RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000400053.8

PTPRM-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRM, Length 5,292 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-202ENST00000400053 G2E3Q7L622 706 aa10.08□□□□□ -0.8
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PTPRM-202ENST00000400053 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP10.08□□□□□ -0.8
PTPRM-202ENST00000400053 CTAGE9A4FU28 777 aa10.07□□□□□ -0.8
PTPRM-202ENST00000400053 HOXC9P31274 260 aa10.07□□□□□ -0.8
PTPRM-202ENST00000400053 EVCP57679 992 aa10.07□□□□□ -0.8
PTPRM-202ENST00000400053 RRAGBQ5VZM2 374 aa10.07□□□□□ -0.8
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP10.07□□□□□ -0.8
PTPRM-202ENST00000400053 KIAA0753Q2KHM9 967 aa10.07□□□□□ -0.8
PTPRM-202ENST00000400053 FAM173BQ6P4H8 233 aa10.07□□□□□ -0.8
PTPRM-202ENST00000400053 COPS6Q7L5N1 327 aa10.07□□□□□ -0.8
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PTPRM-202ENST00000400053 TTC37Q6PGP7 1564 aa10.07□□□□□ -0.8
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PTPRM-202ENST00000400053 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP10.03□□□□□ -0.8
PTPRM-202ENST00000400053 CHRNA2Q15822 529 aa10.03□□□□□ -0.8
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PTPRM-202ENST00000400053 ERMNQ8TAM6 284 aa10.03□□□□□ -0.8
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PTPRM-202ENST00000400053 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
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