F8W031 263 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
SBDSP1-202ENST00000423945 MTMR14Q8NCE2 650 aa22.24■■□□□ 1.15
SBDSP1-202ENST00000423945 CAPNS2Q96L46 248 aa22.24■■□□□ 1.15
SBDSP1-202ENST00000423945 GRIK5Q16478 980 aa22.23■■□□□ 1.15
SBDSP1-202ENST00000423945 MFSD14BQ5SR56 506 aa22.23■■□□□ 1.15
SBDSP1-202ENST00000423945 HHIPL1Q96JK4 782 aa22.23■■□□□ 1.15
SBDSP1-202ENST00000423945 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
SBDSP1-202ENST00000423945 SRGAP3O43295 1099 aa22.22■■□□□ 1.15
SBDSP1-202ENST00000423945 GNAI2P04899 355 aa22.22■■□□□ 1.15
SBDSP1-202ENST00000423945 CAVIN4Q5BKX8 364 aa22.22■■□□□ 1.15
SBDSP1-202ENST00000423945 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa22.22■■□□□ 1.15
SBDSP1-202ENST00000423945 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
SBDSP1-202ENST00000423945 LPIN2Q92539 896 aa22.22■■□□□ 1.15
SBDSP1-202ENST00000423945 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
SBDSP1-202ENST00000423945 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa22.21■■□□□ 1.15
SBDSP1-202ENST00000423945 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
SBDSP1-202ENST00000423945 IL15P40933 162 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
SBDSP1-202ENST00000423945 CFAP100Q494V2 611 aa22.21■■□□□ 1.15
SBDSP1-202ENST00000423945 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
SBDSP1-202ENST00000423945 VPS37DQ86XT2 251 aa22.21■■□□□ 1.15
SBDSP1-202ENST00000423945 CEP126Q9P2H0 1117 aa22.21■■□□□ 1.15
SBDSP1-202ENST00000423945 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
SBDSP1-202ENST00000423945 AOC2O75106 756 aa22.2■■□□□ 1.14
SBDSP1-202ENST00000423945 SLC5A1P13866 664 aa22.2■■□□□ 1.14
SBDSP1-202ENST00000423945 HUNKP57058 714 aa22.2■■□□□ 1.14
SBDSP1-202ENST00000423945 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
SBDSP1-202ENST00000423945 DLGAP5Q15398 846 aa22.2■■□□□ 1.14
SBDSP1-202ENST00000423945 ATP2B3Q16720 1220 aa22.2■■□□□ 1.14
SBDSP1-202ENST00000423945 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
SBDSP1-202ENST00000423945 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
SBDSP1-202ENST00000423945 SPDYE2BA6NHP3 402 aa22.19■■□□□ 1.14
SBDSP1-202ENST00000423945 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
SBDSP1-202ENST00000423945 SPDYE6P0CI01 402 aa22.19■■□□□ 1.14
SBDSP1-202ENST00000423945 ECE1P42892 770 aa22.19■■□□□ 1.14
SBDSP1-202ENST00000423945 GRM1Q13255 1194 aa22.19■■□□□ 1.14
SBDSP1-202ENST00000423945 WBP1LQ9NX94 342 aa22.19■■□□□ 1.14
SBDSP1-202ENST00000423945 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa22.19■■□□□ 1.14
SBDSP1-202ENST00000423945 FOXN1O15353 648 aa22.18■■□□□ 1.14
SBDSP1-202ENST00000423945 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
SBDSP1-202ENST00000423945 C2orf69Q8N8R5 385 aa22.18■■□□□ 1.14
SBDSP1-202ENST00000423945 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
SBDSP1-202ENST00000423945 ADORA1P30542 326 aa22.17■■□□□ 1.14
SBDSP1-202ENST00000423945 PANK1Q8TE04 598 aa22.17■■□□□ 1.14
SBDSP1-202ENST00000423945 C1orf115Q9H7X2 142 aa22.17■■□□□ 1.14
SBDSP1-202ENST00000423945 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
SBDSP1-202ENST00000423945 TFCP2Q12800 502 aa22.16■■□□□ 1.14
SBDSP1-202ENST00000423945 MOB2Q70IA6 237 aa22.16■■□□□ 1.14
SBDSP1-202ENST00000423945 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
SBDSP1-202ENST00000423945 ITPRIPQ8IWB1 547 aa22.16■■□□□ 1.14
SBDSP1-202ENST00000423945 ZIC5Q96T25 663 aa22.16■■□□□ 1.14
SBDSP1-202ENST00000423945 SERPINA10Q9UK55 444 aa22.16■■□□□ 1.14
SBDSP1-202ENST00000423945 CLRN2A0PK11 232 aa22.15■■□□□ 1.14
SBDSP1-202ENST00000423945 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
SBDSP1-202ENST00000423945 PHKA1P46020 1223 aa22.15■■□□□ 1.14
SBDSP1-202ENST00000423945 POLA2Q14181 598 aa22.15■■□□□ 1.14
SBDSP1-202ENST00000423945 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa22.15■■□□□ 1.14
SBDSP1-202ENST00000423945 CRKP46108 304 aa22.14■■□□□ 1.13
SBDSP1-202ENST00000423945 TIMM10P62072 90 aa22.14■■□□□ 1.13
SBDSP1-202ENST00000423945 RGMBQ6NW40 437 aa22.14■■□□□ 1.13
SBDSP1-202ENST00000423945 SSC5DA1L4H1 1573 aa22.13■■□□□ 1.13
SBDSP1-202ENST00000423945 MAP2K2P36507 400 aa22.13■■□□□ 1.13
SBDSP1-202ENST00000423945 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP22.13■■□□□ 1.13
SBDSP1-202ENST00000423945 ATP8B2P98198 1209 aa22.13■■□□□ 1.13
SBDSP1-202ENST00000423945 SSH3Q8TE77 659 aa22.13■■□□□ 1.13
SBDSP1-202ENST00000423945 DEFB129Q9H1M3 183 aa22.13■■□□□ 1.13
SBDSP1-202ENST00000423945 A0A1B0GUL7 405 aa22.12■■□□□ 1.13
SBDSP1-202ENST00000423945 FKBP1BP68106 108 aa22.12■■□□□ 1.13
SBDSP1-202ENST00000423945 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
SBDSP1-202ENST00000423945 TNS4Q8IZW8 715 aa22.12■■□□□ 1.13
SBDSP1-202ENST00000423945 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
SBDSP1-202ENST00000423945 ZBTB22O15209 634 aa22.11■■□□□ 1.13
SBDSP1-202ENST00000423945 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
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