RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000404321.3

PTPRN2-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N2, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRN2, Length 1,374 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN2-204ENST00000404321 CAVIN4Q5BKX8 364 aa22.63■■□□□ 1.21
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PTPRN2-204ENST00000404321 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
PTPRN2-204ENST00000404321 FGFR2P21802 821 aa22.62■■□□□ 1.21
PTPRN2-204ENST00000404321 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
PTPRN2-204ENST00000404321 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
PTPRN2-204ENST00000404321 FBXO33Q7Z6M2 555 aa22.62■■□□□ 1.21
PTPRN2-204ENST00000404321 SULF1Q8IWU6 871 aa22.62■■□□□ 1.21
PTPRN2-204ENST00000404321 PANK1Q8TE04 598 aa22.62■■□□□ 1.21
PTPRN2-204ENST00000404321 C1orf115Q9H7X2 142 aa22.62■■□□□ 1.21
PTPRN2-204ENST00000404321 HDAC9Q9UKV0 1011 aa22.62■■□□□ 1.21
PTPRN2-204ENST00000404321 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
PTPRN2-204ENST00000404321 VEGFBP49765 207 aa22.61■■□□□ 1.21
PTPRN2-204ENST00000404321 COPRSQ9NQ92 184 aa22.61■■□□□ 1.21
PTPRN2-204ENST00000404321 CEP126Q9P2H0 1117 aa22.61■■□□□ 1.21
PTPRN2-204ENST00000404321 WNT10BO00744 389 aa22.6■■□□□ 1.21
PTPRN2-204ENST00000404321 SLC5A1P13866 664 aa22.6■■□□□ 1.21
PTPRN2-204ENST00000404321 GRM1Q13255 1194 aa22.6■■□□□ 1.21
PTPRN2-204ENST00000404321 MTX1Q13505 466 aa22.6■■□□□ 1.21
PTPRN2-204ENST00000404321 DEFB115Q30KQ5 88 aa22.6■■□□□ 1.21
PTPRN2-204ENST00000404321 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa22.6■■□□□ 1.21
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PTPRN2-204ENST00000404321 FAM205AQ6ZU69 1335 aa22.59■■□□□ 1.21
PTPRN2-204ENST00000404321 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa22.59■■□□□ 1.21
PTPRN2-204ENST00000404321 RASSF10A6NK89 507 aa22.59■■□□□ 1.21
PTPRN2-204ENST00000404321 IL15P40933 162 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
PTPRN2-204ENST00000404321 ATP2B3Q16720 1220 aa22.59■■□□□ 1.21
PTPRN2-204ENST00000404321 MFSD14BQ5SR56 506 aa22.59■■□□□ 1.21
PTPRN2-204ENST00000404321 LPIN2Q92539 896 aa22.59■■□□□ 1.21
PTPRN2-204ENST00000404321 FBXO3Q9UK99 471 aa22.59■■□□□ 1.21
PTPRN2-204ENST00000404321 CDCA5Q96FF9 252 aa22.58■■□□□ 1.21
PTPRN2-204ENST00000404321 RCAN3Q9UKA8 241 aa22.58■■□□□ 1.21
PTPRN2-204ENST00000404321 TLL2Q9Y6L7 1015 aa22.58■■□□□ 1.21
PTPRN2-204ENST00000404321 DLGAP5Q15398 846 aa22.57■■□□□ 1.2
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PTPRN2-204ENST00000404321 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa22.56■■□□□ 1.2
PTPRN2-204ENST00000404321 SAPCD2Q86UD0 394 aa22.56■■□□□ 1.2
PTPRN2-204ENST00000404321 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
PTPRN2-204ENST00000404321 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP22.55■■□□□ 1.24e-6■■■□□ 15.8
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PTPRN2-204ENST00000404321 GRIK5Q16478 980 aa22.55■■□□□ 1.2
PTPRN2-204ENST00000404321 CFAP100Q494V2 611 aa22.55■■□□□ 1.2
PTPRN2-204ENST00000404321 CYP4F22Q6NT55 531 aa22.55■■□□□ 1.2
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PTPRN2-204ENST00000404321 CAPNS2Q96L46 248 aa22.54■■□□□ 1.2
PTPRN2-204ENST00000404321 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
PTPRN2-204ENST00000404321 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa22.54■■□□□ 1.2
