RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000272317.10

RPS27A-201, Transcript of ribosomal protein S27a, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RPS27A, Length 1,071 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS27A-201ENST00000272317 IL15P40933 162 aaPredicted RBP20.68■□□□□ 0.9
RPS27A-201ENST00000272317 VEGFBP49765 207 aa20.68■□□□□ 0.9
RPS27A-201ENST00000272317 MTX1Q13505 466 aa20.68■□□□□ 0.9
RPS27A-201ENST00000272317 NBPF9Q3BBW0 867 aa20.68■□□□□ 0.9
RPS27A-201ENST00000272317 DLK2Q6UY11 383 aa20.68■□□□□ 0.9
RPS27A-201ENST00000272317 LPIN2Q92539 896 aa20.68■□□□□ 0.9
RPS27A-201ENST00000272317 ZNF408Q9H9D4 720 aa20.68■□□□□ 0.9
RPS27A-201ENST00000272317 CEP126Q9P2H0 1117 aa20.68■□□□□ 0.9
RPS27A-201ENST00000272317 TLL2Q9Y6L7 1015 aa20.68■□□□□ 0.9
RPS27A-201ENST00000272317 ADM5C9JUS6 153 aa20.67■□□□□ 0.9
RPS27A-201ENST00000272317 WNT10BO00744 389 aa20.67■□□□□ 0.9
RPS27A-201ENST00000272317 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP20.67■□□□□ 0.9
RPS27A-201ENST00000272317 JAG2Q9Y219 1238 aa20.67■□□□□ 0.9
RPS27A-201ENST00000272317 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa20.67■□□□□ 0.9
RPS27A-201ENST00000272317 SPEF2Q9C093 1822 aa20.67■□□□□ 0.9
RPS27A-201ENST00000272317 BCAMP50895 628 aa20.66■□□□□ 0.9
RPS27A-201ENST00000272317 SAPCD2Q86UD0 394 aa20.66■□□□□ 0.9
RPS27A-201ENST00000272317 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP20.65■□□□□ 0.9
RPS27A-201ENST00000272317 SLC5A1P13866 664 aa20.65■□□□□ 0.9
RPS27A-201ENST00000272317 DLGAP5Q15398 846 aa20.65■□□□□ 0.9
RPS27A-201ENST00000272317 F8W031 263 aaPredicted RBP20.64■□□□□ 0.89
RPS27A-201ENST00000272317 RLBP1P12271 317 aa20.64■□□□□ 0.89
RPS27A-201ENST00000272317 MFSD14BQ5SR56 506 aa20.64■□□□□ 0.89
RPS27A-201ENST00000272317 MTMR14Q8NCE2 650 aa20.64■□□□□ 0.89
RPS27A-201ENST00000272317 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP20.64■□□□□ 0.89
RPS27A-201ENST00000272317 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
RPS27A-201ENST00000272317 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
RPS27A-201ENST00000272317 MS4A1P11836 297 aa20.63■□□□□ 0.89
RPS27A-201ENST00000272317 ECE1P42892 770 aa20.63■□□□□ 0.89
RPS27A-201ENST00000272317 ITPRIPQ8IWB1 547 aa20.63■□□□□ 0.89
RPS27A-201ENST00000272317 HHIPL1Q96JK4 782 aa20.63■□□□□ 0.89
RPS27A-201ENST00000272317 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
RPS27A-201ENST00000272317 ATP2B3Q16720 1220 aa20.62■□□□□ 0.89
RPS27A-201ENST00000272317 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
RPS27A-201ENST00000272317 C2orf69Q8N8R5 385 aa20.62■□□□□ 0.89
RPS27A-201ENST00000272317 CDCA5Q96FF9 252 aa20.62■□□□□ 0.89
RPS27A-201ENST00000272317 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
RPS27A-201ENST00000272317 CFAP100Q494V2 611 aa20.61■□□□□ 0.89
RPS27A-201ENST00000272317 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa20.61■□□□□ 0.89
RPS27A-201ENST00000272317 CAPNS2Q96L46 248 aa20.61■□□□□ 0.89
RPS27A-201ENST00000272317 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
RPS27A-201ENST00000272317 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
RPS27A-201ENST00000272317 HUNKP57058 714 aa20.6■□□□□ 0.89
RPS27A-201ENST00000272317 ATP8B2P98198 1209 aa20.6■□□□□ 0.89
RPS27A-201ENST00000272317 CYP4F22Q6NT55 531 aa20.6■□□□□ 0.89
RPS27A-201ENST00000272317 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
RPS27A-201ENST00000272317 RCAN3Q9UKA8 241 aa20.6■□□□□ 0.89
RPS27A-201ENST00000272317 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
