RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419302.1

PDCL2P1-201, Transcript of phosducin-like 2 pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene PDCL2P1, Length 352 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL2P1-201ENST00000419302 PHACTR2O75167 634 aa6.28□□□□□ -1.4
PDCL2P1-201ENST00000419302 RXRBP28702 533 aa6.28□□□□□ -1.4
PDCL2P1-201ENST00000419302 IKBKEQ14164 716 aa6.28□□□□□ -1.4
PDCL2P1-201ENST00000419302 NUTM2GQ5VZR2 741 aa6.28□□□□□ -1.4
PDCL2P1-201ENST00000419302 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
PDCL2P1-201ENST00000419302 GIMAP7Q8NHV1 300 aa6.28□□□□□ -1.4
PDCL2P1-201ENST00000419302 SHKBP1Q8TBC3 707 aa6.28□□□□□ -1.4
PDCL2P1-201ENST00000419302 ASAP3Q8TDY4 903 aa6.28□□□□□ -1.4
PDCL2P1-201ENST00000419302 BSNDQ8WZ55 320 aa6.28□□□□□ -1.4
PDCL2P1-201ENST00000419302 HHIPQ96QV1 700 aa6.28□□□□□ -1.4
PDCL2P1-201ENST00000419302 USP26Q9BXU7 913 aa6.28□□□□□ -1.4
PDCL2P1-201ENST00000419302 POLIQ9UNA4 740 aa6.28□□□□□ -1.4
PDCL2P1-201ENST00000419302 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
PDCL2P1-201ENST00000419302 NFKBIEO00221 500 aa6.27□□□□□ -1.41
PDCL2P1-201ENST00000419302 EDN3P14138 238 aa6.27□□□□□ -1.41
PDCL2P1-201ENST00000419302 LCE1DQ5T752 114 aa6.27□□□□□ -1.41
PDCL2P1-201ENST00000419302 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
PDCL2P1-201ENST00000419302 SOX13Q9UN79 622 aa6.27□□□□□ -1.41
PDCL2P1-201ENST00000419302 MTMR7Q9Y216 660 aa6.27□□□□□ -1.41
PDCL2P1-201ENST00000419302 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
PDCL2P1-201ENST00000419302 ARID3CA6NKF2 412 aa6.26□□□□□ -1.41
PDCL2P1-201ENST00000419302 WDR64B1ANS9 1081 aa6.26□□□□□ -1.41
PDCL2P1-201ENST00000419302 USP5P45974 858 aa6.26□□□□□ -1.41
PDCL2P1-201ENST00000419302 EHHADHQ08426 723 aa6.26□□□□□ -1.41
PDCL2P1-201ENST00000419302 MTMR3Q13615 1198 aa6.26□□□□□ -1.41
PDCL2P1-201ENST00000419302 SNX29Q8TEQ0 813 aa6.26□□□□□ -1.41
PDCL2P1-201ENST00000419302 MFSD14AQ96MC6 490 aa6.26□□□□□ -1.41
PDCL2P1-201ENST00000419302 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa6.26□□□□□ -1.41
PDCL2P1-201ENST00000419302 CHRDQ9H2X0 955 aa6.26□□□□□ -1.41
PDCL2P1-201ENST00000419302 CYP4F12Q9HCS2 524 aa6.26□□□□□ -1.41
PDCL2P1-201ENST00000419302 EREGO14944 169 aa6.25□□□□□ -1.41
PDCL2P1-201ENST00000419302 TNFRSF21O75509 655 aa6.25□□□□□ -1.41
PDCL2P1-201ENST00000419302 WNT11O96014 354 aa6.25□□□□□ -1.41
PDCL2P1-201ENST00000419302 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
PDCL2P1-201ENST00000419302 TXKP42681 527 aa6.25□□□□□ -1.41
PDCL2P1-201ENST00000419302 HGSNATQ68CP4 663 aa6.25□□□□□ -1.41
PDCL2P1-201ENST00000419302 FBXL6Q8N531 539 aa6.25□□□□□ -1.41
PDCL2P1-201ENST00000419302 NXPE3Q969Y0 559 aa6.25□□□□□ -1.41
PDCL2P1-201ENST00000419302 ATG3Q9NT62 314 aa6.25□□□□□ -1.41
PDCL2P1-201ENST00000419302 MEGF11A6BM72 1044 aa6.24□□□□□ -1.41
PDCL2P1-201ENST00000419302 PRR19A6NJB7 356 aa6.24□□□□□ -1.41
PDCL2P1-201ENST00000419302 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
PDCL2P1-201ENST00000419302 FAM13AO94988 1023 aa6.24□□□□□ -1.41
PDCL2P1-201ENST00000419302 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
PDCL2P1-201ENST00000419302 SPINK2P20155 84 aa6.24□□□□□ -1.41
PDCL2P1-201ENST00000419302 USP11P51784 963 aa6.24□□□□□ -1.41
PDCL2P1-201ENST00000419302 SGO2Q562F6 1265 aa6.24□□□□□ -1.41
PDCL2P1-201ENST00000419302 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa6.24□□□□□ -1.41
PDCL2P1-201ENST00000419302 GSTM4Q03013 218 aa6.23□□□□□ -1.41
PDCL2P1-201ENST00000419302 NFKBIBQ15653 356 aa6.23□□□□□ -1.41
PDCL2P1-201ENST00000419302 VN1R5Q7Z5H4 357 aa6.23□□□□□ -1.41
