RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000378357.8

CA9-201, Transcript of carbonic anhydrase 9, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CA9, Length 1,618 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA9-201ENST00000378357 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa22.22■■□□□ 1.15
CA9-201ENST00000378357 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
CA9-201ENST00000378357 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
CA9-201ENST00000378357 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
CA9-201ENST00000378357 SSC5DA1L4H1 1573 aa22.21■■□□□ 1.15
CA9-201ENST00000378357 UTYO14607 1347 aa22.2■■□□□ 1.15
CA9-201ENST00000378357 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa22.2■■□□□ 1.15
CA9-201ENST00000378357 ZNF804AQ7Z570 1209 aa22.2■■□□□ 1.15
CA9-201ENST00000378357 MTMR14Q8NCE2 650 aa22.2■■□□□ 1.15
CA9-201ENST00000378357 AOX1Q06278 1338 aa22.2■■□□□ 1.14
CA9-201ENST00000378357 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
CA9-201ENST00000378357 OTOFQ9HC10 1997 aa22.19■■□□□ 1.14
CA9-201ENST00000378357 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
CA9-201ENST00000378357 SLFN5Q08AF3 891 aa22.19■■□□□ 1.14
CA9-201ENST00000378357 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
CA9-201ENST00000378357 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
CA9-201ENST00000378357 CNNM1Q9NRU3 951 aa22.19■■□□□ 1.14
CA9-201ENST00000378357 JAG2Q9Y219 1238 aa22.19■■□□□ 1.14
CA9-201ENST00000378357 PLIN1O60240 522 aa22.18■■□□□ 1.14
CA9-201ENST00000378357 RGS19P49795 217 aa22.18■■□□□ 1.14
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CA9-201ENST00000378357 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
CA9-201ENST00000378357 TAF7LQ5H9L4 462 aa22.18■■□□□ 1.14
CA9-201ENST00000378357 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP22.17■■□□□ 1.14
CA9-201ENST00000378357 DLGAP5Q15398 846 aa22.17■■□□□ 1.14
CA9-201ENST00000378357 F8W031 263 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
CA9-201ENST00000378357 NF2P35240 595 aa22.17■■□□□ 1.14
CA9-201ENST00000378357 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
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CA9-201ENST00000378357 FZD1Q9UP38 647 aa22.17■■□□□ 1.14
CA9-201ENST00000378357 FAM205AQ6ZU69 1335 aa22.16■■□□□ 1.14
CA9-201ENST00000378357 PRKG1Q13976 671 aa22.16■■□□□ 1.14
CA9-201ENST00000378357 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
CA9-201ENST00000378357 CFAP100Q494V2 611 aa22.16■■□□□ 1.14
CA9-201ENST00000378357 LDLRAD1Q5T700 205 aa22.16■■□□□ 1.14
CA9-201ENST00000378357 SPDYE2BA6NHP3 402 aa22.15■■□□□ 1.14
CA9-201ENST00000378357 SPDYE6P0CI01 402 aa22.15■■□□□ 1.14
CA9-201ENST00000378357 UBE4AQ14139 1066 aa22.15■■□□□ 1.14
CA9-201ENST00000378357 ANKRD44Q8N8A2 993 aa22.15■■□□□ 1.14
CA9-201ENST00000378357 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
CA9-201ENST00000378357 DEFB129Q9H1M3 183 aa22.15■■□□□ 1.14
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CA9-201ENST00000378357 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa22.15■■□□□ 1.14
CA9-201ENST00000378357 MYH13Q9UKX3 1938 aa22.15■■□□□ 1.14
CA9-201ENST00000378357 ZBED9Q6R2W3 1325 aa22.14■■□□□ 1.14
CA9-201ENST00000378357 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.14
CA9-201ENST00000378357 HTTP42858 3142 aa22.14■■□□□ 1.13
CA9-201ENST00000378357 GYG1P46976 350 aa22.13■■□□□ 1.13
CA9-201ENST00000378357 TM4SF4P48230 202 aa22.13■■□□□ 1.13
CA9-201ENST00000378357 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
CA9-201ENST00000378357 ARMC9Q7Z3E5 817 aa22.13■■□□□ 1.13
CA9-201ENST00000378357 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
CA9-201ENST00000378357 CLRN2A0PK11 232 aa22.13■■□□□ 1.13
CA9-201ENST00000378357 SSH1Q8WYL5 1049 aa22.13■■□□□ 1.13
CA9-201ENST00000378357 CDCA7LQ96GN5 454 aa22.13■■□□□ 1.13
CA9-201ENST00000378357 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
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CA9-201ENST00000378357 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa22.11■■□□□ 1.13
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CA9-201ENST00000378357 MROH5Q6ZUA9 1318 aa22.1■■□□□ 1.13
CA9-201ENST00000378357 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
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CA9-201ENST00000378357 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
CA9-201ENST00000378357 CLMNQ96JQ2 1002 aa22.09■■□□□ 1.13
CA9-201ENST00000378357 VEZTQ9HBM0 779 aa22.09■■□□□ 1.13
CA9-201ENST00000378357 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa22.09■■□□□ 1.13
CA9-201ENST00000378357 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
CA9-201ENST00000378357 GRIK5Q16478 980 aa22.08■■□□□ 1.13
CA9-201ENST00000378357 FBXO33Q7Z6M2 555 aa22.08■■□□□ 1.13
CA9-201ENST00000378357 KLHDC4Q8TBB5 520 aa22.08■■□□□ 1.13
CA9-201ENST00000378357 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
CA9-201ENST00000378357 USP44Q9H0E7 712 aa22.08■■□□□ 1.13
CA9-201ENST00000378357 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa22.08■■□□□ 1.13
CA9-201ENST00000378357 MYO1BO43795 1136 aa22.07■■□□□ 1.12
CA9-201ENST00000378357 SPDYE2Q495Y8 402 aa22.07■■□□□ 1.12
CA9-201ENST00000378357 CFHR5Q9BXR6 569 aa22.07■■□□□ 1.12
CA9-201ENST00000378357 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
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CA9-201ENST00000378357 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
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CA9-201ENST00000378357 CDAN1Q8IWY9 1227 aa22.05■■□□□ 1.12
CA9-201ENST00000378357 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
CA9-201ENST00000378357 USP2O75604 605 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
CA9-201ENST00000378357 PDE8BO95263 885 aa22.04■■□□□ 1.12
CA9-201ENST00000378357 ALDH1L2Q3SY69 923 aa22.04■■□□□ 1.12
CA9-201ENST00000378357 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa22.04■■□□□ 1.12
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