PTPRN2-204ENST00000404321 ADORA1P30542 326 aa22.53■■□□□ 1.2
PTPRN2-204ENST00000404321 MMP14P50281 582 aa22.53■■□□□ 1.2
PTPRN2-204ENST00000404321 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
PTPRN2-204ENST00000404321 AOX1Q06278 1338 aa22.53■■□□□ 1.2
PTPRN2-204ENST00000404321 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
PTPRN2-204ENST00000404321 PCNTO95613 3336 aa22.53■■□□□ 1.2
PTPRN2-204ENST00000404321 CLRN2A0PK11 232 aa22.52■■□□□ 1.2
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PTPRN2-204ENST00000404321 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
PTPRN2-204ENST00000404321 HUNKP57058 714 aa22.52■■□□□ 1.2
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PTPRN2-204ENST00000404321 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
PTPRN2-204ENST00000404321 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
PTPRN2-204ENST00000404321 SPDYE2BA6NHP3 402 aa22.51■■□□□ 1.19
PTPRN2-204ENST00000404321 SPDYE6P0CI01 402 aa22.51■■□□□ 1.19
PTPRN2-204ENST00000404321 ATP8B2P98198 1209 aa22.51■■□□□ 1.19
PTPRN2-204ENST00000404321 C2orf69Q8N8R5 385 aa22.51■■□□□ 1.19
PTPRN2-204ENST00000404321 PHKA1P46020 1223 aa22.5■■□□□ 1.19
PTPRN2-204ENST00000404321 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP22.5■■□□□ 1.19
PTPRN2-204ENST00000404321 COG6Q9Y2V7 657 aa22.5■■□□□ 1.19
PTPRN2-204ENST00000404321 TRPM7Q96QT4 1865 aa22.5■■□□□ 1.19
PTPRN2-204ENST00000404321 A0A1B0GUL7 405 aa22.5■■□□□ 1.19
PTPRN2-204ENST00000404321 POLA2Q14181 598 aa22.5■■□□□ 1.19
PTPRN2-204ENST00000404321 MTMR14Q8NCE2 650 aa22.5■■□□□ 1.19
PTPRN2-204ENST00000404321 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa22.5■■□□□ 1.19
PTPRN2-204ENST00000404321 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
PTPRN2-204ENST00000404321 MS4A1P11836 297 aa22.49■■□□□ 1.19
PTPRN2-204ENST00000404321 ECE1P42892 770 aa22.49■■□□□ 1.19
PTPRN2-204ENST00000404321 MOB2Q70IA6 237 aa22.49■■□□□ 1.19
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PTPRN2-204ENST00000404321 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
PTPRN2-204ENST00000404321 MYO1BO43795 1136 aa22.48■■□□□ 1.19
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PTPRN2-204ENST00000404321 CRKP46108 304 aa22.48■■□□□ 1.19
PTPRN2-204ENST00000404321 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
PTPRN2-204ENST00000404321 MVPQ14764 893 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
PTPRN2-204ENST00000404321 CCDC102BQ68D86 513 aa22.48■■□□□ 1.19
PTPRN2-204ENST00000404321 SSH3Q8TE77 659 aa22.48■■□□□ 1.19
PTPRN2-204ENST00000404321 XAGE2Q96GT9 111 aa22.48■■□□□ 1.19
PTPRN2-204ENST00000404321 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
PTPRN2-204ENST00000404321 SERPINA10Q9UK55 444 aa22.48■■□□□ 1.19
PTPRN2-204ENST00000404321 AKAP2Q9Y2D5 859 aa22.48■■□□□ 1.19
PTPRN2-204ENST00000404321 SURF6O75683 361 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
PTPRN2-204ENST00000404321 DEFB129Q9H1M3 183 aa22.47■■□□□ 1.19
PTPRN2-204ENST00000404321 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
PTPRN2-204ENST00000404321 PRKG1Q13976 671 aa22.46■■□□□ 1.19
PTPRN2-204ENST00000404321 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
PTPRN2-204ENST00000404321 C20orf194Q5TEA3 1177 aa22.46■■□□□ 1.19
PTPRN2-204ENST00000404321 CEP85Q6P2H3 762 aa22.46■■□□□ 1.19
PTPRN2-204ENST00000404321 RGMBQ6NW40 437 aa22.45■■□□□ 1.18
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