PDCL2P1-201ENST00000419302 DTX1Q86Y01 620 aa6.23□□□□□ -1.41
PDCL2P1-201ENST00000419302 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa6.23□□□□□ -1.41
PDCL2P1-201ENST00000419302 PIM2Q9P1W9 311 aa6.23□□□□□ -1.41
PDCL2P1-201ENST00000419302 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
PDCL2P1-201ENST00000419302 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
PDCL2P1-201ENST00000419302 LEMD3Q9Y2U8 911 aa6.23□□□□□ -1.41
PDCL2P1-201ENST00000419302 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa6.22□□□□□ -1.41
PDCL2P1-201ENST00000419302 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
PDCL2P1-201ENST00000419302 ABL1P00519 1130 aa6.22□□□□□ -1.41
PDCL2P1-201ENST00000419302 SSFA2P28290 1259 aa6.22□□□□□ -1.41
PDCL2P1-201ENST00000419302 PAOXQ6QHF9 649 aa6.22□□□□□ -1.41
PDCL2P1-201ENST00000419302 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
PDCL2P1-201ENST00000419302 YIPF2Q9BWQ6 316 aa6.22□□□□□ -1.41
PDCL2P1-201ENST00000419302 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa6.22□□□□□ -1.41
PDCL2P1-201ENST00000419302 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa6.21□□□□□ -1.42
PDCL2P1-201ENST00000419302 ADAMTS4O75173 837 aa6.21□□□□□ -1.42
PDCL2P1-201ENST00000419302 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
PDCL2P1-201ENST00000419302 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
PDCL2P1-201ENST00000419302 FMNL2Q96PY5 1086 aa6.21□□□□□ -1.42
PDCL2P1-201ENST00000419302 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
PDCL2P1-201ENST00000419302 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
PDCL2P1-201ENST00000419302 SUGCTQ9HAC7 445 aa6.21□□□□□ -1.42
PDCL2P1-201ENST00000419302 RNF114Q9Y508 228 aa6.21□□□□□ -1.42
PDCL2P1-201ENST00000419302 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
PDCL2P1-201ENST00000419302 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
PDCL2P1-201ENST00000419302 DRD2P14416 443 aa6.2□□□□□ -1.42
PDCL2P1-201ENST00000419302 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
PDCL2P1-201ENST00000419302 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP6.2□□□□□ -1.42
PDCL2P1-201ENST00000419302 CCDC82Q8N4S0 544 aa6.2□□□□□ -1.42
PDCL2P1-201ENST00000419302 LATS2Q9NRM7 1088 aa6.2□□□□□ -1.42
PDCL2P1-201ENST00000419302 TMEM88BA6NKF7 163 aa6.19□□□□□ -1.42
PDCL2P1-201ENST00000419302 TIAF1O95411 115 aa6.19□□□□□ -1.42
PDCL2P1-201ENST00000419302 F13BP05160 661 aa6.19□□□□□ -1.42
PDCL2P1-201ENST00000419302 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP6.19□□□□□ -1.42
PDCL2P1-201ENST00000419302 FBLIM1Q8WUP2 373 aa6.19□□□□□ -1.42
PDCL2P1-201ENST00000419302 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
PDCL2P1-201ENST00000419302 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa6.19□□□□□ -1.42
PDCL2P1-201ENST00000419302 ANO2Q9NQ90 1003 aa6.19□□□□□ -1.42
PDCL2P1-201ENST00000419302 METTL12A8MUP2 240 aa6.18□□□□□ -1.42
PDCL2P1-201ENST00000419302 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
PDCL2P1-201ENST00000419302 FOSL1P15407 271 aa6.18□□□□□ -1.42
PDCL2P1-201ENST00000419302 NPR3P17342 541 aa6.18□□□□□ -1.42
PDCL2P1-201ENST00000419302 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
PDCL2P1-201ENST00000419302 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
PDCL2P1-201ENST00000419302 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
PDCL2P1-201ENST00000419302 TBC1D32Q96NH3 1257 aa6.18□□□□□ -1.42
PDCL2P1-201ENST00000419302 CCDC87Q9NVE4 849 aa6.18□□□□□ -1.42
PDCL2P1-201ENST00000419302 A0A096LPE4 126 aa6.17□□□□□ -1.42
PDCL2P1-201ENST00000419302 A0A1W2PPZ6 126 aa6.17□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.6 ms