RPS27A-201ENST00000272317 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa20.59■□□□□ 0.89
RPS27A-201ENST00000272317 SPDYE2BA6NHP3 402 aa20.59■□□□□ 0.89
RPS27A-201ENST00000272317 MYO1BO43795 1136 aa20.59■□□□□ 0.89
RPS27A-201ENST00000272317 SPDYE6P0CI01 402 aa20.59■□□□□ 0.89
RPS27A-201ENST00000272317 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
RPS27A-201ENST00000272317 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
RPS27A-201ENST00000272317 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP20.59■□□□□ 0.89
RPS27A-201ENST00000272317 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
RPS27A-201ENST00000272317 PANK1Q8TE04 598 aa20.59■□□□□ 0.89
RPS27A-201ENST00000272317 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
RPS27A-201ENST00000272317 SERPINA10Q9UK55 444 aa20.59■□□□□ 0.89
RPS27A-201ENST00000272317 AKAP2Q9Y2D5 859 aa20.59■□□□□ 0.89
RPS27A-201ENST00000272317 TIMM10P62072 90 aa20.58■□□□□ 0.89
RPS27A-201ENST00000272317 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP20.58■□□□□ 0.89
RPS27A-201ENST00000272317 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa20.58■□□□□ 0.89
RPS27A-201ENST00000272317 TFCP2Q12800 502 aa20.57■□□□□ 0.88
RPS27A-201ENST00000272317 GRM1Q13255 1194 aa20.57■□□□□ 0.88
RPS27A-201ENST00000272317 WDR66Q8TBY9 1149 aa20.57■□□□□ 0.88
RPS27A-201ENST00000272317 SSH3Q8TE77 659 aa20.57■□□□□ 0.88
RPS27A-201ENST00000272317 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa20.57■□□□□ 0.88
RPS27A-201ENST00000272317 PSME4Q14997 1843 aa20.56■□□□□ 0.88
RPS27A-201ENST00000272317 MAP2K2P36507 400 aa20.56■□□□□ 0.88
RPS27A-201ENST00000272317 FKBP1BP68106 108 aa20.56■□□□□ 0.88
RPS27A-201ENST00000272317 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
RPS27A-201ENST00000272317 POLA2Q14181 598 aa20.56■□□□□ 0.88
RPS27A-201ENST00000272317 GRIK5Q16478 980 aa20.56■□□□□ 0.88
RPS27A-201ENST00000272317 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa20.56■□□□□ 0.88
RPS27A-201ENST00000272317 MRIQ9BWK5 157 aa20.56■□□□□ 0.88
RPS27A-201ENST00000272317 C1orf115Q9H7X2 142 aa20.56■□□□□ 0.88
RPS27A-201ENST00000272317 CRKP46108 304 aa20.55■□□□□ 0.88
RPS27A-201ENST00000272317 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
RPS27A-201ENST00000272317 RGMBQ6NW40 437 aa20.55■□□□□ 0.88
RPS27A-201ENST00000272317 DEFB129Q9H1M3 183 aa20.55■□□□□ 0.88
RPS27A-201ENST00000272317 WBP1LQ9NX94 342 aa20.55■□□□□ 0.88
RPS27A-201ENST00000272317 A0A1B0GUL7 405 aa20.54■□□□□ 0.88
RPS27A-201ENST00000272317 CLRN2A0PK11 232 aa20.54■□□□□ 0.88
RPS27A-201ENST00000272317 SEMA3EO15041 775 aa20.54■□□□□ 0.88
RPS27A-201ENST00000272317 ZBTB22O15209 634 aa20.54■□□□□ 0.88
RPS27A-201ENST00000272317 ADORA1P30542 326 aa20.54■□□□□ 0.88
RPS27A-201ENST00000272317 NF2P35240 595 aa20.54■□□□□ 0.88
RPS27A-201ENST00000272317 PHKA1P46020 1223 aa20.54■□□□□ 0.88
RPS27A-201ENST00000272317 DENND2AQ9ULE3 1009 aa20.54■□□□□ 0.88
RPS27A-201ENST00000272317 CCDC102BQ68D86 513 aa20.53■□□□□ 0.88
RPS27A-201ENST00000272317 TEKT1Q969V4 418 aa20.53■□□□□ 0.88
RPS27A-201ENST00000272317 CCDC102AQ96A19 550 aa20.53■□□□□ 0.88
RPS27A-201ENST00000272317 AIDAQ96BJ3 306 aa20.53■□□□□ 0.88
RPS27A-201ENST00000272317 XAGE2Q96GT9 111 aa20.53■□□□□ 0.88
RPS27A-201ENST00000272317 NEUROD6Q96NK8 337 aa20.53■□□□□ 0.88
RPS27A-201ENST00000272317 A0A1B0GUL6 1792 aa20.52■□□□□ 0.88
RPS27A-201ENST00000272317 AOC2O75106 756 aa20.52■□□□□ 0.88
RPS27A-201ENST00000272317 SURF6O75683 361 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
RPS27A-201ENST00000272317 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 110.6 ms